DICOM3

More documents

Recommendations

Info

TTKK(PKY) Selvitys <strong>DICOM3</strong> tiedostoformaatista Versio 1.1 3.5.2 DICOM-tiedoston syntaksi Mm. se kumpaa tavukoodausta (Little Endian vai Big Endian) DICOM-tiedostossa käytetään selviää tiedoston "syntaksista". Käytän tässä lainausmerkkejä sanan syntaksi ympärillä koska termi on virallisesti "transfer syntax" eli sananmukaisesti "lauseoppi siirrosta" :-) . Kyseessä on kuitenkin oikeastaan DICOM -tiedoston dataalkioiden "koodaustapa" joka ilmaisee miten tiedoston dataa tulisi tulkita. Yleisimmät DICOM:n tukemat syntaksit on listattu alla olevassa kuvassa. Kuva 3.5 DICOM "transfer syntaxes"[Barre] Pakattuun DICOM -formaattiin liittyvät syntaksit on ilmaistu kuvakkeella . 25.10.03 40/53
TTKK(PKY) Selvitys <strong>DICOM3</strong> tiedostoformaatista Versio 1.1 3.5.3 Pikselidata Syntaksi ilmoitetaan tiedoston ryhmän " DICOM File Meta Information " "transfer syntax UID" data-alkiolla. Käytännössä siis data-alkio (0002,0010) määrää tiedoston tulkinnassa käytettävän syntaksin. DICOM -tiedostossa varsinaisen koodatun kuvadatan välitykseen käytetään Pixel Data Element (7FE0,0010) -data-alkiota (ts. kuvan pikselidata on alkiossa (7FE0,0010)). Pikselidata (Pixel Data) koostuu pikselialkioista tai pikselisoluista (Pixel Cell), joista kukin sisältää yksittäisen pikselin näytearvon. Image Pixel module –ominaisuusryhmän data-alkiot Bits Allocated, Bits Strored ja High Bit antavat pikselisolujen tulkintaan tarvittavat perustiedot. Bits Allocated (0028, 0100) ilmaisee varatut bitit , Bits Strored (Tag: 0028, 0101) käytetyt bitit ja High Bit (0028,) eniten merkitsevän bitin (Most Significant Bit). Pikselidata voi riippuen tiedoston syntaksista (Transfer syntax UID) olla joko pakattussa (Encapsulated format) tai pakkaamattomassa muodossa (Native Format) 3.5.3.1 Pakkaamaton pikselidatan koodaus (Native) Pakkaamattoman pikselidatan VR:nä (Value Reprentation) käytetään yleensä yleensä OW:tä (ks. kuva 3.3). OB:tä voidaan käyttää ainoastaan kun data-alkion Bits allocated arvo on pienempi tai yhtäsuuri kuin 8, mutta silloinkin vain explisiittisen VR:n yhteydessä. Pikselisolut koodataan yksinkertaisesti liittämällä kunkin solun bitit yhteen siten, että seuraavan solun merkitsevin bitti seuraa aina edellisen solun vähiten merkitsevintä bittiä. (ks [DICM/5](8.2)) 3.5.3.2 Pakatun pikselidatan koodaus (Encapsulated) Pakatun pikselidatan yhteydessä käytetään VR:nä aina OB:tä. Pakkauksen yhteydessä käytettävät koodaustavat on määritelty DICOM standardin osassa 5 [DICM/5](Annex A). Pakkaus algoritmina voidaan käyttää joko JPEG:iä (ks. [DICM/5](8.2.1)) tai RLE :tä (Run Length Encoding Compression) (Ks. [DICM/5] (8.2.2)). 25.10.03 41/53
Page 1 and 2: Selvitys tiedostoformaatista DICOM3
Page 3 and 4: TTKK(PKY) Selvitys DICOM3 tiedostof
Page 39: TTKK(PKY) Selvitys DICOM3 tiedostof
Page 53: TTKK(PKY) Selvitys DICOM3 tiedostof

DICOM3

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?