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线粒体证据揭示秦陵修陵劳工的来源 - 现代人类学通讯

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15(S):100-109<br />

COM. on C. A. 3:e12, 2009<br />

ª 现 代 人 类 学 通 讯 第 三 卷 2009 年 Communication on Contemporary Anthropology Vol. 3<br />

研 究 报 告<br />

线 粒 体 证 据 揭 示 秦 陵 修 陵 劳 工 的 来 源<br />

袁 媛 1 , 徐 智 1 , 谭 婧 泽 1 , 张 帆 1 , 许 渤 松 1 , 李 士 林 1 , 李 春 香 2 , 周 惠 2 , 朱 泓 2 , 张 君 3 , 段 清 波 4 ,<br />

1,5<br />

1<br />

金 力 , 李 辉<br />

1. 复 旦 大 学 生 命 科 学 学 院 生 物 医 学 研 究 院 现 代 人 类 学 教 育 部 重 点 实 验 室 进 化 生 物 学 中 心 , 上 海 200433;2. 吉 林 大 学 边 疆 考 古<br />

研 究 中 心 古 DNA 实 验 室 , 长 春 130012;3. 中 国 社 会 科 学 院 考 古 研 究 所 , 北 京 100710;4. 陕 西 省 文 物 与 考 古 研 究 所 , 西 安 710054;<br />

5. 中 国 科 学 院 上 海 生 命 科 学 研 究 院 - 马 普 学 会 计 算 生 物 学 伙 伴 研 究 所 , 上 海 200031.<br />

摘 要 : 越 来 越 多 的 研 究 试 图 利 用 古 DNA 的 手 段 揭 示 古 代 人 类 个 体 的 来 源 。2003 年 秦 始 皇 陵 秦 俑 坑 附 近 出 土<br />

的 一 批 人 骨 被 推 测 是 建 陵 劳 工 的 遗 骸 , 年 代 大 约 在 2200 年 前 。 我 们 通 过 克 隆 测 序 和 PCR-PRLP 的 方 法 , 成 功<br />

地 从 19 个 骨 样 本 中 得 到 线 粒 体 HVR 区 和 编 码 区 的 SNP 位 点 的 序 列 信 息 。 为 了 揭 示 这 些 劳 工 的 来 源 , 我 们 将<br />

所 得 序 列 与 中 国 现 代 人 的 32 个 群 体 (2164 个 体 ) 的 线 粒 体 序 列 分 别 在 个 体 和 群 体 水 平 上 作 比 较 , 结 果 表 明 秦 陵<br />

劳 工 墓 的 劳 工 来 源 是 多 样 的 。 本 文 详 尽 地 介 绍 了 古 DNA 的 操 作 方 法 、 序 列 信 息 的 甄 别 和 数 据 分 析 方 法 。<br />

关 键 词 : 古 DNA; 线 粒 体 DNA; 秦 始 皇 陵 劳 工<br />

Origins of the Workers Who Built the First Qin Emperor’s<br />

Mausoleum Revealed by Mitochondrial DNA<br />

YUAN Yuan 1 , XU Zhi 1 , TAN Jingze 1 , ZHANG Fan 1 , XU Bosong 1 , LI Shilin 1 , LI Chunxiang 2 ,<br />

ZHOU Hui 2 , ZHU Hong 2 , ZHANG Jun 3 , DUAN Qingbo 4 , JIN Li 1,5 , LI Hui 1<br />

1. MOE Key Laboratory of Contemporary Anthropology and Center for Evolutionary Biology, School of Life Sciences and Institutes of<br />

Biomedical Sciences, Fudan University, Shanghai 200433 China; 2. Ancient DNA Laboratory, Research Center for Chinese Frontier<br />

Archaeology, Jilin University, Changchun JL130012 China; 3. Institute of Archaeology, Chinese Academy of Social Sciences, Beijing<br />

100710 China; 4. Shaanxi Provincial Institute of Cultural Relics and Archaeology, Xi’an SA710054 China; 5. Chinese Academy of Sciences<br />

and Max Planck Society Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of<br />

Sciences, Shanghai 200031 China.<br />

Abstract: Ancient DNA analyses are always employed to reveal the ethnic origins of the ancient human remains. In<br />

this paper, we analyzed 19 human bone remains excavated from a tomb near the Qin Dynasty’s Terra-Cotta Warriors<br />

and dated some 2,200 years before present. There samples were supposed to be workers building the mausoleum for<br />

the First Emperor of China. The polymorphisms in the first hypervariable region and coding regions of mitochondrial<br />

DNA were analyzed using cloning sequencing and RFLP. The results were compared with 2,164 mtDNA profiles<br />

from 32 contemporary Chinese populations at both population and individual levels. Our results showed that<br />

mausoleum-building workers may be originated from very diverse ethnic populations.<br />

Key words: Ancient DNA; mtDNA; Mausoleum-building workers (MBWs); the First Emperor of China<br />

2003 年 2-3 月 , 陕 西 省 考 古 研 究 所 始 皇<br />

陵 考 古 队 在 清 理 一 处 秦 代 窑 址 时 发 现 了 121<br />

具 人 骨 架 。 从 骨 骼 结 构 改 变 ( 可 能 因 繁 重 的 体<br />

力 劳 动 造 成 )、 几 乎 全 为 男 性 ( 除 一 例 怀 疑 为 女<br />

性 )、 屈 肢 的 埋 葬 方 式 以 及 生 产 工 具 和 刑 具 等<br />

伴 随 物 品 这 四 个 方 面 , 张 君 等 推 测 他 们 是 当<br />

年 修 建 始 皇 陵 的 劳 动 者 。 目 前 尚 未 发 现 任 何<br />

墓 志 或 其 他 证 据 能 够 说 明 该 人 群 的 来 源 。 由<br />

于 埋 藏 环 境 曾 受 到 水 的 侵 蚀 , 窑 址 人 骨 保 存<br />

状 况 并 不 好 。 多 数 头 骨 严 重 受 压 变 形 甚 至 残<br />

碎 , 不 能 得 到 较 好 的 测 量 数 据 , 因 而 无 法 从<br />

骨 骼 形 态 上 分 析 这 些 人 的 来 源 。 初 步 观 察 发<br />

现 , 个 体 间 的 颅 面 部 形 态 特 征 差 异 较 大 , 推<br />

测 该 人 群 来 源 多 元 化 。<br />

秦 始 皇 ( 公 元 前 259 年 - 公 元 前 210 年 )<br />

是 中 国 历 史 上 第 一 个 封 建 集 权 王 朝 ——<br />

秦 王 朝 的 开 国 皇 帝 。 据 史 书 记 载 , 秦 始 皇 即<br />

位 的 次 年 即 开 始 修 陵 园 , 到 公 元 前 208 年 完<br />

工 , 历 时 39 年 ( 另 两 资 料 分 别 为 36 年 和 38<br />

年 )。 当 时 的 丞 相 李 斯 为 陵 墓 的 设 计 者 , 由 大<br />

将 军 章 邯 监 工 , 共 征 集 了 72 万 人 力 , 修 陵 人<br />

数 最 多 时 近 于 80 万 , 几 乎 相 当 于 修 建 胡 夫 金<br />

字 塔 人 数 的 8 倍 。 秦 始 皇 陵 位 于 陕 西 省 西 安<br />

市 以 东 30 公 里 的 骊 山 北 麓 ( 另 两 资 料 : 位 于<br />

临 潼 以 东 5 千 米 处 的 下 河 村 ; 位 于 西 安 市 以<br />

东 35 公 里 的 临 潼 区 境 内 ), 陵 园 总 面 积 为<br />

56.25 平 方 公 里 , 建 筑 材 料 是 从 湖 北 、 四 川 等<br />

地 运 来 的 。 陵 上 封 土 原 高 约 115 米 , 现 仍 高<br />

收 稿 日 期 :2009 年 11 月 11 日 修 回 日 期 :2009 年 11 月 16 日 联 系 人 : 谭 婧 泽 tanjingze@gmail.com<br />

2009 年 11 月 18 日 http://COMonCA.org.cn/Abs/2009/012.htm 100 © 上 海 人 类 学 学 会 Shanghai Society of Anthropology


