05.01.2015 Views

زﻧﺒﻮر ﻋﺴﻞ اﯾﺮان ژﻧﻮم ﻣﯿﺘﻮﮐﻨﺪري در ﺟﻤﻌﯿﺖ ﺗﻨﻮع ﻣﻨﻄﻘﻪ ي C - دانشگاه تهران

زﻧﺒﻮر ﻋﺴﻞ اﯾﺮان ژﻧﻮم ﻣﯿﺘﻮﮐﻨﺪري در ﺟﻤﻌﯿﺖ ﺗﻨﻮع ﻣﻨﻄﻘﻪ ي C - دانشگاه تهران

زﻧﺒﻮر ﻋﺴﻞ اﯾﺮان ژﻧﻮم ﻣﯿﺘﻮﮐﻨﺪري در ﺟﻤﻌﯿﺖ ﺗﻨﻮع ﻣﻨﻄﻘﻪ ي C - دانشگاه تهران

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

تنوع منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی COI-COII ژنوم میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong> <strong>در</strong> جمعیت<br />

زنبور عسل ایران<br />

1<br />

1<br />

1<br />

1<br />

1<br />

مریم صف<strong>در</strong><strong>ي</strong> شاهرود<strong>ي</strong> ، حسن مهربانی یگانه ، عباس پاکدل ، اردشیر نجاتی جوارمی و غلامعلی نهضتی پاقلعه<br />

1<br />

دانشکده کشاورز<strong>ي</strong> و منابع طبیعی کرج،‏ <strong>دانشگاه</strong> <strong>تهران</strong><br />

‏*مریم صف<strong>در</strong><strong>ي</strong> شاهرود<strong>ي</strong> safdai_m2002@yahoo.com<br />

چکیده<br />

هدف این مطالعه تعیین تنوع ژنتیکی <strong>در</strong> منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی<br />

استفاده از تکنیک<br />

COI-COII<br />

PCR-RFLP<br />

DNA صورت گرفت و منطقه بین ژنی<br />

بود.‏ به این منظور از حدود<br />

200<br />

COI-COII<br />

ناحیه DNA<br />

تکثیر شده با<br />

DraI<br />

دو الگو<strong>ي</strong> هضمی متفاوت<br />

4<br />

ژنوم میتوکن<strong>در</strong>یایی <strong>در</strong> جمعیت ها<strong>ي</strong> مختلف زنبور عسل ایران با<br />

زنبور کارگر بالغ جمع آور<strong>ي</strong> شده از مناطق مختلف ایران استخراج<br />

<strong>در</strong> آنها با استفاده از یک جفت آغازگر عمومی تکثیر یافت.‏ با برش آنزیمی این<br />

قطعه ا<strong>ي</strong> با اندازه ها<strong>ي</strong><br />

420 و 64 ،47 ،41<br />

و همچنین با اندازه ها<strong>ي</strong><br />

،420<br />

39 و 47 ،64<br />

DNA<strong>ي</strong> میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong> بودند.‏<br />

کلمات کلید<strong>ي</strong>:‏<br />

جفت باز<strong>ي</strong> تولید شد.‏ بر اساس نتایج الگو<strong>ي</strong> هضمی آنزیم<br />

DraI<br />

تنوع ژنتیکی-‏ زنبور عسل-‏ منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی DNA<strong>ي</strong> -COI-COII میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong><br />

جمعیت ها<strong>ي</strong> زنبور عسل ایرانی متعلق به گروه C خط<br />

مقدمه<br />

یکی از حشرات شناخته شده <strong>در</strong> رده بند<strong>ي</strong> حیوانات زنبور عسل است<br />

(Apis mellifera)<br />

محدودیت ها<strong>ي</strong> جغرافیایی پراکنده شده است.‏ با استفاده از نتایج مطالعات ریخت شناسی و ملکولی،‏<br />

که <strong>در</strong> کل جهان با همه <strong>ي</strong><br />

26<br />

زیر گونه <strong>ي</strong> زنبور<br />

عسل شناسایی شده است که <strong>در</strong> پنج خط تکاملی جا<strong>ي</strong> می گیرند:‏ خط اروپا<strong>ي</strong> شمالی و غربی (M)، آفریقا<strong>ي</strong> مرکز<strong>ي</strong> و جنوبی<br />

(A)، منطقه <strong>ي</strong> مدیترانه <strong>ي</strong> شمالی و اروپا<strong>ي</strong> شرقی<br />

