résumé (Format PDF) - ED 406 - Université Pierre et Marie CURIE

Conférences Plénières

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Maurizio PRATO
Chemistry & Nanotechnology: Synthesis and Applications
of Functionalized Carbon Nanotubes
Dipartimento di Scienze Chimiche e Farmaceutiche, Università degli Studi di Trieste,
Piazzale Europa 1, 34127 Trieste, Italy
e-mail: prato@units.it
Among the wide range of novel nanometer scale structures available, single-wall
carbon nanotubes (SWNT) and multi-wall carbon nanotubes (MWNT) stand as unique
materials for fundamental research and potential applications. However, manipulation and
processing of carbon nanotubes (CNTs) has been difficult because of their intractability and
insolubility in most common solvents. Considerable effort has therefore been devoted to the
chemical modification of CNTs, which might open the way to many useful applications.
Our group has been involved in the organic functionalization of various types of nanocarbons,
including carbon nanotubes, nanohorns, fullerenes and nanoonions. The organic
functionalization offers the great advantage of producing soluble and easy-to-handle CNTs.
As a consequence, since biocompatibility of CNT is expected to improve, many
functionalized carbon nanotubes may find useful applications in the field of nanomedicine.
Their use as drug delivery agents and scaffolds for vaccines has already been demonstrated.
CNT functionalized with bioactive moieties are particularly suited for targeted drug delivery.
In fact, not only they exhibit reduced toxicity but also possess a high propensity to cross cell
membranes.
Carbon nanotubes can act as active substrates for neuronal growth, a field that has given so
far very exciting results. Nanotubes are compatible with neurons, but especially they play a
very interesting role in interneuron communication. Improved synaptic plasticity is just one
example.
In addition, in combination with polyoxometalate catalysts, carbon nanotubes can serve as
wires for the splitting of water molecules to give oxygen, but, especially, molecular hydrogen,
ideal for clean energy generation.
During this talk, we will illustrate the latest advances in our laboratory of the most exciting
results in these fast developing fields.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Ally AUKAULOO
Molecular Complexes For Artificial Photosynthesis
a Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d’Orsay, Université Paris Sud XI, 91405
ORSAY, France
b Institute of Biology and Technologies Saclay, URA 2096 CNRS, CEA Saclay, 91191, Gif-sur-
Yvette, France
E-mail: ally.aukauloo@u-psud.fr
Understanding how nature uses light and a Mn 4 Ca (the Oxygen Evolving Complex in
Photosystem II) to perform the four electron four proton water oxidation on one side and
implementing the key concepts in robust synthetic systems on the other are gathering an
unprecedented effort from the scientific community. Artificial photosynthesis aims to drive
the photodecomposition of water. We will discuss on three main topics, capturing of light,
conferring vectorial electron transfer and catalysis for activation of water and for the
reduction of protons to H 2 .

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Prof. Nicolas GIUSEPPONE
Towards Self-constructing Materials: A Systems Chemistry Approach
University of Strasbourg, Institut Charles Sadron CNRS
23 rue du Loess, BP 84047, 67034 Strasbourg Cédex 2, France
e-mail: giuseppone@unistra.fr
The confluence of dynamic and constitutional features
related to supramolecular self-assemblies [1-2] – when they
occur within mixtures of competing molecular architectures –
has recently opened a very intriguing branch of chemical
science, the so-called dynamic combinatorial chemistry
(DCC). Within this framework, emerging lines of
investigations have been directed towards the development of
dynamic combinatorial materials and devices. [3,4] These ones
can be defined as multi-component chemical systems which,
thanks to the reversibility of their interconnections within networks of competing reactions,
and thanks to their sensitivity to environmental parameters, aim at performing modular
functional tasks by responding to external stimuli. The behaviour of such dynamic materials is
by essence more complex than the one produced by their static or single-component
counterparts and as such, they hold higher potentialities in terms of information processing
and functionality tuning. Besides materials science, another recent approach in DCC consists
in coupling networks of reversible reactions with autocatalytic loops, in order to combine
their constitutional “plasticity” with a self-replicating process as an amplification tool. [5-7] We
will discuss some of our works concerning such responsive systems along these two different
lines and, more particularly, we will focus on their merging to access self-constructing
materials with advanced functional properties for electronic conduction. [8-10] We will also
outline the potential of such systems to act as vectors of information. [11-12]
[1] Moulin, E., Giuseppone, N. – Encyclopedia of Supramolecular Chemistry – From molecules to
nanomaterials - Reactions in Dynamic Assemblies, John Wiley & Sons, Ltd., 2012, 4, 1543.
[2] Giuseppone, N., Lutz, J.-F., Nature, 2011, 473, 40.
[3] Moulin, E., Cormos, G., Giuseppone, N., Chem. Soc. Rev., 2012, 41, 1031.
[4] Tauk, L., Schröder, A., Decher, G., Giuseppone, N., Nat. Chem., 2009, 1, 649.
[5] Xu, S., Giuseppone, N., J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 1826.
[6] Nguyen, R., Allouche, L., Buhler, E., Giuseppone, N. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 1093.
[7] Moulin, E., Giuseppone, N., Top. Curr. Chem., 2012, 322, 87.
[8] Moulin, E., Niess, F., Maaloum, M., Buhler, E., Nyrkova, I., Giuseppone, N., Angew. Chem. Int. Ed. 2010,
49, 6974.
[9] Faramarzi, V., Niess, F., Moulin, E., Maaloum, M., Dayen, J.-F., Beaufrand, S. Zanettini, J.-B., Doudin, B.,
Giuseppone, N., Nat. Chem. 2012, 4, 485.
[10] Moulin, E., Cid, J.-J., Giuseppone, N., Adv. Mat. 2012, DOI: 10.1002/adma.201201949.
[11] Giuseppone, N., Acc. Chem. Res., 2012, 45, 2178.
[12] Du, G., Moulin, E., Jouault, N., Buhler, E., Giuseppone, N., Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 12504.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Peter J. SADLER
Precious metal anticancer complexes
with new mechanisms of action
Department of Chemistry
University of Warwick, Coventry CV4 7AL, UK
E-mail : P.J.Sadler@warwick.ac.uk
I will describe our work on the design of low-spin d 6 complexes of Ru II , Os II , Ir III and
Pt IV as anticancer agents. [1] Our aim is to control the activation of the complexes so that they
reach specific target sites. The design features for activation and targeted delivery include
photoactivation, hydrolysis, ligand-based oxidation and reduction, hydride transfer, peptide
tagging, and dual mode nucleobase binding and DNA intercalation.
Diazido Pt IV complexes are relatively unreactive in the dark, but can be rapidly
activated in cancer cells with UVA and visible light. A particularly potent complex is
trans,trans,trans-[Pt(N 3 ) 2 (OH) 2 (pyridine) 2 ] which forms unusual adducts with DNA and other
biomolecules. [2] Excited state reactions are very rapid and can generate highly reactive active
species, including azidyl radicals. [3a] We are also designing receptor-targeted photoactivatable
Ru II complexes. [3b]
Osmium(II) arene azopyridine complexes can exhibit nanomolar potency against a
range of cancer cells and in vivo activity. [4] The most active complexes are relatively inert
towards substitution, and perturb the redox balance in cells.
The selectivity of Ir III Cp* anticancer complexes towards G and A bases can be
controlled by N,N- and N,C-chelating ligands, and phenyl substituents on Cp* can intercalate
into DNA. [5] Such complexes can also be efficient transfer hydrogenation catalysts using
coenzyme NADH as an hydride source, [6] so allowing the redox status of cells to be
modulated in a novel way.
We thank the ERC, EPSRC, BBSRC, EC Marie Curie and COST Action CM1105, and Science City
(ERDF/AWM) for support.
[1] (a) P.C.A. Bruijnincx and P.J. Sadler Adv. Inorg. Chem. 2009, 61, 1-62; (b) S. van Rijt, P.J. Sadler Drug
Discovery Today, 2009, 14, 1089-1097; (c) A.L. Noffke, A. Habtemariam, A.M. Pizarro, P.J. Sadler Chem.
Commun. 2012, 48, 5219-5246.