袁 媛 等 : 线 粒 体 证 据 揭 示 秦 陵 修 陵 劳 工 的 来 源<br />

研 究 报 告<br />

达 76 米 , 陵 园 有 内 外 两 重 城 垣 , 内 城 周 长<br />

3840 米 , 外 城 周 长 6210 米 。 内 外 城 廓 有 高<br />

约 8-10 米 的 城 墙 , 今 尚 残 留 遗 址 。 秦 始 皇 陵<br />

是 中 国 历 史 上 第 一 个 皇 帝 陵 园 , 其 巨 大 的 规<br />

模 、 丰 富 的 陪 葬 物 居 历 代 帝 王 陵 之 首 ; 古 埃<br />

及 金 字 塔 是 世 界 上 最 大 的 地 上 王 陵 , 而 中 国<br />

秦 始 皇 陵 是 世 界 上 最 大 的 地 下 皇 陵 。1974 年<br />

春 , 在 秦 始 皇 陵 坟 丘 东 侧 1.5 公 里 处 , 当 地<br />

农 民 打 井 , 无 意 中 挖 出 一 个 陶 制 武 士 头 。 后<br />

经 国 家 有 组 织 的 发 掘 , 终 于 发 现 了 震 惊 全 世<br />

界 的 秦 始 皇 陵 兵 马 俑 。 兵 马 俑 坑 是 秦 始 皇 陵<br />

的 陪 葬 坑 , 位 于 陵 园 东 侧 1500 米 处 。 现 已 发<br />

掘 3 座 , 俑 坑 坐 西 向 东 , 呈 “ 品 ” 字 形 排 列 ,<br />

坑 内 有 陶 俑 、 陶 马 8000 多 件 , 还 有 4 万 多 件<br />

青 铜 兵 器 , 被 誉 为 “ 世 界 第 八 大 奇 迹 ”。1987<br />

年 , 联 合 国 教 育 、 科 学 文 化 组 织 , 把 秦 始 皇<br />

陵 列 入 世 界 文 化 遗 产 保 护 目 录 , 成 为 全 人 类<br />

的 共 同 财 富 。<br />

通 过 生 物 学 研 究 分 析 秦 俑 坑 附 近 出 土 的<br />

秦 代 劳 工 遗 骸 , 无 疑 有 助 于 了 解 秦 俑 和 秦 陵<br />

建 造 者 的 来 源 , 进 而 使 我 们 对 秦 代 历 史 有 更<br />

多 更 直 接 的 理 解 。 本 项 研 究 就 是 通 过 古 代<br />

DNA 研 究 来 分 析 这 批 遗 骸 的 族 属 情 况 。 古 代<br />

DNA 是 指 保 留 在 古 代 生 物 遗 骸 和 遗 迹 中 的<br />

遗 传 物 质 , 是 一 种 重 要 的 遗 传 资 源 。 近 年 来<br />

人 类 遗 传 学 及 人 类 基 因 组 研 究 的 迅 速 发 展 ,<br />

促 生 了 在 DNA 分 子 水 平 上 研 究 人 群 的 遗 传<br />

学 特 征 的 方 法 , 即 分 子 人 类 学 。1997 年 ,<br />

Krings 等 [1] 从 尼 安 德 特 人 (Homo neanderthalensis)<br />

化 石 中 成 功 地 提 取 了 mtDNA 片 段 ,<br />

并 进 行 PCR 扩 增 和 测 序 , 同 全 世 界 1600 例<br />

现 代 人 的 mtDNA 进 行 比 较 之 后 , 得 出 尼 安 德<br />

特 人 与 现 代 欧 洲 人 没 有 直 接 的 继 承 关 系 , 只<br />

是 现 代 人 的 旁 系 远 亲 而 非 直 系 祖 先 , 支 持 非<br />

洲 起 源 假 说 。 这 是 古 DNA 研 究 用 于 人 类 学 研<br />

究 的 里 程 碑 事 件 。 其 中 , 线 粒 体 DNA(mtDNA)<br />

位 于 线 粒 体 中 , 母 系 遗 传 , 是 闭 合 的 环 状 双<br />

链 DNA 分 子 。 人 类 的 mtDNA 由 16569 个 碱<br />

基 对 组 成 , 其 中 非 编 码 区 里 含 有 三 个 高 变 区 ,<br />

分 为 HVRI (16024-16400)、HVRII(44-340)、<br />

HVRIII (438-576)。 利 用 mtDNA 多 态 性 遗 传<br />

标 记 来 追 溯 人 类 群 体 起 源 迁 移 事 件 发 生 的 大<br />

致 时 间 及 路 线 , 成 为 人 类 进 化 研 究 的 重 要 手<br />

段 。<br />

一 、 材 料 与 方 法<br />

1. 墓 葬 人 骨 材 料<br />

我 们 从 陕 西 考 古 所 获 得 了 所 有 121 份 个<br />

体 的 样 本 , 形 态 学 分 析 表 明 这 些 样 本 均 来 自<br />

不 同 个 体 。 我 们 随 机 选 取 了 50 个 样 本 进 行<br />

DNA 分 析 , 人 骨 样 品 主 要 是 肢 骨 残 段 。<br />

2. 实 验 方 法<br />

DNA 提 取 : a) 去 污 染 预 处 理 : 在 股 骨 中<br />

段 取 1cm×2cm 的 骨 片 , 打 磨 去 除 表 面<br />

1-2mm; 漂 白 液 浸 泡 、 无 水 乙 醇 清 洗 后 , 空<br />

气 干 燥 ; 置 于 256nm 紫 外 灯 下 照 射 。b) 样 品<br />

的 粉 碎 : 用 SPEX Sample Prep Freezer/<br />

Mills6750 粉 碎 处 理 过 的 骨 片 。c)DNA 抽 提 :<br />

DNA 抽 提 步 骤 按 照 Rohland 和 Hofreiter[2] 所<br />

描 述 。<br />

PCR 扩 增 : a)25μl 的 PCR 体 系 :1U rTaq<br />

聚 合 酶 (Takara),200μM dNTP,1.5mM Mg 2+ ,<br />

1μM 引 物 ( 表 1),1μg BSA(Takara) 以 及 4μl<br />

的 DNA 抽 提 液 。b)PCR 程 序 :94°C 预 变 性<br />

15min,45 个 循 环 (94°C30s,52°C30s,72°C30s),<br />

72°C 延 伸 7min。c)PCR 产 物 鉴 定 :5μl PCR<br />

产 物 通 过 2% 的 琼 脂 糖 凝 胶 电 泳 , 条 带 单 一 且<br />

长 度 准 确 的 PCR 产 物 被 用 于 后 续 操 作 。<br />

PCR 产 物 直 接 测 序 : 所 得 PCR 产 物 , 首<br />

先 通 过 直 接 测 序 初 步 了 解 其 DNA 的 序 列 情<br />

况 。a)PCR 产 物 纯 化 :1.5-2μl(10ng) 的 PCR<br />

产 物 与 0.1U 虾 碱 磷 酸 酶 (Shrimp Alkaline<br />

Phosphatase,SAP) 和 1.25U 外 切 酶 (ExonI) 混<br />

合 后 ,37℃ 孵 育 80min,80℃15min 变 性 失 活<br />

酶 。b) 测 序 反 应 : 使 用 Big Dye Terminator kit<br />

(Applied Biosystems), 程 序 为 96℃10s 预 变<br />

性 ,25 个 循 环 (96℃10s,50℃5s,60℃90s),<br />

60℃ 延 伸 4min; 测 序 引 物 为 相 应 的 PCR 引<br />

物 。<br />

克 隆 测 序 : 直 接 测 序 得 到 的 序 列 信 息 不<br />

能 真 实 地 反 应 古 代 样 品 中 DNA 的 序 列 , 要 获<br />

得 可 靠 的 序 列 信 息 , 需 要 进 行 克 隆 测 序 。<br />

a)PCR 产 物 纯 化 、 连 接 : 使 用 AxyPrep PCR<br />

Clean-up Kit(Axygen) 纯 化 PCR 产 物 , 所 得 产<br />

物 5μl 与 5μl 的 Solution1 和 0.5μ 的 pMD18-T<br />

Simple Vector(Takara) 混 合 ,4℃ 放 置 过 夜 。<br />

b) 克 隆 : 氯 化 钙 法 制 备 大 肠 杆 菌 感 受 态 细 胞 ,<br />

转 化 , 活 化 , 平 皿 培 养 过 夜 。c)PCR 鉴 定 克<br />

101


REPORT<br />

COM. on C. A. 3:e12, 2009<br />

表 1 古 DNA 分 析 所 用 引 物 Tab. 1 The primers used in ancient DNA analysis<br />

引 物 序 列 (5'-3') 片 段 长 度 多 态 位 点<br />

L16053 GGGAAGCAGATTTGGGTAC<br />

H16158 GATGTGGATTGGGTTTTTATG<br />

146bp HVRI<br />

L16154 TACCATAAATACTTGACCACCTG<br />

H16265 GTTTGTTGGTATCCTAGTGGG<br />

156bp HVRI<br />

测 序<br />

L16263 AACTCCAAAGCCACCCC<br />

H16366 TGAGGGGGGTCATCCAT<br />

235bp HVRI<br />

L16016 ATTCTCTGTTCTTTCATGGG<br />

H16403 ATTGATTTCACGGAGGATGG<br />

138bp HVRI<br />

L16017♪ TTCTCTGTTCTTTCATGGGGA<br />

H16251♪ GGAGTTGCAGTTGATGTGTGA<br />

408bp HVRI<br />

L16201♪ CAAGCAAGTACAGCAATCAAC<br />

H16409♪ AGGATGGTGGTCAAGGGA<br />

235bp HVRI<br />

L629 CACATCACCCCATAAACAAAT<br />

H742 ATCGTGGTGATTTAGAGGGT<br />

113bp 663HaeIII<br />

L5135 CTCCAGCACCACGACCCTAC<br />

H5253 GCAAAAAGCCGGTTAGCG<br />

119bp 5176AluI<br />

L12362 CCCTAACCCTGACTTCCCTAAT<br />

H12449 AAGGTGGATGCGACAATGG<br />

106bp 12406HpaI<br />

RFLP<br />

L13188 CACTCTGTTCGCAGCAGTCTG<br />

H13280 GTTGGTTGATGCCGATTGTAA<br />

113bp 13262AluI<br />

L8226 TCCCCTAAAAATCTTTGAAATA<br />

H8325 AAAAGGTTAATGCTAAGTTAGCTTTA<br />

100or91bp 9bpΔ<br />

L4798 CCTTTCACTTCTGAGTCCCA<br />

H4914 GTGAGGGAGAGATTTGGTATATG<br />

117bp 4833HhaI<br />

L10341 ATCATCATCCTAGCCCTAAGTC<br />

10398DdeI<br />

99bp<br />

H10439 GTCGAAATCATTCGTTTTGTT<br />

10400AluI<br />

克 隆 测 序<br />

RV-M GAGCGGATAACAATTTCACACAGG<br />

M13-47 CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC<br />

156bp<br />

L 和 H 分 别 代 表 mtDNA 的 轻 、 重 链 , 引 物 编 号 参 照 rCRS[3](Genbank, AC_000021), ♪ 代 表 在 吉 林 大 学 重 复 实<br />

验 所 使 用 的 引 物 。L and H indicate the light and heavy chains of mtDNA respectively numbering according to the<br />

revised Cambridge reference sequence (rCRS) [3](Genbank, AC_000021). Symbol ♪ represents primers used for the<br />

