WebLab 中文使用文档 - abc

WebLab 中 文 使 用 文 档“Utility” 是 一 些 用 于 生 物 信 息 学 分 析 的 小 部 件 。 这 些 “Utility” 主 要 由 javascript,Java插 件 和 其 它 基 于 浏 览 器 的 客 户 端 程 序 组 成 。 它 们 一 般 运 行 的 时 间 不 是 太 长 不 过 非 常 有 用 。 截至 日 前 , 在 WebLab 中 共 有 66 “utilities”, 其 中 大 部 分 都 集 中 在 序 列 编 辑 , 数 据 可 视 化 等方 面 。注 : 在 运 行 WebLab 上 的 “utility” 之 前 , 请 设 置 浏 览 器 允 许 运 行 Java 和 JavaScript, 并 要 安装 Java 运 行 环 境 。2). Program—— 构 造 元 件WebLab 中 的 程 序 包 含 三 种 不 同 类 型 的 服 务 :· 本 地 程 序 : 这 类 程 序 在 WebLab 的 计 算 节 点 上 运 行 , 其 中 大 部 分 程 序 来 自 EMBOSS,NCBI BLAST 等 最 通 用 的 生 物 信 息 分 析 软 件 包 。·Web 服 务 程 序 : 现 在 Web 服 务 在 生 物 信 息 领 域 变 得 越 来 越 热 门 , 因 此 WebLab 也 为一 些 著 名 的 生 物 信 息 的 网 站 的 web 服 务 提 供 了 客 户 端 程 序 。 通 过 我 们 提 供 的 web 界 面 你 可以 向 远 程 web 服 务 器 提 交 任 务 。· 基 于 网 格 的 服 务 程 序 :WebLab 也 提 供 一 些 基 于 网 格 的 程 序 来 处 理 像 blast 这 样 的 计算 和 输 入 输 出 密 集 型 服 务 。到 目 前 为 止 ,WebLab 上 有 264 个 程 序 。 用 户 可 通 过 它 们 的 软 件 包 , 功 能 及 字 母 顺 序 进行 浏 览 。程 序 的 运 行 :WebLab 为 不 同 的 程 序 服 务 提 供 了 统 一 的 符 合 感 官 的 界 面 便 于 用 户 的 使用 。在 程 序 提 交 页 面 , 具 有 相 似 功 能 的 参 数 聚 成 一 组 。 在 提 交 任 务 以 前 , 用 户 需 要 注 意 下面 几 个 方 面 :· 对 于 输 入 文 件 , 未 注 册 用 户 可 通 过 上 传 文 件 或 直 接 贴 入 数 据 , 而 注 册 用 户 还 可 以 通过 “my data” 来 输 入 数 据 。· 注 册 用 户 需 要 指 定 输 出 的 路 径 。· 带 * 号 的 参 数 为 必 须 填 的 项 目 。· 如 果 你 不 清 楚 那 个 参 数 的 意 义 , 可 以 通 过 点 击 右 面 的 “?” 获 得 帮 助 。· 如 果 你 想 知 道 程 序 的 具 体 细 节 , 请 点 击 程 序 名 查 看 程 序 文 档 。在 为 每 个 参 数 输 入 一 个 恰 当 的 值 后 , 你 就 可 以 点 击 “Run” 来 提 交 任 务 了 。16