[2] (a) N.J. Farrer, J.A. Woods, L. Salassa, Y. Zhao, K.S. Robinson, G. Clarkson, F.S. Mackay, P.J. Sadler
Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 8905-8908; (b) J. Pracharova, L. Zerzankova, J. Stepankova, O. Novakova, N.J.
Farrer, P.J. Sadler, V. Brabec, J. Kasparkova Chem. Res. Toxicol. 2012, 25, 1099-1111; (c) H.-C, Tai, R.
Brodbeck, J. Kasparkova, N.J. Farrer, V. Brabec, P.J. Sadler, R.J. Deeth Inorg. Chem. 2012, 51, 6830-6841.
[3] (a) J.S. Butler, J.A. Woods, N.J Farrer, M.E. Newton, P.J. Sadler J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 16508-16511;
(b) F. Barragán, P. López-Senín, L. Salassa, S. Betanzos-Lara, A. Habtemariam, V. Moreno, P.J. Sadler, V.
Marchán J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 14098-14108.
[4] (a) Y. Fu, A. Habtemariam, A.M. Pizarro, S.H. van Rijt, D.J. Healey, P.A. Cooper, S.D. Shnyder, G.J.
Clarkson, P.J. Sadler J. Med. Chem. 2010, 53, 8192-8196; (b) Y. Fu, A. Habtemariam, A.M.B.H. Basri, D.
Braddick, G. Clarkson, P.J.Sadler Dalton Trans. 2011, 40, 10553-10562; (c) S.D. Shnyder, Y. Fu, A.
Habtemariam, S.H. van Rijt, P.A. Cooper, P.M. Loadman, P.J. Sadler MedChemComm 2011, 2, 666-668.
[5] (a) Z, Liu, A. Habtemariam, A. Pizarro, S. Fletcher, A. Kisova, O. Vrana, L. Salassa, P. Bruijnincx, G.
Clarkson, V. Brabec, P.J. Sadler J. Med. Chem. 2011, 54, 3011-3026; (b) Z. Liu, L. Salassa, A. Habtemariam,
A.M. Pizarro, G.J. Clarkson, P.J. Sadler Inorg. Chem. 2011, 50, 5777-5783; (c) Z. Liu, A. Habtemariam, A.M.
Pizarro, G.J. Clarkson, P.J. Sadler Organometallics 2011, 30, 4702–4710.
[6] S. Betanzos-Lara, Z. Liu, A.M. Pizarro, B. Qamar, A. Habtemariam, P.J. Sadler Angew. Chem. Int. Ed. 2012,
51, 3897-3900.

Présentations Orales

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Elise ROMAIN
La chimie des hélicènes : synthèse et applications
Directeurs de thèse : Fabrice Chemla & Alejandro Pérez-Luna
Equipe Synthèse Sélective et Organométalliques
Institut Parisien de Chimie Moléculaire
Université Pierre et Marie Curie
elise.romain.enscr@gmail.com
Les hélicènes constituent une famille de composés aromatiques polycycliques dont le
squelette est composé de noyaux aromatiques fusionnés. On distingue deux catégories
générales au sein de cette famille, à savoir les carbohélicènes, dont le squelette est constitué
uniquement de benzènes, et les hétérohélicènes qui incluent au moins un hétéroatome dans
leur squelette. Ces molécules se caractérisent par leur géométrie hélicoïdale tout à fait
particulière qui induit alors leur chiralité, bien qu’elles ne présentent aucun carbone
asymétrique ou autre centre chiral au sein de leur structure. Ainsi il existe deux énantiomères
caractérisés par les préfixes P et M, les (P)-hélicènes ayant un pas droit et les (M)-hélicènes
ayant un pas gauche.
Il existe différentes voies de synthèse pour les hélicènes. La méthode la plus courante
est la photocyclisation. 1 En effet, il s’agit d’une voie permettant d’obtenir des hélicènes ou
dérivés en relativement peu d’étapes. 2 D’autres méthodes de synthèse consistent à utiliser des
réactions de Diels-Alder, de Friedel-Crafts, ou encore de métathèse. 3 Durant ces dernières
années, les cyclisations [2+2+2] catalysées par des métaux se sont avérées constituer une voie
de synthèse intéressante pour les hélicènes. 4a,b Nous nous pencherons donc particulièrement
sur ce type de réactions.
Enfin, les hélicènes possèdent certaines applications intéressantes que nous
développerons brièvement.
1 Flammang, M.; Nasielsk, J.; Martin, R. H. Tetrahedron Lett. 1967, 8, 743.
2 Martin, R. H. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1974, 13, 649.
3 Shen, Y.; Chen, C.-F. Chem. Rev. 2012, 112, 1463.
4 (a) Sehnal, P.; Stará, I. G.; Šaman, D.; Tichý, M.; Mĩsek, J.; Cvačka, J.; Rulĩsek, L.; Chocholousova, J.; Vacek,
J.; Goryl, G.; Szymonski, M.; Císařová, I.; Starý, I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 13169. (b) Donovan,
P.M.; Scott, L.T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3108.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Coralie TUGNY
Synthetic approaches to angular triquinanes
Louis Fensterbank
Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM) - UMR 7201
4, Place Jussieu, 75252 Paris Cedex 05
louis.fensterbank@upmc.fr
Angular triquinane sesquiterpenes constitute an important class of natural products,
with both their structural and biological properties being attractive. Thus, there has been
significant interest in the construction of their highly condensed framework 1
for the
construction of which the strategies described in the literature are extremely various. 2 Most of
them are employing cycloaddition reactions, either metal-catalyzed or not, as they certainly
are among the most efficient reactions in producing increased molecular complexity. 3 Radical
chemistry offers the possibility of cascade reactions. In particular, tandem 5-exo-trig radical
cyclizations allow rapid access to the angular triquinane framework. 4
Electrocyclization
reactions are much less represented. One nonetheless constitutes a particularly impressive
scaffolding. 5
1 Pierre, M.-C., Tenaglia, A., Santelli, M. Tetrahedron 1998, 54, 14803-14810; Singh, V., Lahiri, S. Tetrahedron
Lett. 2003, 44, 4239-4242; Srikrishna, A., Gowri, V. Tetrahedron: Asymm. 2011, 22, 1553-1559; Seo, J., Fain,
H., Blanc, J.-B., Montgomery, J. J. Org. Chem. 1999, 64, 6060-6065; Gharpure, S.J., Niranjana, P., Porwal, S.K.
Org. Lett. 2012, 14, 5476-5479.
2 Mehta, G., Srikrishna, A. Chem. Rev. 1997, 97, 671-719.
3 Meyer, C., Marek, I., Normant, J.-F. Tetrahedron Lett. 1996, 37, 857-860; Renaud, J.-L., Aubert, C., Malacria,
M. Tetrahedron 1999, 55, 5113-5128; Rawal, V.H., Dufour, C. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 2613-2614;
Veenstra, S.J., De Mesmaeker, A., Ernst, B. Tetrahedron Lett. 1988, 29, 2303-2306.
4 Curran, D.P., Sisko, J., Balog, A., Sonoda, N., Nagahara, K., Ryu, I. J. Chem. Soc., Perkin Trans 1 1998, 1591-
1593; Curran, D.P., Kuo, S.-C. Tetrahedron 1987, 43, 5653-5661; De Boeck, B., Harrington-Frost, N.M.,
Pattenden, G. Org. Biomol. Chem. 2005, 3, 340-347.
5 Paquette, L.A., Doyon, J. J. Org. Chem. 1997, 62, 1723-1729.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Jean-Philippe KRIEGER
Synthèse de pyridines substituées par cycloadditions [4+2]
Christophe Meyer, Janine Cossy
Laboratoire de Chimie Organique de l’ESPCI ParisTech
10 rue Vauquelin – 75231 PARIS Cedex 05
jean-philippe.krieger@espci.fr
Les pyridines substituées sont rencontrées dans un grand nombre de molécules
biologiquement actives, en particulier en pharmacologie et en agrochimie. 1 La plupart des
voies d’accès aux pyridines reposent soit sur la condensation de composés carbonylés avec
des nucléophiles, soit sur des cycloadditions. La réaction de Diels-Alder est suffisamment
flexible pour être appliquée à une large variété de substrats pour accéder aux pyridines.
