Unità tecnica UTAGRI

More documents

Recommendations

Info

RISULTATICreazione librerie Ion Torrent - regione V3 del gene 16S (amplicone 180 bp).Campioni 18 e F20.• Lattughino 18 (Campionamento 2011, Kit di estrazione, 10°g, busta 18)• Lattughino F20 (Campionamento 2011, buffer di estrazione tris HCl, 10°g, busta 20)18 F20 C-Profilo libreria Ion TorrentSequenziamento Ion Torrent200100Sequenze ottenute:Campione 18: 108.425Campione F20: 170.871Alessia Fiore, Elio Fantini, Giulio Gianese
RISULTATIL’analisi informatica delle sequenze ha messo in evidenza che i generimaggiormente rappresentati appartengono ai due “phyla” battericiProteobatteri (Pseudomonas) e Bacteroidetes (Flavobacterium)Genere N° reads %Pseudomonas 1384 35,7Flavobacterium 932 24,1Chryseobacterium 245 6,3Duganella 229 5,9Janthinobacterium 167 4,3Stenotrophomonas 96 2,5Acinetobacter 77 2,0Acidovorax 66 1,7Sphingobacteriaceae 66 1,7Rheinheimera 61 1,6Pantoea 58 1,5Delftia 40 1,0Rhizobium 39 1,0Tabella1: Generi maggiormente rappresentati nei campioni di lattughino analizzatiAlessia Fiore, Elio Fantini, Giulio Gianese
Page 1 and 2: Unità tecnica UTAGRILaboratori GEN
Page 3 and 4: DISEGNO SPERIMENTALELactuca sativaI
Page 5 and 6: ANALISI MICROBIOLOGICADay 1 Day 3 D
Page 7 and 8: Tecniche molecolariREAL-TIME PCRlog
Page 9 and 10: DNA (ng/g matrice vegetale)REAL-TIM
Page 11 and 12: Tecniche molecolariT-RFLPTerminal R
Page 13 and 14: PRINCIPAL COMPONENT ANALISI (PCA)Il
Page 15 and 16: ANALISI MICAL’analisi degli T-FRs
Page 17 and 18: PL 77.2 - Metodologie diagnostiche
Page 19: ATTIVITA’ SPERIMENTALEMessa a pun
Page 23 and 24: PL 77.2 - IN PROGRESSCaricamento de
Page 29 and 30: MONDAY, JULY 22, 2013MICROBIAL FOOD
Page 31 and 32: FEMS MICROBIOLOGY LETTERS-----Messa

Unità tecnica UTAGRI

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?