05.01.2015 Views

زﻧﺒﻮر ﻋﺴﻞ اﯾﺮان ژﻧﻮم ﻣﯿﺘﻮﮐﻨﺪري در ﺟﻤﻌﯿﺖ ﺗﻨﻮع ﻣﻨﻄﻘﻪ ي C - دانشگاه تهران

زﻧﺒﻮر ﻋﺴﻞ اﯾﺮان ژﻧﻮم ﻣﯿﺘﻮﮐﻨﺪري در ﺟﻤﻌﯿﺖ ﺗﻨﻮع ﻣﻨﻄﻘﻪ ي C - دانشگاه تهران

زﻧﺒﻮر ﻋﺴﻞ اﯾﺮان ژﻧﻮم ﻣﯿﺘﻮﮐﻨﺪري در ﺟﻤﻌﯿﺖ ﺗﻨﻮع ﻣﻨﻄﻘﻪ ي C - دانشگاه تهران

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

تنوع منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی COI-COII ژنوم میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong> <strong>در</strong> جمعیت<br />

زنبور عسل ایران<br />

1<br />

1<br />

1<br />

1<br />

1<br />

مریم صف<strong>در</strong><strong>ي</strong> شاهرود<strong>ي</strong> ، حسن مهربانی یگانه ، عباس پاکدل ، اردشیر نجاتی جوارمی و غلامعلی نهضتی پاقلعه<br />

1<br />

دانشکده کشاورز<strong>ي</strong> و منابع طبیعی کرج،‏ <strong>دانشگاه</strong> <strong>تهران</strong><br />

‏*مریم صف<strong>در</strong><strong>ي</strong> شاهرود<strong>ي</strong> safdai_m2002@yahoo.com<br />

چکیده<br />

هدف این مطالعه تعیین تنوع ژنتیکی <strong>در</strong> منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی<br />

استفاده از تکنیک<br />

COI-COII<br />

PCR-RFLP<br />

DNA صورت گرفت و منطقه بین ژنی<br />

بود.‏ به این منظور از حدود<br />

200<br />

COI-COII<br />

ناحیه DNA<br />

تکثیر شده با<br />

DraI<br />

دو الگو<strong>ي</strong> هضمی متفاوت<br />

4<br />

ژنوم میتوکن<strong>در</strong>یایی <strong>در</strong> جمعیت ها<strong>ي</strong> مختلف زنبور عسل ایران با<br />

زنبور کارگر بالغ جمع آور<strong>ي</strong> شده از مناطق مختلف ایران استخراج<br />

<strong>در</strong> آنها با استفاده از یک جفت آغازگر عمومی تکثیر یافت.‏ با برش آنزیمی این<br />

قطعه ا<strong>ي</strong> با اندازه ها<strong>ي</strong><br />

420 و 64 ،47 ،41<br />

و همچنین با اندازه ها<strong>ي</strong><br />

،420<br />

39 و 47 ،64<br />

DNA<strong>ي</strong> میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong> بودند.‏<br />

کلمات کلید<strong>ي</strong>:‏<br />

جفت باز<strong>ي</strong> تولید شد.‏ بر اساس نتایج الگو<strong>ي</strong> هضمی آنزیم<br />

DraI<br />

تنوع ژنتیکی-‏ زنبور عسل-‏ منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی DNA<strong>ي</strong> -COI-COII میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong><br />

جمعیت ها<strong>ي</strong> زنبور عسل ایرانی متعلق به گروه C خط<br />

مقدمه<br />

یکی از حشرات شناخته شده <strong>در</strong> رده بند<strong>ي</strong> حیوانات زنبور عسل است<br />

(Apis mellifera)<br />

محدودیت ها<strong>ي</strong> جغرافیایی پراکنده شده است.‏ با استفاده از نتایج مطالعات ریخت شناسی و ملکولی،‏<br />

که <strong>در</strong> کل جهان با همه <strong>ي</strong><br />

26<br />

زیر گونه <strong>ي</strong> زنبور<br />

عسل شناسایی شده است که <strong>در</strong> پنج خط تکاملی جا<strong>ي</strong> می گیرند:‏ خط اروپا<strong>ي</strong> شمالی و غربی (M)، آفریقا<strong>ي</strong> مرکز<strong>ي</strong> و جنوبی<br />

(A)، منطقه <strong>ي</strong> مدیترانه <strong>ي</strong> شمالی و اروپا<strong>ي</strong> شرقی<br />

