Mapeamento da autoincompatibilidade sexual do cacau e ... - Uesc

2.9 Marcadores moleculares e desenvolvimento de mapas de ligação
Os polimorfismos genéticos em nível do DNA são abundantes nos
genomas vegetais e podem ser detectados por diferentes técnicas de biologia
molécular, gerando marcadores moleculares informativos. Marcadores
moleculares baseados na amplificação de fragmentos de DNA pela reação em
cadeia da polimerase (PCR) têm sido largamente empregados nos programas
de melhoramento de plantas, como na caracterização de populações,
construções de mapas de ligação e detecção de QTL entre outras aplicações
(FERREIRA; GRATTAPAGLIA, 1998).
Na construção de mapas de ligação normalmente são empregados
grande número de marcadores moleculares, sejam eles loco-específicos
dominantes (como RAPD – DNA polimórfico amplificado ao acaso; AFLP –
polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados) ou loco co-
dominante (como microssatélites; RFLP – polimorfismo de comprimento de
fragmentos de restrição obtidos por cortes aleatórios da fita dupla de DNA).
Presentes na maioria dos genomas dos organismos eucariotos, os
marcadores moleculares do tipo microssatélites (Simple Sequence Repeats -
SSR) consistem de seqüências curtas de 2-5 nucleotídeos repetidas em
tandem, flanqueadas por seqüências únicas não repetidas, sendo os elementos
repetidos mais comuns os di-nucleotídeos AT e CA. A variação alélica em locos
de microsatélites pode ser facilmente detectada por PCR usando primers
flanqueadores específicos. O polimorfismo baseado na variação do número de
seqüências repetidas dos microssatélites é provavelmente ocasionado por
escorregamento da DNA polimerase na replicação do DNA ou por troca de
partes desigual entre os cromossomos (HANCOCK, 2000).
Os marcadores microssatélites tornaram-se rapidamente os mais
utilizados pelos geneticistas de humanos, para o desenvolvimento de mapas de
ligação e para a identificação de indivíduos. Em plantas, os microssatélites são
muito freqüentes e distribuídos ao acaso ao longo do genoma, também sendo
amplamente utilizados nos estudos de diversidade genética, caracterização de
germoplasma, construção de mapas genéticos e localização de QTLs. Esses
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