ExPASy使用初探 - abc - 北京大学

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3.MPsrch:a biological sequence comparison tool that implements thetrue Smith and Waterman algorithm.以斑头雁的血红蛋白为例 :
上述三种工具的比较 :Fasta3 所使用的 SSEARCH 严格按照 Smith-Waterman 原理进行相似序列搜索 ,FASTA 则对于低相似性的长序列分析比对具有专一性 ;MPsrch 目前被认为是最灵敏的序列比对工具 , 也是使用 Smith-Waterman 原理 , 但它利用了 exhaustive algorithm, 而 BLAST and FASTA仅仅是启发式的。
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Page 3 and 4: ExPASy 简介• ExPASy 是 Expert
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Page 7 and 8: 斑头雁血红蛋白研究
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Page 13 and 14: 3.PeptideCutter: 蛋白质酶
Page 15 and 16: 与 PeptideCutter 比较分析 :
Page 17 and 18: ( 二 )Protein DNA• Reverse Trans
Page 19 and 20: 同时它还给出了 , 每
Page 21 and 22: ( 三 ) 蛋白序列比对•
Page 23: 2.Fasta3: 用 FASTA 和 SSEARCH pro
Page 27 and 28: 1.Three-/one-letter amino acid conv
Page 29 and 30: ( 五 ) 二级结构分析•
Page 31 and 32: 2.SOPMA: 蛋白质二级结
Page 33 and 34: 1.ProP: 分析蛋白质中赖
Page 35 and 36: 第三部分斑头雁血红
Page 37 and 38: Codon Plot 可以对 DNA 序列

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