COURS APOPTOSE X. Caubit
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Mécanismes de mort cellulaire<br />
Mort par apoptose: processus physiologique qui inclue des signaux<br />
spécifiques induisant le suicide et la mort cellulaire.<br />
Les études effectuées chez le nématode, la drosophile et les mammifères montrent<br />
que l’apoptose est un programme génétiquement contrôlé impliquant de multiples<br />
effecteurs en réponse à de nombreux stimuli.<br />
L’apoptose est une des modalités de mort cellulaire programmée
DEFINITIONS<br />
La mort cellulaire programmée désigne une mort cellulaire physiologique impliquant un<br />
processus actif et sous le contrôle d’un programme codé génétiquement par la cellule<br />
elle-même.<br />
L’apoptose est un cas de mort cellulaire programmée suivant une séquence d’évènements<br />
cellulaires, cytologiques, bien précis, décrits en 1972 par Kerr, Wyllie et Currie (tissus humains et<br />
de rongeurs).<br />
Elle concerne les animaux et constitue le cas le mieux connu de mort cellulaire programmée.<br />
Apoptose vient d’un terme grec qui désigne la chute des feuilles d’un arbre ou des pétales d’une fleur.<br />
De nombreuses évidences montrent qu’il existe des cas de mort cellulaire programmée chez les végétaux (au<br />
cours du développement ou en réponse à des pathogènes) mais les évènements cellulaires et cytologiques<br />
associés ne sont pas comparables à ceux mis en jeu dans l’apoptose. D’autre part, il ne semble pas que les<br />
programmes génétiques impliqués soient conservés.<br />
La mort cellulaire programmée s’oppose à la nécrose, qui constitue un cas de mort «<br />
accidentelle. La nécrose est un processus dégénératif qui intervient dans des cellules ayant<br />
subi<br />
des dommages physiques, chimiques ou osmotiques. Initialement considéré comme un<br />
processus accidentel et non contrôlé, cependant il y a de plus en plus d’évidence montrant que<br />
les morts par nécrose et apoptose présentent des similarités, la nécrose serait donc également<br />
un mode de mort cellulaire régulée<br />
La sénescence correspond à un arrêt de la prolifération irréversible. Des cellules normales en<br />
culture ne peuvent se multiplier qu’un nombre limité de fois puis entre en sénescence. Elle peut<br />
être induite prématurément par des signaux oncogéniques, des dommages dans l’ADN ou des<br />
conditions de culture inappropriées.
Classification of cell death<br />
Kroemer et al., 2008<br />
L’apoptose : une modalité de mort cellulaire programmée
Mort cellulaire par apoptose classique– caractérisée par une marginalisation de<br />
la chromatine et la fragmentation de la cellule et du noyau avant que des<br />
modifications morphologiques soient observées dans les organites<br />
intracellulaires<br />
Nature Immunology 4, 416 - 423 (2003)
Autophagic cell death : mort cellulaire par<br />
autophagie<br />
(Sandu et al., 2005)<br />
L’autophagie est le processus par lequel les organites et les autres constituants<br />
cellulaires sont séquestrés et dégradés par les lysosomes. Le cytoplasme est<br />
activement détruit bien avant que des changements soient observables dans le<br />
noyau. Morphologiquement elle se caractérise par une vacuolisation du<br />
cytoplasme et la formation de vésicules autophagiques.<br />
C’est un mode de résistance au stress, permettant à la fois la survie au cours de<br />
carences nutritionnelles et la mort des cellules endommagées au carencées<br />
en facteurs de survie.
Différents types de morts<br />
cellulaires<br />
(Lockshin & Zakeri (2004). Int. J. Biochem. Cell Biol. 36: 2405)
La nécrose est une forme rapide et violente de populations<br />
cellulaires étendues, caractérisée par un gonflement du<br />
cytoplasme, la destruction de tout les organites et la rupture de la<br />
membrane plasmique<br />
A la différence de la nécrose, l'apoptose affecte en général des cellules<br />
isolées, aboutissant à un processus de condensation et de fragmentation.<br />
Induction intrinsèque de l’apoptose<br />
Induit en réponse à des stimulation de mort<br />
(activation d’oncogène, ADN dégradée)<br />
Caractérisée par l’engagement des<br />
mitochondries (et caspase-dépendante)<br />
Apoptose/nécrose<br />
Induction extrinsèque de l’Apoptose<br />
Initiaté par la fixation d’un ligand de mort<br />
”death ligand” (e.g. FasL) à un récepteur de<br />
mort ”death receptor” (e.g. Fas).<br />
Apoptose médiée par récepteur, apoptose<br />
Caspase-Dependante.
Induction de l’apoptose<br />
• Mort cellulaire programmée impliquée<br />
dans l’élimination de cellules qui sont<br />
produites en excès (lymphocytes,<br />
neurones, ..)<br />
• stimulus toxique (virus, produit chimique,<br />
radiation ionisante)<br />
• Signaux extracellulaires (Fas, p75 NGF-R,<br />
TNF)<br />
• ADN endommagée (p53)
Description cytologique de l’apoptose<br />
<strong>APOPTOSE</strong> et NECROSE<br />
L’apoptose a été décrite grâce à des observations en microscopie électronique<br />
à transmission.<br />
Elle se déroule en deux phases:<br />
1. formation des corps apoptotiques<br />
2. phagocytose de ces corps<br />
La formation des corps apoptotiques est précédée de plusieurs évènements:<br />
-La cellule se détache de ses voisines<br />
-La chromatine se condense et s’accole à l’enveloppe nucléaire<br />
-Le noyau et le cytoplasme se condense<br />
-Les organites s’agglomèrent<br />
-Le noyau se fragmente<br />
-Enfin la cellule se condense<br />
Ceci aboutit à la formation de protubérances à la surface des cellules qui<br />
lorsqu’elles se détachent donnent les corps apoptotiques.<br />
Ceux ci sont phagocytés.<br />
Les modifications de la chromatine sont le résultat d’une fragmentation internucléosomique<br />
réalisé par une DNAse.
L’apoptose se caractérise par une<br />
fragmentation de l’ADN<br />
Clivage de l’ADN au niveau des liens<br />
internucléosomiques<br />
DNA Laddering: fragmentation en<br />
multiple de 180 bp
Nucléofilament<br />
ADN de haut<br />
poids moléculaire<br />
ADN « fragmentée»<br />
Faible poids moléculaire<br />
ADN ladder<br />
Après electrophorèse
Les premières manifestations morphologiques se caractérisent<br />
par une compaction et une marginalisation de la chromatine<br />
nucléaire, une convolution des membranes nucléaires et<br />
cytoplasmique, une condensation du cytoplasme.<br />
Le noyau se fragmente ensuite, chaque fragment est entouré<br />
d'une double enveloppe.<br />
Des corps apoptotiques<br />
(éléments cytoplasmiques<br />
et nucléaires) sont ensuite<br />
relargués, et vont être phagocytés<br />
par les cellules voisines,<br />
sans aucune réaction inflammatoire.<br />
On distingue très nettement l'apoptose<br />
de la nécrose, qui détruit<br />
immédiatement tous les organites<br />
cellulaires, avec une conservation de<br />
la forme générale (fantômes de cellules).
