TRAKYA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KALİKS[4 ...

More documents

Recommendations

Info

O C R' Q N H C R'' H C H O C N = N ile amino asitin yan zincirinde ki C atomu ile arasındaki dönme açısı 42 Şekil 3.2: Amino asitlerin genel tanımı H Q = amino asidin yan zincirinde ki C atomu ile karbonil arasındaki dönme açısı
43 3.2.1. Paraler ve Anti Paralel β-peptid Zincileri β dizi, ikincil yapıdaki proteinlerde bulunan, yanyana üç veya daha fazla hidrojen bağlı beta strandların (zincirlerin) ikincil yapısıdır. Bir beta strand (zincir) tipik olarak 5 ile 10 arasındaki amino asidin birleşimi ile olan peptid zincirinde tam olarak uzanmıştır. Beta diziler ile ilgili protein toplulukları birçok insan hastalıklarında gözlenmiştir. Peptid zincirlerinin sahip olduğu N ve C terminal yönlülüğü, Beta strandlarda da (zincirlerde de) aynı şekilde mevcuttur. Genellikle protein topolojisi diagramlarında C terminalinden işaret edilerek gösterilirler. Bitişik Beta zincirler paralel, anti paralel ve karışık formlarında hidrojen bağları gösterebilirler. Bir antiparalel diziliminde, peşpeşe yönlü olan β zincirlerde bir zincirin N terminali ile bir sonraki zincirin C terminali bitişiktir. Bu dizilim güçlü ve kararlı olan iç zinciri oluşturur çünkü iç strandlarda karbonil ve aminler arasında düzlemsel olarak H bağları oluşmaktadır. Peptid zincirinin iskeleti dihedral açıları (φ, ψ) yaklaşık antiparalel dizilimde (–140°, 135°)’dir. Bu durumda eğer iki atom Ci ve Cj iki hidrojen bağında bitişikse, bunlar iskelette karşılıklı H bağları oluştururlar yani karşılıklı peptid zincirleri arasında oluştururlar (şekil 3.3). Paralel dizilimde peşpeşe olan tün N terminal dizilimler hep aynı oryantasyondadır, böyle olduğu içinde az karalıdırılar. Ayrıca iç strandlarda düzlemsel olmadığı için buralarda da H bağları oluşmaz. Dihedral açıları (φ, ψ) yaklaşık olarak (– 120°, 115°)’dir. Beş paralel strandtan daha dizili paralel peptidler bulmak oldukça güçtür çünkü çok kararsızdırlar.Bu durumda iki atom olan Ci ve Cj iki H bağında bitişikse bunlar bir biri ile H bağı yapmazlar (şekil 3.4).
Page 1 and 2: TRAKYA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİM
Page 3 and 4: Yüksek Lisans Tezi Trakya Ünivers
Page 5 and 6: iii TEŞEKKÜR Tez yöneticiliğimi
Page 7 and 8: 2.8.1.3. p-Kinonmetit Metodu 23 2.8
Page 9 and 10: 1.GİRİŞ 1 Fenol ve formaldehitin
Page 11 and 12: R 3 Kaliksarenlerin aşağıda gös
Page 13 and 14: 5 siklik tetramerleri, biyoorganik
Page 15 and 16: 2.4. Kaliksarenlerin Sentezi 2.4.1.
Page 17 and 18: 9 stokiyometrik oranda baz kullanı
Page 19 and 20: R OH Şekil 2.6: Hidroksimetil feno
Page 21 and 22: H 2C Şekil 2.10: Kaliks[8]arenin k
Page 23 and 24: 2 OH 2 OH OH HO OH R CH 2OH OH 15 O
Page 25 and 26: 17 2.6.2.2. Nükleer Magnetik Rezon
Page 27 and 28: 19 asetonitril gibi polar çözüc
Page 29 and 30: 2.8.1. Kaliksarenlerin üst kenarla
Page 31 and 32: 2.8.1.3. p-Kinonmetit Metodu 23 Kal
Page 33 and 34: 2.9. Kaliksarenlerin Kullanım Alan
Page 35 and 36: 27 Şekil 2.24: Kaliksarenlerin kom
Page 37 and 38: O HN NH t-Bu N O O HO HO t-Bu t-Bu
Page 39 and 40: O 31 S S N C H CH 2 4 OC8H17 Şekil
Page 41 and 42: XH 2C O H 2C OH OH 33 Blanda ve Ado
Page 43 and 44: tub-t 4 35 X CH2 CH Şekil 2.35: Ka
Page 45 and 46: 3. BİLGİSAYARLI KİMYA (MOLEKÜLE
Page 47 and 48: 39 Φ, Slater determinantıdır, va
Page 49: 41 Diğer farmakolojik etkilerinden
Page 53 and 54: 45 Amino asitleri ilk olarak tek te
Page 55 and 56: 47 Bu sonuçlar da bize geometri op
Page 57 and 58: 49 Açı Ölçüsü Zincir I 180 o
Page 59 and 60: 51 Açı Ölçüsü Zincir I -141.1
Page 61 and 62: 4. MATERYAL VE METOD 4.1. Kullanıl
Page 63 and 64: 4.3. Çalışmalarda Kullanılan Y
Page 65 and 66: 5. BULGULAR 5.1 Deneysel Bölüm 57
Page 67 and 68: 59 5.2 IR ve NMR Spektrumlarının
Page 69 and 70: O H3C C O H H H 61 Şekil 5.4: 3-o-
Page 71 and 72: OH 63 Şekil 5.6: 5,11,17,23-tetra-
Page 73 and 74: KAYNAKLAR 65 Charles J. Pedersen 19
Page 75 and 76: J. Phys. Rev. A, , 140, 1133 67 Per
Page 77 and 78: 69 C. David Gutsche, Jeffrey A. Lev

TRAKYA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KALİKS[4 ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?