Manuscrit - laboratoire PROTEE - Université du Sud - Toulon - Var

La première amélioration, consiste à réaliser un « recuit » à la fin de la première
optimisation ; i.e., quand le simplex ne bouge plus et qu’il a atteint un minimum local, un
nouveau simplex est généré permettant de voir si il n’y a pas une meilleure solution ailleurs.
Si le nouveau biais est inférieur à plus de 5% à l’ancien biais, une nouvelle optimisation est
réalisée, et ce, au maximum 5 fois.
Ce nouveau code contient aussi un calcul d’intervalle de confiance sur chaque paramètre
optimisée. Celle-ci est calculée, une fois le calcul d’optimisation terminé, en modifiant un à
un, chacun des paramètres, jusqu’à obtenir une variation du biais de 10%.
Enfin, pour chacune des optimisations effectuées, une modélisation est effectuée
systématiquement avec 1 ou 2 ligands dans le cas de calcul de complexation avec le métal, ou
de 2 à 6 ligands pour celui réalisé avec le proton. Le choix du modèle se fait suivant la
modélisation donnant le meilleur résultat, pour le minimum de ligands.
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