Abschlußbericht zum Projekt „Molekularbiologische ... - UOK

Abschlussbericht FKZ UGV04070803084
in Probe 10 und die Art Ulocladium in Probe 12 mithilfe des Kits nicht detektiert
werden, da dieser diese Gattungen/Arten nicht beinhaltet. Im Großen und Ganzen
stimmen die Ergebnisse mit der morphologischen Bestimmung und den Ergebnissen
aus der Sequenzierung überein. Teilweise deuteten die Ergebnisse des Kits darüber
hinaus auf das Vorhandensein weiterer Gattungen/Arten hin (siehe Probe 2,4,7,9
und 12). Mögliche Ursache hierfür kann sein, dass die jeweilige Art bei der
Vereinzelung der Schimmelpilze auf die Sabouraud-Glukose-Agarplatte
verlorengegangen ist.
Der Kit enthält ferner Schimmelpilze, die häufig in feuchten Häusern vorkommen als
auch Pilze, als Background, die charakteristisch für trockene Häuser sind. Die
jeweiligen Arten wurden aber aufgrund von Daten, die in den USA erhoben wurden,
ausgewählt und sind so für die USA spezifisch. Die Ergebnisse zeigen, dass in
deutschen Häusern Penicillium chrysogenum häufig in trockenen Häusern vorkommt
(in 7 von 12 Proben detektiert). Aus der Gruppe der typischen mit Feuchtigkeit
assoziierten Pilze waren besonders häufig Vertreter von Penicillium brevicompactum
/ stoloniferum (3/12) (nicht zu unterscheiden), Penicillium crustosum/ camembertii/
commune/ echinulatum/ solitum (ebenfalls nicht zu unterscheiden (4/12) und
Aspergillus versicolor (4/12) anzutreffen.
4.4.2 Adaption der PCR-basierten Methode auf lebensmittelrelevante
Pilzspezies
Auf der Homepage der U.S. Environmental Protection Agency
(http://www.epa.gov/nerlcwww/moldtech.htm) sind neben der im Kit enthaltenen
Primer und Sonden weitere Sequenzen zur Identifizierung von Schimmelpilzen,
darunter auch lebensmittelrelevante Pilze, enthalten. Um diese auf ihre Spezifität hin
zu überprüfen, wurden sie gegen 44 DNAs (40 Pilzstämme) der hausinternen
Stammsammlung getestet. Die für die Gattung der Fusarien spezifischen Sonden
und Primersequenzen wurden der Literatur entnommen (Waalwijk et al., 2004). In
Tabelle 6 sind die Sequenzen der einzelnen Nachweissysteme zusammengestellt.
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