Nécrose Apoptose<br />
L’apoptose
<strong>APOPTOSE</strong> et NECROSE<br />
Différences apoptose/nécrose<br />
Nécrose Apoptose<br />
Déclenchée par des traumatismes,<br />
des infections, des poisons, une<br />
ischémie (embolie).<br />
-concerne des groupes de cellules voisines<br />
-pas d’activité endonucléasique observée<br />
-dilatation de certains organites et compartiments<br />
-dilatation cytoplasmique<br />
-rupture des membranes<br />
-réaction inflammatoire<br />
Déclenchée par des infections,<br />
des maladies, le vieillissement,<br />
au cours du développement,…<br />
-intervient dans des cellules isolées<br />
-activité endonucléasique<br />
-les organelles restent en général intacts<br />
-condensation nucléaire et cytoplasmique<br />
-formation de corps apoptotiques<br />
-pas de réaction inflammatoire<br />
La nécrose est considérée comme une mort cellulaire « passive » par opposition à l’apoptose,<br />
Processus dans lequel la cellule joue un rôle actif.
Lors de l’apoptose l’élimination des cellules se fait par phagocytose<br />
Phagocytosis tags and receptors
L’apoptose : un phénomène contrôlé et ordonné qui comprend de multiples étapes<br />
1) Libération du cytochrome c, perte du potentiel de membrane de la mitochondrie<br />
2) Activation des caspases<br />
3) Inversion du positionnement de la phosphatidyl sérine<br />
4) Condensation, marginalisation de la chromatine et dégradation de l’ADN par<br />
des DNAses<br />
5) Formation de corps apoptotiques phagocytés pas les macrophages
Généralités sur les rôles de l’apoptose<br />
Longtemps, la mort cellulaire a été considérée comme le résultat d’une situation pathologique<br />
même si dès le 19ième siècle certains scientifiques avaient déjà observé que la mort cellulaire<br />
était une constante au cours du développement.<br />
Il faut attendre la seconde moitié du 20ième siècle pour que l’idée selon laquelle la mort<br />
cellulaire, notamment la mort cellulaire programmée comme l’apoptose, peut être, dans<br />
certains cas, la réponse d’une situation non pathologique s’impose et devienne un sujet<br />
d’intérêt.<br />
Ainsi l’apoptose est impliquée dans:<br />
-Le développement embryonnaire et post-natal (exemples: formation des doigts par destruction<br />
des tissus interdigitaux, différentiation des organes sexuels, métamorphose chez les<br />
amphibiens, les insectes….)<br />
- Trois modalités de mort cellulaire<br />
- phylogénétique: régression d’organes vestigiaux<br />
- morphogénétique: fusion, repliement, mise en forme d’organes<br />
- Histogénétique: ajustement d’un nombre de cellules à la fonction
Rôle de l'apoptose (suite)<br />
• Au cours du développement<br />
Le développement normal d'un organe s'effectue non<br />
par modelage, mais par sculpture : les cellules sont<br />
produites en grand excès puis certaines meurent, en<br />
fonction des critères particuliers requis.<br />
• A l'âge adulte<br />
Dans le tissu normal, il existe un équilibre entre mitose<br />
et apoptose. Les cellules nécessitent en permanence<br />
certains 'facteurs de croissance' pour survivre.<br />
Homéostasie: Renouvellement de la peau,<br />
des cellules intestinales,…..
Métamorphose<br />
Rôles de la mort cellulaire programmée dans le<br />
développement embryonnaire et la morphogenèse<br />
Les tubes de Muller important pour les<br />
femelles sont éliminés chez les males<br />
Formation de structures : Espaces interdigitaux<br />
Elimination de structures : différenciation sexuelle, métamorphose,<br />
Organogenèse : tube digestif, reins, tube neural, remodelage des os…<br />
Contrôle du nombre de cellules: neurones dans le système nerveux central
Apoptose et développement<br />
• Développement du système nerveux au cours duquel on<br />
estime que 50% des neurones meurent par apoptose). Dans le<br />
système nerveux les neurones sont produits en excès, ceux qui<br />
survivent reçoivent des signaux de leurs cellules cibles<br />
. Régulation/ajustement du nombre des neurones<br />
• Le développement du système immunitaire (exemple:<br />
constitution du répertoire T par sélection clonale dans le<br />
thymus)<br />
l'apoptose est responsable de la délétion des cellules T autoréactives<br />
(permettant la tolérance du soi), et la sélection des<br />
lymphocytes B responsables de la réponse immunitaire
Quelques exemples pour le système nerveux<br />
Mort phylogénétique dans le système nerveux:<br />
Suppression de cellules qui ont une fonction transitoire:<br />
chez la sauterelle, deux neurones pionniers envoient leurs axones du SNC au<br />
bourgeon de membre, puis meurent une fois que ces axones ont permis le<br />
guidage des axones des autres neurones et ont formé le nerf principal de la<br />
patte<br />
Suppression de cellules qui ne sont plus nécessaires:<br />
Chez les vertébrés: mort des neurones dans la partie caudale de la moelle<br />
épinière permettant de ne laisser que des cellules gliales<br />
Mort histogénétique dans le système nerveux:<br />
- Très fréquent : correction des erreurs de connexion.<br />
- Plasticité dans le cerveau adulte<br />
- Mort des neurones impliqués dans la production du chant saisonnier du<br />
canari
Apoptose et système immunitaire)<br />
• Dans le système immunitaire, l'apoptose est responsable de<br />
la délétion des cellules T auto-réactives (constitution du<br />
répertoire T par sélection clonale dans le thymus, permettant la<br />
tolérance du soi), et la sélection des lymphocytes B<br />
responsables de la réponse immunitaire.<br />
• Apoptose chez les organismes adultes<br />
La réponse immunitaire: élimination de cellules infectées, élimination<br />
en fin de réponse d’un certain nombre de cellules de l’immunité<br />
ayant participé à cette réponse (à l’exception des lymphocytes T<br />
ou B mémoire), élimination de cellules tumorales ou de cellules<br />
infectées (virus, élimination des cellules anormales (Lésions de l’<br />
ADN).<br />
« Privilège immun » dans certains tissus (chambre antérieure de<br />
l’oeil, le cerveau, les testicules, des antigènes ne déclenchent pas<br />
de réponse immunitaire. Les cellules de ces tissus produisent un<br />
fort niveau de FasL, les cellules T qui expriment Fas seraient<br />
tuées si elles entraient dans ces tissus.<br />
• Les lymphocytes cytotoxiques sont tueurs par induction de<br />
l'apoptose de la cellule cible
• Elimination de cellules « dangereuses »<br />
Cellules ayant de l’ADN endommagée<br />
Cellules présentant un « signaling mitogénique » inapproprié qui est en conflit<br />
avec l’environnement cellulaire<br />
Élimination des cellules autoréactive du système immunitaire<br />
Élimination des cellules infectées (virus, …) par le lymphocytes Tcytotoxiques.<br />
Cellule cible<br />
Lymphocyte T cytotoxique<br />
Défense contre le cancer,<br />
les agents infectieux :<br />
Élimination des cellules tumorales<br />
et des cellules infectées
Maladies associées à un dérèglement du processus apoptotique<br />
Apoptose et pathologie<br />
→ maladies neurodégénératives, maladies auto-immunes, Cancers
Mécanismes biochimiques<br />
• De nombreux facteurs interviennent pour susciter l’apoptose, mais<br />
tous aboutissent à une voie commune passant par la<br />
mitochondrie, la protéine Bcl-2 et les caspases (voir plus loin).<br />
• Les principaux mécanismes mettant en route le mécanisme de<br />
mort cellulaire programmée sont :<br />
– Le traitement des cellules par des substances cytotoxiques<br />
– L’atteinte de l’ADN par des radiations ionisantes (protéine P53)<br />
– L’hypoxie<br />
– Une infection par des virus<br />
– La transmission d’un signal de mort provenant de l’extérieur de<br />
la cellule (récepteur Fas des lymphocytes cytotoxiques, des<br />
natural killer, du facteur de nécrose TNFa )<br />
– La privation de facteurs de croissance
C elegans un modèle pour étudier<br />
les mécanismes d’apoptose<br />
• L’identification des gènes impliqués dans l’apoptose<br />
au cours du développement chez C. elegans<br />
• La nature hautement reproductible du programme de<br />
mort cellulaire et en particulier la reproduction des<br />
patrons spécifiques de division/mort dans des mutants<br />
suggère fortement une détermination génétiques.<br />
• La mort cellulaire n’est pas une détérioration<br />
passive comme on l’avait souvent cru<br />
jusqu’alors, mais une fonction active, une voie<br />
de différenciation terminale de la cellule,<br />
nécessitant l’intervention de molécules<br />
spécialisées.
