ExPASy使用初探 - abc - 北京大学

上 述 三 种 工 具 的 比 较 :Fasta3 所 使 用 的 SSEARCH 严 格 按 照 Smith-Waterman 原理 进 行 相 似 序 列 搜 索 ,FASTA 则 对 于 低 相 似 性 的 长 序列 分 析 比 对 具 有 专 一 性 ;MPsrch 目 前 被 认 为 是 最 灵 敏的 序 列 比 对 工 具 , 也 是 使 用 Smith-Waterman 原 理 , 但它 利 用 了 exhaustive algorithm, 而 BLAST and FASTA仅 仅 是 启 发 式 的 。