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Les acides gras Structure des acides gras - Biologie

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<strong>Les</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

<strong>Les</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> appartiennent à la classe de composés appelée « lipi<strong>des</strong> », molécules<br />

hydrophobiques très importantes qui possèdent plusieurs fonctionnes.<br />

<strong>Les</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> ont au moins 4 rôles physiologiques majeurs<br />

Ils sont <strong>des</strong> éléments<br />

constitutifs <strong>des</strong> phospholipi<strong>des</strong><br />

et <strong>des</strong> glycolipi<strong>des</strong> (constituants<br />

importants <strong>des</strong> membranes)<br />

Des dérivés <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

sont <strong>des</strong> hormones nécessaires<br />

au métabolisme<br />

Ils sont une source d’énergie<br />

très importante<br />

Ils peuvent être liés aux<br />

protéines pour en permettre la<br />

localisation cellulaire<br />

<strong>Structure</strong> <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

Groupe carboxylique<br />

(acide)<br />

Chaîne hydrocarbure<br />

(hydrogène et carbone),<br />

typiquement en nombre pair<br />

entre 14 et 24 C<br />

S’il y a une ou plus<br />

doubles liaisons entre<br />

deux carbones (-CH=CH-),<br />

l’acide <strong>gras</strong> est appelé<br />

insaturé<br />

S’il y a seulement<br />

singles liaisons entre<br />

les carbones, l’acide<br />

<strong>gras</strong> est appelé<br />

saturé<br />

Plus élevé est l’insaturation,<br />

plus basse est la température de<br />

fusion de l’acide <strong>gras</strong> et majeur<br />

la fluidité de la membrane que<br />

l’<strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> forme


<strong>Les</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> sont stockés surtout sous forme de triacylglycérol (esters non chargés<br />

du glycérol):<br />

Cellule adipose:<br />

-Cytoplasme<br />

-Noyau<br />

-Globule de<br />

stockage <strong>des</strong><br />

triacylglycérols<br />

<strong>Les</strong> carbones <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> sont très réduits, donc ils possèdent beaucoup d’énergie<br />

chimique. <strong>Les</strong> triacylglycérol sont donc <strong>des</strong> molécules de stockage de l’énergie très efficaces:<br />

leur oxydation donne environ 9 kcal/gramme, tandis que pour le sucres l’oxydation donne<br />

environ 4 kcal/gramme.<br />

Nomenclature <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

Différents types de nomenclature:<br />

Numération <strong>des</strong> carbones à<br />

partir du groupe carboxylique<br />

<strong>Les</strong> carbones 2 et 3 e le dernier sont souvent<br />

appelés respectivement et (oméga)<br />

Exemple de nomenclature souvent utilisée:<br />

C18: 3 <br />

Nombre de carbones<br />

Nombre de double<br />

liaison<br />

Position de la dernière<br />

double liaison par rapport<br />

au carbone <br />

On peut trouver aussi l’indication, par exemple:<br />

cis- 9 ça signifie une double liaison avec configuration cis entre le carbone 9 et 10


Hydrolyses <strong>des</strong> triacylglycérols<br />

<strong>Les</strong> triacylglycérols sont la forme principale de stockage <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> (chez l’homme ils<br />

stockent environ 150 fois plus d’énergie que le glycogène), et pour les utiliser il faut hydrolyser<br />

les triacylglycérols accumulés dans les adipocytes ou assimilés.<br />

Des enzymes appelés lipase catalysent<br />

l’hydrolyse de la liaison ester entre<br />

<strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> et glycérol.<br />

Le glycérol peut être<br />

converti en DHAP et<br />

former glucose par la<br />

gluconéogenèse<br />

<strong>Les</strong> lipases <strong>des</strong> cellules adipeuses<br />

sont activées par phosphorylation<br />

induit par <strong>des</strong> hormones telles que le<br />

glucagon et l’adrénaline (et<br />

l’insuline a l’effet opposé)


Dégradation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>: activation<br />

<strong>Les</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> sont dégradés par oxydation au niveau du carbone ( oxydation).<br />

La première étape est l’activation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> par liaison avec le Coenzyme A (en utilisant<br />

l’énergie de l’ATP):<br />

Acyl-CoA synthétase<br />

Acide <strong>gras</strong><br />

Coenzyme A<br />

Acyl-CoA<br />

pyrophosphate<br />

La réaction est rendue irréversible par l’hydrolyse rapide du pyrophosphate à 2 molécules de P i (déjà vu<br />

par l’enzyme UDP-glucose pyrophosphorylase pour la synthèse du glycogène)<br />

L’activation est effectuée dans la membrane mitochondriale externe, la dégradation (oxydation)<br />

dans la matrice mitochondriale:<br />

Activation<br />

Oxydation<br />

Le transport <strong>des</strong> acyl-CoA dans la<br />

matrice mitochondriale est facilité<br />

par une petite molécule appelée<br />

carnitine<br />

Dégradation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>: oxydation<br />

