METINIS PRANEÅ IMAS 2007 - Biotechnologijos institutas

Metinis pranešimas – 2007nulemiančių mutacijų tyrimai, papildomai ištiriant 35 atsparias ofloksacinui ir 35 atspariaskanamicinui padermes. Genotipavimo metodais ištiriant 11 atvejų, pradėti M. tuberculosisgenotipų stebėsenos nuo atsparios tuberkuliozės gydymo eigoje tyrimai, kurie parodė, jogsavavališkai nutraukę gydymą asmenys platina sunkias tuberkuliozės formas. Atlikus reinfekcijostyrimus nustatyta, jog keturiems iš septynių tirtų asmenų jų antrinis tirtas tuberkuliozės atvejisįvyko dėl užsikrėtimo kita M. tuberculosis paderme.7.7. Bioinfomatikos laboratorija (BL)2007 m. laboratorijoje dirbo 8 darbuotojai:Lentelė 7.7.Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnisPareigos1. Česlovas Venclovas dr. vyriaus. mokslo darb.2. Albertas Timinskas dr. vyresn. mokslo darb.3. MindaugasMargelevičiusdr.vyresn. mokslo darb.4. Alvydas Špokas jaun. mokslo darb.5. Jolita Višinskienė doktorantė6. Rytis Dičiūnas inžinierius informatikasPastabos7. Darius Kazlauskas laborantas (studentas) iki 08.06.308. Mindaugas Laganeckas laborantas (studentas) iki 08.06.30Per ataskaitinius metus Bioinformatikos laboratorijos darbuotojai intensyviai kūrėbioinformatinius metodus bei juos taikė įvairioms konkrečioms biologinėms problemoms spręsti.Metodų kūrimo srityje šiais metais baigtas automatinės giminingų baltymų paieškos sistemoskūrimas. Ši sistema Re-searcher, nuo angl. recurrent searches) leidžia norimu periodiškumuautomatiškai atlikti baltymų sekų paieškas pasirinktose duomenų bazėse ir pateikti išanalizuotusrezultatus. Tuo būdu ši sistema įgalina vartotoją be jokių papildomų pastangų reguliariai gautiinformaciją apie naujai atsiradusias sekas ir struktūras, giminingas jį dominančiai sekai. Maža to,Re-searcher sistema gali „kuruoti“ ne vieną, bet kelias ar net keliasdešimt baltymų sekų. Researchersistema yra atviro kodo programinė įranga ir yra laisvai prieinama kiekvienambesidominčiam šiuo adresu: http://www.ibt.lt/bioinformatics/re-searcher/Šiais metais taip pat toliau buvo tobulinamas sekų profiliais paremtas metodas tolimiems (ir todėlvisiškai neakivaizdiems) evoliucinio giminingumo ryšiams tarp baltymų šeimų nustatyti.Pagrindiniai metodo kūrimo darbai jau baigti. Lieka nuodugniai naująjį metodą ištestuoti irišsamiai palyginti su kitais, šiuo metu efektyviausiais metodais.Reikšmingų rezultatų taip pat buvo gauta apjungiant bioinformatinius metodus su praktiniaiseksperimentais.© Biotechnologijos institutas 64