L'hybridation gÃ©nomique comparative en microrÃ©seau d'ADN (HGCM)

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Hybridation Génomique Comparative en Microréseau d’ADN (HGCM)Contrôles pools d’échantillons d’ADN NA15510 et NA10851 du NIGMS (US National Institute of General Medical Sciences) L'hybridation de l’ADN contrôle contre lui-même (efficacité d’analyse X10)Recommandations surestimation des CNV (contrôle unique) diminution de la détection des CNV dans les CNP critiquer les données obtenues-dosages différentiels dus aux hétérochromosomes-réarrangements somatiques des immunoglobulines-des altérations géniques engendrées par la culture cellulaire (trisomies en mosaïque)-instabilité génomique due aux transformations virales
GESTION DU SIGNAL EN HGCMFiltre bruit de fondFiltre dye-swapTRAITEMENT DU SIGNAL BRUTCONFRONTATIONAUXBASES DE DONNEESFiltre sonde consécutive (>3)Filtre récurrenceRéplicas d’expériencesIncidence de la variationCNP?, duplication?, délétion?Pertinence de la variationCodante?, régulation?, inconnue?Antécédents cliniquesComparaison avec l’observation faiteQ-PCRVALIDATIONDES RESULTATSCaryotype/FISHséquençage
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