Caenorhabditis elegans
Caenorhabditis elegans<br />
(nématode)<br />
Identification des gènes contrôlant l’apoptose
Le développement de C elegans<br />
Sur 1090 cellules<br />
générées, 131 meurent<br />
Un animal adulte contient 959 cellules qui proviennent de 1090 cellules produites au<br />
cours du développement embryonnaire.<br />
Exactement 131 cellules somatiques subissent le programme de mort cellulaire (dans un<br />
vers « sauvage »)<br />
Parmi les 1090 cellules, 302 sont des neurones et de nombreuses morts cellulaire<br />
programmée se produisent dans le lignage neuronal.
Le contrôle du développement à lieu lors de divisions asymétriques qui<br />
produisent deux cellules filles qui adopteront des comportements différents.<br />
Des mutations (mutants lin: pour «lineage » (lignage) altèrent le programme<br />
de développement de différentes façons.<br />
Exemple: mutants à lignage heterochronique, lin14, altération du « timing »<br />
du changement d’états, une cellule adopte un programme de division<br />
normalement destiné à une cellule plus jeune.<br />
X indique une mort par mort cellulaire programmée
La mort peut être étudier à la résolution d’une<br />
cellule<br />
X<br />
X<br />
P11<br />
P11aap<br />
Adapter de Sulston and Horvitz,<br />
Dev. Biology 56, 110-150, 1977
En 1983, E. Hedgecock a isolé deux mutants (ced-1 and ced-2)<br />
impliqué dans la mort cellulaire, la découverte des ces mutants a été<br />
très importante.<br />
Dans le mutant ced-1, des cellules meurent mais ne sont pas<br />
éliminées par phagocytose. Il y a persistance de corpuscules<br />
cellulaire<br />
(ced = Cænorhabditis elegans death genes)<br />
sauvage<br />
Mutant ced-1
Ellis et Horvitz ont recherché des mutations suppresseurs de ced-1<br />
Ils ont isolé deux mutations ced-3 et ced-4<br />
Dans ces mutants aucune cellules ne meurt d’apoptose, il s’agit de l’identification<br />
des deux premiers gènes « tueurs de cellules »<br />
Découverte du mutant ced-9, dans lequel toutes les cellules meurent
Les gènes impliqués dans la C.<br />
elegans:<br />
• egl-1, egg laying defective.<br />
premier gène découvert impliqué dans le<br />
processus de mort cellulaire programmé.<br />
Une mutation gain de fonction provoque la mort<br />
de deux neurones innervant la vulve, ce qui<br />
conduit défaut de ponte des œufs.<br />
• ced-4, cell death determining<br />
caractérisé comme un suppresseur d’un gain de<br />
fonction egl-1.
Gènes impliqués dans le processus de mort cellulaire<br />
programmée (suite)<br />
• ced-3<br />
supprime la persistance de corpuscules cellulaire dans<br />
des animaux défectifs pour la phagocytose. Dans le<br />
double mutant ced-3/ced-1, il n’y a pas de mort par<br />
apoptose.<br />
• ced-9<br />
Favorise la survie ou agit comme un régulateur négatif de<br />
la mort cellulaire.<br />
. Ced-1,-2,-5,-6,-7,-10<br />
gènes impliqués dans la phagocytose (ou gène de<br />
nettoyage). Ils n’agissent pas directement dans le<br />
« système » de décision.
Identification des gènes contrôlant l’apoptose (suite)<br />
Ced-9::Bcl-2<br />
Ced-4::Apaf-1<br />
Ced-3::protéase à cystéine active
Gènes impliqués dans la mort cellulaire chez C. elegans<br />
(suite):<br />
• L’analyse des phénotypes des doubles mutants<br />
et des mutants gains de fonction<br />
(surexpression/ou expression ectopique) indique<br />
les relations entre les différents gènes.
Régulation moléculaire de l’apoptose:<br />
C. Elegans:<br />
Se fixe et inhibe Ced-9<br />
Se fixe et inhibe<br />
Ced-4<br />
Se fixe sur et active Ced-3<br />
Par oligomérisation<br />
Caspase<br />
Coupures de substrats<br />
et mort
L’équivalent de Ced-3 chez les mammifères est l’enzyme de conversion<br />
initialement connue comme ICE et rebaptisée Caspase 1 (Cys catalytic Asp<br />
targeting protease).<br />
Ced-4 agit comme adaptateur pour l’activation de caspases (Yang et al,<br />
1998); l’équivalent chez les mammifères est Apaf-1.<br />
Ced-9 a pour équivalent Bcl-2, considéré initialement comme un oncogène<br />
découvert dans un lymphome humain, mais aujourd’hui considéré comme associé avec<br />
un contrôle négative (protecteur) de l’apoptose. Les protéines Bcl-2 et ced-9 présentent<br />
23% identité, et bcl-2 peut remplacer ced-9 chez C. elegans. Chez les animaux<br />
supérieurs, Bcl-2 est un membre d’une grande famille de protéines dont certaines<br />
favorisent la survie, d’autre la mort (voir plus loin).<br />
Le gène egl1 code pour une protéine de cette famille qui contient un<br />
domaine BH3 qui favorise la mort.<br />
Les gènes ced représentent tous des composants communs à<br />
toutes les morts cellulaires programmées.
Conservation des différentes familles de protéines impliquées dans l’apoptose
Inactivation de caspase 9<br />
+/+<br />
+/+<br />
Diminution de la mort cellulaire programmée dans le cerveau des embryons Casp9-/-<br />
-/-<br />
-/-<br />
-/-<br />
Hakem et al, 98
L’apoptose un évènement bénéfique !<br />
Apoptose dans les neurons au cours du développement du cerveau<br />
Embryon sauvage E18.5. Embryon mutant Caspase 9-knockout E18,5<br />
(From Kuida et al. (1998).<br />
94: 325-37).
Inactivation de apaf chez la souris<br />
-/-<br />
Yoshida et al, 1998
L’équivalent de ced-9 chez les<br />
mammifères est Bcl-2<br />
• 1986: le gène Bcl-2 est cloné à<br />
partir d’un évènement de<br />
translocation (14/18)<br />
responsable d’un lymphome.<br />
• Bcl2 = B cell lymphoma<br />
• Dans cette translocation, le<br />
gène Bcl-2 est juxtaposé à<br />
coté du locus qui code pour les<br />
chaînes lourdes<br />
d’immunoglobulines. Dans ce<br />
locus Bcl-2 est surexprimé et<br />
empêche la mort
Les travaux menés chez C elegans, la drosophile et les mammifères ont permis<br />
de définir trois phases dans le déroulement du processus :<br />
une phase de décision, une phase d’exécution et une phase d’élimination des<br />
débris cellulaires.<br />
La phase de décision peut dépendre de facteurs externes, sous la forme de signaux<br />
de survie ou de mort émis par certaines cellules de l’organisme.<br />
Elle peut aussi dépendre de facteurs internes, qui activent souvent, mais pas<br />
toujours, la protéine P53.
