BProbeTec ET Legionella pneumophila (LP) Amplified DNA ... - BD

More documents

Recommendations

Info

Tabel 2: BD ProbeTec ET LP analyse - Prospektive resultater fra ekspektoratpræparater sammenlignet med dyrkning Sted Sensitivitet (95 % konfidensinterval) 100% (17/17) 1 IR 0/0 (80,5% – 100%) 100% (2/2) 2 IR 0/0 (15,8% – 100%) 100% (31/31) 3 IR 0/0 (88,8% – 100%) 100% (33/33) 6 IR 2/0 (89,4% – 100%) a Af de 114 dyrknings-negative præparater var alle negative over for direkte fluorescens antigen (Direct Fluorescent Antibody, DFA) Syvogfirs af de 114 patienter blev desuden testet med en urin antigen analyse og fundet at være negative b Ét præparat gav negativt resultat ved gentagelse og blev inkluderet i specificitetsberegningenMængden af ét præparat var ikke tilstrækkelig til at testen kunne gentages c To præparater var fortsat inkonklusive ved gentaget testning Mængden af ét præparat var ikke tilstrækkelig til at testen kunne gentages IR = Ikke relevant Retrospektiv undersøgelse BD ProbeTec ET LP analysen blev også evalueret med 83 retrospektive ekspektoratpræparater fra kliniske steder i USA, Europa og Canada De retrospektive præparater blev opbevaret i frossen tilstand i op til seks år, med størstedelen af præparaterne (65,1 %; 54/83) opbevaret i under to år Hvert sted registrerede det oprindelige dyrkningsresultat for hvert retrospektivt præparat Hvert sted testede ekspektoratpræparaterne i BD ProbeTec ET LP analysen og sammenlignede resultaterne med dyrkningsresultatet Et præparat blev betragtet som positivt, hvis dyrkningsresultatet var positivt Et præparat blev betragtet som negativt, hvis dyrkningsresultatet var negativt BD ProbeTec ET LP analyseresultater fra de retrospektive ekspektoratpræparater sammenlignet med dyrkningsresultater er sammenfattet i Tabel 3 Tabel 3: BD ProbeTec ET LP-analyse - Retrospektive resultater fra ekspektoratpræparater sammenlignet med dyrkning Dyrkning Procent overensstemmelse estimater (95 % konfidensinterval) Sted LP Resultat Positiv Negativ I alt Positiv Negativ Samlet 6 Positiv 1 0 1 Negativ 0 0 0 b 100% (31/31) 7 IR 3/2 (88,8% – 100%) c 100% (114/114) Samlet IR a 5/2 (96,8% – 100%) I alt 1 0 1 8 Positiv 16 5 21 Negativ 1 24 25 I alt 17 29 46 9 Positiv 1 3 4 Negativ 0 22 22 I alt 1 25 26 10 Positiv 3 0 3 Negativ 1 6 7 I alt 4 6 10 Samlet Positiv 21 8a 29 Negativ 2b 52 54 I alt 23 c 60 83 sammenlignet med dyrkning Specificitet (95 % konfidensinterval) 100% (1/1) (2,5% – 100%) 94,1% (16/17) (71,3% – 99,9%) 100% (1/1) (2,5% – 100%) 75% (3/4) (19,4% – 99,4%) 91,3% (21/23) (72% – 98,9%) InkonklusivInitial/ Endelig a Otte præparater var dyrknings-negative, BD ProbeTec ET LP analyse-positive Samtlige otte præparater var positive i en urin antigen analyse PCR testning blev udført på seks af de otte præparater; alle seks præparater var positive med PCR b To præparater var dyrknings-positive, BD ProbeTec ET LP analyse-negative Begge præparater var negative i en urin antigen analyse PCR testning blev udført på begge præparater; et præparat var positivt med PCR c De 23 dyrknings-positive præparater blev fordelt blandt de følgende serogrupper: 47,8 % (11/23) serogruppe 1; 17,4 % (4/23) serogruppe 3; 13,0 % (3/23) serogruppe 4; 4,3 % (1/23) serogruppe 5; 4,3 % (1/23) serogruppe 6 og 13 % (3/23) serogruppe information ikke tilgængelig IR = Ikke relevant 10 IR 82,8% (24/29) (64,2% – 94,2%) 88% (22/25) (68,8% – 97,5%) 100% (6/6) (541% – 100%) 86,7% (52/60) (75,4% – 94,1%) 100% (1/1) (2,5% – 100%) 87% (40/46) (73,7% – 95,1%) 885% (23/26) (69,8% – 97,6%) 90% (9/10) (55,5% – 99,7%) 88% (73/83) (79% – 94,1%)
BEMÆRK: PCR metoden anvendt til at teste diskordant dyrkning og BD ProbeTec ET LP analyseresultater var ikke en metode, der er godkendt af FDA Analytiske undersøgelser BD ProbeTec ET LP analysens amplifikationsreaktionsvolumen er 100 µL bearbejdet prøve Analytisk sensitivitet Den analytiske sensitivitet af BD ProbeTec ET LP analysen på tværs af 14 forskellige serogrupper af L pneumophila blev bestemt ved at fortynde bakterielle suspensioner til niveauer på 0, 150, 300 og 450 kolonidannende enheder (CFU) pr reaktion Prøver blev bearbejdet og analyseret tredobbelt Baseret på 100 % positivitet var den analytiske sensitivitet for serogruppe 2 - 