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Nukleinsäureanalytik

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<strong>Nukleinsäureanalytik</strong><br />

(270073 VO)<br />

Margit Cichna-Markl


Folien als pdf-Files<br />

http://anchem.univie.ac.at<br />

Studium und Lehre<br />

Skripten<br />

M. Cichna-Markl<br />

Vorlesung <strong>Nukleinsäureanalytik</strong>


Rasante Entwicklung in den „Life Sciences“<br />

Jahr Beitrag<br />

1909 – frühe 1950er Entschlüsselung der DNA (u.a. Erwin Chargaff, Rosalind Franklin)<br />

1944 Erkennung der DNA als Träger der Erbinformation (Oswald Avery)<br />

1953 Aufklärung der 3D-Struktur der DNA (James Watson, Francis Crick)<br />

1961-1969 Entschlüsselung des genetischen Codes (Nierenberg, Matthaei,<br />

Ochoa)<br />

1973 Erste Klonierung eines Plasmids (Boyer, Chang, Cohen)<br />

1977 Entwicklung der DNA-Sequenzierung (Frederick Sanger)<br />

1983 Entwicklung der Polymerasekettenreaktion (Kary Mullis)<br />

1990 Start des Human Genome Projects<br />

1995 Vollständige Sequenzierung von Haemophilus influenzae<br />

2004 Veröffentlichung des menschlichen Genoms


Effizienz der DNA-Sequenzierung<br />

Jahr Basen / Tag<br />

1986 1.000<br />

1995 15.000<br />

1997 500.000<br />

1998 1 Million<br />

2005 80 Millionen<br />

2009 8,8 Milliarden


VO - Übersicht<br />

Einführung (Struktur der DNA, RNA)<br />

Methodik:<br />

• Isolierung und Aufreinigung der DNA<br />

• Vervielfachung der DNA (Klonieren, PCR)<br />

• Hybridisierung und Nachweistechniken<br />

• DNA Microarrays (Genexpressionsanalyse)<br />

• Sequenzierung<br />

• DNA-Methylierungsanalyse<br />

• Analyse von Protein-Nukleinsäure-Wechselwirkungen<br />

• Einsatz von Aptameren in der Analytik<br />

Anwendungen:<br />

• Forensik, Vaterschaftstest<br />

• Suche und Detektion von Mutationen: Diagnose von Krebs, Diagnose von<br />

Erbkrankheiten<br />

• Suche nach epigenetischen Biomarkern zur Früherkennung von Krankheiten<br />

• Lebensmittelanalytik (GVO, Authentizitätsprüfung)


Buchempfehlung


Organisation des Genoms in Eukaryoten


Bausteine der DNA<br />

Nucleoside


Synthese der DNA


Struktur der DNA<br />

3´- OH<br />

5´- Phosphat<br />

5´-Phosphat<br />

3´- OH<br />

DNA-Doppelhelix<br />

Minor groove<br />

(Kleine Furche)<br />

Major groove<br />

(Große Furche)


Basenpaarung


Struktur der DNA<br />

3´- OH<br />

5´- Phosphat<br />

5´-Phosphat<br />

3´- OH<br />

DNA-Doppelhelix<br />

Minor groove<br />

(Kleine Furche)<br />

Major groove<br />

(Große Furche)


Verpackung der DNA


„Zentrales Dogma der Molekularbiologie“


Unterschiede zwischen DNA und RNA


Bausteine der RNA


Typen von RNA<br />

RNA Typ Größe (Zahl der<br />

Nukleotide)<br />

Funktion<br />

mRNA 500 – 4500 + Kodiert die Aminosäuresequenz<br />

rRNA 100 – 3000 Assoziiert mit Proteinen, bildet<br />

Ribosomen, die strukturell die<br />

Proteinsynthese unterstützen und<br />

katalysieren<br />

tRNA 75 – 80 Transportiert spezifische Aminosäuren<br />

für die Proteinsynthese zu den<br />

Ribosomen<br />

miRNA durchschnittlich 22 Reguliert Expression bestimmter Gene<br />

siRNA 20 – 25 Reguliert Expression bestimmter Gene


Der genetische Code

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