Dans la majorité des cas, la cycloaddition [4+2] initiale fait intervenir un azadiène
hétéroaromatique (voies a – e) ou non (voies f, g) et un alcyne ou un alcène comme
diénophiles partenaires. 2 L’utilisation d’hétérodiénophiles tels que des nitriles est moins
répandue (voie h) et représente un défi en l’absence de groupe électroattracteur activant
(R = Ts, CO 2 R, CCl 3 ). 3
Les différentes voies d’accès aux pyridines faisant intervenir une cycloaddition [4+2]
comme étape-clé seront présentées et discutées.
1 Henry, G. D. Tetrahedron 2004, 60, 6043.
2 Boger, D. L. Chem. Rev. 1986, 86, 781.
3 Ohashi, M.; Takeda, I.; Ikawa, M.; Ogoshi, S. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 18018.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Avassaya VANITCHA
The Synthesis of Macrocyclic Schiff Bases
Pr. Louis Fensterbank, Dr. Virginie Mouriès-Mansuy
Institut Parisien de Chimie Moléculaire
4 place Jussieu
Bâtiment F, 2 éme étage
75005 Paris
avassaya.vanitcha@upmc.fr
Schiff bases are widely studied and utilized in both organic and metal ion
complexations. These bases are generally obtained from the condensation of carbonyl
compounds and amine derivatives. Interestingly, Schiff base macrocycles are very important
in macrocyclic, biological and supramolecular chemistry. A huge number of Schiff base
macrocycles can be applied to be host-guest receptors and metal template agents. The design
and optimization of symmetrical and unsymmetrical macrocyclic Schiff base have been
studied. 1 For example, symmetric aliphatic derivatives of hydrazinophyrine have been
developed to be liquid crystals in order to be applied in display optoelectronic devices. 2
Unsymmetrical new ligands 2,6-bis{[bis-(2-aminoethyl) ethylamino]methyl}phenol behaves
as hexaprotic base and as monoprotic acid and have coordination properties toward some
metal transition cations. 3 In additions, macrocyclic ligand Schiff bases such as polypyrrolic
2,5-diamidothiophenes can be used as biological anion receptors effectively. 4
3,4-dialkoxy-2,5-diformylpyrroles
with Hydrazine 2
2,6-bis{[bis-(2-aminoethyl)
ethylamino]methyl}phenol 3
Polypyrrolic 2,5-
diamidothiophene 4
1. Borisova, N.E; Reshetova, M.D.; Ustynyuk, Y.A., Chem. Rev., 2007, 107, 46-79.
2. Sessler, J. L.; Callaway, W.; Dudek, S. P.; Date, R. W.; Lynch, V.; Bruce, D. W. Chem. Commun. 2003, 2422.
3. Ambrosi, G.; Formica, M.; Fusi, V.; Giorgi, L.; Guerri, A.; Micheloni, M.; Pontellini, R.; Rossi, P.
Polyhedron 2003, 22, 1135.
4. Sessler, J. L.; Roznyatovskiy, V.; Pantos, G. D.; Borisova, N. E.; Reshetova, M. D.; Lynch, V. M.;
Khrustalev, V. N.; Ustynyuk, Yu. A. Org. Lett. 2005, 7, 5277.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Baba Wandiam Maiga
Méthodes non Enzymatiques de Désymétrisation de 1, w Diols
Encadrant(s): Dr Andrei Corbu, Pr Janine Cossy
ESPCI, 10 rue Vauquelin, 75231 Paris
Andrei Corbu , Janine Cossy
Les 1, w diols sont des unités structurales très fréquemment rencontrées les produits
naturels, d’ou l’intérêt de mettre au point des méthodes efficaces pour les préparer. L’accès à
des diols énantioénrichis a été principalement exploré par voie enzymatique. Récemment,
l’organocatalyse et la catalyse organométallique, se sont avérées des méthodes efficaces et
complémentaires aux méthodes enzymatiques pour réaliser la désymétrisation
énantiosélective de diols méso (DEDM). 1 Au cours de notre exposé nous présenterons des
nouvelles méthodes de désymétrisation de diols méso et un accent sera mis sur les différents
types de catalyseur mis au point, tout en comparant les méthodes organométalliques avec les
avec les méthodes enzymatiques.
1 Enríquez-García, Á.; Kündig, E. P. Chem. Soc. Rev. 2012, 41, 7803–7831; Zhao, Y.; Rodrigo, J.; Hoveyda, A.
H.; Snapper, M. L. Nature 2006, 443, 67–70.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Elodie BRUN
Méthodes de formation de spirocétals et exemples
d’application en synthèse totale
Pr Janine COSSY, Pr Véronique BELLOSTA
Laboratoire de Chimie Organique de l’ESPCI
10, rue Vauquelin - 75231 PARIS Cedex 05
elodie.brun@espci.fr
Le motif spirocétalique est présent dans de nombreux produits naturels, d’origines
diverses et d’intérêt biologique, tel que l’acide okadaïque (Figure 1). 1
Figure 1 : Acide okadaïque
La méthode traditionnelle pour préparer les motifs spirocétaliques consiste à
déshydrater une dihydroxycétone, en milieu acide (Schéma 1, voie a). 2 Cependant cette
méthode, qui conduit au spirocétal thermodynamiquement le plus stable, peut se révéler
problématique vis-à-vis de certains groupes fonctionnels, en raison des conditions acides
utilisées.
De nouvelles méthodes de synthèse de spirocétals, catalysées par des métaux de
transition, ont été développées, notamment à partir d’alcyne-diols ou d’époxyalcynes
(Schéma 1, voie b). 3 Elles offrent une plus grande tolérance fonctionnelle, et la possibilité
d’accéder également à des stéréoisomères qui ne sont pas toujours les plus stables. Ces
diverses méthodes seront présentées, ainsi que leur application en synthèse totale.
Schéma 1
1 Tsukitani Y.; Scheuer P.J. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 2469-2471.
2 Perron F.; Albizati K.F. Chem. Rev. 1989, 89, 1617-1661.
3 Palmes J.A.; Aponick A. Synthesis 2012, 44, 3699-3721.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Quentin DUMONT
Fonctionnalisation des stéroïdes pour leur analyse par GC/MS
Directeur de thèse : Richard Cole
Institut Parisien de Chimie Moléculaire – Equipe Spectrométrie de Masse
4 place Jussieu, 75252 Paris cedex 5
quentin.dumont@upmc.fr
Les stéroïdes sont des composés naturellement présents dans l’organisme, dont la
fonction est de réguler certaines activités biologiques, comme les cycles hormonaux ou la
croissance des muscles. L’abus de stéroïdes (notamment anabolisants) dans le monde du
sport, afin d’artificiellement accroitre les performances des athlètes, pose un problème à la
fois éthique et de santé. La chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de
masse (GC/MS) est actuellement la technologie la plus utilisée pour l’analyse des stéroïdes
exogènes, grâce à ses excellentes performances et à la rapidité d’obtention des résultats. 1
Cependant, la plupart des stéroïdes sont des composés neutres peu volatils, et donc
difficiles à analyser par GC. De ce fait, le plan d’analyse des stéroïdes inclut
systématiquement une étape de fonctionnalisation afin d’améliorer leur comportement
chromatographique et leur détection. Parmi les réactions disponibles (alkylation, acylation,
dransylation, silylation), cette dernière est de loin la méthode la plus employée car elle allie
une préparation facile à un large choix de réactifs. 2
importante la volatilité des composés modifiés.
La silylation augmente de manière
Les stéroïdes polyfonctionnels posent le problème de la spécificité et de l’efficacité de
la silylation : la formation d’un seul dérivé conduisant à un seul ion en MS facilite le
diagnostic et permet d’obtenir une sensibilité et sélectivité maximale. Le choix du réactif en
fonction du stéroïde est donc crucial. 3
L’optimisation de la réaction passe aussi par le choix
du solvant, la présence et la nature d’un catalyseur, et le moyen de chauffage. En effet, le
développement de l’utilisation des micro-ondes pour les réactions organiques a permis une
importante diminution du temps nécessaire pour la fonctionnalisation, tout en gardant les
mêmes rendements. 4
La fonctionnalisation reste une étape fastidieuse et coûteuse, c’est pourquoi de
nouvelles techniques comme la LC/MSMS sont de plus en plus employées.
