Prog de 1Ã 28 - Eurobiomed
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Transcriptomique Génomique <strong>de</strong> Marseille-LuminyNotre plate-forme TGML donne accès aux outils tantexpérimentaux que bioinformatiques pour l’étu<strong>de</strong>du Transcriptome et <strong>de</strong> la Génomique FonctionnelleNos clients :Yves RocherBio<strong>de</strong>rmaDiptaPrediguardPlateformecollaborativeet <strong>de</strong> services :GénomiqueTranscriptomiqueSecteurd’activité :Analyse et caractérisationproduit biologiqueMots clés :SéquençageProfilsPuces ADNAgilentDéveloppement<strong>de</strong> métho<strong>de</strong>sFormationsLa plate-forme TGML c’est :Une expertise à votre service• TGML Deep-Seq : séquençage à très haut débit permettant <strong>de</strong> séquencer enquelques jours jusqu'à 60 gigabases <strong>de</strong> fragments d'ADN (50 nt).De plus le multiplexage permet <strong>de</strong> séquencer jusqu'à 320 échantillonssimultanément.• TGML Agilent : permet en plus <strong>de</strong> l’étu<strong>de</strong> du transcriptome <strong>de</strong> nombreuxorganismes, <strong>de</strong>s applications en CGH, ChIP-on-chip, miRNA, DNAmethylation (http://www.home.agilent.com/).• TGML Nylon : rendre l’étu<strong>de</strong> du Transcriptome accessible à tous avec unetechnologie simple et un cout compétitif.• Réalisation <strong>de</strong> profils• Analyses bioinformatiques• Conseils pour le <strong>de</strong>sign <strong>de</strong> plans d’expériences et le développement <strong>de</strong>métho<strong>de</strong>sUn équipement performant• Séquenceur SOLiD3Plus Applied Biosystems• Agilent pour la fluorescence dans une pièce ozone free• Dépôt à façon sur membrane nylon (Microgrid) jusqu’à 10 000 dépôts• Puces humaines, murines disponibles• informatique : Cluster offline – Stockage:Total calcul : 56 cores, 88 threadsTotal stockage : 50 TbModalités d’accèsDeman<strong>de</strong> examinée par le comité <strong>de</strong> pilotage avant la prise en charge du projet.Un formulaire <strong>de</strong> <strong>de</strong>man<strong>de</strong> d’accès est disponible en ligne.http://tagc.univ-mrs.fr/plateforme/accueil/Pour tout renseignement, contacter :Beatrice Loriod / 04 91 82 87 13 / loriod@tagc.univ-mrs.frResponsables scientifiques : Catherine Nguyen et Jean ImbertCoordonnées : TAGC 163 avenue <strong>de</strong> Luminy 13288 MarseillePartenaires : INSERM et Université Aix-Marseille 2Site Internet:http://tagc.univ-mrs.fr/plateforme/11
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