2004 - Instituto de Biotecnología - UNAM

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Instituto de Biotecnología UNAM Instituto de Biotecnología UNAM Instituto de Biotec Principal Indice Dr. Ricardo Alfredo Grande Cano Investigador Nivel I del SNI Grupo del Dr. Juan Enrique Morett - Licenciatura: Biología, Fac. de Ciencias-UNAM (1996) - Maestría: en Biotecnología, IBt-UNAM (1995-1997)Ingreso directo al Doctorado sin titulacion Premio Weizmann Kahn a la mejor tesis de doctorado en el área de Ciencias Naturales (2001) Publicaciones recientes Gaytan,P. Yanez,J. Grande,R. Morett,E. Soberon,X. 2005. Improving random mutagenesis by purification of the oligonucleotide variants Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening 8 537-544. Chaney,M. Grande,R. Wigneshweraraj,S.R. Cannon,W. Casaz,P. Gallegos,M.T. Schumacher,J. Jones,S. Elderkin,S. Dago,A.E. Morett,E. Buck,M. 2001. Binding of transcriptional activators to sigma 54 in the presence of the transition state analog ADP-aluminum fluoride: insights into activator mechanochemical action Genes Dev 15 2282-2294. Instituto de Biotecnología UNAM Instituto de Biotecnología UNAM Instituto de Biotecnología U Anterior Principal Indice
Instituto de Biotecnología UNAM Instituto de Biotecnología UNAM Instituto de Biotec Principal Indice Grupo del Dr. Juan Enrique Morett E VOLUCIÓN DE LA ACTIVIDAD CATALÍTICA: UN ENFOQUE EXPERIMENTAL Y BIOINFORMÁTICO El tema central de investigación de nuestro grupo comprende el estudio de los mecanismos evolutivos que operan en las proteínas. Adicionalmente, continuamos con nuestra línea sobre el mecanismo molecular de activación de la expresión de los genes transcritos por la RNA polimerasa con el factor sigma 54 (Es54). Nuestras herramientas y estrategias de trabajo han combinado el trabajo experimental con los estudios bioinformáticos, principalmente en análisis de secuencias, la genómica comparativa y la filogenia molecular. Nuestro modelo de estudio principal son las vías de síntesis de las vitaminas en los organismos cuyos genomas han sido completamente secuenciados. Este modelo nos permite el estudio de múltiples casos de convergencia funcional (gene dissplacement). A continuación describimos brevemente los avances de algunos de nuestros proyectos: Mecanismo de activación de la transcripción por Es54 El inicio de la transcripción es un complejo mecanismo en el que participan un gran número de proteínas, que involucra diferentes pasos. El objetivo central de este proyecto es entender el mecanismo molecular de la activación de los genes transcritos por la RNA polimerasa asociada al factor sigma-54 (Es54). Esta forma de la RNA polimerasa presenta varias características que la distinguen del resto de las polimerasas bacterianas. Es54 tiene la capacidad de reconocer un tipo único de promotores con secuencias conservadas a -24 y -12 nucleótidos del inicio de la transcripción, a diferencia del resto de los promotores conformados por secuencias a -35 y -10 nucleótidos, y formar un complejo cerrado estable. Este complejo se isomeriza a un complejo abierto, activo, exclusivamente en presencia de proteínas regulatorias de la familia de las Enhancer-Binding Proteins. Estas proteínas son los únicos reguladores bacterianos conocidos cuyos sitios de reconocimiento se localizan a cientos de nucleótidos del promotor, por lo que son funcionalmente similares a los "enhancers" de los genes eucariotes. Al activar la transcripción las EBP se unen a estos sitios y contactan simultáneamente a Es54. Como resultado el DNA intermedio se dobla formando un asa. Otra particularidad de la activación por Es54 es el requerimiento de energía, la cual se obtiene de la hidrólisis de ATP, catalizada por las EBP. Las EBP están formadas generalmente por tres dominios estructurales y funcionales distintos: Un dominio NH2 terminal con funciones regulatorias; el dominio central, de 240 amino ácidos, que es el único dominio conservado en todos los miembros de esta familia; y un dominio COOH terminal con la función de reconocimiento e interacción con el DNA. El dominio central tiene todos los determinantes para la activación de la transcripción. Por medio de comparación de secuencias hemos detectado siete regiones altamente conservadas involucradas en diferentes funciones que llevan a la activación. Mediante estudios genéticos, bioquímicos y estructurales se ha demostrado
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través de promotores regulados por
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Garay-Arroyo,A. Colmenero-Flores,J.
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Campos-Alvarez,F. Cruz-Garcia,F. To
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en Arabidopsis thaliana" Antonio Za
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cómputo. Instituto de Biotecnolog
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Ramirez-Benitez,M.D. Almagro,J.C. 2
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Nakajima,T. Naoki,H. Corzo,G. Li,D.
