Catálogo de Servicios Genómicos y Proteómicos CIC

El precio incluye:1) Análisis de cantidad y calidad de los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent).2) Síntesis de cDNA.3) Síntesis de cRNA biotinilado.4) Hibridación con chips humanos, de ratón u otros.5) Integración informática de los resultados obtenidos.6) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso enotros programas informáticos de análisis genómicos. Los datos que se suministrarán contendrán ellistado total de genes con su detección (Presencia/Ausencia) y su señal.El servicio tarda por lo general 2-3 semanas si el cliente avisa con antelación del suministro de lasmuestras.Éxito garantizado. El precio incluido es por el servicio completo. Si el investigador suministra yael cRNA marcado, los precios serán reducidos (contactar con servicio para precios de serviciosparciales).En el CIC, a través de su Unidad de Bioinformática, puede también realizar, a petición delusuario, análisis estadísticos y de anotación funcional de los resultados obtenidos. Más informaciónsobre este servicio adicional, que no se incluye en el precio de los chips dados en este catálogo,puede encontrase en la página web: http://ubioinfo.cicancer.org2 ● Otros servicios que se ofrecen en la Unidad del Genómica del CICGene Chip Human Mapping 250K NspI/StyI ArraysArrays para realizar análisis de polimorfismos SNPs y de variación del número de copias (CopyNumber). Más información sobre este chip puede encontrarse en: www.affymetrix.comPara este servicio, el usuario deberá suministar 500 ng de ADN genómico, no degradado y sincontaminantes, diluído en “reduced TE-EDTA buffer”. La mitad de esta muestra se empleará parala hibridación del NspI-array. La mitad restante se utilizará en el StyI-array. Según el métodoestándar en uso, 250 ng de ADN genómico son digeridos inicialmente con las enzimas derestricción StyI o NspI, posteriormente ligados a un adaptador común usando la DNA ligasa de T4 yamplificados por PCR. Los productos de PCR una vez purificados y normalizados, sonfragmentados con DNAsaI y finalmente marcados usando desoxinucleotidil transferasa, paraposteriormente hibridar en el correspondiente 250 K array.Al cliente se le entrega un informe en papel y un DVD con todos los ficheros obtenidos, incluyendolos generados mediante el uso del software GTYPE.NOTA IMPORTANTE: Dada la complejidad del estudio bioinformático que conllevan estosestudios, la Unidad de Genómica del CIC dará como servicio sólo los datos en crudo (es decir losarchivos .CEL). El usuario deberá realizar el estudio final en su laboratorio o, alternativamente,contactar con la Unidad de Bioinformática del CIC (http://ubioinfo.cicancer.org).Gene Array System- Gene Chip Human Gene 1.0 ST Array- Gene Chip Mouse Gene 1.0 ST Array- Gene Chip Rat Gene 1.0 ST ArrayNueva versión (2007) de arrays para estudios de expresión diferencial más completo y económicoque los clásicos GeneChip Arrays. Más información sobre estos chips puede encontrarse en lapágina web: www.affymetrix.com5