1 Thevis, M. et Schänzer, W. Mass Spectrom. Rev. 2007, 26, 79-107.
2 Shareef, A.; Angove, M.J. et Wells, J.D. J. Chromatogr. A 2006, 1108, 121-128.
3 Ding, W-H. et Chiang C-C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2003, 17, 56-63.
4 Bowden, A.J. et al. Anal. Chem. 2009, 81, 6725-6734.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Jean BOULICAULT
Fonctionnalisation de surface pour la désorption/ionisation laser
directeurs de thèse : R. B. Cole et S. Alves
Bâtiment F, 7 ème étage
4 Place Jussieu
75005 Paris
jean.boulicault@upmc.fr
L'analyse en spectrométrie de masse nécessite la production initiale d'ions. De multiples
techniques ont été expérimentées et notamment la technique de désorption laser assistée par
matrice. Cette voie d'ionisation permet d'ioniser tout type de composés dès lors que le
mélange entre l'échantillon, parfois accompagnée de sels particuliers, et de la matrice
appropriée a été mis au point.
Néanmoins de nombreux inconvénients découlent de cette technique, à commencer par
l'impérative compatibilité des solubilités des analytes et de la matrice désirée, ainsi que la
technique chronophage de préparation des échantillons. En outre les ratios analyte/matrice
sont importants et tolèrent mal les variations, c'est pourquoi l'échantillon ne peut pas être
totalement inconnu et doit être relativement pur. De plus la présence d'un bruit de fond
important créé par les molécules de matrice (généralement de petites molécules aromatiques)
rend extrêmement délicat la visualisation des molécules de faible poids moléculaire (

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Guillaume PACI
La structure des Polyketides synthases
directeur de thèse : Olivier Ploux
LABORATOIRE CHARLES FRIEDEL
ENSCP
11 rue Pierre et Marie Curie
75231 PARIS CEDEX 5
olivier-ploux@chimie-paristech.fr
Les polyketides synthases (PKS) sont de véritables chaines de montage moléculaires capables
de synthétiser de nombreuses molécules complexes dont certaines ont un intérêt
pharmaceutique important comme l’erythromycine 1,2 . Leurs mécanismes commencent à être
bien connus ainsi que la stéréochimie des composés synthétisés 3 . Comme souvent dans le cas
de molécules complexes et surtout pour des protéines, la structure des PKSs n’est pas
totalement élucidée 4,5 . C’est la raison pour laquelle nous allons nous y intéresser et essayer de
voir quelles sont les connaissances actuelles sur la structure des différentes PKSs et de leurs
domaines.
FIGURES 1. PKS responsable de l’assemblage de la 6-deoxyerythronolide B et la structure du module
de cette PKS
1 Khosla, C. J. Org. Chem. 2009, 74, 6416–6420.
2 Meier, J. L.; Burkart, M. D. Curr Opin Chem Biol 2011, 15, 48–56.
3 Kwan, D. H.; Schulz, F. Molecules 2011, 16, 6092–6115.
4 Zheng, J.; Gay, D. C.; Demeler, B.; White, M. A.; Keatinge-Clay, A. T. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 615–621.
5 Anand, S.; Mohanty, D. BMC Struct. Biol. 2012, 12, 10.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Lucie GONZALEZ
L'acide para-aminobenzoïque : découverte d'un nouveau précurseur
dans la biosynthèse de l'ubiquinone chez S. Cerevisiae
directeur(s) de thèse : Marc Fontecave et Murielle Lombard
Laboratoire de Chimie des Processus Biologiques FRE3488
11 Place Marcelin Berthelot 75005 Paris
lucie.gonzalez@college-de-france.fr
L’ubiquinone ou coenzyme Q est une molécule lipophile composée d’un noyau
benzoquinone polysubstitué et d’une chaîne polyisoprényle (Figure 1). Elle joue un rôle
essentiel dans la chaîne respiratoire des mitochondries et est un important antioxydant
liposoluble. Au minimum neuf enzymes (Coq1 à Coq9) interviennent dans sa voie de
biosynthèse qui est conservée de la levure à l’humain : il a été montré que plusieurs mutations
affectant ces gènes chez l’homme entraînent une déficience en coenzyme Q à l’origine de
divers dysfonctionnements 1 .
Figure 1 : Ubiquinone ou Coenzyme Q
Le précurseur du noyau benzoquinone dans la biosynthèse de l’ubiquinone chez
S.Cerevisiae est l’acide 4-hydrobenzoïque 2,3 (Figure 2a.) qui, après liaison de la chaîne
polyisoprényle, subit une décarboxylation, trois hydroxylations et trois hydroxylations.
Pierrel et al. ont voulu déterminer quelle était la source d’électrons des deux
monooxygénases, une flavoprotéine et une enzyme à di-fer, connues pour intervenir dans la
biosynthèse de l’ubiquinone. Pour ce faire, ils ont étudié le couple ferrédoxine/ferrédoxine
réductase Yah1p/Arh1p présent dans la matrice mitochondriale et ont isolé et caractérisé les
intermédiaires formés lorsque l’une ou l’autre de ces protéines n’était pas exprimée chez S.
Cerevisiae. Ils ont ainsi découvert que ce couple intervenait dans la première étape
d’hydroxylation du noyau quinone et qu’un autre précurseur, jusqu’alors inconnu, entrait en
compétition avec l’acide 4-hydroxybenzoïque : l’acide para-aminobenzoïque. Ainsi, une étape
supplémentaire de déamination de cet intermédiaire interviendrait dans la biosynthèse de
l’ubiquinone chez la levure 4 .
Figure 2 : a. acide 4-hydroxybenzoïque, b. acide para-aminobenzoïque.
1 Quinzii, C.M.; Hirano, M.; Dev. Disabil. Res. Rev. 2010, 16, 183-188.
2 Olson, R.E.; Springer, C.M.; Aiyar, A.S.; Gold, P.H.; Ramsey, G.; Dialameh, G.H.; Bentley, R. J. Biol. Chem
1963, 238, 3146-3148.
3 Rudney, H.; Parson, W.W. J. Biol. Chem. 1963, 238, 3137-3138.
4 Pierrel, F.; Hamelin, O.; Douki, T.; Kieffer-Jaquinod, S.; Mühlenhoff, U.; Ozeir, M.; Lill, R.; Fontecave , M.
Chemistry & Biology 2010, 17, 449-459.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Paul DEMAY-DROUHARD
Marquage paramagnétique de biomolécules. Application à la mesure
de distances nanométriques par RPE.
Directeurs de thèse : Pr Clotilde Policar, Dr Hélène Bertrand
Laboratoire des Biomolécules (UMR7203), Département Chimie, Ecole Normale
Supérieure, 24 rue Lhomond – 75005 Paris
paul.demay-drouhard@ens.fr
Le marquage de biomolécules à l’aide de sondes paramagnétiques couplé à la
résonance paramagnétique électronique (RPE) constitue un outil puissant pour l’élucidation
de la structure et de l’environnement d’une protéine dans les conditions physiologiques. 1 Ce
marquage peut s’effectuer par l’introduction de sondes nitroxyde de type MTSSL
(methanethiosulfonate spin label) sur les résidus cystéine des protéines d’intérêt (Schéma 1).
Schéma 1
Une fois incorporée dans une protéine, la dynamique d’une sonde nitroxyde est régie
par son environnement local. La forme du spectre RPE étant très affectée par le mouvement
de la sonde considérée, il est alors possible d’accéder à des informations structurales sur la
protéine.
Par ailleurs, le développement de nouvelles méthodes de RPE pulsée de type
PELDOR (pulse electron-electron double resonance) permet d’accéder à la distance intersonde
quand celle-ci est comprise entre 2 et 80 nm. 2 La déconvolution mathématique du
spectre RPE d’un échantillon gelé permet en effet d’extraire uniquement le couplage spin-spin
entre les deux sondes, et ainsi de remonter à la distance entre celles-ci.
