PLAQUETTE L3 10-02-2012 - Université Paris Diderot-Paris 7
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<strong>L3</strong> BBM / BEE<br />
30 BMBI 36 BIO-INFORMATIQUE (ECUE 2) 3 ECTS<br />
Enseignants : J-C. Gelly, S. Pasquali<br />
Cours : <strong>10</strong> heures - TD : 4 heures - TP : 8 heures<br />
Responsable de l’UE : Mme Samuela PASQUALI<br />
Cet enseignement est obligatoire.<br />
L’objectif de cet enseignement est d’initier l’étudiant à quelques principes de la bio-informatique,<br />
notamment la recherche de propriétés biologiques sur les serveurs WEB.<br />
PROGRAMME des COURS<br />
1 La bio-informatique : 2 heures<br />
Pour quoi faire ?<br />
2 Fondements : 2 heures<br />
Matrices<br />
Scores<br />
Alignements<br />
3 Bases de données biologiques : 4 heures<br />
Swiss-Prot<br />
Genbank<br />
prosite<br />
Prodom<br />
PDB<br />
PFAM<br />
Bases de génomes<br />
4 Recherche d’homologie et fonctions biologiques : 2 heures<br />
PROGRAMME des TRAVAUX DIRIGÉS<br />
Alignement de séquences<br />
Scores ; E-values et P-values ; Lois de distribution<br />
TRAVAUX PRATIQUES sur ORDINATEUR<br />
Les TP se déclinent sous forme d’un projet et visent essentiellement les deux points suivants :<br />
Alignements de séquences<br />
Recherche de fonctions et homologies<br />
MODALITÉS d’ÉVALUATION<br />
Cours : 60%<br />
TP : 40%<br />
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