Modelagem molecular e avaliação da relação estrutura ... - UFRJ

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candidatos a fármacos por CADD pode ser dividido em duas abordagens
denominadas planejamento ―direto‖ e ―indireto‖.
Com o método ―direto‖ considera nos estudos a estrutura tridimensional do
complexo ligante e macro-molecula-alvo, quer seja experimentalmente por por
difração de raios-X ou por ressonância magnética nuclear, quer seja obtida por
modelagem por homologia (ou comparativa). Por esse método analisa-se o
complexo ligante-macromolecula, identificando possíveis sítios de ligação e
principais modos de interação. Isso permite sugerir modificações específicas no
ligante, com o objetivo de aumentar o grau de afinidade e/ou especificidade com
relação ao alvo (JORGENSEN et al., 2004; CHAVATTE E FARCE, 2006).
O método ―indireto‖, por sua vez, não considera a estrutura tridimensional da
molécula-alvo. Nesse caso, informações como atividade biológica, características
estruturais e estéreos eletrônicas de uma serie de ligantes ( compostos ativos e
inativos) determinam propriedades específicas que podem influenciar na interação
com a macromolécula-alvo (JORGENSEN et al., 2004). Esses dados podem ser
usados em estudos de Relação Estrutura-Atividade (Structure Activity Relationship,
SAR), permitindo gerar um modelo que pode ser utilizado para a seleção de
compostos de um banco de dados ou para orientar no processo de planejamento de
novos fármacos (SOUZA, 2007; BARREIRO et al., 1997; LEACH, 1996; COHEN,
1990).
Outra estratégia que pode reduzir o tempo gasto em Pesquisa e
desenvolvimento de um novo fármaco é a realização de estudos farmacocinéticos e
toxicologicos com estágios iniciais de P&D. A predição in silico de parâmetros
ADMET (Absorção, Distribuição, Metabolismo, Excreção e Toxicidade) permite uma
avaliação, a priori, do perfil farmacocinético e toxicológico esperado para candidatos