1 Klare, J.P.; Steinhoff, H.-J. Photosynth. Res. 2009, 102, 377–390.
2 Schiemann, O.; Piton, N.; Mu, Y.; Stock, G.; Engels, J.W.; Prisner, T.F. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5722–
5729.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Laure L’HARIDON
Quelques exemples d’application biomédicale utilisant
des nanoparticules d’oxyde de fer, SPION.
directeur de thèse : Jean Maurice MALLET
Laboratoire des biomolécules, 24 rue lhomond, 75005 PARIS
Laure.lharidon@etu.upmc.fr
Les nanoparticules superparamagnétiques d’oxyde de fer ont reçu beaucoup
d’attention dernièrement du fait de leur possible vaste champ d’applications. Il s’agit de
structure ayant un coeur d’oxyde de fer entouré d’une couche de polymères fonctionnalisés
qui permet, entre autres, de rendre ces nanoparticules biocompatibles et actives
biologiquement. Ces dernières pourraient révolutionner l’oncologie en alliant un ciblage
efficient des cellules cancéreuses via des peptides spécifiques accrochés sur l’enveloppe
polymérique des nanoparticules et un moyen de destruction efficace due aux propriétés
d’hyperthermie de l’oxyde de fer. Quelques applications dans le domaine biomédical vont
1, 2, 3
ainsi être présentées.
Structure simplifiée des nanoparticules d’oxyde de fer.
(http://tpe-nanotech.eklablog.fr/i-les-nanomateriaux-et-nano-objets-p35007)
1 Zhou, L.; Yuan, J.; Wei Y. Core-shell structural iron oxide hybrid nanoparticules : from controlled synthesis to
biomedical applications. J. Mater. Chem. 2011, 21, 2823-2840.
2 Oh, J. K. ; Park, J. M. Iron oxide-based superparamagnetic polymeric nanomaterials : Design, preparation, and
biomedical application. Progress in Polymer Science. 2011, 36, 168-189.
3 Mahmoudi M.; Sant, S.; Wang, B.; Laurent S.; Sen, T. Superparamagnetic iron oxide nanoparticules
(SPIONs) : Development, surface modification and applications in chemotherapy. Advanced Drug Delivery
Reviews. 2011, 63, 24-46.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Pinglu ZHANG
Bridged Cyclodextrin-Metal Complexes
Directeurs de thèse : Yongmin Zhang, Mickaël Ménand, Matthieu Sollogoub
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6, IPCM (UMR-CNRS 7201), 4 place Jussieu,
Bâtiment F/74, 75005 Paris, Paris
zhangpinglu@hotmail.com
The Combination of a cyclodextrin (CDs) with a metal was first reported by T. Osa in
1985 1 . Over these years it has proven a very attractive goal means to achieve highly selective
and efficient catalysis. 2 Position of the metal in respect to the cavity appears to be essential to
fully exploit the intrinsic properties. Two methods to place the metal at the bridge of the
cavity have been explored: either the ligand is capped the cavity or it is the metal that covers
it. 3
Figure. 1 Different kinds of bridged-cyclodextrin complexes
Different systems of metal-cyclodextrin complexes have been extensively investigated by
Matt et al. 4 We will explain the various possibilities developed in the literature.
1 A, Ueno, F. Moriwaki, T. Matsue, T. Osa, Makromol. Chem. Rapid commun. 1985, 6, 231;
2 E. U. Akkaya, A. W. Czarnik, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 8553-8554;
3 A. Dominique, M. Dominique, P. Frederic, L. Pierre, Eur. J. Inorg. Chem, 2003, 805-809 ;
4 E. Eric, A. Dominique, M. Dominique, Chem. Rev. 2003, 103, 4147

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Jean-Philippe Porcher
Les photosensibilisateurs : classification, mécanisme et intérêt en
catalyse inorganique
directeur(s) de thèse : Pr.Marc Fontecave
11, place Marcelin Berthelot
75231 Paris Cedex 05
jean-philippe.porcher@etu.upmc.fr
Les photosensibilisateurs sont des espèces chimiques qui sous irradiation lumineuse
passent d’un état fondamental à un état excité. Le retour à l’équilibre de ces molécules fait
intervenir différents mécanismes avec le passage d’un électron par un état excité singulet ou
triplet suivi par l’émission de fluorescence ou de phosphorescence. Cet état triplet métastable
est dans certaines conditions réactif et permet des réactions de transfert électronique. 1
Ces molécules ont un intérêt tout particulier dans les réactions de photocatalyse. Ce type de
réaction implique différents acteurs comme des donneurs d’électron sacrificiels, une molécule
photoactivable, un catalyseur et son substrat. 2
Figure 3: Schéma simplifié d'un système de photoréduction
Le photosensibilisateur Ru(bpy) 3 a été très largement étudié et est couramment utilisé en
photocatalyse inorganique. Il permet à la fois des réactions de photooxydation et de
photoréduction. Dans cette présentation, nous nous intéresserons aux catalyseurs moléculaires
photoinduits, à l’origine de l’oxydation ou de la réduction d’H 2 O et aux possibles applications
dans le domaine de la photosynthèse artificielle. 3,4,5,6
Figure 4 : Photooxydation et photoréduction de l’eau catalysée par des complexes inorganiques
1 Bioinorganic Photochemistry, Photophysical Deactivation of Electronic Excited States, 2009, 25-33
2 Account. Chemical. Research., 1980,13, 83-90
3 Energy Environ. Sci., 2012, 5, 6012
4 Chem. Soc. Rev., 2012, 41, 7572–7589
5 Inorg. Chem. 2010, 49, 209–215
6 ChemCatChem ,2012, 4, 1746 – 1750

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Frida Nzulu
« Smart Polymers »: Synthetic stimuli-responsive polymers
combining temperature and light responsiveness
PhD advisor: Dr. Jean-Philippe Goddard
Dr. Marion Barbazanges, Pr. Louis Fensterbank, Dr. Cyril Ollivier,
Dr. Marc Petit, Dr. Jutta Rieger, Dr. François Stoffelbach
Institut Parisien de Chimie Moléculaire, Bâtiment F, 2 ème étage, 75252 Paris cedex 05
frida.nzulu@upmc.fr
Stimuli-responsive polymers are macromolecules that undergo structural
modifications in response to variations of physical, chemical or biochemical environment. 1
New methods for the polymerization of functional monomers have been developed within the
last decades. In this context, these materials are playing an increasing role in the field of
nanomedicine, nanoscience and nanotechnology. 2
Fig.1 Schematic model of the photo-responsive enzyme switch using temperature and
light-responsive copolymer.
Their synthesis will be presented and a special attention will be paid to the
combination of temperature and light-responsive stimuli (see Fig.1). Examples of promising
applications will be discussed during this presentation.
1 (a) Jochum, F. D; Theato P. Chem. Soc. Rev. 2012, doi: 10.1039/c2cs35191a. (b) Gil, E. S.; Hudson, S. M.
Prog. Polym. Sci. 2004, 29, 1173-1222.
2 (a) Stayton, P. S.; Shimoboji, T.; Long, C.; Chilkoti, A.; Ghen, G.; Harris, J. M.; Hoffman, A. S. Nature 1995,
378, 472-474. (b) Stuart, M. A. C.; Huck, W. T. S.; Genzer, J.; Muller, M.; Ober, C.; Stamm, M.; Suhorukov,
G.B.; Szleifer, I.; Tsukruk, V; Urban, M.; Winnik, F.; Zauscher, S.; Luzinov, I.; Minko, S. Nat. Mater. 2010, 9,
101-113. (c) Liu, F.; Urban, M. W. Prog. Polym. Sci.2009, 35, 3-23. (d) Urban, M. W. Prog. Polym. Sci. 2009,
34, 679-687. (e) Roy, D.; Cambre, J. N.; Sumerlin, B. S. Prog. Polym. Sci. 2010, 35, 278-301.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Dmitri COLESNIC
Polymères supramoléculaires à base de cyclodextrines
Directeur de thèse : Pr. Matthieu SOLLOGOUB
Encadrant : Dr. Mickaël MENAND
Institut Parisien de Chimie Moléculaire, équipe GOBS
4, Place Jussieu, 75005 Paris, Bât. F 2ème étage
dmitri.colesnic@upmc.fr
Depuis l’introduction du concept de chimie supramoléculaire 1 par J.-M. Lehn dans les années
‘90, de nombreux polymères supramoléculaires ont été développés.
Les polymères supramoléculaires sont définis 2 comme « des polymères basés sur des
interactions intermoléculaires non-covalentes comme les liaisons hydrogènes, la coordination
métal-ligand et les interactions hôte-invité ». Ils sont ubiquitaires dans la nature 2 , plus
particulièrement dans les systèmes biologiques (microtubules, microfilaments, etc.).