Un acyl-CoA saturé est dégradé par une séquence récurrente de 4<br />

réactions:<br />

1) Oxydation par le FAD<br />

Résultat pour<br />

chaque cycle<br />

2) Hydratation<br />

3) Oxydation par le NAD +<br />

4) Thiolyse par le CoA<br />

-Formation d’un acyl-CoA plus court de 2 carbone.<br />

-Formation du FADH 2<br />

, NADH et acétyl-CoA<br />

(1)<br />

(2)<br />

Acyl-CoA déshydrogénase<br />

1) Acyl-CoA + E-FAD trans- 2 -énoyl-CoA + E-FADH 2<br />

énoyl-CoA hydratase<br />

2) trans- 2 -énoyl-CoA + H 2 O L-3-hydroxyacyl-CoA<br />

(3)<br />

hydroxyacyl-CoA déshydrogénase<br />

3) L-3-hydroxyacyl-CoA + NAD + 3-cétoacyl-CoA + NADH + H +<br />

-cétothiolase<br />

4) 3-cétoacyl-CoA (n carbones) + HS-CoA acétyl-CoA + acyl-CoA (n-2 carbones)<br />

(4)<br />

Remarquer que les étapes 1, 2 et 3 sont très similaires à celles-là du<br />

cycle de Krebs du succinate à l’oxaloacétate (étapes 6, 7 et 8).


<strong>Les</strong> acétyl-CoA produits par<br />

l’oxydation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

entrent dans le cycle de Krebs<br />

<strong>Les</strong> FADH 2 et les NADH produits sont oxydés par la chaîne de transport électronique<br />

mitochondriale pour permettre à la production d’ATP


Dégradation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>: oxydation sur <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> insaturés<br />

Pour la dégradation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> insaturés (avec <strong>des</strong> double liaisons), deux enzymes<br />

supplémentaires sont nécessaires: une réductase et une isomérase.<br />

Cette intermédiaire ne peut pas être utilise pour les<br />

réactions suivantes d’oxydation<br />

La réductase (NADPH dépendent) réduit une double<br />

liaison et déplace l’autre en position 3.<br />

La double liaison (cis- 3 ) entre C3 et C4 empêche<br />

la formation de la double liaison entre C2 e C3<br />

(premier intermédiaire de la -oxydation)<br />

L’isomérase convertit la double liaison cis- 3 en trans- 2<br />

pour obtenir l’intermédiaire normal de la -oxydation<br />

Règle: les double liaison impair sont traitées par l’isomérase,<br />

tandis que les double liaison pair par la réductase e l’isomérase<br />

Synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

La synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> est faite de 3 phases à partir de l’acétyl-CoA:<br />

1) Activation<br />

2) Élongation<br />

3) Terminaison<br />

Phase 1: Activation<br />

La synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> commence par la carboxylation de l’acétyl-CoA en malonyl-CoA<br />

Acétyl-CoA<br />

carboxylase<br />

Cette réaction irréversible est l’étape qui engage la synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>.<br />

Le cofacteur de la carboxylase est la biotine.


Acétyl-CoA<br />

carboxylase<br />

gluconéogenèse<br />

Pyruvate<br />

carboxylase<br />

Pyruvate<br />

Oxaloacétate<br />

Le cofacteur <strong>des</strong> deux carboxylases est la biotine<br />

Synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>: le complexe de l’acide <strong>gras</strong> synthase<br />

Chez les eucaryotes, un seul complexe multifonctionnel cytosolique catalyse toutes les<br />

réactions de synthèse de l’acide <strong>gras</strong><br />

Phase 2: Élongation<br />

La chaîne <strong>des</strong> acide <strong>gras</strong> en croissance est allongée par addition séquentielle d’unités à 2 carbones<br />

Cette phase commence par la formation d’acétyl-ACP et de malonyl-ACP.<br />

L’ACP (acyl carrier protein) a la fonction de transporter les unités acétyl; le groupe qui lie<br />

l’acétyl a la même structure que celui du Coenzyme A.<br />

Acétyl-CoA + ACP Acétyl-ACP + CoA<br />

Malonyl-CoA + ACP Malonyl-ACP + CoA


L’acide <strong>gras</strong> est allongé par une séquence récurrente de 4 réactions:<br />

