Modelagem molecular e avaliação da relação estrutura ... - UFRJ

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SUMARIO RESUMO ABSTRACT LISTA DE FIGURAS LISTA DE TABELAS LISTA DE ABREVIATURAS E SIGLAS SUMÁRIO 1 INTRODUÇÃO.................................................................................................. 19 1.1 CONSIDERAÇÕES GERAIS......................................................................... 19 1.2 VÍRUS HERPES SIMPLES (HSV)................................................................. 20 1.2.1 Aspectos Gerais....................................................................................... 20 1.2.2 Morfologia Viral......................................................................................... 23 1.2.3 Ciclo Replicativo do HSV e Alvos Anti-HSV........................................... 23 1.3 FÁRMACOS ANTIVIRAIS USUAIS............................................................... 29 1.3.1 Análogos de Nucleosídeos: Um Marco Como Antivirais...................... 29 1.3.2 Inibidores Não Nucleosídeos: Diversidade Estrutural.......................... 32 1.3.3 Derivados Acridona.................................................................................. 34 1.4 PLANEJAMENTO RACIONAL DE FÁRMACOS........................................... 38 1.4.1 Panorama Geral........................................................................................ 38 1.4.2 Métodos de Cálculo de Modelagem Molecular...................................... 41 1.4.2.1 Mecânica Molecular................................................................................. 41
1.4.2.2 Mecânica Quântica.................................................................................. 43 1.4.2.2.1 Cálculos ab initio................................................................................... 44 1.4.2.2.2 Cálculos Semi-Empíricos...................................................................... 46 1.4.3 Análise Conformacional........................................................................... 48 1.4.4 Descritores Moleculares........................................................................... 49 1.4.5 Parâmetros Farmacocinéticos e Toxicológicos In silico...................... 50 1.4.5.1 ADMET in silico........................................................................................ 52 1.4.5.2 Outras abordagens farmacocinéticas (“Regra-dos-Cinco” de Lipinski).... 55 1.4.5.3 Regra de Lipinski – Abordagens para o Sistema Nervoso Central.......... 57 2 JUSTIFICATIVA................................................................................................ 58 3 OBJETIVOS...................................................................................................... 60 3.1 OBJETIVOS GERAIS..................................................................................... 60 3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS.......................................................................... 60 4 METODOLOGIA............................................................................................... 62 4.1 CÁLCULOS DOS PARÂMETROS TEÓRICOS DE MODELAGEM MOLECULAR ...................................................................................................... 62 4.1.1 Mapa de Potencial Eletrostático.............................................................. 62 4.1.2 Energias dos Orbitais Moleculares......................................................... 64 4.1.3 Densidade dos Orbitais de Fronteira...................................................... 64 4.1.4 Coeficiente de Distribuição Tridimensional dos orbitais de fronteira. 64 4.1.5 Momento de Dipolo................................................................................... 65
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