谷子中真核生物翻译起始因子3 G亚基（eIF3G）分析 - abc

H124Yu1

H124Yu1H124Yu1

H124Yu1H124Yu1H124Yu1H124Yu1

LocusnameLocationFunctional annotationsSi009227m.g scaffold_7: 27330562 - 27339119 EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2CSi012949m.g scaffold_7: 27340132 - 27340649 there are no functional annotations for this locusSi010740m.g scaffold_7: 27354499 - 27356216 EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3Si012767m.g scaffold_7: 27365689 - 27367287 Protein of unknown function (DUF1618)

基 因 注 释 信 息http://www.phytozome.net/genePage.php?crown&method=2304&search=1&searchText=clusterid%3A28133979&detail=1

基 因 注 释 信 息http://pfam.sanger.ac.uk/family/PF12353?type=Family相 关 文 献 :Masutani M, Sonenberg N, Yokoyama S, Imataka H;, EMBO J. 2007;26:3373-3383.:Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3.

基 因 注 释 信 息http://pfam.sanger.ac.uk/family/PF00076?type=Family相 关 文 献 :Birney E., Kumar S., Krainer A.R. , Nucleic Acid Res 1993;21:5803-5816.: Analysis of the RNArecognitionmotif and RS and RGG domains: conservation in metazoan pre-mRNA splicing factors.