1) Condensation<br />

2) Réduction par le NADPH<br />

3) Déshydratation<br />

4) Réduction par le NADPH<br />

Enzyme condensant<br />

acyl-malonyl-ACP<br />

1) Acétyl-ACP + malonyl-ACP acétoacétyl-ACP + ACP + CO 2<br />

La décarboxylation est nécessaire pour rendre exergonique la réaction<br />

de condensation.<br />

Le deuxième cycle et les suivants permettent l’allongement de<br />

la chaîne par la condensation du butyryl-ACP (au lieu de<br />

l’acétyl-ACP) avec une molécule de malonyl-ACP<br />

Phase 3: terminaison<br />

<strong>Les</strong> réactions d’allongement sont termines quand la chaîne est<br />

composée de 16 carbones. L’intermédiaire lié à l’enzyme est hydrolysé<br />

pour donner un acide <strong>gras</strong> C:16 (palmitate)<br />

Stœchiométrie total pour la synthèse du palmitate:<br />

8 acétyl-CoA + 7 ATP + 14 NADPH + 6 H + palmitate + 14 NADP + + 8 CoA + 6 H2O + 7 ADP + 7 P i<br />

Remarquer que la synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> est faite par une série de réactions de type contraire à<br />

celle de l’oxydation (mais évidemment les enzyme et les cofacteurs sont différents)<br />

-Oxydation<br />

1) Oxydation par le FAD<br />

2) Hydratation<br />

3) Oxydation par le NAD +<br />

4) Thiolyse par le CoA<br />

Oxydation<br />

•Mitochondrie<br />

•NADH, FADH 2<br />

•CoA<br />

•No CO 2<br />

•Enzymes séparés<br />

Différences<br />

Synthèse<br />

Synthèse<br />

1) Condensation<br />

2) Réduction par le NADPH<br />

3) Déshydratation<br />

4) Réduction par le NADPH<br />

•Cytosol<br />

•NADPH<br />

•Acyl carrier protéine (ACP)<br />

•CO 2 activation<br />

•Un seul complexe


Modification du palmitate<br />

Le palmitate, l’acide <strong>gras</strong> synthétisé par l’acide <strong>gras</strong> synthase, est un acide <strong>gras</strong> saturé à 16<br />

atomes de carbone, mais la cellule possède nombreux types d’acide <strong>gras</strong> .<br />

Des systèmes enzymatique accessoires catalysent l’élongation et la désaturation du palmitate<br />

pour former différents types <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>. Plusieurs enzymes qui catalysent ces réactions<br />

sont associés à la membrane cytosolique du réticulum endoplasmique (dans les plantes il y en a<br />

aussi dans le chloroplaste)<br />

IMPORTANT:<br />

<strong>Les</strong> mammifères n’ont pas la capacité<br />

d’introduire <strong>des</strong> double liaison entre<br />

atomes de carbone au-delà de C-9<br />

dans une chaîne d’<strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>.<br />

Il faut donc assimiler certains <strong>aci<strong>des</strong></strong><br />

<strong>gras</strong>, qui sont donc appelés essentiels<br />

(par ex. ceux-là connus comme 3 et<br />

6)<br />

Source du NADPH<br />

Le NADPH utilisé par le synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> (voie anabolique) provient de deux sources<br />

principales:<br />

-NADPH produit par la voie <strong>des</strong> pentoses phosphates<br />

-NADPH produit par l’enzyme malique<br />

Matrice mitochondriale<br />

ATP + CoA<br />

Cytosol<br />

citrate<br />

CoA<br />

Acétyl-CoA<br />

oxaloacétate<br />

ADP + P i + 2 H +<br />

citrate<br />

ATP-citrate<br />

lyase<br />

Malate<br />

déshydrogénase<br />

cytosolique<br />

Enzyme<br />

malique<br />

Acétyl-CoA + ADP + P i<br />

oxaloacétate<br />

malate<br />

NADH + H +<br />

NAD +<br />

NADP +<br />

ATP + H 2 O<br />

Pyruvate + CO 2<br />

Pyruvate + CO 2<br />

NADPH<br />

Le transport de l’acétyl-CoA de la matrice mitochondriale au cytosol est réalisé par formation du citrate;<br />

dans le cytosol le citrate est puis retransformé en oxaloacétate et acétyl-CoA; la malate déshydrogénase<br />

cytosolique et l’enzyme malique permettent de obtenir du NADPH à partir du NADH


Régulation de la synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

Le synthèse <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> est faite lorsque les gluci<strong>des</strong> et l’énergie sont abondants, et<br />

lorsque les <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> sont rares.<br />