Identification des gènes contrôlant l’apoptose<br />
Prix Nobel de Physiologie ou de Médecine 2002<br />
pour leur travaux sur l’organogenèse et la mort cellulaire programmée<br />
Sydney Brenner<br />
(britannique)<br />
H. Robert Horvitz<br />
(américain)<br />
John E. Sulston<br />
(britannique)
Qu’est ce qu’une caspase?<br />
• Ced-3 et les caspases de mammifères : « les<br />
exécuteurs » .<br />
• Ced-3 code pour une cystéine protéase de 503 résidus<br />
(55 kDa), qui est fortement apparenté à la caspase 1 de<br />
mammifères.<br />
• Cys catalytic Asp targeting protease, Caspase : Cystéine<br />
protéase qui clive après un acide aspartique.<br />
• Initialement identifié comme l’enzyme qui convertit (active)<br />
l’interleukine 1β (ICE).<br />
• Elles sont activées par protéolyse (après Asp).<br />
• Elles peuvent s’auto activées et elles peuvent aussi<br />
activées d’autres caspases. Elles peuvent donc réalisées<br />
des cascades d’amplifications dans les cellules.<br />
• • Les substrats « apoptotiques » des Caspases sont<br />
nombreux (~40/nombre en augmentation).
CASPASES<br />
Les caspases sont nécessaires et suffisantes pour induire l’apoptose<br />
Mise en évidence du rôle des caspases en 1993 par la découverte de l’homologie<br />
entre ced-3 et l’enzyme ICE (interleukin-1b processing enzyme) renommée depuis<br />
caspase-1 et par la démonstration que la surexpression de la caspase-1 dans des<br />
cellules de mammifères est suffisante pour induire l’apoptose.<br />
surexpression de caspases<br />
apoptose<br />
Signaux inducteurs de l’apoptose<br />
caspases<br />
apoptose<br />
Inhibiteur de caspases
Les caspases<br />
Caspase-1, enzyme initialement identifiée comme ICE (Interleukin 1ß Converting Enzyme).<br />
Elle se forme à partir d’une proenzyme de 45 kD, qui est activé par clivage protéolytique<br />
en une forme « large » (p20) et « petite » (p10). La forme fonctionnelle (caspase active)<br />
correspond à une forme homodimérique (p20:p10)2.
Mécanisme d’activation des caspases
Structure et régulation des Caspases<br />
• Leur activité nécessite le clivage en deux sites.<br />
• Elles contiennent un site actif conservé (Cystéine) dans le « Large<br />
domaine »<br />
• Elles possèdent un prodomaine qui contient des domaines<br />
d’interactions avec d’autres protéines. Ces domaines permettent<br />
l’activation des caspases<br />
– CARD domain (domaine de recrutement des caspases)<br />
– DED (Death Effector Domain)
CASPASES<br />
Activation post-traductionnelle des caspases-8, 9<br />
La pro-caspase 9 se trouve en majorité sous forme monomérique dans le cytoplasme et<br />
le clivage n’est ni nécessaire ni suffisant pour l’activation.<br />
Le changement de conformation permettant l’activation se produit lors de la dimérisation.<br />
La dimérisation est stimulée par la liaison de la pro-caspase aux facteurs Apaf-1 et au<br />
cytochrome c.<br />
Grande ss-u Petite ss-u<br />
Apaf-1<br />
Cytochrome c<br />
Activation par<br />
régulation allostérique<br />
Apoptosome<br />
[caspase-9/Apaf-1/cyto c]<br />
L’activation de la caspase-8 procèderait d’un mécanisme impliquant clivage et<br />
régulation allostérique. La liaison à des protéines adaptatrices (voir plus loin) entraîne<br />
la multimérisation et un changement de conformation qui constituerait une première<br />
étape d’activation. Puis, le clivage permettrait alors d’obtenir une forme pleinement<br />
active.
L’apoptosome<br />
Complexe protéique de 1,7 Mda composé les<br />
Protéines Apaf1, procaspase9 et cytochrome c<br />
Ce complexe se forme (en présence d’ATP ) en deux<br />
étapes, il favorise l’activation de la procaspase 9.
Autres niveaux de régulation des caspases<br />
LES CASPASES<br />
Bien que les caspases soient exprimées de façon constitutive par de multiples types<br />
cellulaires et que les processus d’activation post-traductionnels sont de loin les plus<br />
importants, d’autres mécanismes de régulation ont été identifiés.<br />
1. Régulations transcriptionnelles<br />
2. Phosphorylation<br />
3. Dégradation (régulation de la demi-vie des caspases)
Les substrats cellulaires des caspases<br />
CASPASES<br />
Les caspases ne dégradent pas massivement les protéines cellulaires car leur<br />
spécificité de coupure est trop étroite. Elles clivent en un ou quelques sites seulement<br />
certaines protéines clés impliquées dans la structuration ou le fonctionnement de la<br />
cellule. Une centaine de substrats ont été identifiés à ce jour, substrats qui peuvent être<br />
classés en 6 catégories:<br />
1. Protéines impliquées dans l’apoptose<br />
2. Protéines kinases<br />
3. Protéines de structure et protéines essentielles<br />
4. Protéines impliquées dans des mécanismes de réparation cellulaire<br />
5. Protéines de régulation du cycle cellulaire<br />
6. Protéines impliquées dans des pathologies<br />
Il est à noter que les modifications introduites par les caspases (clivage) et leurs<br />
conséquences ont un caractère IRREVERSIBLE: notion de POINT DE NON RETOUR<br />
(correspond au moment ou l’arrêt du stimulus apoptotique ne peut plus arrêter le<br />
processus, coïncide avec l’activation des caspase effectrices) .
Les substrats cellulaires des caspases<br />
CASPASES<br />
1/ Caspases<br />
Bid, Bcl-2, Bcl-xL (voir plus loin)<br />
IAPs (inhibitor of apoptosis; voir plus loin)<br />
DFF45/ICAD (DNA fragmentation factor 45 kDa; son inactivation permet le clivage<br />
internucléosomique de la chromatine)<br />
2/ Akt, FAK (kinases impliquées dans des signaux de survie)<br />
PAK2 (kinase pro-apoptotique impliquée dans la formation des corps apoptotiques)<br />
ROCK1 (membrane blebbing)<br />
3/ gelsoline (entraîne la coupure des microfilaments d’actine et contribuerait ainsi à<br />
l’arrondissement des cellules et à leur détachement de la matrice extracellulaire)<br />
kératines, vimentine<br />
lamines A, B, C<br />
b-caténine, g-caténine (destruction des interactions cellule-cellule)<br />
topoisomérase I et II, RNA pol I
Fragmentation de l’ADN par CAD lors de<br />
l’apoptose<br />
Lorsque ICAD est présente, elle inhibe CAD (caspase activated DNAse),<br />
Lorsque ICAD est coupé par la caspase 3, elle n’exerce plus d’activité inhibitrice<br />
sur CAD, celle-ci rentre dans le noyau et coupe l’ADN au niveau des liens<br />
internucléosomiques.
