de la structure à la croissance cellulaire - Université Bordeaux 1

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CHAPITRE 2 : RESULTATS………………………………………………………………….p74 PARTIE 1 : ARTICLE 1 :.............................................................................................................p75 In planta quantification of endoreduplication using Fluorescent In Situ Hybridization (FISH) PARTIE 2 : ARTICLE 2……………………………………………………………………………...……..p109 Structural analysis of endopolyploid nuclei from tomato (Solanum lycopersicum) fruit cells PARTIE 3 : CRIBLAGE DE LA BANQUE DE MUTANTS TILLING MICRO-TOM……………..…..p140 Recherche de mutants affectés dans l’endoréduplication CHAPITRE 3 : DISCUSSION – CONCLUSION..............................................p165 1. Contexte et problématique……………………………………………………………..…………….p165 2. Implication de l’endopolyploïdisation dans la croissance cellulaire………..……………….p166 3. Amplification fonctionnelle du génome et profils d’expression……………………..………..p171 associés à l’endopolyploïdisation 4. Supra-organisation et ergonomie de la cellule endopolyploïde……………………...……….p172 5. CONCLUSION……………………………………………………………………………………..……p178 REFERENCES DISCUSSION – CONCLUSION……………………………………………..…......…..p179 ANNEXES : PRODUCTION SCIENTIFIQUE.......................................................p181
Abréviations Acides nucléiques et nucléotides ADN Acide désoxyribonucléique ADNg Acide désoxyribonucléique génomique ARN Acide ribonucléique ARNm Acide ribonucléique messager ARNr Acide ribonucléique ribosomal ARNt Acide ribonucléique de transfert ATP Adenosine 5’ triphosphate Kb, Mb kilobase, mégabase kDa, MDa Kilodalton, Mégadalton RNA Pol II RNA polymérase II TC Territoire chromosomique Unités °C degré Celsius g accélération rpm round per minute s, min, h seconde, minute, heure EI Endoreduplication Index MCV : Mean C Value Divers 2-D , 3-D deux dimensions; troiss dimensions GFP Green Fluorescent Protein BY-2 lignée cellulaire de Tabac ayant pour origine le cultivar BY-2 (Bright Yellow – 2) RE Réticulum Endoplasmique EMS Ethyl Methyl Sulfonate BSA Bovine Serum Albumin cv Cultivar DEPC Diethylpyrocarbonate DAPI 4’,6-diamino-2-phenylindole FISH Fluorescent in situ Hybridization SSC tampon ”saline-sodium citrate” TBS tampon “tris buffer sakine” NOR Nucleolar Organizing Regions DIOC6(3), Dihexyloxacarbocyanine iodide TEM Transmission Electron Microscopy - 1 -
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PARTIE 3 : Endopolyploïdisation :
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l’oligomérisation du système ce
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d’expression génétique pouvaien
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homologue. Chez les plantes, ce pro
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sur l’organisation du génome. Ce
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Partant de ce constat, l’endopoly
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L’étude de l’enveloppe nucléa
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(Schwacke et al. 2007) ont révél
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cellulaire et ainsi d’étudier fi
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endoreduplication and ploidy-depend
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Lee, H.-C., Chiou, D.-W., Chen, W.-
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Zybina, E.V. and Zybina, T.G. (2008
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PARTIE 1 : ARTICLE 1 In planta quan
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INTRODUCTION Endopolyploidy is a wi
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DNA content of individual cells fro
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1, Figure S1). It was therefore not
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Since the shape of the nuclei is ve
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(D’Amato, 1984; Bourdon et al., 2
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appeared to be the best compromise
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that the cell layers located in the
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CONCLUSION Despite the widespread o
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µm thick) were made on a Reichert
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Image analysis The surface of the s
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step was realized in a moist chambe
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SUPPORTING INFORMATION Figure S1. D
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Grandjean, O., Vernoux, T., Laufs,
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exchange ability. On the contrary,
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We next calculated the ratio of mit
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As shown in Figure 5a, the 5.8S rRN
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Endoreduplication triggers the form
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linked to the endoreduplication-ass
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EXPERIMENTAL PROCEDURES Plant mater
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DIG labeling efficiency was then ch
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Mitochondria staining All steps wer
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enclosed invaginations. Counting of
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REFERENCES Anisimov, A.P. (2005) En
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Hernandez-Verdun, D. (2006) Nucleol
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Schauer, N., Semel, Y., Roessner, U
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comparer des lignées de tomate sig
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- gros fruits : 35 familles. - peti
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Chaque donnée de la génération B
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nous pensons qu’une partie de la
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observé ans cette famille serait a
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moyen des fruits sauvages de Micro-
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Bünger-Kibler, S. and Bangerth, F.
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division à différents stades de d
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presse) ont montré que l’intégr
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REFERENCES DISCUSSION - CONCLUSION
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PRODUCTION SCIENTIFIQUE Revues à c
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