PubMed的使用 - abc

PubMed 的 使 用
生 物 信 息 学 2 班 A 组

内 容 提 要 :
• PubMed 的 基 本 使 用 方 法
• PubMed 的 高 级 使 用 方 法
• PubMed 与 My NCBI

一 、PubMed 的 基 本 使 用

• 通 过 作 者 搜 索
• 在 搜 索 框 中 输 入 作 者 姓 及 名 首 字 母 , 不
要 在 搜 索 框 中 输 入 标 点 , 点 击 Go。 如 果
你 只 知 道 作 者 的 名 字 而 不 知 道 姓 氏 , 需
要 使 用 作 者 搜 索 标 签 [AU]。 使 用 Limit 选
框 可 以 作 者 搜 索 引 擎 , 输 入 你 知 道 的 名
字 会 自 动 生 成 含 有 姓 氏 的 姓 名 。

• 使 用 刊 物 名 搜 索
• 在 搜 索 框 中 输 入 刊 物 名 或 者 题 目 的 缩 写 ,
可 以 附 加 任 何 相 关 条 目 , 点 击 Go。
• 与 搜 索 姓 名 时 相 同 同 样 可 以 运 用 Limit 选
框 , 同 样 在 刊 物 搜 索 引 擎 中 会 自 动 生 成
完 整 的 刊 物 名 , 如 下 :

• PubMed 把 所 有 可 检 索 关 键 词 按 字 母 顺 序 排 列 ,
方 便 读 者 快 速 查 找 。
• 1 点 击 Preview/Index 框 ( 几 个 选 框 的 内 容 )
• 2 在 页 面 底 部 选 择 检 索 领 域
• 3 在 检 索 框 中 输 入 关 键 词 , 如 果 想 检 索 所 有 领
域 , 检 索 框 为 空 。
• 4 点 击 Index
• 5 在 检 索 词 后 的 括 号 内 会 显 示 关 键 词 使 用 频 率
• 6 选 择 相 应 的 词 条 , 可 以 使 用 布 尔 逻 辑 语 法
( 系 统 从 左 到 右 识 别 优 先 级 别 )。
• 7 添 加 其 他 的 检 索 条 目 , 进 一 步 精 确 描 述 检 索
对 象 , 缩 小 检 索 范 围 。

•

• 预 测 检 索 结 果 (Preview), 在 展 开 检 索 结 果 之 前 预 览 引
用 频 率 :
• 1 点 击 Preview/Index 栏
• 2 在 检 索 框 中 输 入 检 索 关 键 词
• 3 点 击 Preview. 就 可 以 看 见 检 索 内 容
• 4 如 果 想 看 检 索 频 率 , 就 点 击 它 的 链 接
• 搜 索 参 考 文 献 前 , 可 以 用 Preview 进 一 步 限 制 检 索 范 围
• 1 在 检 索 框 中 输 入 检 索 关 键 词
• 2 点 击 预 览 , 会 看 到 现 实 的 结 果
• 3 按 这 种 方 法 , 把 范 围 缩 小 到 可 以 准 确 找 到 结 果 的 程 度
• 注 : Preview 只 显 示 History 中 的 最 近 三 个 检 索 词 , 检 索
历 史 包 括 19 条 历 史 检 索 信 息

• 查 看 搜 索 历 史 记 录
• 点 击 History 按 钮 , 会 显 示 搜 索 的 运 行 结
果 。 例 如 : 某 次 检 索 的 运 行 结 果 为 :#18
PMC Links for PubMed (Search avian
influenza) 12:28:03 644 , 点 击 蓝 色 的 结 果
数 644, 可 以 查 看 搜 索 结 果 。 点 击 搜 索 号
码 ( 例 如 本 例 中 的 #18) 可 以 打 开 选 项 菜
单 , 包 括 布 尔 逻 辑 符 AND, OR 、 NOT,
以 及 Delete、Go、Details 等 。

• Clipboard
• clipboard 可 以 暂 时 保 存 所 检 索 的 文 献 , 最
多 可 保 存 500 条 ,8 小 时 之 后 就 会 被 删 除 。
要 想 永 久 无 限 量 的 保 存 检 索 文 献 需 要 注
册 My NCBI。

• Details
• 显 示 检 索 的 一 些 细 节 :
•

• 解 读 搜 索 结 果
• PubMed 的 搜 索 结 果 以 汇 总 的 方 式
罗 列 出 来 , 看 以 下 的 搜 索 结 果 分
析 表 :

• 获 得 摘 要
• 点 击 文 章 的 标 题 阅 读 摘 要 , 如 果 显 示
“No abstract available” 说 明 没 有 摘 要 供
阅 读 。

二 、PubMed 的 高 级 使 用 方 法
• 1、 想 使 搜 索 的 效 率 更 高 可 以 使 用 一 些 搜
索 域 和 标 签 来 缩 小 搜 索 范 围 , 这 些 标 签
如 下 :