Les substrats cellulaires des caspases<br />
CASPASES<br />
4/ DNA-dependent protein kinase (DNA-PK; active les mécanismes de réparation de<br />
l’ADN en cas de cassures double-brin)<br />
ATM (Ataxia Telangectasia Mutated; active les mécanismes de réparation de l’ADN<br />
suite à certains dommages)<br />
PARP (Poly ADP-Ribose Polymerase; mécanisme de réparation de l’ADN)<br />
5/ Wee1 (inhibition de Cdks; augmente la quantité de certains facteurs proapoptotiques)<br />
p27 KIP1 (idem)<br />
p21 CIP1 (idem)<br />
Rb (inhition de E2Fs; augmente le niveau de synthèse des pro-caspases)<br />
6/ certaines caspases clivent, par exemple, l’huntingtine et la protéine APP (amyloid<br />
precursor protein), protéines impliquées respectivement dans la maladie de<br />
Huntington et la maladie d’Alzheimer. Ce clivage favorise l’apparition des formes<br />
pathogènes de ces protéines qui entraînent la mort de certains neurones.
L’initiation de l’apoptose implique une cascade<br />
auto activée de protéase<br />
il est essential d’avoir des régulateurs négatifs<br />
très fort pour empêcher la mort par inadvertance,<br />
ainsi qu’un mécanisme pro apoptotique bien<br />
contrôlé pour initier le processus quand cela<br />
est nécessaire.
Deux voies peuvent initier<br />
Voie intrinsèque ou voie de la<br />
mitochondrie<br />
- Régulée par la mitochondrie<br />
- Relargage du cytochrome c<br />
Induction intrinseque de l’apoptose<br />
Induit en reponse à des stimulation de mort<br />
(activation d’oncogène, ADN dégradée)<br />
Médiée via les mitochondries (et caspase<br />
dépendante)<br />
l’apoptose<br />
Voie extrinsèque, via un récepteur de mort<br />
-Activée par un ligand<br />
- Fas, TNF alpha<br />
Ces deux voies sont interconnectées, notemment au niveau des effecteurs (caspases)<br />
Induction extrinsèque de l’apoptose<br />
Initiaté par la fixation d’un ”ligand de mort”<br />
(e.g. FasL) à un ”récepteur de mort”<br />
(e.g. Fas).<br />
Apoptose Caspase-Dependante liée à<br />
l’activation de récepteur
L’apoptose dans les cellules matures<br />
dépends de signaux soient internes<br />
soient externes.<br />
• Les cellules répondent à des conditions internes<br />
non favorables ou des signaux provenant en<br />
général des points de contrôle du cycle cellulaire<br />
• Les cellules peuvent recevoir des signaux de mort<br />
venant de l’extérieur<br />
- Privation de facteur de croissance<br />
- Élimination de l’auto-immunité par apoptose des<br />
lymphocytes reconnaissant les auto déterminants<br />
- Effets tueurs des lymphocytes T sur d’autres<br />
cellules
La mort cellulaire et sa regulation<br />
SURVIVAL<br />
”Composants” de la survie et de l’apoptose<br />
Extracellaires: Neurotrophic Factors and ”Death Receptor Ligands”<br />
Membrane plasmique: Neurotrophic Receptors and ”Death Receptors”<br />
Reguleurs cytoplasmiques: Bcl-2 family proteins, adaptor proteins<br />
Effectors cytoplasmiques: Caspases<br />
Regulation/Signalisation<br />
"Survival Signal" "Death Signal"<br />
YES<br />
NO<br />
YES<br />
APOPTOSIS
Voie de survie : PKB/Akt
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
La voie intrinsèque: engagement de la mitochondrie<br />
Cette voie est encore appelé voie du stress. Elle est activée en réponse à des signaux intracellulaires<br />
(dommages à l’ADN), des signaux de stress (hypoxie, privation en facteurs sériques et<br />
cytokines) ou par la dérégulation de la transduction de signaux contrôlant la prolifération<br />
cellulaire (stimuli oncogéniques).<br />
L’activation de cette voie converge vers la mitochondrie pour entraîner le relargage d’un certain<br />
nombre de facteurs pro-apoptotiques contenus dans cet organite suite à la perméabilisation de la<br />
membrane mitochondriale externe (nous nous limiterons à cet aspect).<br />
Dommages ADN Stress Oncogènes<br />
mitochondrie<br />
Cytochrome-c Smac/Diablo<br />
<strong>APOPTOSE</strong>
La mitochondrie : le forum de la mort<br />
Mitochondrie et apoptose<br />
- La mitochondrie est l’usine énergétique de la cellule<br />
- Contient les moyens de sa destruction, elle séquestre un certain<br />
nombre de protéines pro-apoptotiques, comme le cytochrome c<br />
(transporteur d’électron).<br />
Le cytochrome c à un rôle central avec la protéine Apaf-1, dans l’activation de la<br />
caspase-9, dans le cytoplasme. Il doit traverser la membrane mitochondriale<br />
externe<br />
La régulation de ce processus est sous la dépendance des protéines de la famille<br />
Bcl2.
Le Cytochrome c est une protéine abondante de la membrane interne de la mitochondrie,<br />
elle agit comme un intermédiaire dans le transport des électrons. cytochrome c est<br />
monomérique, et peut diffusé librement dans la membrane interne (contraire aux autres<br />
cytochrome).<br />
Les évènement de l’activation apoptotique conduisent à l’altération de la perméabilité des<br />
protéines « pores » de la membrane mitochondriale. Il a été montré que le relargage initiale du<br />
cytochrome c à lieu suite à un processus hautement spécifique impliquant les protéines de la<br />
famille Bcl-2. (Adrain and Martin, 2001).
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
La voie intrinsèque: rôle des facteurs pro-apoptotiques libérés par la mitochondrie<br />
Cas du cytochrome-c:<br />
Cyt-c Apaf-1 Caspase-9 (initiatrice) Casp-3, 6, 7<br />
Interaction et<br />
Changement<br />
de conformation<br />
pour Apaf-1<br />
Recrutement via<br />
domaines CARD<br />
Interactions<br />
homophiliques<br />
Apaf-1: Apoptosis Protease Activating Factor-1<br />
Cas de Smac/Diablo et Htra2/omi:<br />
Smac/Diablo<br />
IAPs (Inhibitors of Apoptosis) Caspases activées<br />
Htra2/Omi<br />
Interactions<br />
protéine-protéine
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Les protéines de la famille bcl-2 contrôle la perméabilisation de la membrane mitochondriale<br />
externe<br />
Il existe au moins une vingtaine de protéines dans cette famille. Elles peuvent être classées<br />
en trois groupes en tenant compte de leurs caractéristiques structurelles et fonctionnelles.<br />
BH: Bcl-2 Homology domain<br />
Le domaine trans-membranaire (TM) est important dans le ciblage des protéines Bcl-2 vers les membranes<br />
internes. Dans des cellules saines, Bcl-2 est localisé au niveau de l’enveloppe nucléaire, du réticulum<br />
endoplasmique (RE) et de la membrane externe mitochondriale (Bcl-x L et Bcl-w se localisent dans la<br />
membrane externe mitochondriale de façon prépondérante).
