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de sistemas com muitos átomos, por sua simplicidade comparada aos métodos quânticos.
Porém, como característica dos métodos clássicos, a MM não apresenta informações da parte
eletrônica do sistema, como em um método quântico. Uma referência do uso da MM são os
sistemas biológicos, como as proteínas [21], atualmente um dos limites na simulação atomística
de sistemas orgânicos, podendo envolver centenas de milhares de átomos.
A descrição mais simples do método de MM é considerar a aproximação de Bohr & Oppenheimer.
Esta aproximação leva em conta que o movimento dos núcleos é mais lento que o
movimento dos elétrons, com isso é possível separar a informação nuclear e eletrônica em duas
partes e resolvê-las separadamente. Dessa aproximação (da mecânica quântica), observamos
que em MM a energia total do sistema depende exclusivamente da posição dos átomos do
sistema e os efeitos eletrônicos não são computados explicitamente. A energia total então
é dada via potencial nuclear dependente das posições mais conhecido pela denominação de
campo de força (CF).
O campo de força é uma peça fundamental, se não a mais importante, em MM. Para
se ter um sistema bem descrito, isto é, com uma boa de geometria em MM, é necessário
que o CF esteja adequado ao tipo de problema no qual deseja tratar. Normalmente os CF
são compostos por termos harmônicos para átomos ligados e termos de van der Walls e de
Coulomb para átomos não ligados. Os termos dos átomos ligados têm a forma de kx 2 , onde
x pode assumir valores de distância, ângulo e torção.
Uma vez descrito o CF para o sistema em estudo e assumindo que a energia total do
sistema é conservado, a força do sistema é obtida via pelo gradiente do CF (a derivada
espacial da expressão do potencial). A aproximação de que a força pode ser escrita como
menos o gradiente do potencial é utilizada tendo em vista algumas restrições, em que além
da conservação da energia total isto só é válido se o nosso sistema de referência for um
referencial inercial. No entanto todas as simulações baseada nessas aproximações não deve
ter, por exemplo, um referencial acelerado, para que seja respeitado o princípio de conservação
de energia.
Para exemplificar um CF, na equação 2.1 temos um CF que utilizamos para otimizar a
geometria das moléculas de Lander e também em outras simulações baseadas em dinâmica
molecular.
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