应用ExPASy相关工具对GCR2蛋白进行分析 - abc

Fasta3• Fasta 的 基 本 思 路 是 识 别 与 代 查 序 列 相 匹 配的 很 短 的 序 列 片 段 , 称 为 k-tuple。 蛋 白 质 序列 数 据 库 搜 索 时 , 短 片 段 的 长 度 一 般 是 1-2个 残 基 长 。Fasta 程 序 采 用 渐 进 (heuristicapproach) 算 法 将 位 于 同 一 对 角 线 上 相 互 接近 的 短 片 段 连 接 起 来 。 也 就 是 说 , 通 过 不匹 配 的 残 基 将 这 些 匹 配 残 基 片 段 连 接 起 来 ,以 便 得 到 较 长 的 相 似 性 片 段 , 与 blast 类 似 。