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Les protéines de la famille bcl-2 contrôle la perméabilisation de la membrane mitochondriale<br />
externe<br />
Bax et Bak sont nécessaires<br />
pour l’apoptose. Ils pourraient<br />
jouer un rôle dans le processus<br />
de perméabilisation.<br />
Bak est membranaire<br />
(mitochondrie et RE).<br />
Bax est cytoplasmique.<br />
Les protéines BH3-only<br />
fonctionnent en amont comme<br />
capteurs des signaux proapoptotiques.<br />
BH3<br />
Bcl-2
Les protéines de la famille bcl-2 contrôlent la perméabilisation de la<br />
membrane mitochondriale externe<br />
membrane<br />
externe<br />
mitochondriale<br />
Signal pro-apoptotique<br />
BH3<br />
?<br />
Bcl-2 Bak<br />
Bax<br />
?<br />
Bax<br />
Bak Bax<br />
oligomérisation<br />
?<br />
Cytochrome-c<br />
Changements de conformation de Bax et Bak en réponse aux signaux proapoptotiques<br />
permettent homo-oligomérisation
Bcl2 interagit avec les domaines BH3 des protéines tueuses BH3 (Bad, Bid, et NoxA)<br />
Une manière d’empêcher l’inhibition par Bcl-2 est d’activer la transcription des<br />
genes Bad, Bid, et NoxA, ces protéines empêcheraient l’action de Bcl2 et activeraient Bax<br />
et/ou Bak<br />
• Bax et Bak formeraient alors des multimères, s’insereraient dans la membrane externe de la<br />
Mitochondrie. Cela conduirait à la perte du potentiel de membrane, l’ouverture de pore et la<br />
libération du cytochrome c, et la multimerization de Apaf-1, ……etc
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
La voie extrinsèque: engagement des récepteurs de mort (vertébrés)<br />
Induction extrinséque de l’apoptoses<br />
Apoptose caspase dependante induite par des récepteurs<br />
Composants:<br />
• Recepteurs aux ligands de mort<br />
• Ligands de ”mort”<br />
• Proteines adaptatrices<br />
• Caspases
Voie de mort par récepteur/ voie<br />
extrinsèque
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
La voie extrinsèque: engagement des récepteurs de mort (vertébrés)<br />
Les récepteurs de mort sont des protéines transmembranaires. Ils induisent l’apoptose suite à<br />
leur activation par des ligands spécifiques. L’apoptose est donc ici déclenchée par des signaux<br />
provenant de l’environnement de la cellule. Cette voie est importante, par exemple, dans le cadre<br />
de l’immunité (développement du système immunitaire mais aussi réponse immunitaire).<br />
Ligands et récepteurs de mort<br />
(Shakibaei et al. (2005). Antioxid. Redox. Signal. 7: 482).
Ligands et recepteurs de morts<br />
(Curtin & Cotter (2003). Cell. Signalling. 15: 983).
Famille des récepteurs TNF<br />
Cysteine-Rich Domains<br />
(CRD)<br />
Death Domains (DD)<br />
Se fixent sur DDs d’autres<br />
protéines (e.g. FADD)…<br />
…ce qui provoque leur<br />
recrutement à la membrane<br />
plasmique
Structure des récepteurs de mort<br />
extracellulaire<br />
intracellulaire<br />
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
CD95<br />
DD<br />
CRD<br />
CRD<br />
CRD<br />
CRD: Cystein-Rich Domain<br />
(le nombre de domaines CRD est variable selon les récepteurs)<br />
DD: Death Domain (80 acides aminés)<br />
domaine d’interaction protéine-protéine
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Transduction du signal par les récepteurs de mort: cas de CD95<br />
DISC<br />
(3, 6, 7)<br />
FADD: Fas Associated Death Domain<br />
Protéine adaptatrice<br />
DED: Death Effector Domain<br />
domaine d’interaction protéine-protéine<br />
DISC: Death Inducing Signalling Complex<br />
la caspase-8 contient un DED dans son<br />
prodomaine
Activation de l’apoptose par le<br />
ligand Fas (FasL)
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Interactions entre les voies intrinsèque et extrinsèque<br />
Type cellulaire I<br />
Voie extrinsèque seule<br />
Type cellulaire II<br />
Amplification par voie intrinsèque<br />
Notion démontrée pour des lignées<br />
et certains types cellulaires in vivo<br />
mais la réalité physiologique de cette<br />
dichotomie n’est pas clairement<br />
établie
Lymphocyte T cytotoxique<br />
Cellule tumorale<br />
La voie perforine/ granzyne<br />
Young et al., Sci. Am., 1988.
Voie perforine/granzyme
1. Augmentation de Ca2+ intracellulaire<br />
2. Induction d’une exocytose<br />
3. Libération de perforine dans l’espace inter-cellulaire<br />
4. Insertion dans la membrane de la cellule cible<br />
5. Polymérisation des monomères de perforine<br />
6. Formation de pores cylindriques
Mécanismes de survie en aval du cytochrome c<br />
Sequestration by heat shock proteins<br />
La protéine Apaf1 interagit avec les protéines heat shock hsp70 et hsp90, qui sont<br />
des "holdase" de type chaperones. Hsp70 séquestre directement le domaine<br />
CARD<br />
et bloque le recrutement de la caspase-9 (Beere et al, 2000). Hsp90 s’ associe aussi<br />
avec le monomère Apaf1, et contribue probablement à l’inhibition de la caspase.<br />
Hsp90 pourrait entrer en compétition avec le cytochrome c (Pandey et al., 2000).<br />
Inhibition directe de la catalyse des caspases:<br />
les inhibiteurs des protéines apoptotique (IAPs)<br />
Les IAPs représentent la dernière ligne de défense contre l’apoptose et agissent<br />
en se fixant directement sur le site substrat des caspases.
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Les IAPs: protéines inhibitrices de l’apoptose<br />
Les premiers IAPs ont été identifiés chez les baculovirus et depuis ont été trouvés chez la drosophile et les<br />
vertébrés.<br />
Le domaine BIR est un caractère essentiel des IAPs mais n’est pas suffisant pour assigner un rôle antiapoptotique<br />
à une protéine.<br />
NAIP: Neuronal apoptosis inhibitory protein<br />
c-IAP: Cellular IAP<br />
XIAP: X-chromosome-linked IAP<br />
Ts-IAP: testis-specific IAP<br />
BIR: Baculoviral IAP repeat
Mécanismes de l’inhibition des caspases par les IAP<br />
A. Situation non-apoptotique : Les domaines BIR des protéines IAP se lient aux formes clivées<br />
dimériques des caspases-9, -3 et -7. Cette inhibition compétitive empêche l’association des<br />
hétérodimères de caspases et leur activation.<br />
B. Situation apoptotique : La protéine Smac/Diablo est libérée de l’espace inter-membranaire<br />
mitochondrial et se lie avec les protéines IAPs. La formation de complexes entre IAP et<br />
Smac/Diablo autorise l’association des hétérodimères de caspases. Celles-ci peuvent dès lors<br />
induire la mort cellulaire (d’après Goyal, 2001).
Interactions entre les voies intrinsèque et extrinsèque<br />
Schéma (simplifié) intégré des « voies de mort » par apoptose
Schéma général représentant<br />
les deux voies principales<br />
de déclenchement de la mort<br />
cellulaire
Rôle primordial de la protéine p53 dans la régulation du cycle cellulaire.<br />
En cas de prolifération cellulaire, en présence de c-myc, la protéine p53 va<br />
contrôler la division cellulaire en vérifiant l’intégrité du DNA.<br />
Si le DNA n’est pas correct ou si Bcl-2 est absent ou inhibé, on observe<br />
une stimulation de la voie de l’apoptose. Si, au contraire, le DNA a pu être<br />
réparé, le cycle cellulaire se poursuit.
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Rôle de p53 dans l’apoptose<br />
p53 découvert en 1979. Depuis 1985, identification d’isoformes<br />
p53 est une protéine suppresseur de tumeurs; p53 est un facteur de transcription.<br />
Dommages ADN<br />
(UV, rayons X, Agents chimiques)<br />
Hypoxie Oncogènes<br />
Points de contrôle du cycle<br />
Arrêt de la prolifération<br />
Réparation de l’ADN<br />
p53<br />
?<br />
Apoptose<br />
Sénescence<br />
?: régulations transcriptionnelles et non transcriptionnelles de gènes impliqués dans l’apoptose
Vérification de l’état de l’ADN par la protéine p53<br />
certaines mutations entrainent une réelle instabilité génétique (par exemple perte de<br />
fonction de la protéine nucléaire p53). Cette instabilité augment la fréquence de<br />
mutations. D’autres mutations préviennent l’arrêt du cycle cellulaire nécessaire<br />
Indispensable à l’examen et à la réparation d’ADN (par exemple la perte-de-fonction de<br />
la protéine Rb).
