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como implementado em PAUP (Swofford, 1999). Para verificar possível saturação de
transições e transversões, graficou-se a distância p versus transições e distância p
versus transversões para cada par de seqüências nucleotídicas.
3.4.4 – Análise dos haplotipos e polimorfismo de DNA
O número de haplotipos dentro e entre as populações amostradas foi
determinado com o auxílio do programa COLAPSE 1.1 (http://www .bioag. byu.
edu/ zoology/crandall_lab/programs.htm).
Várias análises que estimam direta e indiretamente o polimorfismo de DNA
foram feitas com o programa DNAsp 3.0 (Rozas & Rozas, 1999). Entre os parâmetros
estimados inclui-se: 1) diversidade haplotípica, que é probabilidade de cada duas
seqüências serem diferentes em uma população (HD) (Nei, 1987 equação 8.4); 2)
diversidade nucleotídica, que indica o número médio de diferenças nucleotídicas por
sítio entre as seqüências (Pi) (Nei, 1987 p. 259); 3) média das diferenças nucleotídicas
entre pares de indivíduos (K) e respectivas variâncias [observada V(k)o e esperada
V(k)] (Tajima, 1983; Tajima, 1993); 4) número total de mutações (Eta) (Nei, 1987
equação 10.3); 5) média do número de substituições por sítio (Dxy); 6) substituição
líquida por sítio (Da) (Nei, 1987) e 7) estimador de fluxo gênico, em termos de
número de migrações por ano (Nm) (Nei, 1982). No cálculo de alguns dos
parâmetros acima foi adotada a correção de Jukes-Cantor, JC (Jukes & Cantor, 1969) a
fim de assegurar a consistência dos dados, dada a impossibilidade de implementar o
modelo definido pelo programa MODELTEST (HKY+Γ+I) em DNAsp.
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