Des exemples de polymères supramoléculaires seront présentés pour chaque type
d’interaction, avec une attention particulière pour l’interaction hôte-invité 3 qui constitue
l’interaction de base des polymères supramoléculaires à base de cyclodextrines 4 .
N x
Polymère supramoléculaire à base de 3-cinnamoyl-α-cyclodextrine
1 J.-M. Lehn, Supramolecular Chemistry: Concepts and Perspectives 1995 (VCH:Weinheim).
2 T. F. A. De Greef, M. M. J. Smulders, M. Wolffs, A. P. H. J. Schenning, R. P. Sijbesma, E. W. Meijer, Chem.
Rev. 2009, 109, 5687
3 Soto Tellini, V. H., Jover, A., García, J. C., Galantini, L., Meijide, F., Tato, J. V., J. Am. Chem. Soc. 2006, 128,
5728.
4 Harada, A., Takashima, Y., Yamaguchi, H. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 875

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Siddhartha De
N-heterocyclic carbene in olefin metathesis réaction
directeurs de thèse :Rodrigue Lescouezec & Alexandrine Flambard
Université Pierre et Marie Curie Paris 6,
4 Place Jussieu, 75252 Paris cedex 5
Bât F74 4eme ETG case 42
siddharthade2010@gmail.com
In recent past metal-catalyzed olefin metathesis has appeared as the most powerful method for
carbon–carbon bond formation in organic chemistry. 1 The development of catalysts since the
initial discoveries of the early 1990s has been tremendous: molybdenum, tungsten and
ruthenium catalysts have proved to be very fruitful metals for this type of reaction. The
discovery of the ruthenium alkylidene complex 1 by Grubbs 2 , combining high catalytic
activity and remarkable tolerance towards polar functional groups, was a breakthrough and
has triggered extensive research activities in this field. 3 The substitution of phosphine ligands
by N-heterocyclic carbenes (NHC) represents a remarkable improvement with respect to the
catalytic activity. 4 However, despite this progress, ruthenium complexes 1 and 3 do not
generally allow the formation of tri- and tetra-substituted double bonds by ring-closing
metathesis (RCM); only Schrock’s tetra-coordinated alkylidene species, such as 2, can
promote such reactions efficiently.
F 3 C CF 3
Ph
Cl
Cl
PCy 3
Ru
PCy 3
Ph
F 3 C
O
Mo
O
CF 3
N
Cl
Cl
PCy 3
Ru
O
[1] Grubbs 1
[2]Schorck's Catalyst
[3] Hoveyda-Grubbs
(1)For reviews on catalytic olefin metathesis see: (a) Grubbs, R. H., Miller, S. J.,Fu, G. C. Acc. Chem.Res.
1995, 28, 446. (b) Schmalz, H.-G. Angew. Chem. Int.Ed. 1995, 34, 1833. (c) Schuster, M.,
Blechert, S. Angew. Chem. Int. Ed.
(2) (a) P. Schwab, M.B. France, J.W. Ziller, R.H. Grubbs, Angew.Chem. 107 (1995) 2179. (b) P. Schwab, M.B.
France, J.W. Ziller,R.H. Grubbs, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34 (1995) 2039.
(3) (a) D.M. Lynn, S. Kanaoka, R.H. Grubbs, J. Am. Chem. Soc.118 (1996) 784. (b) C. Fraser, R.H. Grubbs,
Macromolecules 28(1995) 7248.
(4) (a) W.A. Herrmann, C. Kocher, Angew. Chem. 109 (1997) 2256. (b) W.A. Herrmann, C. Kocher, Angew.
Chem. Int. Ed. Engl. 36(1997) 2162

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Marc Perez
Les acides carboxyliques comme substrats pour la formation de
liaisons C-C catalysée par les métaux de transition
Directrice de thèse : Dr.Virginie VIDAL
Laboratoire Charles Friedel UMR 7223
Chimie ParisTech
11 rue Pierre et Marie Curie
75005 Paris
marc-perez@etu.chimie-paristech.fr
Ces dernières années, les acides carboxyliques ont été utilisés dans des réactions
catalysées par les métaux de transitions pour la formation de liaisons C-C. 1 De nombreux
acides carboxyliques sont commercialement disponibles et peuvent offrir une alternative
économique intéressante par rapport aux acides boroniques utilisés dans la synthèse de
composés biphényles en limitant la quantité de déchets générés.
Dans ce contexte, de nouvelles méthodes ont été développées afin d’étendre le champ
d’application de ce type de réaction. 2
Les principales méthodes développées seront présentées afin de démontrer le
potentiel de ces réactions.
1 Goossen, L.J. ; Deng, G. ; Levy, L. M. Science, 2006, 313, 622.
2 Goossen, L.J. ; Zimmerman, B. ; Linder, C. Angew. Chem. Int. Ed., 2008, 47, 7103. Zhang, F.; Greaney, M. F.
Org. Lett., 2010, 12, 4745. Voutchoka, A.; Coplin, A.; Leadbeater, N. E.; Crabtree, R. H. Chem Comm., 2008,
6312. Myers, A. G.; Tanaka, D.; Mannion, M. R., J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 11250.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Fabien SERPIER
Carbocyclisations catalytiques en cascade initiées par
les dérivés du bore
directeur de thèse : Dr Sylvain Darses
Laboratoire Charles Friedel E.N.S.C.P. Chimie ParisTech
11, rue Pierre et Marie Curie 75005 Paris
fabien-serpier @chimie-paristech.fr
sylvain-darses@chimie-paristech.fr
Le développement de nouvelles réactions conduisant à des structures originales par
formation de liaisons carbone-carbone représente un véritable challenge en synthèse. Parmi
d’autres, les réactions de carbocyclisation en cascade sont des moyens efficaces pour accéder
rapidement à des carbocycles ou des hétérocycles, en permettant la formation successive de
plusieurs liaisons carbone-carbone 1 . Depuis quelques années, des méthodologies
complémentaires sont apparues, via des réactions en cascade initiées par les dérivés du bore
catalysées par le palladium 2 ou le rhodium 3 .
Les molécules qui possèdent deux ou plusieurs liaisons insaturées sont des substrats
particulièrement intéressants pour ce type de réaction, impliquant la formation de multiples
liaisons carbone-carbone avec un seul catalyseur en une seule opération, ce qui permet la
construction d’une variété de composés cycliques (schéma). Le groupe fonctionnel le plus
réactif fournit le point d’entrée pour l’addition d’un nucléophile carboné (ici [Rh-R] ou [Pd-
R]) issu de la transmétallation de R-M sur le rhodium) via une première réaction de
carbométallation intermoléculaire, ce qui déclenche la seconde carbométallation
intramoléculaire de la fonctionnalité la moins réactive pour construire un squelette cyclique.
Schéma
Au cours de cette présentation, nous aborderons différents exemples de cyclisation en
cascade catalysées par le rhodium et le palladium en présence d’organoboranes. Des versions
énantiosélectives seront également exposées.
1 P.Y. Toullec, V. Michelet, Top. Curr. Chem. 2011, 302, 31-80; N.T. Patil, Y. Yamamoto, Chem. Rev. 2008,
108, 3395-3442.
2 K. Shen, X. Han, X. Lu, Org. Lett. 2012, 14, 1756-1759.
3 T. Miura, M. Murakami, Chem. Commun. 2007, 217-224.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Kévin LAFAYE
Trifluorométhylation aromatique : avancées récentes
Pr. Janine COSSY, Dr. Sébastien REYMOND
Laboratoire de Chimie Organique ESPCI ParisTech, 10 Rue Vauquelin 75231 PARIS Cedex 05
Kevin.lafaye@espci.fr
Les composés aromatiques et hétéroaromatiques substitués par un groupement
trifluorométhyle (CF 3 ) sont des motifs importants en chimie agroalimentaire et
pharmaceutique. 1 En effet, l’incorporation d’un groupement CF 3 dans une molécule est une
stratégie largement utilisée pour moduler les propriétés pharmacologiques d’un principe
actif, 2 notamment pour augmenter la stabilité métabolique, la lipophilicité ou la sélectivité.
