Reprogrammation de cellules somatiques en cellules souches - M2 ...
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5, après transduction rétrovirale <strong>de</strong>s <strong>cellules</strong> HDF mais que le niveau d’expression <strong>de</strong> ces facteurs<br />
dans les pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong> obt<strong>en</strong>ues était comparable à celui <strong>de</strong>s HDF (Figures 7A),<br />
suggérant une mise <strong>en</strong> sil<strong>en</strong>ce du rétrovirus. Une RT-PCR utilisant <strong>de</strong>s amorces spécifiques pour les<br />
transcrits rétroviraux a <strong>en</strong> effet, confirmé une mise <strong>en</strong> sil<strong>en</strong>ce <strong>de</strong>s quatre rétrovirus. Les résultats<br />
obt<strong>en</strong>us par Western Blot ont été vérifiés par RT-PCR et la prés<strong>en</strong>ce <strong>de</strong> certains <strong>de</strong> ces marqueurs a<br />
été observée par immunofluoresc<strong>en</strong>ce. Des mesures <strong>en</strong>zymatiques ont égalem<strong>en</strong>t démontré<br />
l’activité <strong>de</strong> la télomérase ainsi qu’un temps <strong>de</strong> doublem<strong>en</strong>t équival<strong>en</strong>t aux CSEh.<br />
Une étu<strong>de</strong> du profil global d’expression génique a été réalisée afin <strong>de</strong> déterminer les similitu<strong>de</strong>s<br />
<strong>en</strong>tre les pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong>, les <strong>cellules</strong> HDF et les CSEh. L’expéri<strong>en</strong>ce consiste à hybri<strong>de</strong>r la<br />
totalité <strong>de</strong>s ARN cellulaires transcrits sur une micropuce du génome humain complet (Whole<br />
Human G<strong>en</strong>ome Microarray, Agil<strong>en</strong>t). L'expéri<strong>en</strong>ce indique que les pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong> ont un<br />
profil d’expression génique plus ressemblant à celui <strong>de</strong>s CSEh qu’à celui <strong>de</strong>s <strong>cellules</strong> HDF (Figure<br />
7).<br />
A<br />
B<br />
Figure 7 : Les pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong> obt<strong>en</strong>ues prés<strong>en</strong>t<strong>en</strong>t <strong>de</strong>s marqueurs géniques <strong>de</strong> CSEh. (A) Analyse par<br />
Western blot <strong>de</strong> gènes marqueurs <strong>de</strong> la pluripot<strong>en</strong>ce <strong>de</strong> pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong> (iPS 201B) au jour 1, 2, 3, 6 et 7, <strong>de</strong><br />
<strong>cellules</strong> <strong>souches</strong> embryonnaires humaines (CSEh, ES sur la figure), <strong>de</strong> <strong>cellules</strong> <strong>de</strong> tératomes NTERA-2 et <strong>de</strong><br />
fibroblastes humain <strong>de</strong> peau (HDF). (B) Comparaison <strong>de</strong>s profils d’expression génique <strong>de</strong>s pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong><br />
avec les <strong>cellules</strong> HDF et les CSEh (lignée H9) avec une puce à oligonucléoti<strong>de</strong>. Les flèches indiqu<strong>en</strong>t le niveau<br />
d’expression <strong>de</strong> Nanog, Sox-2 <strong>en</strong>dogènes et Oct-4 <strong>en</strong>dogènes. Les lignes rouges indiqu<strong>en</strong>t la diagonale et les variations<br />
<strong>en</strong>tre les échantillons.<br />
III. Analyses épigénétiques <strong>de</strong>s pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong>.<br />
Les modifications <strong>de</strong> l’ADN et <strong>de</strong>s histones sont <strong>de</strong>s mécanismes <strong>de</strong> régulation transcriptionnelle.<br />
Les CSEh possè<strong>de</strong>nt un état chromatini<strong>en</strong> spécifique déjà caractérisé (Pan et al., 2007) et très<br />
différ<strong>en</strong>t <strong>de</strong>s <strong>cellules</strong> différ<strong>en</strong>ciées. Le statut épigénétique <strong>de</strong>s pseudo <strong>cellules</strong> <strong>souches</strong> a été<br />
comparé au statut épigénétique <strong>de</strong>s CSEh et <strong>de</strong>s <strong>cellules</strong> HDF, à la suite d’une immunoprécipitation<br />
<strong>de</strong> la chromatine. Les résultats obt<strong>en</strong>us montr<strong>en</strong>t que les modifications épigénétiques<br />
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