Análise Genômica Aplicada a Produção Animal - Centro de ...

al., 1999; HAMMER et al., 2001; SPRINGER et al., 2001; TOZAKI et al., 2001; ICHIKAWA et
al., 2001; LANDRY et al., 2002, YU; PENG, 2002; CAVALI-SFORZA; FELDMAN, 2003;
DENISE et al., 2003; FOKIDIS et al., 2003; WILDER et al., 2004a; WILDER et al., 2004b;
GARRIGAN; HAMMER, 2006; TORO et al., 2009).
Marcadores Mitocondriais
Mitocôndrias são organelas citoplasmáticas encontradas na grande maioria dos
organismos eucariotos. Elas são usualmente descritas como “casa de força” celular visto que são
responsáveis pela produção de ATP via fosforilação oxidativa. Os eucariotos surgiram da interação
de comunidades de células, de maneira que esta organela pode ter surgido a partir da captura e
incorporação de uma protobactéria endossimbionte por um hospedeiro eucariótico com núcleo, com
semelhança a um protista (LANG et al., 1997; GRAY et al., 1999).
O DNA mitocondrial (mtDNA) de mamíferos é um genoma citoplasmático (extra
nuclear), que contém, basicamente, alguns dos genes essenciais ao processo celular de fosforilação
oxidativa. Os genes mitocondriais apresentam uma taxa de fixação de mutações (modificações)
quatro vezes superior, quando comparados aos nucleares, além de estar presente em quase todos os
eucariotos e possuírem herança exclusivamente materna, e, por estas razões, tornaram-se comuns
em estudos filogenéticos e evolucionários (MARGULIS, 1996; AVISE, 2000; GRAY et al., 2004;
BULLERWELL; GRAY, 2004).
A região controle, que inclui D-loop e a seqüência hipervariável (HVS) e os genes
citocromo B (CytB) e citocromo C oxidase I (COI) têm sido os mais empregados na identificação
de espécies, discriminação de sub-espécies, estudos de evolução e domesticação, caracterização de
raças e alterações demográficas recentes em bovinos, suínos, aves e ovinos, entre outras espécies
animais. (LOFTUS et al., 1994; GIUFFRA et al., 2000; HIENDLEDER et al., 2002; LEONARD et
al., 2002; BRUFORD et al., 2003; WU et al., 2003; JOSHI et al., 2004; MEADOWS et al., 2005).
Um projeto internacional conhecido “DNA Barcoding of Live”
(http://www.barcoding.si.edu/DNABarCoding.htm) foi implantado recentemente com o objetivo de
seqüenciar 648 pb do gene citocromo C oxidase, sub-unidade 1 (COI) como ferramenta de auxílio
na catalogação da biodiversidade e em taxonomia. Os “códigos de barra” baseados em seqüências
COI são eficientes na identificação de espécies uma vez que este gene está presente em
praticamente todos os organismos eucariotos, é bastante conservado entre organismos dos mais
diversos táxons, e suficientemente diferenciado entre espécies para apresentam padrão de seqüência
“barcode” espécie-específicos (TAUTZ et al., 2003; WILSON, 2003; BLAXTER et al., 2005;
SCHINDEL et al., 2005; RUBINOFF et al., 2006).
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