ExPASy使用初探 - abc - 北京大学

More documents

Recommendations

Info

( 一 ) 蛋白序列基本特征分析• ProtParam tool• Compute pI/Mw• PeptideCutter• PeptideMass• Isotopident
1.ProtParam tool: 蛋白质的氨基酸组成、分子量、PI 等基本特征的分析。将斑头雁的血红蛋白序列输入该工具中 , 可以得到如下结果 :Number of amino acids: 142Molecular weight: 15467.8Theoretical pI: 8.54Amino acid composition:Ala (A) 19 13.4%Arg (R) 3 2.1%Asn (N) 3 2.1%Asp (D) 7 4.9% ……Total number of negatively charged residues (Asp + Glu): 13Total number of positively charged residues (Arg + Lys): 15Atomic composition:Carbon C 702Hydrogen H 1102Nitrogen N 190Oxygen O 196Sulfur S 4Formula: C 702H 1102N 190O 196S 4Total number of atoms: 2194Extinction coefficients/Estimated half-life /Instability index/Aliphatic index该软件的分析结果包括了蛋白的氨基酸组成、原子组成、分子量、半衰期、等电点等全面的基本信息。
Page 1 and 2: ExPASy 使用初探— 以斑
Page 3 and 4: ExPASy 简介• ExPASy 是 Expert
Page 5 and 6: 第一部分斑头雁背景
Page 7 and 8: 斑头雁血红蛋白研究
Page 9: 第二部分斑头雁血红
Page 13 and 14: 3.PeptideCutter: 蛋白质酶
Page 15 and 16: 与 PeptideCutter 比较分析 :
Page 17 and 18: ( 二 )Protein DNA• Reverse Trans
Page 19 and 20: 同时它还给出了 , 每
Page 21 and 22: ( 三 ) 蛋白序列比对•
Page 23 and 24: 2.Fasta3: 用 FASTA 和 SSEARCH pro
Page 25 and 26: 上述三种工具的比较
Page 27 and 28: 1.Three-/one-letter amino acid conv
Page 29 and 30: ( 五 ) 二级结构分析•
Page 31 and 32: 2.SOPMA: 蛋白质二级结
Page 33 and 34: 1.ProP: 分析蛋白质中赖
Page 35 and 36: 第三部分斑头雁血红
Page 37 and 38: Codon Plot 可以对 DNA 序列

ExPASy使用初探 - abc - 北京大学

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?