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Catálogo de Servicios Genómicos y Proteómicos CIC

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● El cliente <strong>de</strong>be suministrar el RNA Total (aproximadamente 5 μl a una concentración <strong>de</strong> 100ng/μl) Recomendamos el uso <strong>de</strong>l kit “RNAeasy” (Qiagen Cat # 74104 o similar). No serecomienda la obtención <strong>de</strong> RNA usando el método <strong>de</strong> Trizol o similares (si se ha purificado conTrizol, se necesita una segunda purificación con RNAeasy). Nuestra unidad se encarga <strong>de</strong> todo lo<strong>de</strong>más.El precio incluye:1) Análisis <strong>de</strong> cantidad y calidad <strong>de</strong> los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent).2) Síntesis <strong>de</strong> cDNA.3) Síntesis <strong>de</strong> cRNA4) Síntesis <strong>de</strong> la ca<strong>de</strong>na DNA con sentido DNA SS (+)5) Hidrólisis y limpieza <strong>de</strong>l DNA SS(+)6) Fragmentación <strong>de</strong>l DNA SS(+)7) Marcaje <strong>de</strong>l DNA SS (+) fragmentado8) Hibridación con chips humanos, <strong>de</strong> ratón u otros9) Integración informática <strong>de</strong> los resultados obtenidos.10) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso enotros programas informáticos <strong>de</strong> análisis genómicosNOTA: Des<strong>de</strong> la Unidad <strong>de</strong> Genómica sólo po<strong>de</strong>mos ofrecer los datos en crudo (es <strong>de</strong>cir losarchivos .CEL). El usuario <strong>de</strong>berá realizar el estudio final en su laboratorio o, alternativamente,contactar con la Unidad <strong>de</strong> Bioinformática <strong>de</strong>l <strong>CIC</strong> (http://ubioinfo.cicancer.org).Exon Array System- Gene Chip Human Exon 1.0 ST Array- Gene Chip Mouse Exon 1.0 ST Array- Gene Chip Rat Exon 1.0 ST ArrayPermiten analizar expresión diferencial y splicing alternativo <strong>de</strong> genes.Para más información ver www.affymetrix.com● El cliente <strong>de</strong>be suministrar el RNA Total (aproximadamente 5 μl a una concentración <strong>de</strong> 400ng/μl). Recomendamos el uso <strong>de</strong>l kit “RNAeasy” (Qiagen Cat # 74104 o similar). No serecomienda la obtención <strong>de</strong> RNA usando el método <strong>de</strong> Trizol o similares (si se ha purificado conTrizol, se necesita una segunda purificación con RNAeasy). Nuestra unidad se encarga <strong>de</strong> todo lo<strong>de</strong>más.El precio incluye:1) Análisis <strong>de</strong> cantidad y calidad <strong>de</strong> los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent).2) Reducción RNA ribosomal3) Análisis <strong>de</strong>l RNA reducido usando el BioAnalizer (Agilent).4) Síntesis <strong>de</strong> cDNA5) Síntesis <strong>de</strong> cRNA6) Síntesis <strong>de</strong> la ca<strong>de</strong>na DNA con sentido DNA SS (+)7) Hidrólisis y limpieza <strong>de</strong>l DNA SS(+)8) Fragmentación <strong>de</strong>l DNA SS(+)9) Marcaje <strong>de</strong>l DNA SS (+) fragmentado10) Hibridación con chips humanos, <strong>de</strong> ratón u otros11) Integración informática <strong>de</strong> los resultados obtenidos.12) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso enotros programas informáticos <strong>de</strong> análisis genómicosNOTA IMPORTANTE: Des<strong>de</strong> la Unidad <strong>de</strong> Genómica sólo po<strong>de</strong>mos ofrecer los datos en crudo (es<strong>de</strong>cir los archivos .CEL).6

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