METINIS PRANEÅ IMAS 2007 - Biotechnologijos institutas

Metinis pranešimas – 2007Siekiant sukurti molekulinius įrankius, įgalinančius įvesti norimas funkcines ar reporterinesgrupes į RNR molekules griežtai užsibrėžtose vietose, buvo pradėti archėjų C/Dribonukleoproteinininių (C/D sRNP) kompleksų tyrimai. Šie kompleksai atlieka sekai specifinį2’-O-metilinimą daugybėje svarbių ribosominės ir transportinės RNR vietų. Į kompleksų sudėtįįeinančios kreipiančiosios RNR turi konservatyvias dalis (C/D ir C‘/D‘), kurios lemia sRNPbaltymų L7Ae, Nop5p ir aFib susirinkimą į kompleksą. Pyrococcus abyssi C/D sRNPrekombinantiniai komponentai buvo išgryninti Ni-chelatinės chromatografijos pagalba. Surinktiaktyvūs kompleksai metilina 15 nukleotidų ilgio modelinius bei gamtinius tRNR substratus.Sukurta ir optimizuota sistema, įgalinanti stebėti taikinio nukleotido modifikavimąplonasluoksnės chromatografijos metodu. Naudojant šį metodą parodyta, kad laukinio tipo RNPgali pernešti 3-4 anglies atomų grandines nuo sintetinių AdoMet analogų ant modelinio substrato.Augalų RNR metiltransferazė HEN1: struktūros ir funkcijos ryšys.MikroRNR ir siRNR yra trumpos, baltymus nekoduojančios dvigrandės RNR molekulės, kuriosreguliuoja genų raišką potranskripciniame lygmenyje. Šiuo metu didelis skaičius mažųreguliatorinių RNR identifikuota augaluose, kirmėlėse, vabzdžiuose, žuvyse, varlėse iržinduoliuose: skelbiama, kad iki 10 % žinomų žmogaus genų koduoja mikroRNR. Net 53% išanalizuotų 186 žmogaus mikroRNR genų lokalizuoti genomo rajonuose, sietinuose su vėžinėmligom. HEN1 yra neseniai rasta metiltransferazė iš Arabidopsis thaliana, modifikuojanti trumpasdvigrandes RNR, būtina mikroRNR biogenezei augaluose. Norint geriau suprasti veikimomechanizmą ir apibrėžti biologines HEN1 funkcijas, metiltransferazė buvo tirta in vitro:optimizuota metiltransferazės gryninimo schema ir metilinimo reakcijos sąlygos, nustatytastruktūrinė metiltransferazės organizacija ir apibrėžtos skirtingų baltymo domenų funkcijos.Eksperimentiškai nustatyta, kad baltymas turi mažiausiai du dvigrandę RNR surišančiusmotyvus. Be to parodyta, kad, nors katalitinis metiltransferazės domenas yra pakankamasmetilinimo reakcijai, N-galinis ir/ar centrinis domenai yra svarbūs formuojantis katalitiškaikompetentiškam reakcijos kompleksui.7.3. Prokariotų genų inžinerijos laboratorija (PGIL)2007 m. laboratorijoje dirbo 9 darbuotojai.Lentelė 7.3.Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnisPareigos1. Kornelijus Stankevičius dr. vyresnysis mokslo darb.,l. e. laboratorijos vedėjopareigasPastabos2. Artūras Jakubauskas dr. mokslo darb. nuo 05.05 ikikonkurso, atleistas07.12.183. Sonata Jurėnaitė-Urbanavičienėjaun. mokslo darb.4. Eglė Kriukienė dr. jaun. mokslo darb.5. Rimantas Šapranauskas jaun. mokslo darb.© Biotechnologijos institutas 55