Klinisk Biokemi i Norden 4/2008 - Get a Free Blog
Klinisk Biokemi i Norden 4/2008 - Get a Free Blog
Klinisk Biokemi i Norden 4/2008 - Get a Free Blog
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Grafer, figurer og filformater<br />
– hvordan illustrere forskning på få kB?<br />
Johan Bjerner, Fürst medisinske laboratorium, Oslo<br />
johan.bjerner@medisin.uio.no<br />
Filformater er et problem – og definitivt løsbart!<br />
Et manuskript bør ha illustrasjoner som er skarpe og<br />
med leselig tekst, både i trykket utgave og lavoppløst<br />
internettversjon . dessverre er det vanlig med uleselig<br />
tekst og uskarpe bilder i vitenskapelige manuskripter .<br />
ofte forekommer også gigantiske bildefiler . Jeg fikk<br />
under min tid som redaksjonssekretær i SJCli tilsendt<br />
en illustrasjon på 26 MB i e-post . Forfatter var<br />
ikke sikker på om den var kommet frem, og sende<br />
den derfor to ganger… hensikten med denne artikkelen<br />
er å vise hvordan bilder kan spares og prosesseres,<br />
slik at den vitenskaplige forfatteren oppnår best mulig<br />
resultat med minst mulig arbeid .<br />
Hva er et bilde i et dataprogram?<br />
En bildefil er egentlig en sekvens av tegn . denne ”sekvensen<br />
av tegn” er helt ubegripelig å lese som tekst .<br />
En bildefil har først et navn, f . eks ”Figur1” og etter<br />
navnet følger et filformat, som f .eks ” .pdf ” . Filformatet<br />
er en melding som forteller hvilke programmer som<br />
kan brukes for å åpne eller se bildet og hvordan<br />
tegnene skal oversettes til et bilde . ”Figur1 .ppt” er<br />
en fil bestående av en sekvens av tegn . ” .ppt” angir at<br />
sekvensen av tegn skal tolkes som en power-pointpresentasjon<br />
. hvis endrer navnet fra ”Figur1 .ppt” til<br />
”Figur1 .pdf ” vil alle dataprogrammer tro at bildet nå<br />
skal tolkes som et ”Adobe portable document format”,<br />
men tegnsekvensen står fortsatt for en power-pointpresentasjon<br />
. dersom vi nå prøver åpne bildet vil vi<br />
bli avspist med en feilmelding .<br />
Bildeprogrammer er regneprogrammer<br />
hvordan skal vi da gjøre hvis vi virkelig ønsker nå å<br />
lagre ”Figur1 .ppt” i .pdf format? Slik vi har forklart<br />
oven så kan vi ikke bare forandre navnet til ”Figur1 .<br />
pdf ” . Vi må bruke et dataprogram som først kan åpne<br />
” .ppt”-filen som et bilde, for deretter gjøre en avansert<br />
matematisk omregning og så lagre figurfilen som en<br />
ny tekstsekvens, denne gangen på ” .pdf ”-format .<br />
Slike omregninger er vanligvis ikke reversible .<br />
24<br />
| 4 | <strong>2008</strong><br />
omregninger kan medføre at vi forandrer oppløsning<br />
eller fargedybde, og tapt oppløsning eller fargedybde<br />
kan ikke gjenskapes senere . hvis vi bruker et dataprogram<br />
til å omregne ”Figur1 .tif ” til ”Figur1 .gif ” og<br />
deretter tilbake fra ”Figur1 .gif ” til ”Figur1_ny .tif ” så<br />
vil den nye versjonen ”Figur1_ny .tif ” nå ha annerledes<br />
oppløsning og fargedybde enn den opprinnelige<br />
versjonen ”Figur1 .tif ” . Ved all bildebehandling må en<br />
ta vare på originalfilen, som skal spares i helt opprinnelig<br />
versjon . Alle bearbeidinger utgår så fra originalfilen<br />
. hvis tidsskriftet ber deg om å levere figuren<br />
din på et annerledes format, lager du en ny kopi av<br />
originalfilen og gjør de påkrevde bearbeidingene på<br />
denne, ikke på den bearbeidede figuren du opprinnelig<br />
sendte til tidsskriftet .<br />
Bitbaserte og vektorbaserte formater<br />
dataprogrammer lagrer altså figurer som en ”sekvens<br />
av tegn” . det finnes to hovedprinsipper for hvordan<br />
figurer kan lagres som en ”sekvens av tegn” .<br />
1 . Bitbaserte bilder/formater . Tegnsekvensene står for<br />
punkter med fargeinnehold . Et slikt punkt kalles<br />
for et ”bit” . Jo flere ”bits”, jo skarpere bilde, men<br />
også større lagringsplass . Typeeksempel på hvor<br />
bitbaserte formater er viktige er fotografi, siden<br />
digitale fotografier oppstår som fargede punkter<br />
inne i et kamera .<br />
2 . Vektorbaserte bilder/formater . Tegnsekvensene står<br />
ikke for punkter men for ”instrukser” . En instruks<br />
kan være at det skal skrives en setning på en<br />
skjerm, eller at det skal trekkes en strek fra A til<br />
B . Et vektorbasert bilde tar oftest betydelig mindre<br />
lagringsplass enn et bitbasert bilde – hvis en strek<br />
skal lagres som mange punkter tar den mye mer<br />
plass . diagrammer og figurer er typiske eksempler,<br />
hvor bildene ikke består av fargede punkter, men av<br />
vektorer som akser, tall og stjerner . Vektorbaserte<br />
bilder/formater er foretrukket format for alle diagrammer<br />
og figurer, med et unntak, og det er<br />
dersom det er veldig mange observasjoner, f .eks<br />
<strong>Klinisk</strong> <strong>Biokemi</strong> i <strong>Norden</strong>
Change language