L’acétyl-CoA carboxylase est l’enzyme clé pour le control de la voie (sous contrôle<br />

allostérique et par modification covalente):<br />

L’acétyl-CoA carboxylase est inhibée par phosphorylation par<br />

une kinase AMP dépendante; la phosphatase (2A), par contre, est<br />

sous contrôle hormonale (désactivée par le glucagon)<br />

<strong>Les</strong> phospholipi<strong>des</strong> sont <strong>des</strong> constituants de membrane qui contiennent <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

Tête polaire<br />

queue apolaire<br />

La présence <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> insaturés<br />

rompt l’empilement <strong>des</strong> chaînes<br />

hydrophobiques et rend la membrane<br />

plus fluide.


L’organisation <strong>des</strong> lipi<strong>des</strong> dans la<br />

membrane<br />

<strong>Les</strong> doubles liaisons cis dans les<br />

<strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> sont capable<br />

d’augmenter la fluidité <strong>des</strong><br />

membranes en diminuant la<br />

température de fusion.<br />

Utilisation <strong>des</strong> différentes sources d’énergie pendant les activités musculaires<br />

La créatine-phosphate est un<br />

réservoir de liaisons ~P qui<br />

permet la phosphorylation de<br />

l’ATP très rapidement<br />

-ATP 1 seconde<br />

- Créatine-P 5 seconde<br />

- Glycolyse anaérobie dés quelques secon<strong>des</strong> à quelques minutes<br />

- Glycolyse aérobie dés quelques secon<strong>des</strong> à plusieurs heures<br />

- Lipolyse (<strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>) après 15-30 minutes pour plusieurs heures


Stockage de l’énergie (homme de 70 kg):<br />

Glucose libre<br />

40 kcal<br />

Glycogène<br />

600 kcal<br />

(Protéines)<br />

25000 kcal<br />

Triacylglycérol (<strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong>) 100000 kcal<br />

Sport différents utilisent <strong>des</strong> sources d’énergie différentes<br />

Exemples:<br />

Sprint sur 100 mètres 10 secon<strong>des</strong><br />

ATP<br />

(1 s)<br />

Créatine-P<br />

(4 s)<br />

glycolyse anaérobie du glucose<br />

(quelques secon<strong>des</strong>)<br />

L’ATP, la créatine et le glucose sont la principal source d’énergie pour <strong>des</strong> réactions anaérobies


Course 5 km 15 minutes<br />

glycolyse aérobie du glucose libre<br />

(peu de minutes)<br />

glycolyse aérobie du glycogène<br />

(plusieurs minutes)<br />

Le glycogène est la principal source d’énergie à travers la glycolyse aérobie<br />

Course longue (marathon, cyclisme) 2-6 heures<br />

Il faut utiliser les <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> parce que l'énergie stockée sous forme de glycogène n’est pas<br />

suffisante pour <strong>des</strong> activités de plusieurs heures<br />

glycolyse aérobie du glycogène<br />

(heures)<br />

Lipolyse <strong>des</strong> triacylglycérols et<br />

oxydation <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong><br />

(plusieurs heures)<br />

L’organisme maintient le taux du glucose faible dans le sang rapport glucagon/insuline élevé<br />

activation lipolyse l’acétyl-CoA produit par oxydation <strong>des</strong> <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> ralentie la pyruvate<br />

déshydrogénase et donc la glycolyse le glucose (glycogène) est économisé et utilisé pour<br />

plusieurs heures et les <strong>aci<strong>des</strong></strong> <strong>gras</strong> deviennent la principale source d’énergie<br />

<strong>Les</strong> corps cétoniques<br />

transporté<br />

Une série de réactions (qui se déroulent surtout dans le foie) permet la<br />

production de molécules appelées « corps cétoniques » à partir de<br />

l’acétyl-CoA.<br />

L’acétoacétate est une importantes source d’énergie, en condition<br />

normale surtout pour le muscle cardiaque, et en condition de jeûne<br />

prolongé aussi pour le cerveau (qui normalement utilise le glucose).<br />

L’acétoacétate produit dans le foie est transporté par le sang vers les<br />

tissus périphériques qui le retransforment en Acétyl-CoA qui sera<br />

oxydé par le cycle de Krebs.<br />

Au cycle de Krebs

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