independent replication experiment in Jilin University.<br />

隆 :PCR 体 系 同 上 , 引 物 为 RV-M 和<br />

M13-47( 表 1); 程 序 为 94℃5min 预 变 性 ,35<br />

个 循 环 (95℃30s,55℃30s,72℃30s),72℃<br />

延 伸 10min;PCR 产 物 电 泳 鉴 定 , 没 有 片 段<br />

插 入 的 PCR 产 物 长 度 为 156bp, 有 片 段 插 入<br />

的 PCR 产 物 长 度 约 为 300bp, 此 为 成 功 连 接<br />

的 PCR 产 物 。d) 克 隆 子 测 序 : 取 8 个 成 功 连<br />

接 的 PCR 产 物 10ng 作 为 测 序 模 板 测 序 。<br />

RFLP 分 型 : 为 进 一 步 确 定 单 倍 群 归 属 ,<br />

根 据 mtDNA 的 谱 系 树 [4], 通 过 限 制 性 酶 切<br />

获 得 编 码 区 的 SNP 位 点 信 息 。PCR 体 系 同 上 ,<br />

根 据 初 步 确 立 的 单 倍 群 , 选 择 不 同 的 引 物 和<br />

内 切 酶 ( 表 1)。<br />

3. 序 列 分 析<br />

单 倍 型 确 定 : 测 序 源 文 件 导 入 到<br />

Lasergene7.1.0(DNASTAR,http://www.dnastar.<br />

com), 将 rCRS 作 为 参 照 进 行 序 列 比 对 。 通<br />

过 克 隆 序 列 获 得 样 品 的 单 倍 型 , 通 过 与 已 经<br />

发 表 的 来 自 世 界 各 地 的 26000 多 个 个 体 的 单<br />

倍 型 比 较 之 后 , 初 步 确 立 其 单 倍 群 归 属 。<br />

数 据 分 析 : 研 究 秦 陵 劳 工 墓 样 品 的<br />

DNA, 目 的 是 揭 示 其 来 源 。 我 们 获 取 了 来 自<br />

中 国 各 地 的 32 个 群 体 共 2164 个 个 体 的<br />

mtDNA 序 列 ( 表 2, 图 1)。 根 据 其 地 理 位 置 和<br />

民 族 分 类 以 及 南 北 人 群 的 显 著 差 异 [5,6], 该<br />

32 个 群 体 被 分 为 北 方 汉 族 (NH)、 南 方 汉 族<br />

(SH)、 北 方 少 数 民 族 (NM) 和 南 方 少 数 民 族<br />

(SM)。 用 SPSS11.0.1 绘 制 基 于 单 倍 群 比 率 的<br />

主 成 分 分 析 图 ; 通 过 ARLEQUIN3.1[7] 计 算<br />

基 因 和 核 苷 酸 多 样 性 ; 用 Network4.5.0.0<br />

(www.fluxus-engineering.com) 绘 制 基 于 邻 接<br />

法 的 最 大 简 约 树 。<br />

二 、 可 靠 性 分 析<br />

按 照 古 DNA 研 究 的 可 靠 性 标 准 [15-18],<br />

我 们 对 该 50 个 样 本 采 取 严 格 的 实 验 步 骤 , 以<br />

避 免 外 源 污 染 。 其 中 , 有 22 个 样 本 没 有 可 扩<br />

增 的 DNA, 予 以 舍 弃 ; 将 剩 余 的 28 个 样 品<br />

进 行 重 复 实 验 , 其 中 9 个 不 可 重 复 , 予 以 舍<br />

102


袁 媛 等 : 线 粒 体 证 据 揭 示 秦 陵 修 陵 劳 工 的 来 源<br />

研 究 报 告<br />

表 2 用 于 数 据 比 较 的 32 个 现 代 中 国 人 群<br />

Tab. 2 Modern Chinese populations used for<br />

comparison with Qin samples<br />

群 体 编 号 样 本 量 来 源<br />

陕 西 1 53 [6]<br />

青 海 2 44 [6]<br />

北 方 汉 内 蒙 古 3 45 [6]<br />

(NH) 西 安 4 85 [8]<br />

辽 宁 5 51 [6]<br />

甘 肃 6 45 [6]<br />

浙 江 7 61 [6]<br />

云 南 8 59 [6]<br />

南 方 汉<br />

(SH)<br />

北 方 少<br />

数 民 族<br />

(NM)<br />

南 方 少<br />

数 民 族<br />

(SM)<br />

台 湾 9 66 [9]<br />

四 川 10 70 [6]<br />

上 海 1 56 [6]<br />

江 西 12 23 [6]<br />

江 苏 13 67 [6]<br />

湖 南 14 16 [6]<br />

广 西 15 29 [6]<br />

福 建 16 54 [6]<br />

长 沙 17 82 [8]<br />

安 徽 18 42 [6]<br />

广 东 19 29 [10]<br />

蒙 古 20 48 [11]<br />

朝 鲜 21 48 [11]<br />

哈 萨 克 22 53 [12]<br />

鄂 温 克 23 47 [11]<br />

藏 24 56 [13]<br />

维 吾 尔 25 47 [12]<br />

彝 26 56 [14]<br />

土 家 27 96 [13]<br />

瑶 28 395 [14]<br />

苗 29 142 [14]<br />

傣 30 38 [10]<br />

白 31 55 [13]<br />

壮 32 83 [10]<br />

图 1 秦 俑 劳 工 墓 和 32 个 现 代 中 国 人 群 的 地 理 位 置<br />

虚 线 表 示 秦 朝 的 边 疆 , 群 体 的 编 号 见 表 2, 劳 工 墓 位<br />

置 以 实 心 圆 表 示 。<br />

Fig.1 The geographical locations of Qin Mausoleum<br />

worker tomb and the 32 Chinese populations. The dot<br />

line indicates the border of Qin Dynasty; the numbers<br />

are the same as in Table 2, and the big dot indicates the<br />

location of mausoleum worker tomb.<br />

弃 。 在 所 得 的 19 个 样 本 中 随 机 挑 取 两 个 (M54<br />

和 M57) 在 吉 林 大 学 进 行 独 立 重 复 实 验 , 结 果<br />

具 有 一 致 性 。 此 外 , 这 19 个 样 本 的 DNA 显<br />

示 了 各 种 古 DNA 的 分 子 特 性 , 且 与 实 验 人 员<br />

的 序 列 不 同 , 因 此 我 们 认 为 这 19 个 样 本 的 序<br />

列 信 息 是 可 靠 的 。<br />

1. 实 验 过 程 的 控 制<br />

所 有 样 品 都 是 新 近 挖 掘 的 , 且 尽 可 能 避<br />

免 触 摸 ( 研 究 表 明 博 物 馆 收 藏 的 材 料 有 高 比<br />

例 的 污 染 [19], 且 污 染 水 平 多 样 [20])。 所 有 的<br />

PCR 前 操 作 都 在 一 个 隔 离 的 古 DNA 专 用 实<br />

验 室 中 进 行 。 此 外 , 实 验 人 员 保 持 (PCR 前 →<br />

PCR→PCR 后 ) 的 单 向 流 动 , 以 防 止 外 源 DNA<br />

通 过 粘 附 在 衣 物 和 皮 肤 上 进 入 古 DNA 实 验<br />

室 ; 长 时 间 紫 外 照 射 和 次 氯 酸 钠 的 使 用 [21]<br />

是 行 之 有 效 的 消 除 污 染 的 方 法 ; 使 用 一 次 性<br />

手 套 、 口 罩 和 带 滤 芯 的 移 液 头 等 避 免 样 品 间<br />

的 交 叉 污 染 。<br />

三 段 PCR 目 的 产 物 首 尾 有 重 叠 区 域 , 这<br />

样 可 以 减 小 误 扩 增 到 核 mtDNA 的 可 能 性<br />

[17,22,23]( 表 1)。 为 检 测 可 能 的 污 染 , 在 抽 提<br />

和 PCR 时 , 都 引 入 阴 性 对 照 , 与 样 品 的 比 例<br />

为 1:1。<br />

理 论 上 , 一 个 克 隆 序 列 代 表 一 个 DNA 片<br />

段 分 子 的 插 入 , 即 序 列 是 唯 一 的 , 若 存 在 杂<br />

合 , 很 可 能 是 交 叉 污 染 , 将 此 克 隆 剔 除 。 如<br />

果 某 一 信 息 位 点 有 6 个 或 6 个 以 上 的 克 隆 序 列<br />

显 示 同 样 的 碱 基 , 则 认 为 该 位 点 是 可 靠 的 ( 图<br />

2)。 将 所 得 序 列 与 rCRS 比 对 , 逐 一 检 验 各 个<br />

位 点 , 最 后 确 定 该 样 品 的 单 倍 型 。<br />

图 2 中 rCRS[3] 为 参 照 标 准 序 列 ;“.” 表<br />

示 该 位 点 与 rCRS 一 致 ;a、b、c 分 别 代 表<br />

HVRI 上 的 三 段 不 同 片 段 (16053-16158 、<br />

16154-16265、16263-16366)。 克 隆 测 序 反 应<br />

了 PCR 产 物 中 单 分 子 的 序 列 信 息 , 可 以 通 过<br />

不 同 的 克 隆 观 察 到 多 聚 酶 的 低 保 真 度 所 造 成<br />

的 某 一 位 点 的 假 象 、 测 序 错 误 以 及 跳 跃<br />

PCR[24,25]。 在 大 多 数 的 克 隆 中 , 位 点 16223、<br />

16239、16298、16327 和 16357 上 都 出 现 了<br />

转 换 , 因 而 可 以 认 为 样 品 M54 的 mtDNA<br />

HVRI 的 可 靠 单 倍 型 为 16233-16239-<br />

16298-16327。C7 和 C8 不 同 于 C1-C6, 被 认<br />

为 是 外 源 污 染 DNA, 但 和 实 验 人 员 的 DNA<br />

序 列 不 同 ( 表 3), 因 此 并 不 是 源 于 实 验 人 员 。<br />

16079、16089、16107、16109、16148、16172、<br />

16211、16227、16259、16306 和 16313 位 点<br />

上 的 碱 基 置 换 被 认 为 是 散 在 的 碱 基 错 配 , 是<br />

103


REPORT<br />

COM. on C. A. 3:e12, 2009<br />

图 2 秦 陵 劳 工 墓 M54 的 mtDNA 克 隆 序 列 对 比 Fig.2 Alignment of cloned mtDNA sequences from sample M54.<br />

表 3 在 所 有 19 个 劳 工 墓 样 品 的 克 隆 序 列 中 出 现 的 碱 基 错 配<br />

Tab.3 Miscoding lesions observed within clones from MBWs<br />

Transition(Type1) Transition(Type2) Transversion<br />

Sample T→C A→G C→T G→A G→T A→T C→A T→G A→C<br />

M7 4<br />

M17 3 1 2 2 1<br />

M21 1 5 1 1<br />

M31 2 1 1 2<br />

M37 4 3 1<br />

M39 4 4 1<br />

M41 3 3 7 1<br />

M43 4 1<br />

M47 3 3 1<br />

M50 1 4<br />

M53 2 4 1 1<br />

M54 2 2 7 1<br />

M57 1 2 2 1<br />

M60 3 5<br />

M61 1 1 1<br />

M71 1 4 1<br />

M86 4<br />

M91 3 2<br />

M98 1 1<br />

Total 33 17 59 10 3 2 4 1 3<br />

表 4 秦 陵 劳 工 墓 的 挖 掘 和 分 析 人 员 的 线 粒 体 高 变 I 区 的 序 列 特 征 和 所 属 单 倍 群<br />

Tab.4 HVSI motives and mtDNA haplogroups of the staff involved in the excavations and experiments for MBWs.<br />

#<br />

人 员<br />

HVRI(16053-16366), 16000+<br />

单 倍 型<br />

F1 66-223-311 M*<br />

F2 223-234-290-362 M*<br />

F3 172-223-356-362 不 明<br />

F4 223-234-291-316-362 M9a<br />

F5 189-223-311 M*<br />

F6 111-129-140-183C-189-200T-243 B5b<br />

A1 68-86-189-271-304-311 F1<br />

A2 223-362 不 明<br />

J1 136-183C-189-217-218-239-248 B4b1<br />

J1 126-174-223-311-362 不 明<br />

J1 145-182C-183C-189-217-261-360 B4a<br />

#F1-F6, 复 旦 大 学 的 研 究 人 员 ;A1 和 A2, 陕 西 考 古 所 的 研 究 人 员 ;J1-J3, 吉 林 大 学 的 研 究 人 员 。 F1–F6, the<br />

staff of the lab at Fudan University; A1 and A2, the staff of Shaanxi Institute of Archaeology; J1–J3, the staff of the<br />