• Affiliation [AD] Article Identifier [AID]
• All Fields [ALL] Author [AU]
• Comment CorrectionsCorporate Author [CN]
• Create Date [CRDT] EC/RN Number [RN]
• Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER]
• First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU]
• Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR]
• Investigator [IR] Issue [IP] Journal Title [TA]
• Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID]
• MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR]
• MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH]
• NLM Unique ID [JID] Other Term [OT]
• OwnerPagination [PG] Personal Name as Subject [PS]
• Pharmacological Action MeSH Terms [PA]
• Place of Publication [PL] PMCID & MIDPublication Date [DP]
• Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI]
• Subset [SB] Substance Name [NM] Text Words [TW]
• Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT]
• UID [PMID]Volume [VI]

2、 如 何 使 用 Single Citation
Matcher
• 在 PubMed 工 具 条 中 点 击 Single Citation
Matcher, 通 过 它 可 以 实 现 一 对 一 的 检 索 。
• 输 入 要 检 索 的 单 一 信 息 , 系 统 会 根 据
PubMed 中 的 内 存 对 关 键 词 进 行 自 动 匹 配 ,
比 如 作 者 姓 名 的 全 拼 和 简 写 , 第 一 作 者 ,
所 有 作 者 , 和 通 讯 作 者 等 。

3、Batch citation matcher
• 顾 名 思 义 , 与 single citation matcher 相 对 ,
它 可 以 实 现 多 篇 文 献 的 一 次 性 搜 索 , 搜
索 时 按 照 如 下 格 式 输 入 检 索 文 献 的 关 键
词
• journal_title|year|volume|first_page|author_
name|your_key|
• 也 可 以 填 写 E-mail 地 址 ,PubMed 会 通 过
E-mail 将 检 索 结 构 发 送 到 邮 箱 中 。

3、PubMed Clinical Queries 临 床 专 业 检 索 系 统
• PubMed Clinical Queries 页 面 为 临 床 医 学
提 供 了 专 业 检 索 系 统 。
• 在 PubMed 工 具 条 上 点 击 Clinical Queries
• 点 击 Search by Clinical Study Category
• 在 搜 索 框 中 输 入 要 检 索 的 内 容
• 选 择 相 应 的 类 别 : therapy, diagnosis,
etiology, 或 者 prognosis
• 选 择 检 索 范 围 : narrow, specific search or
broad, sensitive search

4、 查 找 引 文 的 其 他 相 关 信 息
• 通 过 Display 下 拉 菜 单 连 接 到 NCBI 的 其 他 数 据 库 。 同 时
搜 索 所 有 NCBI 中 的 数 据 库 可 以 使 用 跨 数 据 库 检 索 系 统 。
即 点 击 “ALL DATABASE” 进 入 ”“Search across
databases“。
• 利 用 LinkOut 找 到 引 文 的 其 他 相 关 链 接 。 大 多 数 引 文 有
LinkOut 可 以 链 接 到 不 同 的 网 站 , 包 括 出 版 商 , 图 书 馆 ,
生 物 数 据 库 , 序 列 中 心 等 。 通 过 链 接 我 们 就 可 以 由 相
关 供 应 商 等 处 , 获 取 全 文 或 一 些 其 他 相 关 资 源 。 要 查
找 引 文 带 有 免 费 全 文 的 链 接 , 在 搜 索 栏 中 输 入 搜 索 字
词 并 在 其 后 加 上 AND free full text[sb] . 同 理 要 查 找 带 有
全 文 的 引 文 , 可 以 在 搜 索 栏 中 输 入 搜 索 字 词 并 在 其 后
加 上 AND full text[sb]。 例 如 : 搜 索 关 于 禽 流 感 的 相 关 免
费 全 文 , 可 以 在 检 索 框 输 入 avian influenza AND free
full text[sb]。

三 、PubMed 与 My NCBI
• 在 使 用 PubMed 时 最 好 注 册 一 个 My NCBI
账 户 , 这 会 使 PubMed 的 使 用 更 具 个 性 化
而 且 功 能 也 更 多 。
• 以 下 介 绍 的 功 能 都 是 在 登 陆 My NCBI 后
实 现 的 。

1、My NCBI HOME
点 击 My NCBI HOME 这 里 , 你 可 以 看 到 保 存
的 NCBI 的 全 部 数 据 。

2、My Saved Data

• Bibliographies
• 可 以 在 这 里 添 加 需
要 保 存 的 引 文 。

• Saved Searchers
• 可 以 对 所 进 行 的 检 索 进 行 保 存 , 下 次 重 复 同
类 操 作 的 时 候 直 接 点 击 便 可 。
• 添 加 的 方 法 如 图

Collection
可 以 将 希 望 保 留 的 引 文 保 存 才 Collection 中 , 方
法 如 下 图 :

• 设 置 个 人 的 filter

• Preference 的 设 置
• 可 以 通 过 设 置 参 数 来 对 搜 索 的 数 据 进 行 过
滤 。

• 其 中 的 E-mail 可 以 设 置 对 感 兴 趣 的 搜 索 信
息 进 行 追 踪 。
• 新 的 搜 索 信 息 会 以 邮 件 的 方 式 发 送 到 邮
箱 中 。

• 谢 谢 !