نهایت گروه منطقه <strong>ي</strong> شرقی کشور اتیوپی<br />

، (C)<br />

خط شرق مدیترانه و خاور نزدیک و شرق خاورمیانه<br />

(O)<br />

.(3) (Y)<br />

خطوط تکاملی زنبورها<strong>ي</strong> عسل را می توان با استفاده از مطالعه <strong>ي</strong> تنوع <strong>در</strong> منطقه <strong>ي</strong> ژنومی<br />

COI-COII<br />

زیر واحد سیتوکروم اکسیداز یک و دو)‏ از ژنوم میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong> مشخص نمود.‏ هضم این منطقه با استفاده از آنزیم<br />

و <strong>در</strong><br />

‏(منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی دو<br />

DraI<br />

50<br />

هدف<br />

الگو<strong>ي</strong> هضمی <strong>در</strong> خطوط A<br />

و M<br />

از این مطالعه،‏ بررسی تنوع ژنتیکی <strong>در</strong> مکان<br />

نشان داده است ولی <strong>در</strong> خط C تنها<br />

5<br />

COI-COII<br />

الگو<strong>ي</strong> باند<strong>ي</strong> برش یافته دیده شده است(‏‎7‎‏).‏<br />

بیشتر از<br />

<strong>در</strong> جمعیت زنبور عسل ایرانی است.‏ زنبور دار<strong>ي</strong> مهاجرتی و<br />

واردات ملکه دو عامل مهم <strong>در</strong> افزایش یکنواختی،‏ از دست دادن تنوع ژنتیکی و وارد شدن ژنها از جمعیت ها<strong>ي</strong> غیر بومی به<br />

جمعیت ها<strong>ي</strong> محلی زنبور عسل است.‏<br />

از تنوع ژنتیکی بین جمعیت ها می توان <strong>در</strong> مطالعات حفاظت،‏ بهبود نژاد ها<strong>ي</strong> زنبور<br />

عسلی که به لحاظ اقتصاد<strong>ي</strong> مهم اند و دارا<strong>ي</strong> ویژگی ها<strong>ي</strong> مطلوبی چون مقاومت به بیمار<strong>ي</strong> ها و سازگار<strong>ي</strong> به شرایط خاص<br />

هستند،‏ استفاده نمود.‏


مواد و روش ها<br />

نمونه گیر<strong>ي</strong> و استخراج :DNA زنبور ها<strong>ي</strong> کارگر بالغ از مناطق مختلف ایران شامل کرج ‏(‏‎40‎نمونه)،‏ چالوس<br />

(20)، گلستان<br />

،(20) اصفهان ،(40) کرمان (20)<br />

کارگر گرفته شد.‏ زنبور ها<strong>ي</strong> عسل تا زمان استفاده برا<strong>ي</strong> استخراج<br />

سلسیوس نگهدار<strong>ي</strong> شدند.‏<br />

استفاده قرار گرفت.‏<br />

و قسمت جنوبی استان سیستان و بلوچستان(‏‎40‎‏)‏ جمع آور<strong>ي</strong> شدند.‏ از هر کلنی یک زنبور<br />

همچنین نمونه هایی از کلنی هایی<br />

DNA<br />

96 <strong>در</strong> اتانول<br />

<strong>در</strong>صد و <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong><br />

-20<br />

(10)<br />

استخراج DNA<br />

از جفت پرایمر زیر تکثیر شد.‏<br />

از کل بدن هر زنبور بر اساس روش اسد<strong>ي</strong> و همکاران<br />

<strong>در</strong>جه <strong>ي</strong><br />

که ملکه <strong>ي</strong> آنها از کشور ترکیه وارد شده بود نیز مورد<br />

(2009)<br />

انجام گرفت.‏ منطقه <strong>ي</strong><br />

COI-COII<br />

با استفاده<br />

Forward: 5' GGC AGA ATA AGT GCA TTG 3'<br />

Reverse: 5' CAA TAT CAT TGA TGA CC 3'<br />

برنامه <strong>ي</strong> PCR نیز به این صورت بود:‏ مرحله <strong>ي</strong> واسرشت ساز<strong>ي</strong> اولیه<br />

چرخه شامل<br />

<strong>ي</strong> بسط نهایی<br />

آگارز<br />

دقیقه <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong> 4<br />

94<br />

<strong>در</strong>جه <strong>ي</strong> سلسیوس،‏ پس از آن<br />

35<br />

30 <strong>در</strong>جه برا<strong>ي</strong> 94<br />

ثانیه،‏ دما<strong>ي</strong> اتصال‎46‎ <strong>در</strong>جه برا<strong>ي</strong><br />