نهایت گروه منطقه <strong>ي</strong> شرقی کشور اتیوپی<br />

، (C)<br />

خط شرق مدیترانه و خاور نزدیک و شرق خاورمیانه<br />

(O)<br />

.(3) (Y)<br />

خطوط تکاملی زنبورها<strong>ي</strong> عسل را می توان با استفاده از مطالعه <strong>ي</strong> تنوع <strong>در</strong> منطقه <strong>ي</strong> ژنومی<br />

COI-COII<br />

زیر واحد سیتوکروم اکسیداز یک و دو)‏ از ژنوم میتوکن<strong>در</strong><strong>ي</strong> مشخص نمود.‏ هضم این منطقه با استفاده از آنزیم<br />

و <strong>در</strong><br />

‏(منطقه <strong>ي</strong> بین ژنی دو<br />

DraI<br />

50<br />

هدف<br />

الگو<strong>ي</strong> هضمی <strong>در</strong> خطوط A<br />

و M<br />

از این مطالعه،‏ بررسی تنوع ژنتیکی <strong>در</strong> مکان<br />

نشان داده است ولی <strong>در</strong> خط C تنها<br />

5<br />

COI-COII<br />

الگو<strong>ي</strong> باند<strong>ي</strong> برش یافته دیده شده است(‏‎7‎‏).‏<br />

بیشتر از<br />

<strong>در</strong> جمعیت زنبور عسل ایرانی است.‏ زنبور دار<strong>ي</strong> مهاجرتی و<br />

واردات ملکه دو عامل مهم <strong>در</strong> افزایش یکنواختی،‏ از دست دادن تنوع ژنتیکی و وارد شدن ژنها از جمعیت ها<strong>ي</strong> غیر بومی به<br />

جمعیت ها<strong>ي</strong> محلی زنبور عسل است.‏<br />

از تنوع ژنتیکی بین جمعیت ها می توان <strong>در</strong> مطالعات حفاظت،‏ بهبود نژاد ها<strong>ي</strong> زنبور<br />

عسلی که به لحاظ اقتصاد<strong>ي</strong> مهم اند و دارا<strong>ي</strong> ویژگی ها<strong>ي</strong> مطلوبی چون مقاومت به بیمار<strong>ي</strong> ها و سازگار<strong>ي</strong> به شرایط خاص<br />

هستند،‏ استفاده نمود.‏


مواد و روش ها<br />

نمونه گیر<strong>ي</strong> و استخراج :DNA زنبور ها<strong>ي</strong> کارگر بالغ از مناطق مختلف ایران شامل کرج ‏(‏‎40‎نمونه)،‏ چالوس<br />

(20)، گلستان<br />

،(20) اصفهان ،(40) کرمان (20)<br />

کارگر گرفته شد.‏ زنبور ها<strong>ي</strong> عسل تا زمان استفاده برا<strong>ي</strong> استخراج<br />

سلسیوس نگهدار<strong>ي</strong> شدند.‏<br />

استفاده قرار گرفت.‏<br />

و قسمت جنوبی استان سیستان و بلوچستان(‏‎40‎‏)‏ جمع آور<strong>ي</strong> شدند.‏ از هر کلنی یک زنبور<br />

همچنین نمونه هایی از کلنی هایی<br />

DNA<br />

96 <strong>در</strong> اتانول<br />

<strong>در</strong>صد و <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong><br />

-20<br />

(10)<br />

استخراج DNA<br />

از جفت پرایمر زیر تکثیر شد.‏<br />

از کل بدن هر زنبور بر اساس روش اسد<strong>ي</strong> و همکاران<br />

<strong>در</strong>جه <strong>ي</strong><br />

که ملکه <strong>ي</strong> آنها از کشور ترکیه وارد شده بود نیز مورد<br />

(2009)<br />

انجام گرفت.‏ منطقه <strong>ي</strong><br />

COI-COII<br />

با استفاده<br />

Forward: 5' GGC AGA ATA AGT GCA TTG 3'<br />

Reverse: 5' CAA TAT CAT TGA TGA CC 3'<br />

برنامه <strong>ي</strong> PCR نیز به این صورت بود:‏ مرحله <strong>ي</strong> واسرشت ساز<strong>ي</strong> اولیه<br />

چرخه شامل<br />

<strong>ي</strong> بسط نهایی<br />

آگارز<br />

دقیقه <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong> 4<br />

94<br />

<strong>در</strong>جه <strong>ي</strong> سلسیوس،‏ پس از آن<br />

35<br />

30 <strong>در</strong>جه برا<strong>ي</strong> 94<br />

ثانیه،‏ دما<strong>ي</strong> اتصال‎46‎ <strong>در</strong>جه برا<strong>ي</strong><br />