基 因 序 列 分 析ATGGCGACGGCGGTGGCGACGCAGCAGCAGCACAAGTTCCGGTGGGGCGACATCGCGGACACGACGGCGACCTCGGCCTCCTCCTCCCGCCGCGGGTCATCCTCGGGCCCGACGCGGCCGGCCTCCAAAAGGTGATCGAGTACCGCTTCGACGATGAGGGCAACAAGGTCAAGGTCACCACCACCACCCGCACCCGCAGCCTCGCGCGCACGCGCCTCTCCAGGAGCGCCGTCGAGCGCCGCGCGTGGACCAAGTTCGGCGACGCCGTCAAGAGGGACGACGCCGGCTCGCGCCTCACCATGGTCTCCACCGAAGAGGTCCTCCTCGAGCGCCCACTTGCCCCAGGTATTGGCTCTCCTGTTATCCCCCCATGCGTTTCTCCCACCCTAGATCTGCTCCGCGTTGATCGATTCATCTGTTAACCATGATTAATCATAATGTGTGTCGACCATTTCCATCGCAGTGCTAATCGAGTAATCGTATTGATGTCAATTATGGACGTGTGGTGTGCACAGATTATACTGTATTTTTATACTTTCGTACCACCTACCATGGAATTGGCATGCCTTTATCCCATTCCAATCGCTTCTTGCGTTAGTGTTACCAAACACCCAAAATTACCATTCTGCATTTTCCTATTGACTCTTCTGTATAATGTCTAGATAATAATTCTATCTGCTGTTGACTGCTAATTTTAGTGTATTAAAGGAAGGAGGCCAGCTCTACACCCTTTCTTAAATTTGTAGACAGATTGTTCCGTTTCATATCAAATACTCGAATTCTGCAGGTGATCTCATTCCACATTAGGATTACATCCTCCTGAAACCTGAATGCAAGCATATTAAATCTAGCATGACTGCTTTGTAGTGTTAACTTTTTGATCAAAACCTTACTCGCCAAATGATCTGTCAGCTTTGTAGTGTACATCTTGTGTTGTGGATATAGAAATCTATCGTTCAGCCATTGTTAACGTTCTTCTAATACTATGACTTTAATCTTCTTAGAGCAAATGACAGTTTCTCTTGTTACATACATTCTTTTTTCTGGTTCTGAAGCCTCAAAACTTGCTGGTTCTGCTGTAATCTTGTTATCCTTTTGCCTTTGTTTGCTAACAGTTAATTCAATTGTAGGGAAGCAAGCTGAGGAACCATCTACTCCTGGTGATCCACTGTCTATGGAAAGTATGAGAGGCGGTGCCCTTCTCATGCTTTGCAGAATCTGTAAGAAAAAGGGTGACCACTGGACCTCAAAGTGCCCCTACAAAGACCTTGCTCCACAGGCAGGAGGTTTTGTCGACACGCCCCCTAGTGCCGACGGCCGTGCAGCACCACCTGGTGAGCGAGCGTATGTTCCTCCAAACAAGAAAGAAGGTGCTGATACGCGGAGAGCAAGTATGATGAGGAGGAATGATGAGAACTCCATCCGTGTGAACAACCTGTCAGAGGACACCCATGAGGCCGACCTCCTCGAGCTGTTCCGCACGTTTGGCCCTGTTACCCGTGCCTTCGTCGCGAGGGATAAGTGGACTCGATCAAGCGGGGGGTTTGGCTTTGTCAACTTCGTTCGCAGAGAGGATGGTGAGAAGGCTATCAGCAAGCTCAATGGGTATGGTTATGATAACCTTATCCTCCGGGTCGAGTGGTCAGACAGACCGAACTAGTTATAGCTACTACCTCTCCTAGCATGGCATATATTCACCCAACCTAGTGCTTTTCAGTWILDTYPE H124-6TATGGCGACGGCGGTGGCGACGCAGCAGCAGCACAAGTTCCGGTGGGGCGACATCGCGGACACGACGGCGACCTCGGCCTCCTCCTCCCGCCGCGGGTCATCCTCGGGCCCGACGCGGCCGGCCTCCAAAAGGTGATCGAGTACCGCTTCGACGATGAGGGCAACAAGGTCAAGGTCACCACCACCACCCGCACCCGCAGCCTCGCGCGCACGCGCCTCTCCAGGAGCGCCGTCGAGCGCCGCGCGTGGACCAAGTTCGGCGACGCCGTCAAGAGGGACGACGCCGGCTCGCGCCTCACCATGGTCTCCACCAAAAAGGTCCTCCTCGAGCGCCCACTTGCCCCAGGTATTGGCTCTCCTGTTATCCCCCCATGCGTTTCTCCCACCCTAGATCTGCTCCGCGTTGATCGATTCATCTGTTAACCATGATTAATCATAATGTGTGTCGACCATTTCCATCGCAGTGCTAATCGAGTAATCGTATTGATGTCAATTATGGACGTGTGGTGTGCACAGATTATACTGTATTTTTATACTTTCGTACCACCTACCATGGAATTGGCATGCCTTTATCCCATTCCAATCGCTTCTTGCGTTAGTGTTACCAAACACCCAAAATTACCATTCTGCATTTTCCTATTGACTCTTCTGTATAATGTCTAGATAATAATTCTATCTGCTGTTGACTGCTAATTTTAGTGTATTAAAGGAAGGAGGCCAGCTCTACACCCTTTCTTAAATTTGTAGACAGATTGTTCCGTTTCATATCAAATACTCGAATTCTGCAGGTGATCTCATTCCACATTAGGATTACATCCTCCTGAAACCTGAATGCAAGCATATTAAATCTAGCATGACTGCTTTGTAGTGTTAACTTTTTGATCAAAACCTTACTCGCCAAATGATCTGTCAGCTTTGTAGTGTACATCTTGTGTTGTGGATATAGAAATCTATCGTTCAGCCATTGTTAACGTTCTTCTAATACTATGACTTTAATCTTCTTAGAGCAAATGACAGTTTCTCTTGTTACATACATTCTTTTTTCTGGTTCTGAAGCCTCAAAACTTGCTGGTTCTGCTGTAATCTTGTTATCCTTTTGCCTTTGTTTGCTAACAGTTAATTCAATTGTAGGGAAGCAAGCTGAGGAACCATCTACTCCTGGTGATCCACTGTCTATGGAAAGTATGAGAGGCGGTGCCCTTCTCATGCTTTGCAGAATCTGTAAGAAAAAGGGTGACCACTGGACCTCAAAGTGCCCCTACAAAGACCTTGCTCCACAGGCAGGAGGTTTTGTCGACACGCCCCCTAGTGCCGACGGCCGTGCAGCACCACCTGGTGAGCGAGCGTATGTTCCTCCAAACAAGAAAGAAGGTGCTGATACGCGGAGAGCAAGTATGATGAGGAGGAATGATGAGAACTCCATCCGTGTGAACAACCTGTCAGAGGACACCCATGAGGCCGACCTCCTCGAGCTGTTCCGCACGTTTGGCCCTGTTACCCGTGCCTTCGTCGCGAGGGATAAGTGGACTCGATCAAGCGGGGGGTTTGGCTTTGTCAACTTCGTTCGCAGAGAGGATGGTGAGAAGGCTATCAGCAAGCTCAATGGGTATGGTTATGATAACCTTATCCTCCGGGTCGAGTGGTCAGACAGACCGAACTAGTTATAGCTACTACCTCTCCTAGCATGGCATATATTCACCCAACCTAGTGCTTTTCAGT

