林怡廷
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生化科技學系微生物學組專題討論<br />
題目:Epstein-Barr Virus-Induced miR-155 Attenuates NF- B Signaling and Stabilizes<br />
Latent Virus Persistence<br />
作者:Fang Lu, Andreas Weidmer, Chang-Gong Liu, Stefano Volinia, Carlo M. Croce, and<br />
Paul M. Leiberman<br />
文章來源:Journal of Virology 82(21): 10436-10443, 2008<br />
演講人:Yi-Ting Lin 林怡廷 B94B02013<br />
指導老師:Li-Kwan Chang PhD 張麗冠博士<br />
演講日期:May 12 th , 2009<br />
演講地點:The 6 th Classroom<br />
摘要<br />
Epstein-Barr Virus (EBV)為疱疹病毒科 gamma 亞科的病毒,接近九成的人類受其感<br />
染,與淋巴及上皮細胞組織的惡性腫瘤有密切相關。當 EBV 進入人體細胞後,絕大部<br />
分都以潛伏的狀態存在於細胞中,但有少部分的病毒會自發性的進入溶裂循環 (lytic<br />
cycle),產生大量的 EB 病毒顆粒並釋放到宿主細胞外,感染其它細胞。LMP1 (latent<br />
membrane protein 1)為 EBV 潛伏期基因產物,是一種很強的 oncoprotein,也是 EBV 使 B<br />
細胞進入不死化 (immortalization)的重要蛋白質。miR-155 為細胞中的 miRNA,由 BIC<br />
轉錄而形成,可以與特定的 mRNA 的 3’-UTR 結合,抑制 mRNA 轉錄並降解 mRNA。<br />
先前的研究指出 miR-155 可與 IKK 的 3’-UTR 結合,而 IKK 可以活化 NF- B,因<br />
此本研究藉由觀察 miR-155 與 IKK 的相互關係,了解 miR-155 調控訊息傳導的機制。<br />
研究中首先發現只有在感染 EBV 的 B 細胞中 LMP1 會誘導 miR-155 表現。細胞加入<br />
miR-155 抑制劑後進行冷光分析發現 miR-155 會降低感染 EBV 的 B 細胞中 NF- B 的<br />
活性。最後以西方點墨法和 real-Time PCR 偵測細胞中 IKK 蛋白質與 EBV 基因的含<br />
量,證實 miR-155 會抑制 IKK 表現,進而調控 NF- B 與 IFN 訊息傳導路徑,並且<br />
藉由調控 EBNA1 的 mRNA 的表現維持潛伏期 EBV 基因的穩定性。<br />
前言<br />
本研究之重要性<br />
EBV 感染了逾九成的人類族群,與鼻咽癌等癌症有重要關聯,LMP1 為 EBV 潛伏<br />
期產物,是一種很強的 oncoprotein,可以藉由許多訊息傳導路徑使 B 細胞進不死化。而<br />
在 EBV 誘發的腫瘤中有大量的 miR-155,藉由研究 miR-155 與 EBV 潛伏期之訊息傳導<br />
的關連性,可以了解 EBV 誘發 B 細胞不死化的詳細機制。<br />
前人做過的研究<br />
先前的研究發現 miR-155 在 B 細胞形成的惡性腫瘤與 EBV 誘發的腫瘤中大量表現<br />
[1,2,3] ,也會參與正常 B 細胞的發育 [4,5] ,最近的研究也指出 miR-155 可與 IKK 的<br />
1
3'-UTR 結合 [6] 。IKK 也被證實可以藉由磷酸化 RelA 與 c-Rel 來調控 NF- B [7,8] 。<br />
作者為何要做本研究<br />
由於目前對於 EBV 誘發 B 細胞不死化 (immortalization)的詳細機制並不清楚,先前<br />
的研究又發現 miR-155 在 EBV 誘發的腫瘤細胞中大量表現,並且與 IKK 3'-UTR<br />
結合。而 IKK 可以調控 NF- B,進而細胞內調節訊息傳導路徑。因此作者希望在此<br />
研究中了解 miR-155 影響 B 細胞不死化的機制和訊息傳導路徑中扮演的角色。<br />
本研究欲完成之項目<br />
