小麦ERF类转录因子生物信息学分析 - abc
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引 物 设 计 时 应 注 意 的 问 题<br />
1、 引 物 长 度 (primer length) 15-30 bp 不 应 大 于 38<br />
2、 引 物 序 列 在 模 板 内 应 当 没 有 相 似 性 较 高 , 尤 其 是 3’ 端 相 似 性<br />
较 高 的 序 列 , 否 则 容 易 导 致 错 配 引 物 3’ 端 出 现 3 个 以 上 的 连 续<br />
碱 基 , 如 GGG 或 CCC, 也 会 使 错 误 引 发 机 率 增 加<br />
3、 序 列 Tm 值 (melting temperature)<br />
如 :Tm=4 ( G+C )+2 ( A+T )<br />
4、G+C 含 量 (composition) 40-60 %<br />
5、 引 物 二 聚 体 及 发 夹 结 构 (duplex formation and hairpin)<br />
6、 避 免 在 引 物 的 3’ 端 使 用 碱 基 A<br />
2013/1/22
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