Direktor: Prof. Dr. med. habil. H. von Schwanewede

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Die Basenfolgen der verwendeten Primer und die Thermoprofile der beiden Stufen
der mtLSU nPCR sind in den Tabellen 3 und 4 dargestellt.
Tab. 3. P. jirovecii mtLSU rRNA Gen nPCR. Primer und PCR-Programm Stufe 1
Nested PCR Stufe 1
PAZ102-E 5‘-GAT GGC TGT TTC CAA GCC CA-3‘
PAZ102-H 5‘-GTG TAG GTT GCA AAG TAG TC-3‘
Thermoprofil Stufe 1 Denaturierung
40 Zyklen:
1 min 94°C
Denaturierung 30 sec 94°C
Anlagerung 30 sec 55°C
Extension 30 sec 72°C
Terminale Extension 5 min 72°C
Kühlen � 4°C
Tab. 4. P. jirovecii mtLSU rRNA Gen nPCR. Primer und PCR-Programm Stufe 2
Nested PCR Stufe 2
P1 5‘-CTA GGA TAT AGC TGG TTT TC-3‘
P2 5‘-TCG ACT ATC TAG CTT ATC GC-3‘
Thermoprofil Stufe 2 Denaturierung
30 Zyklen:
1 min 94°C
Denaturierung 1 min 20 sec 94°C
Anlagerung 1 min 20 sec 55°C
Extension 1 min 20 sec 72°C
Terminale Extension 5 min 72°C
Kühlen � 4°C