作者以 miRNA assay 證實在 EBV 感染之細胞中會持續表現 miR-155 與 BIC,之後<br />
以 RT-PCR 偵測各種細胞感染 EBV 前後 BIC 與 actin 之相對量,確定 miR-155 在哪一種<br />
細胞中表現,最後再觀察 miR-155 與 EBV 潛伏期訊息傳導路徑之關聯性。藉由上述實<br />
驗,作者可以了解 miR-155 調節訊息傳導的機制。<br />
材料方法<br />
細胞株<br />
Raji 細胞是由 Burkitt's 淋巴腫瘤分離出來的第三型潛伏期 B 細胞,LCL 細胞為感<br />
染 B98-5 EBV 的第三型潛伏期 B 細胞,DG-75 細胞為未感染 EBV 的 Burkitt's 淋<br />
巴腫瘤細胞。293T 細胞為未感染 EBV 的 HEK 細胞,ZKO 為感染 EBV 的 293T 細<br />
胞,D98 細胞為感染 EBV P3HR1 病毒株的 HeLa 細胞。<br />
miRNA array analysis<br />
將細胞中 RNA 萃取出來後進行反轉錄 (reverse transcription),再以 Genepix Pro 6.0<br />
進行分析。<br />
冷光酵素分析 (Luciferase assay)<br />
利用 Lipofectamine 2000 (Invitrogen)將 miR-155 相似物送入 293T 細胞,LCL 細胞與<br />
DG75 細胞則以電擊方式轉染 miR-155 抑制劑或相似物,培養 48 小時後以 Promega<br />
Dual-Liciferase reporter assay system 進行冷光分析。<br />
RT-PCR、real-time PCR<br />
RNA 經過反轉錄酶 (reverse transcriptase)作用合成 cDNA,再以 Syber green 探針偵<br />
測 cDNA 含量。<br />
結果討論<br />
EBV 感染細胞中持續表現 miR-155 與 BIC<br />
以 miRNA assay 偵測人類血球細胞感染 EBV 前後各種 miRNA 的含量,發現在被<br />
EBV 感染後 miR-155 會持續表現,而被 EBV 感染前或以 mock 感染之細胞不會表現<br />
miR-155 (圖一 A)。以 RT-PCR 偵測 BIC 和 actin 之相對量可以發現在 EBV 感染後 BIC<br />
RNA 的含量大幅提升 (圖一 B)。利用北方雜合法以 miR-155 的探針偵測第 4、5 與 6 號<br />
樣本,發現在感染 EBV 後可以偵測到 miR-155 (圖一 C)。由上述結果可以得知感染 EBV<br />
後會使細胞中 BIC RNA 含量增加。<br />
2
EBV 感染之 B 細胞中 BIC RNA 會大量表現<br />
作者偵測 B 細胞與上皮細胞感染 EBV 前後 BIC、LMP1 和 EBNA-2 與 actin 的相對<br />
量,發現感染 EBV 的 B 細胞 (Raji 與 LCL)中有很高的 BIC 表現,而上皮細胞 (293T、<br />
ZKO 與 D98)不論有無感染 EBV,BIC 的表現量皆很低 (圖二)。由此結果顯示,只有被<br />
EBV 感染的 B 細胞中 BIC 的表現量會增加。<br />
LMP1 誘發 B 淋巴細胞中 BIC RNA 表現<br />
將 LMP1 和 EBNA-2 轉染至未感染 EBV 的 B 細胞 (DG75)與上皮細胞 (293T)中,<br />
偵測 BIC、LMP1 和 EBNA-2 與 actin 的相對量,發現當 DG75 細胞只轉染 LMP1 時 BIC<br />
的表現量是未轉染 LMP1 的 7 倍 ;只轉染 EBNA-2 時 BIC 的表現量為未轉染的 3 倍;<br />
同時轉染 LMP1 與 EBNA-2 也會使 BIC 的表現量增加,但增加效果比只轉染 LMP1 低 (圖<br />
三 A、B、C)。而在 293T 細胞中,不論有無轉染 LMP1 和 EBNA-2,BIC 的表現量都不<br />
會增加 (圖三 D、E、F)。由上述結果可以得知 LMP1 可在 B 淋巴細胞中誘發 BIC 表現。<br />
miR-155 會降低 NF- B 訊息傳導<br />
以具有 miR-155 可辨認之 3'-UTR 的冷光酶 (luciferase)基因的 LCL 細胞,加入<br />