45<br />

ثانیه و زمان بسط<br />

45<br />

ثانیه <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong><br />

72<br />

دقیقه <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong> 6<br />

72<br />

2<br />

<strong>در</strong>جه بود.‏ مرحله<br />

<strong>در</strong>جه <strong>در</strong> نظر گرفته شد.‏ محصولات PCR جهت اطمینان از تکثیر و کیفیت آن بر رو<strong>ي</strong> ژل<br />

<strong>در</strong>صد الکتروفورز شد و پس از رنگ آمیز<strong>ي</strong> با اتیدیوم بروماید تحت نور ماورا<strong>ي</strong> بنفش مشاهده شد.‏<br />

محصولات PCR<br />

صورت بود که<br />

<strong>در</strong> مرحله <strong>ي</strong> بعد با استفاده از آنزیم<br />

(TTTAAA) DraI<br />

7<br />

میکرولیتر محصول<br />

استفاده از آب مقطر استریل به<br />

2 ،PCR<br />

20<br />

مورد هضم قرار گرفتند.‏ شرایط واکنش هم به این<br />

میکرولیتر بافر و یک میکرولیتر آنزیم استفاده شد و حجم نهایی واکنش با<br />

میکرولیتر رسانده شد.‏ مخلوط واکنش به مدت<br />

12<br />

سلسیوس قرار داده شد.‏ محصولات هضم برا<strong>ي</strong> مشاهده <strong>ي</strong> قطعه <strong>ي</strong> بزرگتر رو<strong>ي</strong> ژل آگارز<br />

قطعات کوچک تر بر رو<strong>ي</strong> ژل اکریل آمید<br />

نتایج و بحث<br />

آنزیم<br />

ساعت <strong>در</strong> حمام آب گرم<br />

37<br />

2/5<br />

12<br />

<strong>در</strong>صد الکتروفورز شد.‏<br />

نتایج حاصل از هضم محصول PCR <strong>در</strong> شکل ها<strong>ي</strong> یک و دو نشان داده شده است.‏ <strong>در</strong> شکل یک قطعه <strong>ي</strong><br />

نشان داده شده است و <strong>در</strong> شکل شماره <strong>ي</strong> دو نیز قطعات کوچک تر نشان داده شده اند.‏<br />

<strong>در</strong>جه<br />

<strong>در</strong>صد و برا<strong>ي</strong> مشاهده <strong>ي</strong><br />

420<br />

DraI<br />

(185 غالب بود<br />

قطعاتی با اندازه ها<strong>ي</strong><br />

جفت باز<strong>ي</strong><br />

دارا<strong>ي</strong> سه مکان برش <strong>در</strong> منطقه <strong>ي</strong> تکثیر شده بود و دو الگو<strong>ي</strong> هضمی ایجاد نمود.‏ <strong>در</strong> الگو<strong>ي</strong> اول که دارا<strong>ي</strong> فراوانی<br />

نمونه)،‏ قطعاتی با طول<br />

420 و 64 ،41 ،47<br />

تولید شد و <strong>در</strong> الگو<strong>ي</strong> دوم<br />

5)<br />

39 و 47 ،64 ،420<br />

ایجاد شد.‏ که این الگوها ویژگی خط<br />

مربوط به کشور ترکیه نیز دارا<strong>ي</strong> الگو<strong>ي</strong> باند<strong>ي</strong> مشابه با الگو<strong>ي</strong> اول بودند.‏<br />

پیش جنگ و همکاران<br />

C<br />

92 (2011)<br />

زنبور کارگر جمع آور<strong>ي</strong> شده از<br />

15<br />

بررسی قرار دادند.‏ هضم این منطقه با DraI چهار قطعه <strong>ي</strong> بریده شده با طول ها<strong>ي</strong><br />

هیچ تنوعی <strong>در</strong> بین نمونه ها مشاهده نشد.‏ جبار<strong>ي</strong> فرهود و کنس<br />

نمونه از نمونه ها<strong>ي</strong> چالوس و کرج)‏<br />

مدیترانه است.‏ الگو<strong>ي</strong> هضمی نمونه ها<strong>ي</strong><br />

منطقه <strong>ي</strong> مختلف ایران به عنوان ماده <strong>ي</strong> آزمایشی مورد<br />

64 ،47 ،41<br />

(2005)<br />

و 420 جفت باز حاصل نمود.‏<br />

با انجام مطالعه ا<strong>ي</strong> بر رو<strong>ي</strong> نمونه ها<strong>ي</strong> زنبور عسل