lab at Jilin University.<br />

104


袁 媛 等 : 线 粒 体 证 据 揭 示 秦 陵 修 陵 劳 工 的 来 源<br />

研 究 报 告<br />

古 DNA 的 一 个 明 显 特 征 [26], 不 是 污 染 。<br />

2. 重 复 实 验<br />

虽 然 古 DNA 存 在 碱 基 错 配 , 但 同 一 个 碱<br />

基 错 配 在 多 次 抽 提 中 重 复 出 现 几 乎 是 不 可 能<br />

的 [26] , 因 此 每 个 样 品 都 经 过 两 次 独 立 重 复<br />

抽 提 。 重 复 实 验 从 预 处 理 样 本 开 始 , 获 得 的<br />

序 列 结 果 与 之 前 的 序 列 比 对 , 如 存 在 较 大 差<br />

异 , 则 舍 弃 该 样 品 ; 如 两 次 的 实 验 结 果 一 致 ,<br />

则 认 为 该 序 列 是 可 靠 的 ; 如 部 分 信 息 位 点 一<br />

致 , 则 再 次 对 样 品 进 行 重 复 实 验 。<br />

3. 不 同 实 验 室 的 独 立 重 复<br />

从 经 过 重 复 实 验 确 认 的 样 品 中 随 机 选 取<br />

2 个 样 品 , 在 吉 林 大 学 边 疆 考 古 研 究 中 心 进<br />

行 独 立 重 复 实 验 。DNA 抽 提 使 用 GENE<br />

CLEAN Kit 或 Ancient DNA(Q-BIOgene);<br />

12.5μl PCR 体 系 包 括 1U Taq 酶 ,200μM<br />

dNTP,2.5mM MgCl2,50mM KCl,2μM 引<br />

物 ( 表 1) 和 2mg/mL BSA。PCR 程 序 为 94°C<br />

4min,6 个 循 环 (94°C 1min,58°C 55s,72°C<br />

1min),34 个 循 环 (94°C 1min,54°C 55s,72°C<br />

1min),72°C 延 伸 10min。PCR 产 物 在 ABI310<br />

上 直 接 测 序 。<br />

4. 古 代 DNA 分 子 特 性<br />

所 有 19 个 样 品 都 显 示 出 一 定 的 古 代<br />

DNA 分 子 特 性 ( 表 3), 包 括 不 同 克 隆 之 间 观<br />

察 到 的 嵌 合 (chimeric) 序 列 [27,28]( 图 2) 以 及<br />

408bp 的 长 片 段 的 扩 增 失 败 。 除 了 M60 带 有<br />

16102T→C 这 一 罕 见 突 变 位 点 [29], 其 他 序 列<br />

都 没 有 超 出 已 定 义 的 单 倍 群 位 点 。 对 mtDNA<br />

HVRI 区 域 共 314 个 核 苷 酸 (16053-16366) 测<br />

序 , 与 rCRS 比 对 , 共 有 45 个 置 换 (38 个 转<br />

换 和 7 个 颠 换 ), 没 有 观 察 到 缺 失 和 插 入 。<br />

虽 然 本 研 究 没 有 测 定 样 本 中 氨 基 酸 的 外<br />

消 旋 性 , 但 是 该 19 个 样 本 在 实 验 室 内 和 实 验<br />

室 间 的 重 复 实 验 都 得 到 一 致 的 结 果 , 即 可 判<br />

断 必 定 存 在 内 源 DNA, 这 一 替 代 方 法 被 用 于<br />

很 多 古 DNA 研 究 [26,30,31]。 为 确 定 样 品<br />

DNA 的 片 段 长 度 和 拷 贝 数 存 在 负 相 关 性 , 需<br />

要 测 定 内 源 DNA 的 含 量 , 但 是 初 步 的 实 时 定<br />

量 PCR 显 示 , 样 品 中 的 抑 制 因 子 使 荧 光 信 号<br />

不 稳 定 或 者 不 存 在 [32], 我 们 进 一 步 扩 增<br />

408bp 的 片 段 [15,33,34], 所 有 样 品 均 无 扩 增<br />

结 果 , 这 证 明 样 品 中 不 存 在 长 片 段 的 DNA( 即<br />

可 能 的 污 染 )。<br />

5. 排 除 实 验 人 员 污 染<br />

将 实 验 人 员 的 mtDNA 序 列 与 获 得 的 样<br />

本 DNA 序 列 做 比 较 , 以 排 除 所 得 序 列 来 自 实<br />

验 人 员 ( 表 4)。<br />

三 、 序 列 分 析<br />

通 过 以 上 一 系 列 筛 选 , 我 们 从 50 个 样 品<br />

中 获 得 19 个 可 靠 的 古 代 样 品 的 mtDNA( 表<br />

5), 并 对 其 进 行 了 序 列 分 析 (http://www.ncbi.<br />

nlm.nih.gov/Genbank/GenbankOverview.html,<br />

EU700062-EU700080)。 线 粒 体 HVRI 单 倍 型 、<br />

RFLP 结 果 以 及 单 倍 群 归 属 如 表 5。<br />

表 5 秦 陵 劳 工 墓 样 品 的 mtDNAHVRI 单 倍 型 、RFLP 结 果 以 及 单 倍 群 归 属<br />

Tab. 5 mtDNA HVRI and RFLP results of MBWs and individual haplogroup assignment.<br />

