Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
v<strong>ee</strong>l nn mirtronid, kus miRNA <strong>ee</strong>lasjärjestus (pri-miRNA) ongi täpselt introni pikkune ja ei vaja<br />
edaspidises protsessinguks mikroprotsessori kompleksi nagu "kanoonilised"miRNAd (Okamu-<br />
ra jt., 2007). Hiljuti näidati, et mirtronid ei esine mitte ainult C. elegans’is ja D. melanogaster’is,<br />
vaid ka imetajates (Berezikov jt., 2007).<br />
MiRNAsid transkrib<strong>ee</strong>rivad RNA polümeraas II (L<strong>ee</strong> jt., 2004) või mõningatel juhtudel ka<br />
RNA polümeraas III (Borchert jt., 2006). Tekib mõne kb pikkune monotsistroonne või polütsist-<br />
roonne cap-struktuuri ja polü(A) sabaga pri-miRNA, milles asub 1-6 juuksenõelstruktuuri. Iga<br />
juuksenõelstruktuuri piiravad ∼40bp regioonid, mis on vajalikud korrektseks protsessinguks.<br />
Pri-miRNAsid lõikab Rnaas III klassi endonukleaas Drosha mis moodustab mikroprotsessori<br />
kompleksi koos DGCR8-ga (Di George syndrome critical region 8- tunneb ära miRNA juukse-<br />
nõelstruktuuri ja positsion<strong>ee</strong>rib Drosha katalüütilise saidi õigele kaugusele külgmise üheahela-<br />
lise regiooni otsast) ja tulemuseks on ∼70 bp ühe juuksenõelstruktuuriga pre-miRNA, mille 3’<br />
otsas on kahenukleotiidiline üleulatuv osa ja 5’ otsas fosfaatgrupp.<br />
Loomades transpordib miRNAsid tuumast tsütoplasmasse valk eksportiin 5, mis tunneb ära<br />
5’ fosfaatgrupi ja 3’ üleulatuva osa ning kasutab transpordiks Ran-GTPd (Bohnsack jt., 2004).<br />
Rnaas III perekonna endonukleaas Dicer teostab kaheahelalise lõike pre-miRNA-sse, kus-<br />
juures ensüümi PAZ domään seondub 3’ otsaga ja s<strong>ee</strong>tõttu toimib valk justkui joonlaud, suuna-<br />
tes katalüütilise saidi 22 bp kaugusele. Alles jääb ∼22 bp pikkune kaheahelaline RNA, mille-<br />
ga seonduvate valkude hulka kuuluvad Dicer (endonukleaas), TRBP (transactivating response<br />
RNA binding protein- stabilis<strong>ee</strong>rib Diceri ja pre-miRNA vahelist interaktsiooni) (Chendrimada<br />
jt., 2005) ja PACT (protein activator of the interferon induced protein kinase- toob valgukomp-<br />
leksi kontakti AGO2-ga). Edasi seonduvad mainitud valgukompleksiga kofaktorid (nt. AGO1,<br />
AGO3, AGO4 ja mõned teised) ning moodustub RISC (RNA induced silencing complex). RISC-<br />
is, mille kõige tähtsamaks komponendiks on AGO2 (Argonaute 2) muudetakse RNA üheahela-<br />
liseks, kusjuures aktiivse ahela valimise krit<strong>ee</strong>riumiks on suurem termodünaamiline stabiilsus<br />
ja väiksem sihtmärgiga seondumise tugevus. Ülajäänud ahelat nimetatakse star-järjestuseks ja<br />
tähistatakse tärniga küpse miRNA nime järel. Arvatavasti <strong>ee</strong>maldatakse star-järjestus dupleksist<br />
ja lagundatakse, sest tavaliselt on seda rakus märksa väiksemas kontsentratsioonis, samas on ka<br />
olukordi kus mõlemad ahelad on aktiivsed ja olemas kõrgetes kontsentratsioonides.<br />
Loomades seondub RISC kompleks suurel enamusel juhtudest märklaud-RNA 3’ UTR-iga.<br />
Seondumiseks on ühes UTR-is tavaliselt mitu sihtmärkjärjestust ja s<strong>ee</strong> toimub mittetäieliku<br />
komplementaarsusega, kui välja arvata nukleotiididest 2-8 koosnev s<strong>ee</strong>d-regioon, kus komple-<br />
mentaarsus on täielik. Taimedes s<strong>ee</strong>vastu on seondumine peaaegu täieliku komplementaarsu-<br />
sega ja sihtmärk-järjestused asuvad g<strong>ee</strong>ni kod<strong>ee</strong>rivas osas. Mittetäieliku paardumise korral on<br />
7
Change language