45<br />

ثانیه و زمان بسط<br />

45<br />

ثانیه <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong><br />

72<br />

دقیقه <strong>در</strong> دما<strong>ي</strong> 6<br />

72<br />

2<br />

<strong>در</strong>جه بود.‏ مرحله<br />

<strong>در</strong>جه <strong>در</strong> نظر گرفته شد.‏ محصولات PCR جهت اطمینان از تکثیر و کیفیت آن بر رو<strong>ي</strong> ژل<br />

<strong>در</strong>صد الکتروفورز شد و پس از رنگ آمیز<strong>ي</strong> با اتیدیوم بروماید تحت نور ماورا<strong>ي</strong> بنفش مشاهده شد.‏<br />

محصولات PCR<br />

صورت بود که<br />

<strong>در</strong> مرحله <strong>ي</strong> بعد با استفاده از آنزیم<br />

(TTTAAA) DraI<br />

7<br />

میکرولیتر محصول<br />

استفاده از آب مقطر استریل به<br />

2 ،PCR<br />

20<br />

مورد هضم قرار گرفتند.‏ شرایط واکنش هم به این<br />

میکرولیتر بافر و یک میکرولیتر آنزیم استفاده شد و حجم نهایی واکنش با<br />

میکرولیتر رسانده شد.‏ مخلوط واکنش به مدت<br />

12<br />

سلسیوس قرار داده شد.‏ محصولات هضم برا<strong>ي</strong> مشاهده <strong>ي</strong> قطعه <strong>ي</strong> بزرگتر رو<strong>ي</strong> ژل آگارز<br />

قطعات کوچک تر بر رو<strong>ي</strong> ژل اکریل آمید<br />

نتایج و بحث<br />

آنزیم<br />

ساعت <strong>در</strong> حمام آب گرم<br />

37<br />

2/5<br />

12<br />

<strong>در</strong>صد الکتروفورز شد.‏<br />

نتایج حاصل از هضم محصول PCR <strong>در</strong> شکل ها<strong>ي</strong> یک و دو نشان داده شده است.‏ <strong>در</strong> شکل یک قطعه <strong>ي</strong><br />

نشان داده شده است و <strong>در</strong> شکل شماره <strong>ي</strong> دو نیز قطعات کوچک تر نشان داده شده اند.‏<br />

<strong>در</strong>جه<br />

<strong>در</strong>صد و برا<strong>ي</strong> مشاهده <strong>ي</strong><br />

420<br />

DraI<br />

(185 غالب بود<br />

قطعاتی با اندازه ها<strong>ي</strong><br />

جفت باز<strong>ي</strong><br />

دارا<strong>ي</strong> سه مکان برش <strong>در</strong> منطقه <strong>ي</strong> تکثیر شده بود و دو الگو<strong>ي</strong> هضمی ایجاد نمود.‏ <strong>در</strong> الگو<strong>ي</strong> اول که دارا<strong>ي</strong> فراوانی<br />

نمونه)،‏ قطعاتی با طول<br />

420 و 64 ،41 ،47<br />

تولید شد و <strong>در</strong> الگو<strong>ي</strong> دوم<br />

5)<br />

39 و 47 ،64 ،420<br />

ایجاد شد.‏ که این الگوها ویژگی خط<br />

مربوط به کشور ترکیه نیز دارا<strong>ي</strong> الگو<strong>ي</strong> باند<strong>ي</strong> مشابه با الگو<strong>ي</strong> اول بودند.‏<br />

پیش جنگ و همکاران<br />

C<br />

92 (2011)<br />

زنبور کارگر جمع آور<strong>ي</strong> شده از<br />

15<br />

بررسی قرار دادند.‏ هضم این منطقه با DraI چهار قطعه <strong>ي</strong> بریده شده با طول ها<strong>ي</strong><br />

هیچ تنوعی <strong>در</strong> بین نمونه ها مشاهده نشد.‏ جبار<strong>ي</strong> فرهود و کنس<br />

نمونه از نمونه ها<strong>ي</strong> چالوس و کرج)‏<br />

مدیترانه است.‏ الگو<strong>ي</strong> هضمی نمونه ها<strong>ي</strong><br />

منطقه <strong>ي</strong> مختلف ایران به عنوان ماده <strong>ي</strong> آزمایشی مورد<br />

64 ،47 ،41<br />

(2005)<br />

و 420 جفت باز حاصل نمود.‏<br />

با انجام مطالعه ا<strong>ي</strong> بر رو<strong>ي</strong> نمونه ها<strong>ي</strong> زنبور عسل