Il existe de nombreuses méthodes qui permettent d’introduire un groupement CF 3 sur des
composés aromatiques, mais ces méthodes requièrent généralement des conditions de réaction
drastiques et ne tolèrent qu’une faible variété de substrat. 3
Bien qu’il existe quelques méthodes catalysées par le palladium, les progrès récents les
plus significatifs ont été obtenus grâce à l’utilisation d’espèces cuivreuses ou de catalyseurs
au cuivre. Au cours de cet exposé, nous présenterons les dernières avancées en
trifluorométhylation aromatique faisant intervenir des méthodes plus sélectives, plus douces
et avec un champ d’application plus vaste. 4
Schéma : Introduction directe d'un groupement trifluorométhyle
1 S. K. Ritter, Chem. Eng. News 2012, 90, 10-17
2 J. P. Bégué, D. Bonnet-Delpon, Bioorganic and Medicinal Chemistry of Fluorine, Wiley-Interscience, New
Jersey, 2008.
3 a) M. S. Miehn, E. Vinogradova, A. Togni, J. Fluorine Chem. 2010, 131, 951. b) D. A. Nagib, D. W. C.
MacMillan, Nature 2011, 480, 224
4 T. Liu, Q. Shen, Eur. J. Org. Chem. 2012, 6679-6687

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Gaël TRAN
Couplages croisés appliqués à la formation de liaisons C(sp 2 )-P
Encadrants: Pr. Janine Cossy et Dr. Domingo Gomez Pardo
Laboratoire de Chimie Organique – UMR 7084
ESPCI
10, rue Vauquelin, 75231 PARIS Cedex 05
gael.tran@cpe.fr
Les ligands phosphorés sont d’une grande importance pour réaliser des réactions de couplage
C-C, C-O et C-N catalysés par les métaux de transition. De plus, l’efficacité des composés
organophosphorés comme agents biocides dans l’industrie agroalimentaire n’est plus à
démontrer. 1 Il est donc important de mettre au point des méthodes efficaces pour accéder à
ces composés phosphorés, et la catalyse par les métaux de transition est récemment apparue
comme une alternative séduisante par rapport aux approches présentes jusque là. 2 La
formation de liaisons C(sp 2 )-P par couplage de dérivés halogénés avec des dérivés phosphorés
catalysée par des métaux de transition sera présentée et discutée.
1 a) D.E.C. Corbridge Phosphorous – An outline of its Chemistry, Biochemistry and Technology 4th Ed.
Amsterdam : Elsevier 1990. b) J.R. Reigart, J.R. Roberts Recognition and Management of Pesticide Poisonings
5 th Ed. U.S.A.:EPA 1999.
2 Pour plusieurs reviews sur ce sujet, voir : a) F.M.J. Tappe, V.T. Trepohl, M. Oestreich Synthesis 2010, 18,
3037-3062. b) A.L. Schwan Chem. Soc. Rev. 2004, 33, 218-224.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Mehdi AMOURA
Applications in vivo de la réaction bio-orthogonale de cycloaddition
1,3 dipolaire catalysée par le cuivre : CuAAC
Fabienne Burlina et Sandrine Sagan
Laboratoire des Biomolécules, UMR 7203, Bât F 7 e étage, UPMC
mehdi.amoura@upmc.fr
Les chimistes et biologistes sont de plus en plus amenés à interagir les uns avec les
autres afin de développer de nouvelles méthodologies et de nouveaux outils permettant
l’étude des biomolécules tels que les protéines (récepteurs ou enzymes), les acides nucléiques
ou encore les lipides, dans leur contexte naturel. Ces dernières années, la modification chimio
sélective de biomolécules a été largement documentée dans la littérature [1]. Ainsi, à travers
l’identification de telle réactions, capables de cibler une fonctionnalité particulière en
présence d’une multitude d’autres groupement fonctionnels, il est aujourd’hui possible
d’étudier des événements cellulaires à l’échelle moléculaire.
Ces réactions bio-orthogonales trouvent ainsi des applications immédiates dans le
développement d’agents pour l’imagerie moléculaire ou de sondes pour la protéomique
fonctionnelle. Parmi ces réactions, la réaction de cycloaddition 1,3 dipolaire entre un dérivé
azoture et un dérivé alcyne est devenue la réaction bio-orthogonale par excellence [2].
figure : Réaction de cycloaddition 1,3 dipolaire entre un azoture et un alcyne
__________________________
[1] E.M. Sletten, C.R. Bertozzi, Bioorthogonal chemistry: fishing for selectivity in a sea of functionality, Angew
Chem Int Ed Engl 48 (2009) 6974-6998.
[2] V.V. Rostovtsev, L.G. Green, V.V. Fokin, K.B. Sharpless, A stepwise huisgen cycloaddition process:
copper(I)-catalyzed regioselective "ligation" of azides and terminal alkynes, Angew Chem Int Ed Engl 41 (2002)
2596-2599.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Marine BEZAGU
La chimie click non-catalysée : un avenir pour la chimie
bioorthogonale ?
Pr Janine Cossy (LCO), Dr Stellios Arseniyadis (LCO), Pr Patrick Tabeling (MMN)
Laboratoire de Chimie Organique et Laboratoire Microfluidique, Mems et Nanostructures –
ESPCI ParisTech, 10 rue Vauquelin, 75005 Paris
marine.bezagu@gmail.com
La cycloaddition entre un alcyne et un azoture catalysée au cuivre, connue sous le nom de
cycloaddition de Huisgen, est également désignée sous le nom de « chimie click » par K. B.
Sharpless et coll. dans les années 2000. 1 L’intérêt pour la chimie click a été avivé par
l’introduction du concept de « chimie bioorthogonale » par C. Bertozzi, 2 puisque cette
réaction peut avoir lieu in vivo sans interférer avec les processus biochimiques du vivant.
Comme la toxicité du cuivre pour les organismes vivants a été établie, de nouveaux types de
cycloadditions sans catalyse ont été développés. Dans ce cas, c’est la structure même des
substrats qui permet à la réaction de prendre place, en particulier dans le cas des alcynes
tendus tels que les cyclooctynes. 3 Le défi pour les chimistes est alors de synthétiser des
composés donnant lieu à des vitesses de click toujours plus rapides.
R
N
R'N 3 N N
R'
R
Δ ou cat.
180° R 120° R
N
N N
R'
R'N 3
160°
120°
Dans cet exposé, nous décrirons des exemples de cyclooctynes et leurs propriétés respectives,
puis nous présenterons d’autres dipôles que les azotures, comme les nitrones 4 ou les
tétrazines, et enfin les possibilités qui s’ouvrent pour la chimie in vivo seront évoquées.
1 Kolb, H. C.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 2004-2021
2 Perscher, J. A.; Bertozzi, C. R. Nat. Chem. Biol. 2005, 1, 13-21.
3 Jewett, J. C.; Bertozzi, C. R. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 1272-1279.
4 McKay, C. S.; Moran, J.; Pezacki, J. P. Chem. Commun. 2010, 46, 931-933

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Yann LAMOTTE
Fragment Based Drug Design : Concept et développements récents.
Philippe Karoyan
UMR 7203 Laboratoire des BioMolécules
Ecole Normale Supérieure - Département de Chimie
24, Rue Lhomond -75252 Paris Cedex 05
yann.2.lamotte@gsk.com
Afin d’enrayer le déclin de la productivité rencontré depuis quelques années par la recherche
pharmaceutique de nouvelles approches sont nécessaires pour réduire l’attrition des candidats
médicaments lors des phases de développement préclinique et clinique. Les analyses
rétrospectives concernant l’arrêt du développement de ces candidats médicaments, ont mis en
évidence que les propriétés physico-chimiques de la molécule ont un impact significatif sur
les propriétés pharmacocinétiques, le métabolisme ou encore une toxicité éventuelle. 1,2
Il est maintenant bien établi que pour optimiser les chances de succès de découverte d’une
nouvelle molécule active, le chimiste médicinal doit s’astreindre à travailler dans un espace
chimique défini (poids moléculaire, lipophilie) afin d’optimiser les critères de dévelopabilité
du composé.
