“Sperimenta il BioLab” - CusMiBio - Università degli Studi di Milano

DOMANDE
In diverse regioni delle sequenze non vi è conservazione di aminoacidi tra le varie specie. A quali
segmenti corrispondono?
In quali tratti della catena polipeptidica invece compaiono gli asterischi?
Che considerazioni puoi fare a riguardo?
Scorrere verso il basso per osservare ora la sezione “Clustal W Dendrogram”. In base alle
differenze nelle sequenze aminoacidiche, il programma costruisce degli alberi filogenetici
(dendrogrammi). In un albero filogenetico si distinguono “rami”, che si sviluppano a partire da
“nodi” (un punto di divergenza evolutiva da un antenato comune) e che terminano in “foglie”, che
corrispondono alle sequenze presenti nei singoli taxa. La lunghezza dei “rami” indica il tempo
trascorso da un evento di divergenza. Esistono due tipi di alberi filogenetici: “rooted tree”, ossia
“con radici” e “unrooted tree”, ossia “senza radici”. Nel primo caso si prende un evento,
evolutivamente molto distante rispetto agli altri, come punto di partenza (la “radice”); nel
secondo caso questo riferimento manca e l’albero può essere utile per esaminare la distanza
filogenetica di gruppi definiti di organismi.
Osservando l’albero filogenetico ottenuto, rispondere alle successive domande.
DOMANDE
Esaminando l’albero “unrooted”, quali due specie risultano più vicine filogeneticamente? Spiega
il motivo della tua scelta.
La lunghezza dei “rami” dà un’idea della distanza evolutiva: dopo aver stampato il
dendrogramma e usando un righello, indica la distanza evolutiva in mm tra l’uomo e gli altri
animali:
uomo e cavallo: ...............................................
uomo e chimera: ...............................................
uomo e coniglio: ...............................................
uomo e maiale: ...............................................
uomo e missina: ...............................................
uomo e mucca: ...............................................
uomo e pecora: ...............................................
uomo e pollo: ...............................................
uomo e salmone: ...............................................
uomo e scimpanzè: ...............................................
uomo e topo: ...............................................
L’insulina della pecora è più strettamente vicina a quella del pollo o dell’uomo?
Che relazione evolutiva c’è tra l’insulina di maiale, pecora e mucca?
Commenta il significato di questi risultati sulla base delle tue conoscenze.
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