Les porteurs de mutations de la protéine p53 transmises par les cellules<br />
germinales, développent des cancers précoces
Rôle de p53 dans l’apoptose<br />
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulations transcriptionnelles de gènes de la famille Bcl-2<br />
p53<br />
Bax<br />
Noxa (BH3)<br />
Puma (BH3)<br />
Régulations transcriptionnelles de gènes de la machinerie apoptotique<br />
p53<br />
Apaf-1<br />
Caspase-6<br />
Ces régulations peuvent initier l’apoptose<br />
Ces régulations ne permettent pas,<br />
probablement, l’initiation de l’apoptose mais<br />
contribuent à potentialiser la réponse<br />
apoptotique dans le contexte d’une libération<br />
de cytochrome-c
Rôle de p53 dans l’apoptose<br />
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulations transcriptionnelles de gènes qui inhibent les voies anti-apoptotiques<br />
p53<br />
PTEN<br />
Régulations transcriptionnelles de gènes codant des IAPs<br />
p53<br />
Répression<br />
transcriptionnelle<br />
RTK<br />
PI3K<br />
Akt/PKB<br />
Survie<br />
Survivine (IAP)<br />
Bcl-2<br />
L’importance de cette régulation<br />
Dépend des types cellulaires
Exécution de l’apoptose dans les cellules<br />
des mammifères.<br />
La protéine P53 et plusieurs autres facteurs pro-apoptotiques<br />
ont comme cible la protéine Bax. Ils stimulent l’activité de celleci,<br />
soit par l’intermédiaire des protéines antagonistes Puma et<br />
BCL2, soit par l’intermédiaire du facteur Bid. La protéine P53<br />
stimule également la synthèse de la protéine Bax. Celle-ci fait<br />
apparaître des pores dans la membrane mitochondriale externe,<br />
par où s’échappent divers promoteurs d’apoptose (Diablo,<br />
cytochrome c, AIF), qui contrôlent l’assemblage et le<br />
fonctionnement de l’apoptosome, ainsi que la dégradation de<br />
l’ADN nucléaire. Ce dernier phénomène peut être déclenché<br />
plus directement par la protéine Parp1, qui contraint les<br />
mitochondries à libérer le facteur AIF. Cette voie apoptotique ne<br />
fait donc pas intervenir la chaîne des caspases.
Rôle de p53 dans l’apoptose<br />
Contrôle non transcriptionnel de l’apoptose<br />
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Des données récentes tendent à montrer qu’en réponses à certaines signaux pro-apoptotiques, p53<br />
s’accumule dans la mitochondrie. Cette accumulation provoquerait, selon un mécanisme non élucidé, la<br />
libération du cytochrome-c et l’activation des caspases.
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulation de l’apoptose dépendante de p53<br />
Points de contrôle du cycle<br />
Arrêt de la prolifération<br />
Réparation de l’ADN<br />
p53<br />
Apoptose<br />
Sénescence<br />
Comment s’effectue le choix d’une réponse versus une autre réponse?<br />
-pourrait dépendre du type cellulaire considéré<br />
-pourrait dépendre du signal pro-apoptotique ou de son intensité<br />
-pourrait dépendre de l’état d’activation d’autres voies ayant un impact sur les<br />
voies apoptotiques par exemple (importance du microenvironnement)
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulation de l’apoptose dépendante de p53<br />
Un modèle postule que c’est l’amplitude et/ou la durée de la « réponse p53 » qui<br />
sera déterminante dans la destinée de la cellule, c’est-à-dire la quantité de forme<br />
active de p53 et la durée de vie de cette forme.<br />
Quantité de<br />
p53 active<br />
q2<br />
q1<br />
arrêt<br />
prolifération<br />
apoptose<br />
dt1 dt2<br />
q1 < q2<br />
(dt1; q1) = f (Intensité signal; durée signal)<br />
(dt2; q2) = f (Intensité signal; durée signal)<br />
p53<br />
p53<br />
Sites de haute affinité<br />
p53<br />
p53<br />
Sites de faible affinité<br />
p21<br />
arrêt prolifération<br />
Noxa<br />
Apaf-1<br />
apoptose<br />
…………..<br />
…………..
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulation de l’apoptose dépendante de p53<br />
Zhao et al. ont utilisé une lignée cellulaire p53-/- dans laquelle ils peuvent<br />
contrôler le niveau d’expression de p53 produit à partir d’un transgène inductible<br />
introduit dans ces cellules (appelées EB-1). L’induction est réalisée en utilisant<br />
des traitements au ZnCl2 à différentes concentrations.<br />
50mM: pas de mort cellulaire les premières 24H<br />
Induction de l’expression de p53<br />
après 8h de traitement au ZnCl2<br />
100mM: Idem<br />
200mM: mort cellulaire massive les premières 24H<br />
Cinétique d’expression de groupes de gènes après un traitement au ZnCl2 (100mM)<br />
Cluster 2: on retrouve des gènes de réponse à p53 qui contrôlent l’arrêt du cycle cellu<br />
Cluster 3 et 4: on retrouve des gènes de réponse à p53 qui contrôlent l’apoptose
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulation de l’apoptose dépendante de p53<br />
Un second modèle intègre le fait que des modifications post-traductionnelles de<br />
p53 peuvent modifier l’activité transcriptionnelle du facteur.<br />
Les modifications les mieux étudiées de p53 sont les phosphorylations.<br />
p53 P<br />
p53 P<br />
Signal 1 Signal 2<br />
p53 P<br />
P<br />
p53<br />
P<br />
p21<br />
p53<br />
Noxa<br />
…………..<br />
P<br />
P<br />
P<br />
P<br />
p53<br />
arrêt prolifération apoptose<br />
Apaf-1<br />
…………..
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
Régulation de l’apoptose dépendante de p53<br />
Zhao et al. ont traité plusieurs lignées<br />
cellulaires avec différents types de<br />
rayonnements entraînant des<br />
dommages dans l’ADN de différents<br />
types et pouvant induire un arrêt du<br />
cycle ou l’apoptose en fonction des<br />
types cellulaires considérés.<br />
UV Rayons g ZnCl2<br />
Lignées 1, 2, 3 et 4 EB-1<br />
Profil 1 Profil 2 Profil 3<br />
Profil: ensemble des gènes induits ou réprimés par p53
La voie PKB/Akt<br />
(Molecular Biology of the Cell (4. Ed;<br />
2002 by Alberts, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, and Walter).<br />
(Cancer Medicine 6 (Holland, Frei) 2003 BC Decker Inc.)
Des facteurs trophiques inhibent l’apoptose<br />
Les récepteurs à dépendance
La voie PI3K/Akt<br />
Voies d’activation des caspases et régulations<br />
P<br />
Akt P<br />
P<br />
p53 Bad (BH3) GSK3<br />
expression de NF-kB<br />
<strong>APOPTOSE</strong><br />
certains gènes proapoptotiques<br />
expression de<br />
gènes de survie<br />
Bcl-X L<br />
IAPs
Signalisation dans les cellules non<br />
Signalisation via les récepteurs de survie,<br />
tyrosine Kinase (en général les récepteurs<br />
aux neurotrophines)<br />
Stimulation de la PI-3 kinase<br />
Stimulation de Akt<br />
Phosphorylation de Bad<br />
14-3-3 se fixe sur et inactivate Bad.<br />
Famille Bcl-2 :<br />
apoptotiques<br />
Bax est de façon prédominante dans le<br />
cytoplasme et une partie des protéines Bax est<br />
fixée à la membrane de la mitochondrie et<br />
intéragit avec Bcl-XL<br />
Bax ne forme pas des canaux ioniques.<br />
Pas de sortie du cytochrome c.<br />
Apaf-1 se fixe sur Bcl- XL et n’interagit avec<br />
la caspase-9<br />
(Pettmann & Henderson (1998). Neuron 20: 633).
