METINIS PRANEÅ IMAS 2007 - Biotechnologijos institutas

Metinis pranešimas – 2007HIF-1α. Parodyta, kad šis faktorius yra svarbus piktybinių navikų vystimuisi, jis randamasdaugelyje žmogaus vėžinių auglių. Šio faktoriaus raiška paprastai lemia blogą prognozę irterapinį atsaką daugelio vėžinių auglių atvejais. Manoma, jog panašios savybės būdingos irfaktoriui HIF-2α, tuo tarpu duomenų apie HIF-3α vaidmenį ląstelėje bei jo funkciją yra nedaug.HIF-1 raiška ir aktyvumas padidėja hipoksinėmis sąlygomis, o reoksigenacijos metu šiebaltymai greitai degraduojami.Neseniai buvo atrastas baltymas, kurio funkcija ląstelėje yra priešinga HIF-3 funkcijai. Šisbaltymas buvo pavadintas IPAS (inhibitorinis PAS domeną turintis baltymas). Parodyta, kadIPAS mRNR susidaro nuo HIF-3α pre-mRNR alternatyvaus pre-mRNR splaisingo pasiekoje. Beto nustatyta, kad šis faktorius nesąveikauja su β-subvienetu tačiau sąveikauja su HIF-1α baltymuir tuo pačiu slopina vėžinių auglių vystimąsi, išlaikant avaskuliarinį jų fenotipą.HIF-3α/IPAS splaisingo reguliacijos tyrinėjimai, lyginant pre-mRNA splaisingo profiliusgautus in vitro pre-mRNR spalisingo reakcijoje HeLa ląstelių augintų normoksinėmis arhiposkinėmis sąlygomis branduolių ekstraktuose parodė kad vienas iš HIF-3α/IPAS splaisingąreguliuojantys faktoriai yra esminiai spalaisingo faktoriai SR baltymai. Nustatyta kad SRbaltymai išskirti iš HeLa ląstelių augintų hipoksinėmis sąlygomis stipriau sąveikaudami su preiRNRskatina IPAS mRNR susidarymą, kai tuo tarpu išskirti iš HeLa ląstelių augintųnormaliomis sąlygomis skatina HIF-3α mRNR susidarymą. Laboratorijoje gauti rezultatai rodokad esminiai pre-iRNR splaisingo faktoriai SR baltymai vaidina svarbų vaidmenį reguliuojantpre-mRNR splaisingą, tuo pačiu ir baltymo slopinančio HIF-1α funkciją susidarymą.Projektas Nr. 03/07.Tuberkuliozės molekulinės epidemiologijos tyrimai. VadovasP. Stakėnas.Tuberkuliozė išlieka rimta sveikatos apsaugos problema Lietuvoje: sergamumo indeksas siekia69,8/100000 gyventojų, sergamumas vaistams atsparios tuberkuliozės formomis – vienas išdidžiausių pasaulyje. Šio tęstinio projekto tikslas yra integruoti tuberkuliozės molekulinėsepidemiologijos tyrimus į Atsparios tuberkuliozės kontrolės strategiją, kas leistų įvertintituberkuliozės sukėlėjo populiacijos pokyčius bei kovos su tuberkulioze efektyvumą. Šiam tiksluipasiekti 2007 metais buvo numatyta genotipavimo metodais detaliai charakterizuoti šiuo metucirkuliuojančių M. tuberculosis padermių populiaciją ir atlikti atsparumo gydymui nuotuberkuliozės naudojamiems rezerviniams genetinių determinančių paiešką. Tyrimai atliktiglaudžiai bendradarbiaujant su Respublikine tuberkuliozės ir infekcinių ligų universitetineligonine.Atlikus 151 neturinčių dauginio atsparumo vaistams M. tuberculosis padermiųgenotipavimo IS6110 RFIP analizės metodu tyrimus buvo identifikuoti 79 unikalūs pagal IS6110RFIP profilius padermių genotipai. Nustatytas aukštas sukibusių į identiškus klasterius M.tuberculosis padermių dažnis (35,1%) patvirtino, kad dauguma žmonių ir vaistams jautriostuberkuliozės atvejais suserga dėl užsikrėtimo tomis pačiomis cirkuliuojančiomis tuberkuliozėssukėlėjo padermėmis. Tačiau padermių klasteriuose dažnis 2007 metais, palyginant su 2005-2006metais, reikšmingai nepakito kas rodo, kad neturinčios dauginio atsparumo vaistamstuberkuliozės situaciją pavyko stabilizuoti. Atlikti 104 turinčių dauginį atsparumą M. tuberculosispadermių analogiškus tyrimai parodė, kad net 98% susirgimų vaistams atsparia tuberkuliozesukėlė anksčiau mūsų identifikuotoms, keturioms padidinto virulentiškumo genetiškaigiminingoms grupėms, priklausančios padermės. Jų paplitimo dažnis, palyginus su ankstesniaistyrimais, nesumažėjo, kas rodo, jog svarbiausios infekcijos pernešimo grandinės nutrauktosnebuvo. Buvo toliau tęsiami M. tuberculosis populiacijos filogenetinės struktūros tyrimai -genotipavimo spoligotipavimo analizės metodu buvo identifikuotos anksčiau minimų padermiųgenetinės genetinės linijos, jų sublinijos ir konkretūs spoligotipų profiliai. Buvo tęsiamiM. tuberculosis atsparumo gydymui nuo atsparios tuberkuliozės rezerviniams vaistams© Biotechnologijos institutas 63