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LE CATABOLISME OXYDATIF

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LMB BCPST1A 2012-2013<br />

Étape 1: la synthèse du citrate par la Citrate synthase<br />

La citrate synthase est la première des 8 enzymes du cycle de Krebs, elle catalyse<br />

l'addition de l'acétyl-CoA sur la double liaison de l’oxaloacétate (un cétone).<br />

Le produit final est le citrate, un composé de 6 carbones.<br />

La réaction est très exergonique ce qui lui permet de se produire facilement, même<br />

lorsque la concentration d'oxaloacétate est basse dans la mitochondrie. La réaction est<br />

irréversible.<br />

La réorganisation du citrate en isocitrate<br />

est suivie de deux phases consécutives de<br />

décarboxylation oxydative avec<br />

production de NADH<br />

Étape 3: Isocitrate déshydrogénase<br />

Isocitrate + NAD + -Cétoglutarate + CO 2 + NADH<br />

Le manganèse (Mn ++ ) est cofacteur<br />

de la réaction.<br />

Pyruvate<br />

DG°’ = -31.5 kJ/mol<br />

Stryer, L., Berg, J, Tymoczko, J., (2003). Biochimie. Paris : Flammarion. (5 ème édition).<br />

Étape 4<br />

Étape 3<br />

Stryer, L., Berg, J, Tymoczko, J., (2003). Biochimie. Paris : Flammarion. (5 ème édition).<br />

acétyl-CoA<br />

-Cétoglutarate Succinyl-CoA<br />

Stryer, L., Berg, J, Tymoczko, J., (2003). Biochimie. Paris : Flammarion. (5 ème édition).<br />

85<br />

Réactions<br />

irréversibles<br />

87<br />

89<br />

Étape 2: Aconitase, isomérisation du citrate<br />

Le citrate est isomérisé en isocitrate par l’enzyme aconitase pour<br />

permettre la décarboxylation suivante.<br />

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Stryer, L., Berg, J, Tymoczko, J., (2003). Biochimie. Paris : Flammarion. (5ème édition).<br />

BRUNET 15<br />

Deux étapes:<br />

1) Déshydratation pour former cis-Aconitate<br />

2) Hydratation pour former isocitrate<br />

Étape 4: -Cétoglutarate déshydrogénase<br />

-Cétoglutarate Succinyl-CoA<br />

La deuxième décarboxylation oxydative permet la<br />

formation d’une molécule riche en énergie<br />

-Cétoglutarate + NAD + + CoA Succinyl-CoA + CO 2 + NADH<br />

Étape 4<br />

Étape 3<br />

Réactions<br />

irréversibles<br />

L’-Cétoglutarate déshydrogénase est un complexe enzymatique très similaire à la<br />

Pyruvate déshydrogénase<br />

88<br />

Stryer, L., Berg, J, Tymoczko, J., (2003). Biochimie. Paris : Flammarion. (5ème édition).<br />

Étape 5: Succinyl-CoA synthétase, phosphorylation au niveau du substrat<br />

La Succinyl-CoA synthétase (le nom de l’enzyme vient de la réactions inverse)<br />

transfère la liaison riche en énergie du succinyl-CoenzymeA au GDP et phosphate<br />

pour synthétiser du GTP.<br />

Cette étape (réversible) est la seule du cycle à fournir directement une liaison riche en<br />

énergie<br />

Le GTP peut facilement transférer son g-phosphoryl à l’ADP grâce à l’enzyme<br />

nucléoside diphosphokinase:<br />

GTP + ADP GDP + ATP<br />

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Stryer, L., Berg, J, Tymoczko, J., (2003). Biochimie. Paris : Flammarion. (5ème édition).

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