جمع آور<strong>ي</strong> شده از پنج منطقه <strong>در</strong> شمال و شمال شرقی ایران،‏ نیز نتایج مشابهی به دست آورند.‏ ازدیل و همکاران (2009) <strong>در</strong><br />

مطالعه <strong>ي</strong> خویش که <strong>در</strong> آن از زنبورها<strong>ي</strong> عسل ایران از منطقه <strong>ي</strong> شمال غربی نیز نمونه گیر<strong>ي</strong> کرده بودند <strong>در</strong> نمونه ها<strong>ي</strong> ایرانی<br />

الگو<strong>ي</strong> باند<strong>ي</strong> با قطعات<br />

47 ،64 ،420<br />

مختلفی و از جمله دارا<strong>ي</strong> الگو<strong>ي</strong><br />

39 و<br />

41 و 47 ،64 ،420<br />

مشاهده نمودند.‏ نمونه ها<strong>ي</strong> مربوط به کشور ترکیه <strong>در</strong> این مطالعه دارا<strong>ي</strong> الگوها<strong>ي</strong><br />

گزارش شده اند که با نتایج ما همخوانی دارد.‏<br />

1- شکل<br />

قطعه <strong>ي</strong> 420 جفت باز<strong>ي</strong> حاصل از هضم محصول PCR بر رو<strong>ي</strong> ژل آگارز<br />

<strong>در</strong>صد.‏ 2/5<br />

2- شکل<br />

قطعات کوچک حاصل از هضم محصول PCR بر رو<strong>ي</strong> ژل اکریل آمید<br />

الگو<strong>ي</strong> نمونه است).‏<br />

12<br />

<strong>در</strong>صد ‏(عدد پایین ستون نشان دهنده <strong>ي</strong>


1. Asadi, N. 2009. Cytogenetics and molecular genetics in animal science. Animal science<br />

research institute of Iran. Karaj. pp 57.<br />

منابع<br />

2. Ferreira, K., O. L. Silva, M. Arias and M. Del Lama. Cytochrome-b variation in Apis<br />

mellifera samples and its association with COI-COII patterns. 2009. Genetica. 135:<br />

149-155.<br />

3. Garnery, L., M. Solignac, G. Celebrano and J. M. Cornuet. 1993. A simple test using<br />

restricted PCR amplified mitochondrial DNA to study the genetic structure of Apis<br />

mellifera L., Experienta 49: 1016-1021.<br />

4. Jabbari Farhoud, H. and M. Kence. 2005. Morphometric and MtDNA analysis in honeybee<br />

populations (Apis mellifera L.) of north and northeast Iran. Proceedings of the Balkan<br />

Scientific Conference of Biology in Plovdiv. P:594-597.<br />

5. Ozdil, F., M. A. Yildiz, H. G. Hall. 2009. Molecular characterization of Turkish honey bee<br />

populations (Apis mellifera) inferred from mitochondrial DNA RFLP and sequence<br />

analysis. Apidologie 40:570-576.<br />

6. Pish Jang, J., M. Ali Yihz, B. Fakhri and A. Nobakht. 2011. A study of the diversity in COI-<br />

COII intergenic region of mitochondrial DNA in different Persian honeybee (A.<br />

Mellifera Meda). J. Basic. Appl. Sci. Res. 1:2150-2154.<br />

7. Ruttner, F. 1988. Biogeography and Taxonomy of Honeybees. Springer-Verlag, Berlin.<br />

variation in mitochondrial COI-COII intergenic region of Iranian honey<br />

bee population<br />

Maryam Safdari Shahroudi 1 , Hassan Mehrabani Yeganeh 1<br />

1 University of Agricalture and Natural Resourse, University of Tehran, Karaj<br />

* safdari_m2002@yahoo.com<br />

Abstract:<br />

The goal of This study was the determination of genetic variation in COI-COII intergenic region of<br />

mtDNA in different Iranian honeybee populations by using RFLP-PCR. DNA extraction was carried<br />

out from 200 worker honey bees, collected from different locations of Iran, and COI-COII intergenic<br />

region of the samples were amplified using a universal primer pair. Based on the results of digestion of<br />

the amplicons by DraI, the samples were separated in two different digestion profiles. The first group<br />

with 4 restriction fragments 41, 47, 64 and 420 bp was distinguished from the second group with<br />

having 39, 47, 64 and 420 bp bands. According to DraI restriction analysis, Iranian honeybees were<br />

grouped as a member of C mtDNA lineage.<br />

Keywords: genetic variation- Apis mellifera- COI-COII - mitochondrial DNA

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!