Signalisation dans les cellules en<br />
apoptose<br />
Pas de signalisation par les récepyeurs de survie<br />
Pas de phosphorylation de Bad<br />
Bad interagit avec Bcl- XL<br />
Bad empèche l’action anti-apoptotique de Bcl- XL.<br />
Famille Bcl-2 :<br />
Bax est localisé de façon prédominante<br />
fixé à la membrane et forment des<br />
cannaux ioniques<br />
Passage d’ion (entrée) à travers la<br />
membrane la mitochondriale.<br />
Sortie du cytochrome c dans le<br />
cytoplasme.<br />
Le cytochrome c se fixe sur Apaf-1.<br />
L’ATP se fixe sur Apaf-1.<br />
Caspase-9 se fixe sur Apaf-1.<br />
Activation de la caspase-9.<br />
Activation de la caspase-3.<br />
On peut ajouter dans certain cas une<br />
voie de mort extrinséque via les récepteurs<br />
de mort ”death recepteur” (Pettmann & Henderson (1998). Neuron 20: 633).
Apport de la drosophile<br />
Le potentiel des antagonistes des IAP antagonists semble plus important<br />
chez la drosophile que chez les vertébrés, ce qui indique que les IAPs<br />
peuvent avoir une importance relative chez différents organismes
Chez la drosophile on trouve 7 caspases (DCP-1, drICE, Dredd, DECAY, STRICA, et<br />
DAMM, don’t un équivalent fonctionel de la caspase 9, DRONC),<br />
- Une protéine homologue de Apaf-1 (Dark/Dapaf-1/HAC-1),<br />
- Deux protéines de la famille Bcl-2 (Drob-1/Debcl/dBorg-1/dBok and Buffy/dBorg-2)<br />
- quatre IAPs, DIAP1, DIAP2, Deterin, and dBruce<br />
Diap1contient deux motifs BIR motifs et en position C-terminal un domaine<br />
RING, qui possède une activité E3-ubiquitin ligase.
cytological region 75C<br />
RHG genes: reaper, hid, grim, sickle<br />
Les petites protéines HID, GRIM, REAPER, et SICKLE contiennent chacune un petit<br />
motif hydrophobe qui se fixe au domaine BIR des IAPs
Les Caspases, Rpr, Grim, Hid and Jafrac2 ont une affinité différentielle et sélective de<br />
fixation sur les domaines BIR des DIAP1. les antagonistes des IAP entrent en compétition<br />
avec les caspases pour la fixation des IAPs. L’affinité relative de chaque “IAP-antagonists”<br />
pour les domaines BIR est indiquée par des +.
Mécanisme d’action des protéines Grim, Reaper, Sickle et Hid<br />
Model du mécanisme d’action de Grim, Reaper, Sickle, et Hid.<br />
Le domaine N-terminal de Grim, Reaper, Sickle, et Hid se fixe aux IAPs, bloque leur capacité à<br />
inhiber les caspases, et favorise l’autoubiquitination et la dégradation des IAPs par le proteasome.<br />
Le domain GH3 de Grim (et peut de Reaper and Sickle), induit l’apoptose par la voie mitochondrial.<br />
Les deux voies cooperent pour induire l’apoptose dans les cellules induites à mourir de façon Grimdependante.
La protéine Reaper a comme cible le facteur Diap1+. Elle agit de deux<br />
manières:<br />
1) elle ralentit la production de Diap1 en inhibant la synthèse protéique.<br />
2) elle entraîne la dégradation de Diap1, en la contraignant à fonctionner<br />
comme ubiquitine ligase et à fixer sur elle-même un signal de destruction<br />
par le protéasome
Diap1 inhibe les caspases Dronc et Drice, en déclenchant la dégradation de<br />
Dronc par le protéasome, et en empêchant Drice de fonctionner :<br />
La protéine Diap1 a donc une double fonction en tant qu’ubiquitine ligase, car<br />
elle peut déclencher sa propre destruction mais aussi celle de la caspase Dronc.<br />
Dans les cellules où Reaper est actif, la protéine DRP1 provoque la<br />
fragmentation des mitochondries<br />
La protéine Reaper active donc les procaspases Dronc et Drice de deux<br />
manières : soit en réduisant la concentration intracellulaire de la protéine<br />
Diap1 soit en activant le facteur DRP1.
Dégradation des caspases<br />
DIAP auto ubiquitination<br />
et dégradation
Méthodes de détection de l’apoptose dans les cellules<br />
Essai TUNEL colorimétrique (TdT-mediated dUTP nick end-labeling)<br />
TdT: Terminal-deoxynucleotidyl-Transferase<br />
Principe: la TdT permet l’ajout de dUTP biotinylé aux extrémités 3’OH de l’ADN fragmenté des cellules<br />
en apoptose. On utilise ensuite de la streptavidine couplée à la peroxydase et on révèle en utilisant un<br />
substrat de cette enzyme (DAB [diaminobenzidine], donne un précipité de couleur brune). Ainsi, les<br />
noyaux des cellules apoptotiques apparaissent bruns ou noirs après le marquage qui peut être réalisé<br />
sur des cultures de cellules ou des sections de tissus.
Essai TUNEL fluorescent<br />
Techniques d’analyse<br />
Principe: le dUTP est couplé cette fois-ci à la fluorescéine. Le marquage peut être réalisé sur des<br />
cellules en culture même si ce sont des cellules non adhérentes et sur des sections de tissus. Ici, on<br />
pourra analyser les résultats par la cytométrie de flux également ce qui permet dans certains cas des<br />
quantifications plus fines du nombre de cellules apoptotiques.
Anticorps dirigés contre les caspases activées<br />
Techniques d’analyse<br />
anti-caspase 3 activée: anticorps polyclonal développé chez le lapin. Le peptide utilisé pour immuniser le<br />
lapin est identique chez l’Homme, la souris, le rat et le hamster ce qui lui confère une réactivité croisée<br />
importante. Il est particulièrement indiqué pour l’immunohistochimie (immuno sur sections de tissus et sur<br />
cultures cellulaires adhérentes)
Coloration de l’ADN
Marquage annexin V
Méthodes de détection de<br />
l’apoptose dans les cellules<br />
Activité des Caspases : mesure de l’activité des caspases<br />
Anticorps contre les formes actives des caspases<br />
Cytochrome c Détection et relarguage du cytochrome c de la mitochondrie vers le cytoplasme<br />
Mitochondrie Détecter des changements du potentiel transmembranaire de la Mitochondrie<br />
Fragmentation d’ADN TUNEL (Terminal deoxynucleotidyl Transferase-dUTP Nick End Labeling).<br />
Caspase Activity TUNEL-staining<br />
Red = active caspases Bright Green = DNA fragmentation<br />
(http://www.b-bridge.com/eng/products/apop/cdk.htm)<br />
Mitochondrial Transmembrane Potential<br />
Apoptotic cell Normal cell<br />
(J. Biol. Chem. 276: 35891-9, 2001).
Fin