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variantes que segregam com a doença
em uma família.
VARIANTES PROVAVELMENTE
PATOGÊNICAS:
variantes que apesar de não reportadas
em bancos de dados ou na literatura
científica e que não foram avaliadas
em estudos funcionais, podem
levar à alteração da função proteica
(nonsense, frameshift, splicing site).
VARIANTES DE SIGNIFICADO
INCERTO:
podem ser variantes em genes conhecidos
relacionados a uma questão clínica,
mas a variante em questão não
tem evidências científicas disponíveis
que permitem concluir se tratar de
uma variante benigna ou patogênica.
Podem ser também variantes em genes
cuja função ainda é incerta, isto é,
naqueles genes potencialmente candidatos
onde a natureza da troca pode
afetar a função deste gene. Geralmente
são variantes raras, ausentes ou em
baixa frequência nos bancos de dados
populacionais, sem relatos anteriores
e, quando analisadas, são aquelas
modificadoras da função proteica
(frameshift). É escolha do laboratório
relatar ou não as VUS encontradas,
mas a ACMG sugere que elas sejam
reportadas quando estão em genes
relacionados com a questão clínica do
paciente.
VARIANTES PROVAVELMENTE
BENIGNAS:
variantes para as quais não foi reconhecida
ou não se espera nenhuma
patogenicidade (silenciosas, intrônicas),
mas que não preenchem todos
os critérios para serem classificadas
como benignas.
VARIANTES BENIGNAS:
variantes com evidências suficientes
para classificação como benignas,
comprovadamente reconhecidas por
não conferirem patogenicidade, podendo
ou não serem reportadas.
A classificação e a interpretação das
variantes refletem o conhecimento
científico disponível na literatura no
momento da análise, interpretação do
resultado e emissão do laudo. Assim,
as variantes provavelmente patogênicas
e, principalmente, as variantes de
significado desconhecido/incerto podem
vir a ser reclassificadas, devendo
sempre passar por um processo de
reinterpretação na literatura científica
após a realização do exame.
Com a diminuição dos valores, houve
um aumento crescente de realização
de sequenciamento de última geração
(sequenciamento do genoma completo
e do exoma completo) e consequentemente
um aumento muito grande
de variantes de significado clínico
desconhecido/incerto e, por isso,
muito tem se discutido sobre a importância
da reinterpretação dos dados,
pois o conhecimento não é estático, é
dinâmico e está em intensa ascensão.
No último dia 29 de abril, um novo
documento foi publicado no ACMG
sugerindo que os dados de pacientes
devem ser reanalisados, principalmente
quando existe VUS. Além da
Academia Americana, a EuroGentest,
UK e a Academia Canadense de
Medicina Genética (Canadian College
of Medical Geneticist) também vêm
discutindo essa reinterpretação dos
dados.
Nós da Tismoo sempre acreditamos
que a reinterpretação dos dados é algo
bastante importante e, por isso, desde
nossa inauguração, já contamos com
o sistema de atualização de dados
chamado de Tismoo 24/7, no qual os
dados dos pacientes que realizaram
os exames T-GEN (sequenciamento
completo do genoma) ou T-EXOM
(sequenciamento completo do exoma)
são atualizados a cada seis meses
durante um ano após a confecção e,
passado esse período, o paciente poderá
solicitar essa reanálise por tempo
ilimitado, pois acreditamos que um
dado que hoje pode ter um significado
incerto pode ser a chave para o
conhecimento no futuro.
É importante ressaltar que um laudo
genético deve ser sempre bem elaborado,
com base nas regras da ANVISA
e da ACMG, ele deve conter resultados,
metodologia e conclusões — e
o mais importante: deve ser relacionado
com a clínica do paciente e ser
interpretado sempre com um suporte
médico.
Lembrem-se que a
variante genética deve
ser avaliada e não
apenas o gene.
GRACIELA PIGNATARI.
Bióloga, Mestrado e Doutorado em
Biologia Molecular pela UNIFESP,
estágio no Mount Sinai School of
Medicine em Nova York, Participou
da criação da ONG “Projeto A Fada
do Dente” e é sócio-fundadora da
startup de biotecnologia TISMOO.