基 因 序 列 分 析MAGA 5.0

蛋 白 分 析MATAVATQQQHKFRWGDIADTTATSASSSRRGSSSGPTRPVIEYRFDDEGNKVKVTTTTRTRSLARTRLSRSAVERRAWTKFGDAVKRDDAGSRLTMVSTEEVLLERPLAPVNSIVGKQAEEPSTPGDPLSMESMRGGALLMLCRICKKKGDHWTSKCPYKDLAPQAGGFVDTPPSADGRAAPPGERAYVPPNKKEGADTRRASMMRRNDENSIRVNNLSEDTHEADLLELFRTFGPVTRAFVARDKWTRSSGGFGFVNFVRREDGEKAISKLNGYGYDNLILRVEWSDRPN

蛋 白 分 析http://www.uniprot.org/uniprot/?query=eif3G+AND+taxonomy%3APoaceae&sort=score

蛋 白 分 析http://www.uniprot.org/align/2012122771P1D5XO2C

蛋 白 分 析MAGA 5.0

蛋 白 分 析MATAVATQQQHKFRWGDIADTTATSASSSRRGSSSGPTRPVIEYRFDDEGNKVKVTTTTRTRSLARTRLSRSAVERRAWTKFGDAVKRDDAGSRLTMVSTEEVLLERPLAPVNSIVGKQAEEPSTPGDPLSMESMRGGALLMLCRICKKKGDHWTSKCPYKDLAPQAGGFVDTPPSADGRAAPPGERAYVPPNKKEGADTRRASMMRRNDENSIRVNNLSEDTHEADLLELFRTFGPVTRAFVARDKWTRSSGGFGFVNFVRREDGEKAISKLNGYGYDNLILRVEWSDRPNWILDTYPEH124-6TMATAVATQQQHKFRWGDIADTTATSASSSRRGSSSGPTRPVIEYRFDDEGNKVKVTTTTRTRSLARTRLSRSAVERRAWTKFGDAVKRDDAGSRLTMVSTKKVLLERPLAPVNSIVGKQAEEPSTPGDPLSMESMRGGALLMLCRICKKKGDHWTSKCPYKDLAPQAGGFVDTPPSADGRAAPPGERAYVPPNKKEGADTRRASMMRRNDENSIRVNNLSEDTHEADLLELFRTFGPVTRAFVARDKWTRSSGGFGFVNFVRREDGEKAISKLNGYGYDNLILRVEWSDRPN

蛋 白 分 析MAGA 5.0

蛋 白 分 析Jemboss1、 由 预 测 的 二 级 结 构 来 看 , 野 生 型 的 由 99-110 均 为 形 成 螺 旋 结 构 ,H124-6T 为 97-102 形 成 螺 旋 ,103-107 形 成 的 是 折 叠野 生 型Different突 变 株

蛋 白 分 析由 图 中 可 以 看 出 , 突 变 株 的 疏 水 性 略 有 增 强野 生 型突 变 株疏 水 性 发 生 变 化

蛋 白 分 析野 生 型 的 等 电 点 为 10.1919; 突 变 株 的 等 电 点 为 10.5112野 生 型突 变 株

总 结通 过 上 述 分 析 , 我 们 得 知 , 突 变 体 H124-6T Si010740 编 码 的 蛋 白质 是 一 个 翻 译 起 始 因 子 , 此 蛋 白 有 两 个 结 构 域 , 分 别 为 eIF3G 和 RRM,其 中 在 编 码 eIF3G 的 序 列 中 存 在 两 个 SNP, 这 两 个 碱 基 的 改 变 使 此 基因 编 码 的 多 肽 101 位 点 和 102 位 点 均 由 酸 性 的 谷 氨 酸 变 为 了 碱 性 的 赖氨 酸 。 通 过 软 件 预 测 , 这 两 个 氨 基 酸 的 改 变 引 起 了 编 码 蛋 白 质 的 结 构上 一 系 列 改 变 。 这 些 变 化 可 能 改 变 的 该 蛋 白 质 的 功 能 , 从 而 引 起 了 植株 的 突 变 表 型 。

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