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Vazquez-Duhalt,R. M.P.Bremauntz R.T
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Adicionalmente, el trabajo se organ
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Jose Juan Perez Administrativo Mari
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Marcelo Espin Estudiante Estefania
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urbujas y microgotas que parecen es
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oth as a function of mycelial morph
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mostraron menos del 95% de similitu
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Ingeniería y Tecnología de las Fe
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la coocurrencia y anticorrelación
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products resulting from DNA shuffli
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asas de ocho barriles seleccionados
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Gaytán R, Sánchez-Flores F, Moral
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petroporphyrins by chemical modifie
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Adriana Dominguez Estudiante Fatima
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través de promotores regulados por
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Norma-Elizabeth Moreno Dr. Joseph D
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3. Aislamiento y caracterización d
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protein 101 gene, HSP101, encoding
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transportador HAK5 en el tonoplasto
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encoding tubulin in Drosophila mela
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estaurosporina. La expresión en an
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glucose and glutamine in the metabo
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Pérez-Martínez L, Uribe R, Sánch
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Instituto de Biotecnolog•UNAM Ins
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Salas E, Castro S, Cuervo R, Lomel
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uso de compuestos enjaulados, nueva
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habíamos utilizado anteriormente e
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Rosario Carolina Gutierrez Estudian
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del TRH, la PPII, así como en los
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Elizabeth Ramirez Estudiante Daniel
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mamíferos asociadas al proceso de
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glucose and glutamine in the metabo
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Cesar Javier Cortes Estudiante Gera
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Reynaud E, Vázquez M, Zurita M . 1
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Vázquez-Padrón RI, de la Riva G,
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Biología Molecular y Bioquimica de
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caracterización de una colección
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Everardo Ramirez Estudiante Yanet R
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conjunto de mas de 4,000 familias d
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Bioinformática Biología Molecular
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organismos. El análisis de la regu
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Dr. Victor Humberto Bustamante Tuto
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los compartimentos definidos por lo
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Batista CV, Del Pozo L, Zamudio FZ,
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Tityus cambridgei y Tityus costatus
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scorpion toxins that specifically i
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Linda Espinosa Administrativo Insti
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procariotes y de células de eucari
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Dra. Yvonne Jane Investigador Rosen
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Sánchez R, Alagón A, Stock R . 20
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Biología Molecular y Bioquímica d
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Yáñez J, Argüello M, Osuna J, So
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Investigador Q.I. Oscar Villa Técn
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Ayuda Instituto de Biotecnología U
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genética y de introducirles la de
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Microbiología Molecular Medicina M
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Maria Xochitl Gonzalez Administrati
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Francisco Reyes Leticia Rodriguez S
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Dr. Edmundo Calva Dr. Francisco Cam
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Ramirez Dr. Octavio Tonatiuh Dr. Jo
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Hector Cardoso Mayra Cardoso Christ
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Juan Carlos Hernandez Leandro David
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Juan Fernando Oviedo Tania Elena Pa
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Cordova Hurtado Dra. Maria Soledad
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Francisco Reyes Leticia Rodriguez S
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Dr. Edmundo Calva Dr. Francisco Cam
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Ramirez Dr. Octavio Tonatiuh Dr. Jo
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Hector Cardoso Mayra Cardoso Christ
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Cordova Hurtado Dra. Maria Soledad
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Gloria Villa Administrativo Institu
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Dr. Federico E. Sánchez Rodríguez
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Microbiología Molecular Medicina M
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Serrano-Carreon, L. Flores, C. Rodr
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Valdez-Cruz, N.A. Davila, S. Licea,
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Rodriguez-de-la-Vega, R. Possani, L
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Soberon, N. Venkova-Canova, T. Rami
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Fernandez-Mora, M. Puente, J.L. Cal
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D'Suze, G. Sevcik, C. Corona, M. Za
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Pascual, I. Gil-Parrado, S. Cisnero
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Yanez, J. Arguello, M. Osuna, J. So
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Ramos-Cerrillo, B. Olvera, A. Odell
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Schulz, J.R. de la Vega-Beltran, J.
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Vazquez-Padron, R.I. de la Riva, G.
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Moreno-Mendoza, N. Torres-Maldonado
Page 1549 and 1550:
Chagot, B. Escoubas, P. Villegas, E
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Lopez, S. Arias, C.F. 2004. Preface
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Rausell, C. Garcia-Robles, I. Sanch
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Le Borgne, S. Bolivar, F. Gosset, G
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Publicaciones Ortiz-Soto,M.E.Olivar
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Publicaciones Leyman,B.Avonce,N.Ram
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● Transducción de señales en Rh
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Caracterización bioquímica y func
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Estudio de la biosíntesis de la TR
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Dr. Jorge Méndez, Dirección de Ve
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Rafael Vázquez-Duhalt (Miembro del
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Profr.María de los Angeles Chávez
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IBt., Cuernavaca, Morelos, México
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2004 - Instituto de Biotecnología - UNAM

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