جمع آور<strong>ي</strong> شده از پنج منطقه <strong>در</strong> شمال و شمال شرقی ایران،‏ نیز نتایج مشابهی به دست آورند.‏ ازدیل و همکاران (2009) <strong>در</strong><br />

مطالعه <strong>ي</strong> خویش که <strong>در</strong> آن از زنبورها<strong>ي</strong> عسل ایران از منطقه <strong>ي</strong> شمال غربی نیز نمونه گیر<strong>ي</strong> کرده بودند <strong>در</strong> نمونه ها<strong>ي</strong> ایرانی<br />

الگو<strong>ي</strong> باند<strong>ي</strong> با قطعات<br />

47 ،64 ،420<br />

مختلفی و از جمله دارا<strong>ي</strong> الگو<strong>ي</strong><br />

39 و<br />

41 و 47 ،64 ،420<br />

مشاهده نمودند.‏ نمونه ها<strong>ي</strong> مربوط به کشور ترکیه <strong>در</strong> این مطالعه دارا<strong>ي</strong> الگوها<strong>ي</strong><br />

گزارش شده اند که با نتایج ما همخوانی دارد.‏<br />

1- شکل<br />

قطعه <strong>ي</strong> 420 جفت باز<strong>ي</strong> حاصل از هضم محصول PCR بر رو<strong>ي</strong> ژل آگارز<br />

<strong>در</strong>صد.‏ 2/5<br />

2- شکل<br />

قطعات کوچک حاصل از هضم محصول PCR بر رو<strong>ي</strong> ژل اکریل آمید<br />

الگو<strong>ي</strong> نمونه است).‏<br />

12<br />

<strong>در</strong>صد ‏(عدد پایین ستون نشان دهنده <strong>ي</strong>


1. Asadi, N. 2009. Cytogenetics and molecular genetics in animal science. Animal science<br />

research institute of Iran. Karaj. pp 57.<br />

منابع<br />

2. Ferreira, K., O. L. Silva, M. Arias and M. Del Lama. Cytochrome-b variation in Apis<br />

mellifera samples and its association with COI-COII patterns. 2009. Genetica. 135:<br />

149-155.<br />

3. Garnery, L., M. Solignac, G. Celebrano and J. M. Cornuet. 1993. A simple test using<br />

restricted PCR amplified mitochondrial DNA to study the genetic structure of Apis<br />

mellifera L., Experienta 49: 1016-1021.<br />

4. Jabbari Farhoud, H. and M. Kence. 2005. Morphometric and MtDNA analysis in honeybee<br />

populations (Apis mellifera L.) of north and northeast Iran. Proceedings of the Balkan<br />

Scientific Conference of Biology in Plovdiv. P:594-597.<br />

5. Ozdil, F., M. A. Yildiz, H. G. Hall. 2009. Molecular characterization of Turkish honey bee<br />

populations (Apis mellifera) inferred from mitochondrial DNA RFLP and sequence<br />

analysis. Apidologie 40:570-576.<br />

6. Pish Jang, J., M. Ali Yihz, B. Fakhri and A. Nobakht. 2011. A study of the diversity in COI-<br />

COII intergenic region of mitochondrial DNA in different Persian honeybee (A.<br />

Mellifera Meda). J. Basic. Appl. Sci. Res. 1:2150-2154.<br />

7. Ruttner, F. 1988. Biogeography and Taxonomy of Honeybees. Springer-Verlag, Berlin.<br />

variation in mitochondrial COI-COII intergenic region of Iranian honey<br />

bee population<br />

Maryam Safdari Shahroudi 1 , Hassan Mehrabani Yeganeh 1<br />

1 University of Agricalture and Natural Resourse, University of Tehran, Karaj<br />

* safdari_m2002@yahoo.com<br />

Abstract:<br />

The goal of This study was the determination of genetic variation in COI-COII intergenic region of<br />

mtDNA in different Iranian honeybee populations by using RFLP-PCR. DNA extraction was carried<br />

out from 200 worker honey bees, collected from different locations of Iran, and COI-COII intergenic<br />

region of the samples were amplified using a universal primer pair. Based on the results of digestion of<br />

the amplicons by DraI, the samples were separated in two different digestion profiles. The first group<br />

with 4 restriction fragments 41, 47, 64 and 420 bp was distinguished from the second group with<br />

having 39, 47, 64 and 420 bp bands. According to DraI restriction analysis, Iranian honeybees were<br />

grouped as a member of C mtDNA lineage.<br />

Keywords: genetic variation- Apis mellifera- COI-COII - mitochondrial DNA

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!