Abarco Caoba Cedro Palorosa y Canelo de los Andaquíes

Planes de Manejo para la conservación de
Abarco, Caoba, Cedro, Palorosa y Canelo de los Andaquíes
Para Abarco y Canelo de los Andaquíes la revisión de literatura especializada indicó que no
existen microsatélites específicos, por ello se evaluó la transferibilidad de marcadores microsatélites
reportados en otras especies del mismo género. Para el caso de Abarco (Cariniana pyriformis)
se evaluaron varios marcadores reportados por Guidugli et al. (2008) y Tambarussi et al. (2013)
trabajos donde se han caracterizado microsatélites para Cariniana legalis y se ha evaluado su
transferibilidad a Cariniana estrellensis (Tambarussi et al. 2013; Guidugli et al. 2010). Para el
Canelo de los Andaquíes (Ocotea quixos) se evaluaron los microsatélites reportados por Martins
(2013), que fueron desarrollados para las especies Ocotea odorifera y Ocotea porosa. Es de anotar
que para Colombia no existen reportes de la aplicación de microsatélites en estas especies.
Extracción de ADN
Para la extracción de ADN se empleó material foliar, previamente seco en sílica gel, del cual se
tomaron aproximadamente 20 mg que se maceraron en un homogenizador FastPrep® (MP). Posteriormente
se empleó el protocolo propuesto por Doyle & Doyle (1987) reportado previamente en
algunas de estas especies. Cuando se presentaron dificultades en la extracción de ADN (p.e. poca
cantidad, baja calidad por presencia de polisacáridos, fenoles, metabolitos secundarios), se utilizaron
kits comerciales de extracción de ADN o columnas de limpieza de basadas en membranas de sílica.
Aplicación de Marcadores Moleculares Microsatélites
Cuando no existían marcadores moleculares reportados para las especies trabajadas, los criterios de
selección de los cebadores fueron principalmente: el contenido de información polimórfica (PIC), la
heterocigocidad, el número de alelos y la transferencia en otras especies del mismo género.
Para Abarco se evaluaron doce marcadores reportados por Guidugli et al. (2008) y Tambarussi
et al. (2013). Para Caoba se evaluaron diez marcadores propuestos por Lemes et al. (2002). Para
el caso de Cedro se emplearon nueve microsatélites reportados por Hernández et al. (2007) y para
el caso del Canelo de los Andaquíes se emplearon los ocho marcadores reportados por Martins
(2013) (Tabla 2).
Los cebadores fueron sintetizados y marcados en el extremo 5’ con fluorocromos diferentes
(6-FAM, PET, NED o VIC) (Tabla 2), en todos los casos condiciones de mezcla y de reacción de
PCR fueron realizadas de acuerdo a lo reportado por cada uno de los autores.
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Tabla 2. Cebadores microsatélites evaluados en las cinco especies
Nombre Secuencia 5’-3’ Marcaje 5’
Abarco
Cle01
Cle02
Cle05
F: TTCTCTTCCCCCTCTTCCTC
*R: GTTTCTTTCCTTTCCAAACCAAACCAC
F: TCTCAAAACTCCCCCTCAAG
R: GTTTCTTCCGAAGAAATCATCACCTCA
F: CAAGCCGCACCTTTATCTAT
R: GTTTCTTGCAGCCAAACAGGATAGCA
6-FAM
NED
PET
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