样 品 单 倍 群 HVRI 单 倍 型<br />

663 5176 12406 13262 10400 10398 4833<br />

9bp<br />

HaeIII AluI HpaI AluI AluI DdeI HhaI<br />

M7 M8a 184-189-192-223-298-311-319 / + 2 + /<br />

M17 B5b 140-183C-189-243-355 / + 1 + /<br />

M21 F* 207-304-311 / / / / /<br />

M31 N* 223-245 + / +<br />

M37 F1b 183C-189-195G-232A-249-258C-304-311 / / +<br />

M39 F1b 189-232A-249-265C-304-311 / / / /<br />

M41 N9a 111-129-223-257A-261 / /<br />

M43 N9a 129-223-257A-261 / + 2 + /<br />

M47 N9a 223-257A-261-311 / +<br />

M50 M7a 209-223 + +<br />

M53 D* 223-299-325-362 / / 2 + /<br />

M54 C 223-239-298-327-357 + + +<br />

M57 F1a1 129-145-162-172-304 / + 2 T/ /<br />

M60 G2a 92-102-223-227-272-278-319-362 + + +<br />

M61 D5 164-172-182C-183C-189-223-362 / / 2 + /<br />

M71 F1a1 162-172-304 / / / /<br />

M86 A 223-290-311-319-362 + + 2 + /<br />

M91 B5 140-183C-189-362 / + 1 + /<br />

M98 B4a 182C-183C-189-217-261-360 / + 1 + /<br />

105


REPORT<br />

COM. on C. A. 3:e12, 2009<br />

1. 主 成 分 分 析<br />

为 了 便 于 比 较 , 现 代 人 数 据 仅 使 用<br />

16053-16366 上 的 序 列 , 即 HVRI 区 。 其 主 成<br />

分 分 析 ( 图 3) 表 明 , 秦 陵 劳 工 墓 19 个 样 品 构<br />

成 的 古 代 群 体 和 32 个 中 国 现 代 对 比 人 群 没<br />

有 群 体 上 的 相 似 性 。<br />

图 3 秦 陵 劳 工 墓 样 品 和 现 代 中 国 人 群 基 于 单 倍 群<br />

出 现 比 率 的 主 成 分 分 析 32 个 群 体 根 据 地 理 位 置 和<br />

民 族 被 分 成 4 组 ( 表 2)。<br />

Fig. 3 Principal component analysis of mtDNA<br />

haplogroup frequencies among MBWs and modern<br />

Chinese populations. The 32 modern populations were<br />

divided into four groups (see Table 2).<br />

2. 群 体 多 样 性 比 较<br />

秦 陵 劳 工 墓 的 19 个 样 本 构 成 的 群 体 基<br />

因 多 样 性 和 核 苷 酸 多 样 性 的 值 分 别 为 1.000<br />

±0.017 和 0.019±0.010, 略 高 于 其 他 32 个<br />

群 体 ( 表 6), 但 是 差 异 不 显 著 (p>0.05)。<br />

3. 最 大 简 约 树<br />

秦 陵 劳 工 墓 的 19 个 样 品 归 属 于 15 个 单<br />

倍 群 , 没 有 显 示 明 显 的 欧 亚 大 陆 西 部 人 群 特<br />

有 的 单 倍 群 。 由 于 单 倍 群 M7a 和 B5 在 2164<br />

个 现 代 人 个 体 中 很 少 见 , 无 法 构 树 ; 图 4 是<br />

其 它 13 个 单 倍 群 的 最 大 简 约 树 。 尽 管 2000<br />

年 来 的 迁 徙 可 能 影 响 群 体 中 单 倍 群 的 频 率 ,<br />

但 聚 类 分 析 对 于 追 溯 样 品 的 来 源 仍 具 有 一 定<br />

参 考 价 值 。 秦 陵 劳 工 墓 样 品 M86( 单 倍 群 A)<br />

与 青 海 的 一 个 北 方 汉 族 个 体 具 有 同 样 的<br />

mtDNA HVRI 单 倍 型 ;M98( 单 倍 群 B4a) 与 南<br />

方 少 数 民 族 聚 类 在 一 起 , 而 且 单 倍 群 B4a 在<br />

南 方 少 数 民 族 中 的 频 率 很 高 [13], 表 明 其 来 源<br />

可 能 是 中 国 南 方 的 少 数 民 族 ;M17( 单 倍 群<br />

B5b) 可 能 来 自 南 方 汉 族 ( 这 里 指 南 方 汉 族 的<br />

祖 先 群 体 , 下 文 的 类 似 情 况 不 再 注 明 ),<br />

M60( 单 倍 群 G2a) 可 能 来 自 汉 族 ;M61( 单 倍 群<br />

D5) 与 一 些 南 方 少 数 民 族 个 体 聚 类 在 一 起 , 而<br />

M21( 单 倍 群 F*) 则 与 一 些 北 方 汉 族 个 体 聚 类<br />

在 一 起 。 尽 管 从 聚 类 上 无 法 区 分 南 方 和 北 方 ,<br />

但 考 虑 到 单 倍 群 F1a1 在 东 南 亚 频 率 较 高<br />

[35], 推 测 M57 和 M71 可 能 来 自 南 方 ; 单 倍<br />

群 D* 在 南 方 [13] 和 北 方 少 数 民 族 [11,12] 中 都<br />

高 频 率 地 存 在 , 而 在 汉 族 中 频 率 很 低 , 所 以<br />

M53 可 能 不 是 汉 族 。 此 外 , 最 大 简 约 树 和 单<br />

倍 群 的 频 率 分 布 无 法 揭 示 M37( 单 倍 群 F1b)、<br />

M39( 单 倍 群 F1b)、M41( 单 倍 群 N9a),M43( 单<br />

倍 群 N9a),M47( 单 倍 群 N9a),M31( 单 倍 群<br />

N*),M54( 单 倍 群 C) 和 M7( 单 倍 群 M8a) 的 来<br />

源 ; 由 于 缺 少 对 比 数 据 , 也 无 法 确 定 M91( 单<br />

倍 群 B5) 和 M50( 单 倍 群 M7a) 的 来 源 。<br />

四 、 讨 论<br />

本 研 究 中 , 我 们 成 功 提 取 并 分 析 了 秦 陵<br />

劳 工 墓 19 个 个 体 的 母 系 遗 传 信 息 , 成 功 率 为<br />

38%, 印 证 了 整 个 墓 葬 保 存 状 况 不 佳 。 在 吉<br />

林 大 学 进 行 的 独 立 重 复 实 验 能 扩 增 出 大 于<br />

200bp 的 DNA 片 段 , 说 明 这 19 个 个 体 的 保<br />

存 状 况 相 对 较 好 。 由 于 获 得 的 DNA 多 样 性 很<br />

高 ( 表 6), 研 究 人 员 污 染 和 样 品 之 间 交 叉 污 染<br />

的 可 能 性 很 小 。 同 时 , 较 长 片 段 (408bp) 扩 增<br />

失 败 也 间 接 证 明 序 列 信 息 的 可 靠 性 。 克 隆 产<br />

物 ( 表 4, 图 2) 显 示 ,Type2(C→T/G→A) 的 碱<br />

基 错 配 在 大 多 数 样 品 中 占 有 比 较 大 比 率 , 这<br />

与 之 前 的 研 究 结 果 [36,37] 一 致 。<br />

通 过 分 析 , 我 们 认 为 , 秦 陵 劳 工 墓 的 劳<br />

工 源 于 东 亚 , 且 来 自 中 国 各 地 人 群 。mtDNA<br />

的 谱 系 树 [4,38,39] 显 示 这 19 个 样 品 无 一 例 外<br />