miR-155 抑制劑作用,再以冷光分析儀測量冷光值,發現加入 miR-155 抑制劑後冷光值<br />
變高 (圖四 A),因此作者猜測 miR-155 可能參與 LMP1 訊息傳導路徑。LMP1 主要透過<br />
NF- B 傳遞訊息,作者以含有 NF- B response element (5x B-L)的冷光酶基因的<br />
LCL 細胞加入 miR-155 抑制劑,再偵測冷光值,發現 miR-155 抑制劑可以活化 5x<br />
B-L (圖四 B)。以 miR-155 相似物作用在未感染 EB 病毒的 DG75 細胞,會使 5x B-L<br />
的活化量降低 5 倍左右 (圖四 C),而 miR-155 相似物作用在 293T 細胞則沒有顯著的差<br />
異 (圖四 D)。由以上結果可以得知 miR-155 可以降低感染 EBV 感染之 B 細胞中 NF-<br />
B 的活性。<br />
先前研究指出 IKK mRNA 為 miR-155 的目標物,因此作者利用西方點墨法偵測<br />
IKK 蛋白質的表現量,由實驗結果得知在 LCL 細胞以 miR-155 抑制劑作用後 IKK<br />
的表現量增加一倍;DG75 細胞以 miR-155 相似物作用後 IKK 的表現量減少一半 (圖<br />
五 A)。以 RT-PCR 偵測 LCL 細胞與 Raji 細胞中 IKK 、BCL2 和 CCL5 的表現量,發<br />
現 miR-155 抑制劑可以活化 BCL2 和 CCL5 的表現 (圖五 B、C),由上述結果可知 miR-155<br />
會抑制 IKK 表現,進而調控 NF- B 與 IFN 訊息傳導路徑。<br />
最後,作者利用 real-time PCR 偵測 LCL 細胞與 Raji 細胞中 EBV 基因的 copy<br />
number。以 miR-155 抑制劑作用後,LCL 細胞與 Raji 細胞中 EBV 的 DNA 與 EBNA1<br />
的含量皆降低 (圖六 A、B、C、D)。以南方雜合法偵測 Raji 細胞中 EBV 的 DNA 也可<br />
發現經過 miR-155 抑制劑作用後,EBV DNA 的含量為控制組的一半 (圖六 E)。由以<br />
上結果可以知道 miR-155 藉由調控 EBNA 的 mRNA 的表現維持潛伏期 EBV 基因的穩<br />
定性。<br />
參考文獻<br />
3
[1] Agami, R. (2007). "All roads lead to IKKepsilon." Cell 129(6): 1043-5.<br />
[2] Gottwein, E., N. Mukherjee, et al. (2007). "A viral microRNA functions as an orthologue<br />
of cellular miR-155." Nature 450(7172): 1096-9.<br />
[3] Hiscott, J. (2007). "Convergence of the NF-kappaB and IRF pathways in the regulation<br />
of the innate antiviral response." Cytokine Growth Factor Rev 18(5-6): 483-90.<br />
[4] Kluiver, J., E. Haralambieva, et al. (2006). "Lack of BIC and microRNA miR-155<br />
expression in primary cases of Burkitt lymphoma." Genes Chromosomes Cancer 45(2):<br />
147-53.<br />
[5] Kluiver, J., S. Poppema, et al. (2005). "BIC and miR-155 are highly expressed in<br />
Hodgkin, primary mediastinal and diffuse large B cell lymphomas." J Pathol 207(2):<br />
243-9.<br />
[6] Thai, T. H., D. P. Calado, et al. (2007). "Regulation of the germinal center response by<br />
