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Biochemie Praktikum I

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<strong>Praktikum</strong>sskript <strong>Biochemie</strong> für Biologen-Bachelor SS2012<br />

Elektrophorese / CPY-Synthese<br />

Biosynthese von CPY<br />

Carboxypeptidase yscY (CPY) ist eine Exopeptidase, die in der Vakuole (entspricht dem<br />

Lysosom) der Hefe Saccharomyces cerevisiae lokalisiert ist. Es handelt sich um eine<br />

unspezifisch agierende Peptidase, welche ihre natürlichen Substrate, d.h. in die Vakuole<br />

eingeschleuste Proteine, vom Carboxy-Terminus her durch Spaltung von Peptidbindungen<br />

abbaut. Dabei spaltet sie bevorzugt hinter hydrophoben Aminosäuren.<br />

So lässt sich ihre Aktivität mit Hilfe synthetischer Peptidsubstrate, in denen z.B. an ein<br />

Phenylalanin oder ein Tyrosin carboxyterminal ein Chromophor gekoppelt ist, durch die<br />

Freisetzung dieser gefärbten Komponente verfolgen. Für die Spaltung des Substrats ist u. a.<br />

ein Serin-Rest im aktiven Zentrum des Enzyms erforderlich, die CPY wird deshalb zu den<br />

Serin-Peptidasen gerechnet.<br />

Die Carboxypeptidase yscY durchläuft nach ihrer Synthese einen Teil des sekretorischen<br />

Weges der Zelle (Endoplasmatisches Retikulum; Golgi-Apparat) und wird von dort in die<br />

Vakuole sortiert. Sie wird als ein höher-molekulares Vorläufermolekül (61 kDa) hergestellt,<br />

das nach seiner Modifizierung mit 4 Kohlenhydratketten im ER ein Molekulargewicht von 67<br />

kDa erreicht (p1-Form) und später durch weitere „outer-chain“-Mannosylierung im Golgi als<br />

69 kDa (p2)-Form vorliegt. In der Vakuole erfolgt die proteolytische Reifung zur aktiven<br />

Carboxypeptidase yscY mit einem Molekulargewicht von 61 kDa.<br />

Die proteolytische Reifung des Enzyms wird durch zwei weitere vakuoläre Peptidasen,<br />

Proteinase yscA und Proteinase yscB, katalysiert. Eine mutierte Form des Proteins, CPY*,<br />

wird im ER als falsch gefaltet erkannt und durch retrograden Transport aus dem ER hinaus<br />

dem Abbau durch das Proteasomen zugeführt. Für den Ablauf dieses Prozesses wird u. a. das<br />

Der3 Protein benötigt.<br />

In diesem Versuch sollen die verschiedenen Reifestadien der CPY mit Hilfe eines Immuno-<br />

Blots visualisert werden. Dazu werden Proteinextrakte von mutierten Hefestämmen<br />

verwendet.<br />

YWO 342 (WT); YWO 1527 (prc1-1 Δder3 Δdoa10); YWO 664 (Δpep4); YWO 636<br />

(Δprc1)<br />

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