均 属 于 欧 亚 大 陆 东 部 特 异 单 倍 群 。 这 19 个 样<br />

本 组 成 的 群 体 的 多 样 性 大 于 其 他 32 个 现 代<br />

群 体 , 且 主 成 分 分 析 也 强 有 力 地 支 持 该 古 代<br />

群 体 和 32 个 现 代 群 体 存 在 显 著 差 异 。 同 时 ,<br />

个 体 水 平 上 的 聚 类 分 析 也 显 示 出 其 来 源 的 多<br />

样 性 。 其 中 ,4 个 样 品 (M86、M60、M21 和<br />

M17), 占 总 数 的 21%, 可 能 来 自 汉 族 ;3 个<br />

样 品 (M98、M61 和 M53), 占 总 数 的 16%,<br />

可 能 来 自 南 方 少 数 民 族 ; 地 理 上 ,7 个 样 品<br />

(M17、M60、M21、M98、M61、M57 和 M71),<br />

占 总 数 的 37%, 可 能 来 自 于 南 方 ; 仅 有 1 个<br />

样 品 (M86), 占 总 数 的 5%, 与 北 方 少 数 民 族<br />

106


袁 媛 等 : 线 粒 体 证 据 揭 示 秦 陵 修 陵 劳 工 的 来 源<br />

研 究 报 告<br />

表 6 秦 陵 劳 工 墓 发 现 单 倍 群 在 32 个 现 代 中 国 人 群 中 的 出 现 比 率 以 及 各 个 群 体 的 基 因 多 样 性<br />

Tab.6 The proportion of the MBWs’ haplogroups in 32 modern populations and the gene diversity of the populations<br />

群 体<br />

样 mtDNA 单 倍 群 在 各 群 体 中 所 占 比 率 (%)<br />

基 因 多 样 性<br />

本<br />

(S.D.)<br />

量<br />

A B4a B5 B5b C D* D5 F* F1a1 F1b G2a M7a M8a N* N9a 其 他<br />

劳 工 墓 19 5.26 5.26 5.26 5.26 5.26 5.26 5.26 5.26 10.53 10.53 5.26 5.26 5.26 5.26 15.79 1.000(0.017)<br />

1 53 5.66 1.89 20.75 1.89 3.77 5.66 1.89 1.89 5.66 1.89 49.06 0.999(0.004)<br />

2 44 9.09 2.27 18.18 9.09 2.27 2.27 4.55 6.82 2.27 2.27 40.91 0.996(0.006)<br />

3 45 4.44 4.44 2.22 4.44 22.22 2.22 2.22 2.22 2.22 2.22 6.67 44.44 0.995(0.006)<br />

北 方 汉 (NH)<br />

4 84 8.24 1.18 3.53 4.71 24.71 5.88 3.53 1.18 1.18 3.53 42.35 0.998(0.002)<br />

5 51 3.92 3.92 1.96 1.96 21.57 3.92 3.92 1.96 1.96 7.84 1.96 3.92 41.18 0.991(0.008)<br />

6 45 17.78 24.44 2.22 6.67 2.22 4.44 2.22 40 0.992(0.007)<br />

7 61 4.92 6.56 1.64 1.64 6.56 6.56 1.64 1.64 1.64 3.28 1.64 3.28 1.64 6.56 50.82 0.996(0.004)<br />

8 59 5.17 3.45 5.17 10.34 3.45 6.9 1.72 3.45 60.34 0.990(0.007)<br />

9 66 7.58 6.06 1.52 3.03 6.06 6.06 4.55 1.52 3.03 3.03 1.52 1.52 3.03 51.52 0.995(0.004)<br />

10 70 4.29 4.29 1.43 1.43 17.14 1.43 1.43 2.86 4.29 1.43 2.86 57.14 0.996(0.003)<br />

11 56 3.57 1.79 5.36 16.07 3.57 1.79 7.14 3.57 3.57 53.57 0.997(0.004)<br />

12 23 8.7 4.35 17.39 17.39 4.35 13.04 4.35 4.35 26.09 0.996(0.014)<br />

南 方 汉 (SH) 13 67 10.45 1.49 2.99 1.49 13.43 5.97 2.99 4.48 2.99 2.99 50.75 0.996(0.004)<br />

14 16 6.25 6.25 12.5 18.75 56.25 0.983(0.028)<br />

15 26 3.45 17.24 3.45 10.34 3.45 3.45 3.45 3.45 3.45 48.28 0.993(0.011)<br />

16 54 1.85 3.7 3.7 9.26 3.7 3.7 5.56 5.56 3.7 5.56 53.7 0.996(0.004)<br />

17 82 6.1 1.22 23.17 1.22 6.1 1.22 1.22 4.88 4.88 50 0.995(0.003)<br />

18 42 11.9 7.14 4.76 9.52 7.14 2.38 4.76 2.38 4.76 45.24 0.995(0.006)<br />

19 56 6.9 3.45 3.45 3.45 10.34 3.45 6.9 62.07 1.000(0.010)<br />

20 48 8.33 2.08 6.25 31.25 6.25 6.25 39.58 0.989(0.007)<br />

北 方 少 数 民<br />

21 48 6.25 4.17 22.92 10.42 6.25 2.08 47.92 0.976(0.010)<br />

族 (NM)<br />

22 53 3.77 3.77 13.21 13.21 5.66 1.89 1.89 1.89 54.72 0.993(0.011)<br />

23 47 4.26 2.13 19.15 25.53 4.26 44.68 0.956(0.011)<br />

24 56 4.76 9.52 4.76 4.76 2.38 4.76 11.9 7.14 11.9 38.1 0.991(0.005)<br />

25 47 4.26 6.38 6.38 2.13 2.13 10.64 6.38 61.70 0.999(0.006)<br />

南 方 少 数 民<br />

族 (SM)<br />

26 56 12.5 1.79 1.79 1.79 12.5 1.79 7.14 3.57 57.14 0.996(0.004)<br />

27 96 3.13 5.21 3.13 9.38 12.5 3.13 8.33 3.13 1.04 4.17 46.88 0.993(0.003)<br />

28 395 0.76 10.13 0.25 0.51 2.28 0.51 0.76 1.27 2.78 2.53 0.25 0.25 3.04 74.68 0.987(0.002)<br />

29 142 4.93 7.04 0.7 7.04 2.82 2.11 2.11 2.82 2.11 1.41 0.7 2.11 64.08 0.983(0.005)<br />

30 38 5.26 7.89 10.53 5.26 5.26 2.63 63.16 0.994(0.008)<br />

31 55 5.45 1.82 14.55 1.82 3.64 3.64 1.82 3.64 63.64 0.997(0.004)<br />

32 83 2.41 1.2 1.2 4.82 1.2 4.82 2.41 3.61 1.2 2.41 74.7 0.992(0.004)<br />

图 4 基 于 邻 接 法 的 13 个 单 倍 群 的 最 大 简 约 树 秦 俑 劳 工 墓 样 品 - 黑 色 , 北 方 汉 - 黄 色 , 南 方 汉 - 绿 色 , 北 方<br />

少 数 民 族 - 红 色 , 南 方 少 数 民 族 - 蓝 色 , 外 类 群 用 黑 色 箭 头 标 识 。Fig.4 The maximum parsimony tree based<br />