Dans cette optique, l’utilisation de l’approche fragment (Fragment Based Drug Discovery)
complète efficacement l’approche par criblage à haut débit (High Troughput Screening) pour
identifier de nouvelles têtes de série (Lead). 3
Cette approche consiste à identifier des ligands de faible poids moléculaire (100-250Da)
pouvant se lier avec une faible affinité (de l’ordre du millimolaire au micromolaire) à la cible
biologique. Ceci est rendu possible par l’utilisation de techniques tels que le criblage à haute
concentration, la RMN, la cristallographie par rayons X ou encore la spectrométrie de masse.
Le ligand ainsi identifié aura une grande efficacité vis-à-vis de sa cible au regard de sa taille
(LE = pIC 50 / # heavy atoms) ou de sa lipophilie (LLE = pIC 50 – logP). Ces paramètres ne
devront pas être altérés au cours du processus d’optimisation afin que les propriétés physicochimiques
du futur candidat médicament restent dans l’espace chimique défini au préalable. 4
L’approche fragment est maintenant une technique mature utilisée dans de nombreux
domaines thérapeutiques aussi bien dans l’industrie que dans le monde académique. Plusieurs
composés, découverts à partir d’une approche fragment, sont actuellement en développement
clinique. 5 En 2011, le Vemurafenib (Zelboraf®) est le premier composé issu de cette
approche à avoir obtenu une autorisation de mise sur le marché.
1) Leeson, P. D. ; Springthorpe, B. Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 881.
2) Leeson, P. D. ; Empfield, J. R. Annu. Rep. Med. Chem. 2010, 45, 393.
3) Congreve, M.; Chessari, G.; Tisi, D.; Woodhead, A. J. J. Med. Chem. 2008, 51, 3661.
4) Murray, C. W.; Rees, D. C. Nat. Chem. 2009, 1, 187.
5) Murray, C. W.; Verdonk, M. L.; Rees, D. C. Trends Pharmacol. Sci. 2012, 33, 224.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Sarah HOSTACHY
Towards traceless affinity labelling of endogenous proteins
directeur(s) de thèse : Pr Clotilde POLICAR, Dr Nicolas DELSUC
Laboratoire des Biomolécules (UMR 7203), Département de Chimie, Ecole Normale
Supérieure, 24 rue Lhomond, 75005 PARIS
sarah.hostachy@ens.fr
The development of imaging techniques, combined with the introduction of genetically
encoded autofluorescent proteins (AFPs) as fusion tags, have offered several tools to study the
localization, function, and interactions of proteins in their native environment.
Although valuable, the protein labelling approaches using AFP-fusion tags also face
limitations, such as the large size of the tag (≈30kDa). Alternative labelling approaches, using
small chemical or biophysical probes, have recently been developed to address these
shortcomings 1,2 .
Among them, “affinity labelling” approaches have the advantage to selectively target proteins
without need of genetic modifications or metabolic uptake of pre-labelled biomolecules 3,4 .
However, this approach often results in protein inactivation, thus limiting its application for in
vivo studies. Nonetheless, recent development of “traceless affinity labelling” has allowed
chemical labelling of proteins without significant loss of functionality in vitro, then in
vivo 5,6,7 .
1
Dieterich D. C. Chemical reporters for the illumination of protein and cell dynamics, Current Opinion in
Neurobiology 2010, 20, 623-630.
2
Hinner M. J.; Johnsson K. How to obtain labeled proteins and what to do with them. Current Opinion in
Biotechnology 2010 , 21, 766–776.
3
Li N.; Overkleeft H. S.; Florea B. I. Activity-based protein profiling: an enabling technology in chemical
biology research. Current Opinion in Chemical Biology, 2012, 16, 227-233.
4
Jessani N.; Cravatt B. F. The development and application of methods for activity-based protein profiling.
Current opinion in chemical biology, 2004, 8, 54–59.
5
Hayashi, T.; Hamachi, I. Traceless Affinity Labeling of Endogenous Proteins for Functional Analysis in Living
Cells. Accounts of Chemical Research 2012, 45, 1460–1469.
6
Tsukiji, S.; Miyagawa, M.; Takaoka, Y.; Tamura, T.; Hamachi, I. Ligand-directed tosyl chemistry for protein
labeling in vivo. Nature chemical biology, 2009, 5, 341–343.
7
Wang, H. et al. Chemical Cell-Surface Receptor Engineering Using Affinity-Guided, Multivalent
Organocatalysts. Journal of the American Chemical Society 2011, 133, 12220–12228.

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Camille PERREARD
Les aptamères, un nouvel outil de diagnostic
Directeurs de thèse : Anne Varenne et Fethi Bedioui
UPCGI, Chimie Paristech
camille-perreard@etu.chimie-paristech.fr
Les aptamères sont des séquences d’ADN ou d’ARN possédant structure tridimensionnelle
unique qui leur permet de se lier à une grande variété de cibles (des petites molécules
organiques aux structures supramoléculaires). Ils font leur apparition en 1990, avec la
découverte de la technique SELEX (« Systematic Evolution of Ligands by EXponential
enrichment » ) par 3 groupes à quelques mois d’intervalle 1,2,3 . Cette technique permet de
sélectionner et d’amplifier des aptamères se liant de façon sélective à une cible. Ils peuvent
remplacer les anticorps dans le diagnostic et la thérapie et présentent beaucoup d’avantage en
termes de fabrication et de stabilité comme présenté dans le tableau 1.
Tableau 1 : Avantages des aptamères par rapport aux anticorps 4
Les aptamères ont de nombreuses applications, notamment pour le diagnostique, en
remplacement des anticorps. Ils peuvent être utilisés pour des tests « sandwich », type ELISA
5,6 , ou associés à des microbilles magnétiques 7 , à des balises moléculaires 8 (molecular
beacons) ou à des nanoparticules d’or 9 , pour la détection de protéines, thrombine ou
interféron-γ par exemple, ou de cellules cancéreuses.
1 Tuerk, C.; Gold, L. Science 1990, 249, 505–510
2 Ellington, A. D.; Szostak, J. W. Nature 1990, 346, 818–822
3 Robertson, D. L.; Joyce, G. F. Nature 1990, 344, 467–468
4 O’Sullivan, C. K. Anal. Bioanal. Chem. 2002, 372, 44-48
5 Ikebukuro, K.; Kiyohara, C.; Koji, S. Biosens. Bioelectron. 2005, 20, 2168–2172
6 Zuo, X.; Xiao, Y.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 6944–6945
7 Tennico, Y. H.; Hutanu, D.; Koesdjojo, M. T.; Bartel, C.M.; Remcho, V. T. Anal. Chem. 2010, 82, 5591–5597
8 Tuleuova, N.; Jones, C. N.; Yan, J.; Ramanculov, E; Yokobayashi, Y.; Revzin, A. Anal. Chem. 2010, 82, 1851–
1857
9 Medley, C. D.; Smith, J.E.; Tang, Z.; Wu, Y.; Bamrungsap, S.; Tan, W. Anal. Chem. 2008, 80, 1067-1072

Journées Bibliographiques de l’EDCM
Mélanie LORION
Ferrocene-based DNA Mimics: Synthesis and Applications
Directeur de thèse : Giovanni Poli
Equipe Synthèse Sélectives et Organométalliques (SSO)
IPCM
4 Place Jussieu 75252 PARIS Cedex 05
melanie.lorion@upmc.com
Detection of specific DNA sequences is of utmost importance in modern molecular
biology and molecular diagnostics, where recognition of a specific disease depends on nucleic
acid identification.
In 1991, Tirouflet's group described the first synthesis of ferrocene-based nucleosides,
which was achieved via several Pd-catalyzed coupling reactions. 1 Ever since, a number of
alternative synthetic pathways has been reported. 2 Thanks to the presence of the ferrocenyl
moiety, such modified nuclosides can be electrochemically detected and thus can function as
gene sensors. 3
1 Meunier, P.; Ouattara, I.; Gautheron, B.; Thirouflet, J.; Camboli, D.; Besancon, J.; Boulay, F. Eur. J. Med.
Chem. 1991, 26, 351-362.
2 Van Staveren, D. R.; Metsler-Nolte, N. Chem. Rev. 2004, 104, 5931-5985.
3 Ihara, T.; Nakayama, M.; Murata, M.; Nakano, K.; Maeda, M. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1997, 1609-
1610.