DAS BAKTERIEN-GENOM

Elemente der Initiation der Replikation
Replikation ist bidirektional
origin ist ca 245 bp lang
5 DnaA Binderegionen
11 GATC (SauIIIA) Sequenzmotive
ENZYME:
a) DnaA/ tritt in Wechselwirkung mit RNA-Polymerase
b) DnaB und C / Primosomzusammensetzung
c) Dam/ A-Methylierung an -GATCd)
DNA-Polymerasen
e) RNA-Polymerase
f) Gyrase
-Für die Initiation der Replikation sind noch nicht genauer charakterisierte Proteine
beteiligt.
-Ein obligatorischer Schritt für den Start der "leading" Strangsynthese ist eine
Transkription der ori Region durch die RNA-Polymerase;
-Bei dem Plasmid Col E-1 kann die RNA direkt als Primer ververwendet werden -
nachdem die RNA durch RNase-H (Hybrid) verkürzt wurde.
-Bei der chromosomalen DNA hat jedoch die durch die RNA-Pol. transkribierte RNA
keine Primer-Funktion;
-Die einzige Rolle der RNA-Pol. ist vermutlich die, den Doppelstrang zu öffnen, damit
das Primosom besser binden und sich assoziieren kann.
Die minimale Sequenz des oriC konnte auf 245 bp eingegrenzt werden. Flankiert ist der
origin von folgenden Genen:
rechts von oriC :
mioC: (modulation of initiation at oriC); kodiert für ein 16 kDa Protein mit unbekannter
Funktion;
asnC: ist ein Transkriptionsaktivator des asnA-Gens und hat einen positiven Effekt auf
die post-transkriptionale Expression von gidA;
asnA: kodiert für eines der beiden Asparaginsynthasen in E. coli.
links von oriC :
gidA und gidB : (glucose inhibition of division); eine Mutation im gidA Gen resultiert in
einer Verringerung der Wachstumsgeschwindigkeit und in einer Glukosehemmung der
Zellteilung.
unc - oder atp - Operon kodieren für Untereinheiten der membrangebundenen FoF1
ATP Synthase.
Die Struktur des oriC
Am linken Ende von oriC sind AT- reiche Sequenzabschnitte.
R1-4 und M stellen Konsensussequenzen dar, an denen das Iniationsprotein DnaA
(DnaA-Boxen) bindet.
GATC - Sequenzen kommen bei allen enteriobakteriellen origins etwa 9-16 Mal vor.
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