Neighbor-joining Method. MBW-black, NH-yellow, SH-green, NM-red, SM-blue, outgroup-black arrow.<br />

107


REPORT<br />

COM. on C. A. 3:e12, 2009<br />

的 群 体 相 似 , 可 能 由 于 我 们 选 取 的 参 照 群 体<br />

的 地 理 位 置 离 秦 朝 的 边 界 ( 图 1) 较 远 , 而 无 法<br />

与 秦 俑 墓 地 样 本 中 可 能 存 在 的 更 多 来 自 北 方<br />

少 数 民 族 的 部 分 匹 配 。 根 据 薛 雅 丽 等 [40] 对<br />

mtDNA 单 倍 群 的 研 究 , 样 品 M7、M53、M54、<br />

M60、M61 和 M86 的 单 倍 群 M8a、D*、C、<br />

G2a、D5 和 A, 高 频 率 地 出 现 在 中 国 北 方 ,<br />

因 此 这 6 个 样 品 可 能 来 自 于 北 方 ; 而 有 10 个<br />

样 品 (M17、M21、M31、M37、M39、M50、<br />

M71、M57、M91 和 M98), 分 别 属 于 单 倍 群<br />

B5b、F*、N*、F1b、F1b、M7a、F1a1、F1a1、<br />

B5 和 B4a, 占 总 数 的 53%, 可 能 来 自 中 国 的<br />

南 方 。<br />

由 此 我 们 认 为 , 秦 陵 劳 工 墓 的 劳 工 有 的<br />

来 自 汉 族 祖 先 群 体 , 有 的 来 自 少 数 民 族 ; 而<br />

且 在 地 理 分 布 上 , 南 方 的 略 多 于 北 方 。 这 与<br />

一 些 考 古 证 据 不 同 , 比 如 赵 背 户 姚 池 头 墓 地<br />

发 现 的 瓦 书 墓 志 记 载 了 死 者 的 来 源 主 要 集 中<br />

在 山 东 、 江 苏 、 河 南 、 河 北 等 地 [41], 但 是 这<br />

些 死 者 大 多 是 有 爵 位 的 ; 而 从 葬 式 、 随 葬 物<br />

品 、 没 有 墓 志 和 骨 骼 损 伤 等 角 度 看 , 这 121<br />

个 劳 工 应 该 是 处 于 修 建 秦 始 皇 陵 的 劳 工 中 最<br />

底 层 的 , 因 而 能 更 真 实 地 反 应 72 万 劳 工 的 来<br />

源 。 有 趣 的 是 , 样 品 M50(mtDNA HVRI 单 倍<br />

型 16209-16223, 属 于 M7a 单 倍 群 ) 与 一 个 日<br />

本 人 [8] 和 几 个 琉 球 人 [9,42] 具 有 同 样 的 单 倍<br />

型 。 考 虑 到 单 倍 群 M7a 在 琉 球 人 种 的 频 率 比<br />

中 国 高 [35], 而 且 其 多 样 性 在 亚 洲 最 高 [42],<br />

很 可 能 在 母 系 关 系 上 样 品 M50 和 日 本 人 的 祖<br />

先 比 较 近 。<br />

五 、 结 论<br />

我 们 的 研 究 显 示 , 在 母 系 上 , 秦 陵 劳 工<br />

墓 的 劳 工 和 现 代 中 国 人 群 具 有 遗 传 一 致 性 ,<br />

并 且 来 源 于 中 国 各 地 人 群 , 而 且 南 方 的 略 多<br />

于 北 方 。 尽 管 秦 朝 之 后 的 迁 徙 对 现 代 人 群 的<br />

遗 传 结 构 会 造 成 一 定 影 响 , 但 该 结 果 一 定 程<br />

度 上 能 证 明 当 年 为 修 建 秦 始 皇 陵 从 全 国 征 用<br />

了 大 量 劳 力 。 如 果 需 要 进 一 步 明 确 秦 陵 劳 工<br />

的 来 源 , 可 对 这 批 样 品 做 更 深 入 的 研 究 , 比<br />

如 mtDNA 全 序 列 测 序 和 Y 染 色 体 的 遗 传 分<br />

析 。<br />

致 谢 : 本 研 究 得 到 国 家 自 然 科 学 基 金 (30571013), 上 海 市 浦<br />

江 人 才 计 划 (05pj14023), 国 家 杰 出 青 年 基 金 (30625016) 的 资<br />

助 。<br />

参 考 文 献<br />

1. Krings M, Krings M, Stone A, Schmitz RW, Krainitzki H,<br />

Stoneking M, Pääbo S. (1997) Neandertal DNA sequences and<br />

the origin of modern humans. Cell 90: 19-30.<br />

2. Rohland N, Hofreiter M(2007)Ancient DNA extraction from<br />

bones and teeth. Nat Protoc 2:1756-1762.<br />

3. Andrews RM, Kubacka I, Chinnery PF, Lightowlers RN,<br />

Turnbull DM, Howell N (1999) Reanalysis and revision of the<br />

Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA.<br />

Nat Genet 23:147.<br />

4. Kivisild T, Tolk HV, Parik J, Wang Y, Papiha SS, Bandelt HJ,<br />

Villems R (2002) The emerging limbs and twigs of the East<br />

Asian mtDNA tree. Mol Biol Evol 19:1737-1751.<br />

5. Zhao TM, Lee TD (1989) Gm and Km allotypes in 74 Chinese<br />

populations:a hypothesis of the origin of the Chinese nation.<br />

Hum Genet 83:101-110.<br />

6. Wen B, Li H, Lu D, Song X, Zhang F, He YG, Li F, Gao Y, Mao<br />

XY, Zhang L, Qian J, Tan JZ, Jin JZ, Huang W, Deka R, Su B,<br />

Chakraborty R, Jin L (2004) Genetic evidence supports demic<br />

diffusion of Han culture. Nature 431:302-305.<br />

7. Excoffier L, Laval G, Schneider S (2005) Arlequin ver. 3. 0:An<br />

integrated software packagefor population genetics data analysis.<br />

Evol Bioinfo 1:47-50.<br />

8. Oota H, Kitano T, Jin F, Yuasa I, Wang L, Ueda S, Saitou N,<br />

Stoneking M (2002) Extreme mtDNA homogeneity in<br />

continental Asian populations. Am J Phys Anthropol<br />

118:146-153.<br />

9. Horai S, Murayama K, Hayasaka K, Matsubayashi S, Hattori Y,<br />

Fucharoen G, Harihara S, Park KS, Omoto K, Pan IH (1996)<br />

mtDNA polymorphism in East Asian Populations, with special<br />

reference to the peopling of Japan. Am J Hum Genet<br />

59:579-590.<br />

10. Yao YG, Nie L, Harpending H, Fu YX, Yuan ZG, Zhang YP<br />

(2002) Genetic relationship of Chinese ethnic populations<br />

revealed by mtDNA sequence diversity. Am J Phys Anthropol<br />

118:63-76.<br />

11. Kong QP, Yao YG, Liu M, Shen SP, Chen C, Zhu CL,<br />

Palanichamy MG, Zhang YP (2003) Mitochondrial DNA<br />

sequence polymorphisms of five ethnic populations from<br />

northern China. Hum Genet 113:391-405.<br />

12. Yao YG, Kong QP, Wang CY, Zhu CL, Zhang YP (2004)<br />

Different matrilineal contributions to genetic structure of<br />

ethnic groups in the silk road region in china. Mol Biol Evol<br />

21:2265-2280.<br />

13. Wen B, Xie X, Gao S, Li H, Shi H, Song XF, Qian TZ, Xiao<br />

CJ, Jin JZ, Su B, Lu D, Chakraborty R, Jin L (2004) Analyses<br />

of genetic structure of Tibeto-Burman populations reveals<br />

sex-biased admixture in southern Tibeto-Burmans. Am J Hum<br />

Genet 74:856-865.<br />

14. Wen B, Li H, Gao S, Mao X, Gao Y, Li F, Zhang F, He YG,<br />

Dong YL, Zhang YJ, Huang W, Jin JZ, Xiao CJ, Lu DR,<br />

Chakraborty R, Su B, Deka R, Jin L (2005) Genetic structure<br />

of Hmong-Mien speaking populations in East Asia as revealed<br />

by mtDNA lineages. Mol Biol Evol 22:<br />

15. Cooper A, Poinar HN (2000) Ancient DNA:do it right or not<br />

at all. Science 289:1139.<br />

16. Pääbo S, Poinar H, Serre D, Jaenicke-Despres V, Hebler J,<br />

Rohland N, Kuch M, Krause J, Vigilant L, Hofreiter M. (2004)<br />

Genetic analyses from ancient DNA. Annu Rev Genet<br />

38:645-679.<br />

17. Willerslev E, Cooper A (2005) Ancient DNA. Proc Biol Sci<br />

272:3-16.<br />

18. Gilbert MT, Bandelt HJ, Hofreiter M, Barnes I (2005)<br />

Assessing ancient DNA studies. Trends Ecol Evol<br />

108


袁 媛 等 : 线 粒 体 证 据 揭 示 秦 陵 修 陵 劳 工 的 来 源<br />

研 究 报 告<br />

20:541-544.<br />

19. Malmström H, Storå J, Dalén L, Holmlund G, Götherström A<br />

(2005) Extensive human DNA contamination in extracts from<br />

ancient dog bones and teeth. Mol Biol Evol 22:2040-2047.<br />

