生物信息学初探 - abc

引 言
斑 头 雁 是 候 鸟 中 一 个 特 殊 的 物 种 。 它 们 夏 天 居 住
在 青 海 湖 , 而 在 秋 天 会 飞 过 青 藏 高 原 到 达 印 度 再
在 春 天 飞 回 。 有 趣 的 是 , 与 斑 头 雁 亲 缘 关 系 接 近
的 灰 雁 长 年 居 住 在 印 度 低 地 , 并 不 迁 徙 。 通 过 两
者 血 红 蛋 白 的 序 列 对 比 发 现 仅 有 4 处 发 生 了 替 换 。
灰 雁 alpha 亚 基 中 第 119 位 脯 氨 酸 在 斑 头 雁 中 变 为
丙 氨 酸 。 该 残 基 位 于 alpha/beta 的 分 界 面 上 。 目
前 研 究 认 为 , 这 种 残 基 的 改 变 导 致 脱 氧 状 态 时 张
力 状 态 的 变 化 使 得 alpha 和 beta 亚 基 之 间 的 接 触
减 少 , 从 而 增 强 了 对 氧 的 亲 和 力 。 下 面 我 们 将 用
SPDBV 软 件 来 证 明 该 结 论 。