microRNA-155." Science 316(5824): 604-8.<br />
[7] Vigorito, E., K. L. Perks, et al. (2007). "microRNA-155 regulates the generation of<br />
immunoglobulin class-switched plasma cells." Immunity 27(6): 847-59.<br />
[8] Yin, Q., J. McBride, et al. (2008). "MicroRNA-155 is an Epstein-Barr virus-induced<br />
gene that modulates Epstein-Barr virus-regulated gene expression pathways." J Virol<br />
82(11): 5295-306.<br />
圖表<br />
圖一、感染 EBV 的初級 B 淋巴細胞誘導 miR-155 與 BIC 表現。 (A)以 miRNA assay<br />
analysis 偵測人類周邊血液細胞感染 EBV 前後以及感染 mock 後各種 miRNA 的表現。 (B)<br />
以 RT-PCR 偵測人類周邊血液細胞感染 EBV 前後以及感染 mock 後 BIC 與 actin 之相對<br />
4
量。 (C)以北方雜合法偵測第 4、5、6 號樣本感染 EBV 前 (D0)、感染 EBV 後 (+)和感<br />
染 mock (-)後 miR-155 含量。<br />
圖二、感染 EBV 之 LCL 細胞中含有最多 BIC RNA。 以 RT-PCR 偵測各種細胞中 BIC<br />
(A)、LMP1 (B)和 EBNA-2 (C)與 actin 之相對量。<br />
圖三、B 細胞中藉由 LMP1 誘導 BIC RNA 表現。 未感染 EBV 的 DG75 細胞轉染 5<br />
g 的 LMP1、EBNA2、LMP1+EBNA2 或 mock 基因,並與 Raji 細胞中 BIC (A)、EBNA-2<br />
(B)及 LMP1 (C)對 actin RNA 的相對量比較。相同的實驗改用 293T 細胞,偵測細胞中<br />
BIC (D)、EBNA-2 (E)及 LMP1 (F)對 actin RNA 的相對量。<br />
5
圖四、B 細胞中 miR-155 可調控 NF- B 訊息傳導路徑。 (A)LCL 細胞加入不同濃度的<br />
miR-155 抑制劑或控制組抑制劑後,以冷光分析法偵測冷光值。LCL 細胞 (B)、DG75<br />
細胞 (C)和 293T 細胞 (D)轉染 5x B-L 和 miR-155 基因後,以冷光分析法偵測冷光值。<br />
圖五、miR-155 會抑制 IKK 路徑。 (A)DG75 細胞轉染 miR-155 相似物 (+)或控制組<br />
(-)、LCL 細胞轉染 miR-155 抑制劑 (+)或控制組 (-),以西方點墨法偵測 IKK 與 PCNA<br />
含量。 (B) LCL 細胞轉染 miR-155 抑制劑 (+)或控制組 (-),以 RT-PCR 偵測 IKK 、<br />
BCL2 和 CCL5 含量。 (C) Raji 細胞轉染 miR-155 抑制劑 (+)或控制組 (-),以 RT-PCR<br />
偵測 IKK 、BCL2 和 CCL5 含量。<br />
6
圖六、miR-155 在潛伏期穩定 EBV DNA 的 copy number。Raji 細胞 (A)和 LCL 細胞 (B)<br />
中轉染 miR-155 抑制劑 (+)或控制組 (-),以 real-time PCR 偵測 EBV 的 DS DNA 與 actin<br />
DNA 之相對量。Raji 細胞 (C)和 LCL 細胞 (D)中轉染 miR-155 抑制劑 (+)或控制組 (-),<br />
以 RT-PCR 偵測 EBNA1 mRNA 與 actin DNA 之相對量。 (E)Raji 細胞中轉染 miR-155<br />
抑制劑 (+)或控制組 (-),以南方雜合法偵測 EBV 的 DNA 與細胞端粒子 DNA (telomere<br />
repeat DNA)。 (F)miR-155 與 EBV 造成的不死化以及穩定潛伏期之關係。<br />
7