Análise Genômica Aplicada a Produção Animal - Centro de ...

conservação e manejo de recursos genéticos também será discutida.
Seqüenciamento Genômico
Com o início do projeto genoma humano, no início dos anos 90, as seqüências do
DNA do genoma humano e de diversas espécies experimentais foram determinadas. Desde então,
os projetos de seqüenciamento foram dedicados a animais domésticos de importância para a
agropecuária. O genoma de galinha foi completado em 2004 (WALLIS et al., 2004), o de bovinos
em 2006 (GAO et al., 2007), e o de suínos está em progresso (Tabela 1 – Status dos Projetos
Genomas até 2007).
O primeiro rascunho/versão da seqüência do genoma bovino foi publicado em
banco de dados público em 2004. A segunda versão, Btau_2.0, com uma cobertura de 6,2X, foi
gerada pela montagem de seqüências “ShotGun”. Em 2006, a terceira versão Btau_3.1, com
cobertura 7,15X montado a partir da combinação de seqüências geradas por “ShotGun” e “Bac
library” foi publicado pela NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/cow/) (GAO et al.,
2007).
A seqüência do genoma bovino está disponível ao público “on line” no web site
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/cow/, http://www.ensembl.org/Bos_taurus/index.html,
http://genome.ucsc.edu/ e http://bovinegenome.org/, onde está conectada a banco de dados com
informações relacionadas à estrutura dos genes (localização, regiões codificadoras e regulatórias) e
função (bioquímica, biológica, regulatória e interações com outros genes) (Gene Ontology - GO),
QTL para as diferentes características, famílias de proteínas, o mapa integrado e outros recursos.
A última montagem Btau_3.1, possui 2,87 10x 9 pb gerados a partir de 26 milhões de
seqüências “shotgun” e “BAClibrary”. Mais do que 1 milhão de “Expressed Sequence Tags”
(ESTs) podem ser posicionados no genoma, o que indica a qualidade da montagem. Na web site
citada anteriormente estão descritos aproximadamente 23,800 genes e 24,800 modelos gênicos
(WHEELER et al., 2007) e podem ser visualizados no site http://bovinegenome.org/. Características
adicionais e anotações (Gene Ontology Consortium, 2006) associadas à seqüência de DNA
(transcritos não-codificadores, famílias de proteínas, ESTs, regiões repetitivas, polimorfismos e
QTL também estão disponíveis (Figura 3- Website Genoma Bovino) (GENE ONTOLOGY
CONSORTIUM, 2006; UNIPROT CONSORTIUM, 2007; ADELSON, 2008).
A informação gerada pelos projetos genomas (seqüência completa de DNA do
genoma de diferentes indivíduos das diversas espécies) pode agora ser mais bem utilizada em
investigação científica em genética/ genômica com a disponibilidade, em abundância, de seqüência
de DNA, anotação estrutural e funcional, mapas de SNPs (polimorfismos pontuais de DNA) (SNPs
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