20. Noonan JP, Hofreiter M, Smith D, Priest JR, Rohland N,<br />

Rabeder G, Krause J, Detter JC, Pääbo S, Rubin EM (2005)<br />

Genomic sequencing of Pleistocene cave bears. Science<br />

309:597-599. Am J Hum Genet 74:856-865.<br />

21. Kemp BM, Smith DG (2005) Use of bleach to eliminate<br />

contaminating DNA from the surface of bones and teeth.<br />

Forensic Sci Int 154: 53-61.<br />

22. Wallace DC, Stugard C, Murdock D, Schurr T, Brown MD<br />

(1997) Ancient mtDNA sequences in the human nuclear<br />

genome:a potential source of errors in identifying pathogenic<br />

mutations. Proc Natl Acad Sci USA 94:14900-14905.<br />

23. Caramelli D, Lalueza-Fox C, Capelli C, Lari M, Sampietro<br />

ML, Gigli E, Milani L, Pilli E, Guimaraes S, Chiarelli B,<br />

Marin VTW, Casoli A, Stanyon R, Bertranpetit J, Barbujani G<br />

(2007) Genetic analysis of the skeletal remains attributed to<br />

Francesco Petrarca. Forensic Sci Int 173:36-40.<br />

24. Gilbert MT, Hansen AJ, Willerslev E, Rudbeck L, Barnes I,<br />

Lynnerup N, Cooper A (2003) Characterization of genetic<br />

miscoding lesions caused by postmortem damage. Am J Hum<br />

Genet 72:48-61.<br />

25. Pääbo S, Irwin DM, Wilson AC (1990) DNA damage<br />

promotes jumping between templates during enzymatic<br />

amplification. J Biol Chem 265:4718-4721.<br />

26. Topf AL, Gilbert MT, Dumbacher JP, Hoelzel AR (2006)<br />

Tracing the phylogeography of human populations in Britain<br />

based on 4th-11th century mtDNA genotypes. Mol Biol Evol<br />

23:152-161.<br />

27. Hebsgaard MB, Wiuf C, Gilbert MT, Glenner H, Willerslev E<br />

(2007) Evaluating Neanderthal genetics and phylogeny. J Mol<br />

Evol 64:50-60.<br />

28. DeSalle R, Barcia M, Wray C (1993) PCR jumping in clones<br />

of 30-million-year-old DNA fragments from amber preserved<br />

termites(Mastotermes electrodominicus) . Experientia<br />

49:906-909.<br />

29. Horai S, Hayasaka K (1990) Intraspecific nucleotide sequence<br />

differences in the major noncoding region of human<br />

mitochondrial DNA. Am J Hum Genet 46:828-842.<br />

30. Lalueza-Fox C, Sampietro ML, Gilbert MT, Castri L, Facchini<br />

F, Pettener D, Bertranpetit J (2004) Unravelling migrations in<br />

the steppe:mitochondrial DNA sequences from ancient central<br />

Asians. Proc Biol Sci 271:941-947.<br />

31. Ricaut FX, Fedoseeva A, Keyser-Tracqui C, Crubezy E,<br />

Ludes B (2005) Ancient DNA analysis of human neolithic<br />

remains found in northeastern Siberia. Am J Phys Anthropol<br />

126:458-462.<br />

32. Sutlovic D, Gamulin S, Definis-Gojanovic M, Gugic D,<br />

Andjelinovic S (2008) Interaction of humic acids with human<br />

DNA:Proposed mechanisms and kinetics. Electrophoresis.<br />

33. Hofreiter M, Serre D, Poinar HN, Kuch M, Pääbo S<br />

(2001)Ancient DNA. Nat Rev Genet 2:353-359.<br />

34. Pääbo S (1989) Ancient DNA: extraction, characterization,<br />

molecular cloning, and enzymatic amplification. Proc Natl<br />

Acad Sci USA 86:1939-1943.<br />

35. Trejaut JA, Kivisild T, Loo JH, Lee CL, He CL, Hsu CJ, Lee<br />

ZY, Lin M (2005) Traces of archaic mitochondrial lineages<br />

persist in Austronesian-speaking Formosan populations. PLoS<br />

Biol 3:e247.<br />

36. Gilbert MT, Binladen J, Miller W, Wiuf C, Willerslev E,<br />

Poinar H, Carlson JE, Leebens-Mack JH, Schuster SC (2007)<br />

Recharacterization of ancient DNA miscoding lesions:insights<br />

in the era of sequencing-by-synthesis. Nucleic Acids Res<br />

35:1-10.<br />

37. Brotherton P, Endicott P, Sanchez JJ, Beaumont M, Barnett R,<br />

Austin J, Cooper A (2007) Novel high-resolution<br />

characterization of ancient DNA reveals C>U-type base<br />

modification events as the sole cause of post mortem<br />

miscoding lesions. Nucleic Acids Res 35:5717-5728.<br />

38. Yao YG, Kong QP, Bandelt HJ, Kivisild T, Zhang YP (2002)<br />

Phylogeographic differentiation of mitochondrial DNA in Han<br />

Chinese. Am J Hum Genet 70:635-651.<br />

39. Kong QP, Yao YG, Sun C, Bandelt HJ, Zhu CL, Zhang YP<br />

(2003) Phylogeny of east Asian. mitochondrial DNA lineages<br />

inferred from complete sequences. Am J Hum Genet 73:<br />

671-676.<br />

40. Xue F, Wang Y, Xu SH, Zhang F, Wen B, Wu XS, Lu M, Deka<br />

R, Qian J, Jin L (2008) A spatial analysis of genetic structure<br />

of human populations in China reveals distinct difference<br />

between maternal and paternal lineages. Eur J Hum Genet<br />

16:705-717.<br />

41. 陕 西 省 考 古 研 究 所 临 潼 县 文 物 工 作 队 (1992) 秦 陵 徭 役 刑<br />

徒 墓 . 西 安 : 陕 西 旅 游 出 版 社 .<br />

42. Tanaka M, Cabrera VM, Gonzalez AM, Larruga JM,<br />

Takeyasu T, Fuku N, Guo LJ, Hirose R, Fujita Y, Kurata M,<br />

Shinoda K, Umetsu K, Yamada Y, Oshida Y, Sato Y, Hattori N,<br />

Mizuno Y, Arai Y, Hirose N, Ohta S, Ogawa O, Tanaka Y,<br />

Kawamori R, Shamoto-Nagai M, Maruyama W, Shimokata H,<br />

Suzuki R, Shimodaira H (2004) Mitochondrial genome<br />

variation in eastern Asia and the peopling of Japan. Genome<br />

Res 14:1832-1850.<br />

译 后 记 : 古 DNA 的 研 究 中 , 由 于 DNA 严 重 降 解 并 损 坏 , 可 用 于 分 型 的 样 本 含 量 极 低 。 因 此 , 古 DNA 研 究<br />

有 成 功 率 低 、 易 出 错 、 易 污 染 的 特 点 。 为 了 避 免 出 错 和 污 染 , 需 要 对 同 一 样 本 在 多 个 具 有 特 殊 洁 净 要 求 的 实<br />

验 室 进 行 多 次 独 立 分 析 印 证 。 在 本 研 究 中 , 我 们 共 对 52 个 样 本 进 行 研 究 , 成 功 提 取 出 DNA 的 有 28 个 个 体 ,<br />

测 序 成 功 的 有 19 个 个 体 , 仅 对 这 19 个 样 本 作 进 一 步 的 分 析 。 我 们 对 所 获 结 果 进 行 了 多 次 验 证 , 并 由 吉 林 大<br />

学 的 古 DNA 实 验 室 印 证 后 才 正 式 发 表 。 我 们 曾 在 内 部 交 流 时 提 及 早 期 结 果 中 有 一 样 本 疑 似 欧 洲 人 种 , 但 在 重<br />

复 实 验 中 无 法 验 证 而 定 为 该 样 本 分 型 失 败 。 由 于 我 们 和 合 作 者 就 发 表 结 果 的 严 格 要 求 沟 通 不 足 , 导 致 了 误 解 ,<br />

我 们 特 此 公 开 致 歉 。<br />

109

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