10 og 12 150 CFU/reaktion; den faktiske påvisningsgrænse (Limit of Detection, LOD) kan dog være under det laveste testede niveau Baseret på 100 % positivitet var den analytiske sensitivitet for serogruppe 1 og 11 300 CFU/reaktion; serogruppe 13 var 450 CFU/reaktion; og serogruppe 14 var 700 CFU/reaktion Den analytiske sensitivitet af BD ProbeTec ET LP analysen ved tilstedeværelse af en lavere matrix af præparater fra de nedre luftveje blev bestemt ved at spike en makrofag-inficeret stamme af L pneumophila serogruppe 1 i spyt ved niveauer på 0, 150, 300 og 450 CFU pr reaktion Præparaterne blev bearbejdet og analyseret tredobbelt Baseret på 100 % positivitet var den analytiske sensitivitet for spikede præparater fra de nedre luftveje 150 CFU/reaktion; den faktiske LOD kan dog være under det laveste testede niveau Analytisk specificitet I alt blev 79 mikroorganismer (69 bakterier, en gærsvamp og ni vira) evalueret ved hjælp af BD ProbeTec ET LP analysen Bakterieisolater blev testet ved koncentrationer, der gik fra 1 x 106 CFU/mL til 1 x 108 CFU/mL Vira blev testet ved en koncentration på 1 x 106 virale partikler/mL Coccidioides immitis blev præpareret som en myceliumsuspension svarende til en McFarland standard på 5 Ingen af de testede mikroorganismer frembragte et positivt resultat eller hæmmede IAC (Tabel 4) Tabel 4: BD ProbeTec ET LP analyse - Analytisk specificitet Acinetobacter calcoaceticus Actinomyces israelii Adenovirus-5 Aeromonas hydrophila Blastomyces dermatitidis Bordetella bronchiseptica Bordetella parapertussis Bordetella pertussis Branhamella catarrhalis Candida albicans Chlamydia trachomatis, serogruppe L2 Chlamydophila pneumoniae, AR-39 Citrobacter freundii Coccidioides immitis Corynebacterium diphtheriae Corynebacterium jeikeium Cryptococcus neoformans Cytomegalovirus Eikenella corrodens Enterobacter aerogenes Enterobacter cloacae Enterococcus faecalis Enterococcus faecium Enterovirus (Echovirus) Escherichia coli Fusobacterium nucleatum Haemophilus influenzae Haemophilus parainfluenzae Herpesvirus-1 Histoplasma capsulatum Influenzavirus A Influenzavirus B Kingella kingae Klebsiella pneumoniae subsp ozaenae type 4 Klebsiella pneumoniae subsp pneumoniae Lactobacillus acidophilus Legionella anisa Legionella bozemanii Legionella cherrii Legionella cincinnatiensis Legionella dumoffii Legionella erytha INTERFERERENDE STOFFER Potentielle, interfererende stoffer, som kan mødes i præparater fra de nedre luftveje, blev testet med BD ProbeTec ET LP analysen ved fravær af fokus eller ved tilstedeværelse af 750 CFU/reaktion af L pneumophila Ved fravær af fokus frembragte ingen af de testede stoffer et positivt resultat eller hæmmede IAC ved de koncentrationer, der er angivet i Tabel 5 Når fokus var i tilstedeværelse af stoffer ved de koncentrationer, der er angivet i Tabel 5, frembragte alle testede prøver et positivt resultat 11 Legionella fairfieldensis Legionella feeleii Legionella gormanii Legionella hackeliae Legionella jordanis Legionella longbeachae Legionella maceachernii Legionella oakridgensis Legionella sainthelensi Legionella spiritensis Legionella worsleiensis Moraxella osloensis Mycobacterium tuberculosis Mycoplasma pneumoniae Neisseria gonorrhoeae Neisseria meningitidis Neisseria mucosa Parainfluenza type 1 Peptostreptococcus anaerobius Porphyromonas asaccharolytica Prevotella oralis Pseudomonas aeruginosa Respiratorisk syncytialvirus, lang stamme Rhinovirus Salmonella choleraesuis serotype Enteritidis Salmonella choleraesuis serotype Typhi Serratia marcescens Staphylococcus aureus, protein A-producerende Staphylococcus aureus, non-protein Aproducerende Staphylococcus epidermidis Stenotrophomonas maltophilia Streptococcus gruppe B Streptococcus mutans Streptococcus pneumoniae Streptococcus pyogenes Tatlockia (Legionella) micdadei Veillonella parvula
Page 1 and 2: BProbeTec ET Legionella pneumophila
Page 3 and 4: 2 Prøveopbevaring og -transport
Page 5 and 6: 33 Mærk et 2 mL glas med skruehæt
Page 7 and 8: Præparatbearbejdningskontroller Pr
Page 9: Hyppighed 60 50 40 30 20 10 0 Figur
Page 13 and 14: 6 US Department of Health and Human

BProbeTec ET Legionella pneumophila (LP) Amplified DNA ... - BD

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?